CHƢƠNG III KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
3.1. Tạo dữ liệu di truyền cho quần thể mới tại Lào
3.2.3. Phân tích xác suất thuộc về nhóm thuần chủng
Phân tích bằng phần mềm GeneClassv2.0 cho xác suất thuộc về nhóm cá thể thuần chủng (Bảng 4). Giá trị này với các cá thể cá sấu nƣớc mặn và Cuba hầu hết là 0%. Khoảng giá trị này đối với các cá thể cần xác định mức độ thuần chủng là: với phƣơng pháp Bayesian 0 - 80,17%; phƣơng pháp khoảng cách là 0 - 98,78%; phƣơng pháp tần số là 0 - 86,06%. Các giá trị này không tỷ lệ thuận giữa các mẫu.
Bảng 4. Kết quả phân tích dữ liệu microsatellite bằng phần mềm GeneClassv2.0 thể
hiện xác suất thuộc về nhóm cá thể thuần chủng
STT Tên lồi Kí hiệu Kí hiệu ngồi Phƣơng pháp Phƣơng pháp Phƣơng pháp Địa điểm PTN thực địa Bayesian khoảng cách tần số
1 C. cf. siamensis Cr1 46,03 75,15 87,05 Kiên Giang: Hòn Me 2 C. cf. siamensis Cr7 Bs1 0,41 51,93 0,86 Tỉnh Khammouane, Lào 3 C. cf. siamensis Cr8 Bs2 0,41 51,93 0,86 Tỉnh Khammouane, Lào 4 C. cf. siamensis Cr9 Bs3 2,97 93,42 4,19 Tỉnh Khammouane, Lào 5 C. cf. siamensis Cr10 Saigon 1 0,02 1,55 0,13 Vƣờn thú Sài Gòn 6 C. cf. siamensis Cr11 Saigon 2 4,89 33,96 20,32 Vƣờn thú Sài Gòn 7 C. cf. siamensis Cr12 Saigon 3 0,01 32,80 0,03 Vƣờn thú Sài Gòn 8 C. cf. siamensis Cr13 Saigon 4 0,35 34,02 2,52 Vƣờn thú Sài Gòn 9 C. cf. siamensis Cr14 Saigon 5 0,93 33,72 5,97 Vƣờn thú Sài Gòn 10 C. cf. siamensis Cr15 Saigon 6 24,39 18,82 50,88 Vƣờn thú Sài Gòn 11 C. cf. siamensis Cr16 Saigon 7 0,38 25,57 2,14 Vƣờn thú Sài Gòn 12 C. cf. siamensis Cr17 Saigon 8 0,01 32,26 0,03 Vƣờn thú Sài Gòn 13 C. cf. siamensis Cr18 Saigon 9 33,53 50,30 70,08 Vƣờn thú Sài Gòn 14 C. cf. siamensis Cr19 Saigon 10 28,54 40,88 62,48 Vƣờn thú Sài Gòn 15 C. cf. siamensis Cr20 Saigon 11 8,02 31,50 27,12 Vƣờn thú Sài Gòn 16 C. cf. siamensis Cr21 Saigon 12 0,57 6,18 2,74 Vƣờn thú Sài Gòn 17 C. cf. siamensis Cr22 Saigon 13 0,11 7,74 1,03 Vƣờn thú Sài Gòn
19 C. cf. siamensis Cr24 Saigon 15 0,00 31,01 0,00 Vƣờn thú Sài Gòn 20 C. cf. siamensis Cr25 Saigon 16 0,00 1,70 0,00 Vƣờn thú Sài Gòn 21 C. cf. siamensis Cr26 Saigon 17 0,00 7,33 0,00 Vƣờn thú Sài Gòn 22 C. cf. siamensis Cr27 Saigon 18 0,00 0,25 0,00 Vƣờn thú Sài Gòn 23 C. cf. siamensis Cr28 Saigon 19 2,38 1,10 14,95 Vƣờn thú Sài Gòn 24 C. cf. siamensis Cr29 Saigon 20 0,08 0,06 1,01 Vƣờn thú Sài Gòn 25 C. cf. siamensis Cr30 Saigon 21 28,92 29,08 69,27 Vƣờn thú Sài Gòn 26 C. cf. siamensis Cr31 Saigon 22 0,02 2,77 0,69 Vƣờn thú Sài Gòn 27 C. cf. siamensis Cr32 Saigon 23 28,52 37,92 59,51 Vƣờn thú Sài Gòn 28 C. cf. siamensis Cr33 Saigon 24 55,14 20,58 95,66 Vƣờn thú Sài Gòn 29 C. cf. siamensis Cr34 Saigon 25 3,40 63,09 5,29 Vƣờn thú Sài Gòn 30 C. cf. siamensis Cr35 Saigon 26 7,76 27,52 25,33 Vƣờn thú Sài Gòn 31 C. cf. siamensis Cr36 Saigon 27 32,81 72,66 68,01 Vƣờn thú Sài Gòn 32 C. cf. siamensis Cr37 Saigon 28 15,62 30,39 39,50 Vƣờn thú Sài Gòn 33 C. cf. siamensis Cr38 Hanoi 41 0,22 25,09 3,33 Vƣờn thú Thủ Lệ 34 C. cf. siamensis Cr39 Hanoi 30 68,67 86,36 99,69 Vƣờn thú Thủ Lệ 35 C. cf. siamensis Cr40 Hanoi 31 0,00 14,69 0,00 Vƣờn thú Thủ Lệ 36 C. cf. siamensis Cr41 Hanoi 32 36,82 24,72 82,48 Vƣờn thú Thủ Lệ 37 C. cf. siamensis Cr42 Hanoi 33 0,05 13,73 0,29 Vƣờn thú Thủ Lệ 38 C. cf. siamensis Cr43 Hanoi 34 2,27 28,36 5,21 Vƣờn thú Thủ Lệ 39 C. cf. siamensis Cr44 Hanoi 35 14,81 59,75 38,17 Vƣờn thú Thủ Lệ 40 C. cf. siamensis Cr45 Hanoi 36 18,61 38,70 50,07 Vƣờn thú Thủ Lệ 41 C. cf. siamensis Cr46 Hanoi 37 19,59 18,22 51,02 Vƣờn thú Thủ Lệ 42 C. cf. siamensis Cr47 Hanoi 38 12,40 67,26 31,87 Vƣờn thú Thủ Lệ 43 C. cf. siamensis Cr48 Hanoi 39 0,11 65,98 1,03 Vƣờn thú Thủ Lệ 44 C. cf. siamensis Cr49 Hanoi 40 55,12 33,78 93,62 Vƣờn thú Thủ Lệ 45 C. cf. siamensis Cr50 Lao Zoo 5 51,13 56,52 63,72 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 46 C. cf. siamensis Cr53 Lao Zoo 14 0,32 0,01 2,95 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 47 C. cf. siamensis Cr54 Lao Zoo 18 0,00 21,81 0,02 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 48 C. cf. siamensis Cr55 Lao Zoo 19 15,07 93,60 34,56 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 49 C. cf. siamensis Cr56 Lao Zoo 15 0,00 9,37 0,02 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 50 C. cf. siamensis Cr57 Lao Zoo 2 28,08 53,56 62,72 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 51 C. cf. siamensis Cr58 Lao Zoo 4 34,51 45,68 78,50 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 52 C. cf. siamensis Cr59 Lao Zoo 11 0,16 0,05 1,62 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 53 C. cf. siamensis Cr60 Lao Zoo 1 1,41 65,06 4,36 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 54 C. cf. siamensis Cr61 Lao Zoo 10 39,20 31,94 85,11 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 55 C. cf. siamensis Cr62 Lao Zoo 12 0,00 30,92 0,21 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 56 C. cf. siamensis Cr63 Lao Zoo 3 51,93 43,69 93,33 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 57 C. cf. siamensis Cr64 Lao Zoo 16 0,52 64,30 3,95 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 58 C. cf. siamensis Cr65 Lao Zoo 13 44,65 21,84 83,41 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 59 C. cf. siamensis Cr66 Lao Zoo 17 0,00 79,21 0,17 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 60 C. cf. siamensis Cr67 Lao Zoo CS20 4,14 27,18 19,38 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 61 C. cf. siamensis Cr68 Lao Zoo CS21 0,00 23,92 0,00 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 62 C. cf. siamensis Cr69 Lao Zoo CS22 6,80 41,25 21,84 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 63 C. cf. siamensis Cr70 Lao Zoo CS23 1,91 75,08 13,57 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 64 C. cf. siamensis Cr71 Lao Zoo CS24 35,58 62,02 80,03 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 65 C. cf. siamensis Cr72 Lao Zoo CS25 31,38 73,72 69,54 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 66 C. siamensis Cr95 S1 78,30 88,65 86,12 Vƣờn thú Plzen, Séc 67 C. siamensis Cr96 S2 28,33 82,63 68,51 Vƣờn thú Plzen, Séc
69 C. siamensis Cr98 COS002 20,17 5,81 49,83 Vƣờn thú Benidorm, Tây Ban Nha 70 C. cf. siamensis Cr 100 COS003 0,00 41,83 0,00 Vƣờn thú Benidorm, Tây Ban Nha 71 C. siamensis Cr77 CT.2018.1 24,56 15,55 31,76 Vƣờn quốc gia Cát Tiên
72 C. siamensis Cr78 CT.2018.2 4,59 82,71 6,98 Vƣờn quốc gia Cát Tiên 73 C. siamensis Cr79 CT.2018.3 0,62 73,29 1,52 Vƣờn quốc gia Cát Tiên 74 C. siamensis Cr80 CT.2018.4 32,89 47,03 39,16 Vƣờn quốc gia Cát Tiên
75 C. cf. siamensis Cr 99 COS004 0,00 37,89 0,00 Vƣờn thú Benidorm, Tây Ban Nha 76 C. porosus Cp1 0 0 0 Vƣờn thú Wilhelma, Đức 77 C. porosus Cp2 0 0 0 Vƣờn thú Wilhelma, Đức 78 C. porosus Cp3 0 0 0 Vƣờn thú Wilhelma, Đức 79 C. porosus Cp4 0 0 0 Vƣờn thú Wilhelma, Đức 80 C. porosus Cp5 0 0 0 Vƣờn thú Wilhelma, Đức 81 C. rhombifer Crb1 0 0 0 Vƣờn thúZagreb, Croatia 82 C. rhombifer Crb2 0 0 0 Terrariet Vissenbjerg, Đan Mạch 83 C. rhombifer Crb3 0 0 0 Vƣờn thú Hoyerswerda, Đức 84 C. rhombifer Crb4 0 0 0 Vƣờn thú Hoyerswerda, Đức 85 C. rhombifer Crb5 0 1,9742 0 Vƣờn thú Hoyerswerda, Đức
Phân tích bằng phần mềm GeneClassv2.0 cho kết quả không đƣợc thống nhất giữa các phƣơng pháp chạy. Một số mẫu thuần chủng có xác suất thuộc vào nhóm thuần chủng rất thấp (dƣới 10%) ở một hoặc hai phƣơng pháp nhƣ Cr 53, Cr79, Cr 98. Ngun nhân của điều này có thể là vì lƣợng mẫu đƣợc xác nhận thuần chủng hiện tại chƣa đủ (13 mẫu) nên dữ liệu quần thể để tham khảo ít, chƣa đủ tính chất đại diện. Thêm vào đó sự thuần chủng của các mẫu thuần chủng chỉ đƣợc xác nhận bởi chủ trang trại mà chƣa có cơ sở khoa học. Do vậy việc xác định mức độ thuần chủng trong nghiên cứu này sẽ phụ thuộc chủ yếu vào tỷ lồi đƣợc phân tích bằng phần mềm STRUCTUREv2.3.4.