Phần 4 Kết quả nghiên cứu và thả olu ận
4.2. Đặc điểm dịch tễ học phân tử của PCV2
4.2.4. Sự lưu hành của các genotype PCV2 theo không gian và thời gian
Về sự phân bố của PCV2 trên thế giới, các genotype khác nhau của PCV2 có mức độ lưu hành rất khác biệt. Genotype PCV2c chỉ có ở mẫu bệnh phẩm thu thập những năm 1989-1990 ở Đan Mạch (Dupont et al., 2008). Đối với genotype PCV2a và PCV2b, các nhà khoa học trên thế giới đã phát hiện được sự chuyển dịch genotype lưu hành phổ biến (genotypic shift) từ PCV2a sang PCV2b diễn ra
trên phạm vi toàn cầu từnăm 2003 (Cortey et al., 2011, Dupont et al., 2008). Vài
năm trở lại đây, người ta cho rằng có một sự dịch chuyển genotype lưu hành phổ
biến sang PCV2d do sự phân bố rộng rãi của nó ở các nước chăn nuôi lợn và sự
tăng về số lượng các trình tự gen PCV2d được công bố (Xiao et al., 2015). Ở
Việt Nam, bằng chứng huyết thanh học cho thấy sự xuất hiện của PCV2 vào năm
2000. Từ đó đến nay, các nghiên cứu được thực hiện ở khu vực phía Nam
(Nguyễn Thị Thu Hồng và cs., 2006) và khu vực phía Bắc đều khẳng định sự hiện diện và nguy cơ ngày càng lan rộng của PCV2 ở mọi quy mô chăn nuôi lợn (Huỳnh Thị Mỹ Lệ và cs., 2012; Trương Anh Đức và cs., 2015). Trên cơ sở phân nhóm genotype PCV2 dựa vào cây phát sinh chủng loại, nghiên cứu này đã làm
rõ sự phân bố của các genotype PCV2 lưu hành tại 20 tỉnh/ thành phố trong cả
nước theo không gian (địa phương phân lập) và thời gian (năm phân lập).
Kết quả ở hình 4.8 (trang bên) cho thấy, tại một số tỉnh phía Bắc (Hà Nội,
Hưng n, Hịa Bình) và phía Nam (Bình Dương) có sự lưu hành của các nhóm
di truyền khác nhau. Ví dụ, từ năm 2009-2016 đều phát hiện được PCV2 nhóm
1A/1B, CRF và PCV2d lưu hành ở đàn lợn nuôi tại Hà Nội. Về mặt thời gian,
nhóm tái tổ hợp CRF có mặt ở Việt Nam ít nhất từ năm 2004, genotype PCV2d xuất hiện ít nhất từ 2008.
2008 2010 2012 2014 2016 2017
Hình 4.8. Phân bố các nhóm di truyền của PCV2 ở Việt Nam theo không gian và thời gian
2004 2009 2011 2013 2015 (Năm)
Với cơ sở dữ liệu hiện thời, kết quả trình bày ở hình 4.8 cho nhận xét: ở
Việt Nam, có sự lưu hành đồng thời nhiều nhóm di truyền của PCV2 ở một địa
phương, trong cùng một khoảng thời gian. Đặc điểm kể trên cũng đã được khẳng định thêm trong một nghiên cứu gần đây của Việt Nam (Lê Thị Thu Phương và
cs., 2018) và có thể thấy diễn ra ở nhiều nước như Hàn Quốc (Kwon el al., 2017a): một số trang trại chỉ có đơn genotype hoặc 2a, 2b, 2d lưu hành; một số trang trại có hỗn hợp 2 hoặc 3 genotype (2a/2b, 2a/2d, 2b/2d và 2a/2b/2d). Ở
Colombia, sự phân bố và biến động genotype PCV2 được xác định khơng có
tương quan với thời gian (năm phân lập) (Rincon el al., 2014).