CHƢƠNG III KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
3.1. Tạo dữ liệu di truyền cho quần thể mới tại Lào
3.2.4. Phân tích tỷ lệ lồi trong từng cá thể
Tại các địa điểm nghiên cứu, hai lồi có khả năng lai với cá sấu Xiêm
(Crococdylus siamensis) là cá sấu nƣớc mặn (C. porosus) và cá sấu Cuba (C. rhombifer) nên chúng tôi tiến hành xác định tỷ lệ của ba loài này trong từng cá thể.
Phần mềm STRUCTUREv2.3.4 đƣợc chạy với các giá trị K (số nhóm) khác nhau. Tuy nhiên việc dùng Structure Harvester [23] để lựa chọn giá trị K là khơng hợp lí bởi số lƣợng cá thể thuần chủng chắc chắn và các loài lai cùng (C. porosus và
C. rhombifer) chƣa đủ lớn nên khơng đủ tính đại diện và khó để tách đƣợc thành ba
Hình 11. Biểu đồ phân tích với bộ dữ liệu microsatellite với K=3
Kết quả cho thấy các cá thể cần xác định đều có phần tỷ lệ của lồi cá sấu Xiêm (C. siamensis) cao từ 88,6% đến 99,6%, trong đó số lƣợng có tỷ lệ trên 99% là 52/65 chiếm 80%. Tỷ lệ loài tƣơng ứng của các cá thể cá sấu nƣớc mặn thuần chủng (C. porosus) có giá trị từ 99,4% đến 99,5%; giá trị này của các cá thể cá sấu
Cuba thuần chủng (C. rhombifer) là 97,7% đến 99,5% và các cá thể cá sấu Xiêm
thuần chủng (C. siamensis) là 99,5% đến 99,6%. Kết quả đƣợc thể hiện ở Hình 11 và thống kê cụ thể ở Bảng 5.
Bảng 5. Kết quả phân tích dữ liệu microsatellite bằng phần mềm STRUCTURE
v2.3.4. Các mẫu tơ đỏ là mẫu có khả năng khơng thuần chủng cao
STT Tên lồi Kí hiệu Kí hiệu ngồi Tỷ lệ Tỷ lệ Tỷ lệ Địa điểm PTN thực địa C. siamensis C. porosusC. rhombifer
1 C. cf. siamensis Cr1 99.6 0.2 0.2 Kiên Giang: Hòn Me
2 C. cf. siamensis Cr7 Bs1 99.6 0.2 0.2 Tỉnh Khammouane, Lào
3 C. cf. siamensis Cr8 Bs2 99.6 0.2 0.2 Tỉnh Khammouane, Lào
4 C. cf. siamensis Cr9 Bs3 99.4 0.3 0.3 Tỉnh Khammouane, Lào
5 C. cf. siamensis Cr10 Saigon 1 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn
6 C. cf. siamensis Cr11 Saigon 2 98.3 0.8 0.9 Vƣờn thú Sài Gòn
7 C. cf. siamensis Cr12 Saigon 3 99.4 0.2 0.3 Vƣờn thú Sài Gòn 8 C. cf. siamensis Cr13 Saigon 4 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn 9 C. cf. siamensis Cr14 Saigon 5 99.5 0.2 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn 10 C. cf. siamensis Cr15 Saigon 6 99.3 0.4 0.3 Vƣờn thú Sài Gòn
11 C. cf. siamensis Cr16 Saigon 7 98.6 1.1 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn
12 C. cf. siamensis Cr17 Saigon 8 99.5 0.2 0.3 Vƣờn thú Sài Gòn 13 C. cf. siamensis Cr18 Saigon 9 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn 14 C. cf. siamensis Cr19 Saigon 10 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn 15 C. cf. siamensis Cr20 Saigon 11 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn 16 C. cf. siamensis Cr21 Saigon 12 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn
17 C. cf. siamensis Cr22 Saigon 13 99.0 0.4 0.5 Vƣờn thú Sài Gòn
18 C. cf. siamensis Cr23 Saigon 14 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn
21 C. cf. siamensis Cr26 Saigon 17 97.1 1.0 1.9 Vƣờn thú Sài Gòn 22 C. cf. siamensis Cr27 Saigon 18 97.4 1.0 1.6 Vƣờn thú Sài Gòn
23 C. cf. siamensis Cr28 Saigon 19 99.3 0.3 0.4 Vƣờn thú Sài Gòn
24 C. cf. siamensis Cr29 Saigon 20 97.5 2.0 0.5 Vƣờn thú Sài Gòn
25 C. cf. siamensis Cr30 Saigon 21 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn
26 C. cf. siamensis Cr31 Saigon 22 98.4 0.6 1.0 Vƣờn thú Sài Gòn
27 C. cf. siamensis Cr32 Saigon 23 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn 28 C. cf. siamensis Cr33 Saigon 24 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn 29 C. cf. siamensis Cr34 Saigon 25 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn 30 C. cf. siamensis Cr35 Saigon 26 99.5 0.2 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn 31 C. cf. siamensis Cr36 Saigon 27 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn 32 C. cf. siamensis Cr37 Saigon 28 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Sài Gòn 33 C. cf. siamensis Cr38 Hanoi 41 99.5 0.2 0.3 Vƣờn thú Thủ Lệ 34 C. cf. siamensis Cr39 Hanoi 30 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Thủ Lệ 35 C. cf. siamensis Cr40 Hanoi 31 99.2 0.3 0.4 Vƣờn thú Thủ Lệ 36 C. cf. siamensis Cr41 Hanoi 32 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Thủ Lệ 37 C. cf. siamensis Cr42 Hanoi 33 95.7 2.5 1.8 Vƣờn thú Thủ Lệ 38 C. cf. siamensis Cr43 Hanoi 34 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Thủ Lệ 39 C. cf. siamensis Cr44 Hanoi 35 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Thủ Lệ 40 C. cf. siamensis Cr45 Hanoi 36 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Thủ Lệ 41 C. cf. siamensis Cr46 Hanoi 37 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Thủ Lệ 42 C. cf. siamensis Cr47 Hanoi 38 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Thủ Lệ 43 C. cf. siamensis Cr48 Hanoi 39 98.2 1.3 0.5 Vƣờn thú Thủ Lệ 44 C. cf. siamensis Cr49 Hanoi 40 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Thủ Lệ 45 C. cf. siamensis Cr52 Lao Zoo 5 99.5 0.2 0.2 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn
46 C. cf. siamensis Cr53 Lao Zoo 14 96.7 2.4 0.9 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 47 C. cf. siamensis Cr54 Lao Zoo 18 98.7 0.4 1.0 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn
48 C. cf. siamensis Cr55 Lao Zoo 19 99.5 0.2 0.2 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 49 C. cf. siamensis Cr56 Lao Zoo 15 99.4 0.3 0.4 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 50 C. cf. siamensis Cr57 Lao Zoo 2 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 51 C. cf. siamensis Cr58 Lao Zoo 4 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 52 C. cf. siamensis Cr59 Lao Zoo 11 99.4 0.2 0.3 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn
53 C. cf. siamensis Cr60 Lao Zoo 1 88.6 10.9 0.5 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn
54 C. cf. siamensis Cr61 Lao Zoo 10 99.5 0.2 0.2 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 55 C. cf. siamensis Cr62 Lao Zoo 12 99.4 0.2 0.4 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 56 C. cf. siamensis Cr63 Lao Zoo 3 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 57 C. cf. siamensis Cr64 Lao Zoo 16 99.5 0.2 0.3 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 58 C. cf. siamensis Cr65 Lao Zoo 13 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 59 C. cf. siamensis Cr66 Lao Zoo 17 99.4 0.2 0.4 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 60 C. cf. siamensis Cr67 Lao Zoo CS20 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 61 C. cf. siamensis Cr68 Lao Zoo CS21 99.3 0.2 0.5 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 62 C. cf. siamensis Cr69 Lao Zoo CS22 99.5 0.2 0.2 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 63 C. cf. siamensis Cr70 Lao Zoo CS23 99.5 0.2 0.3 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 64 C. cf. siamensis Cr71 Lao Zoo CS24 99.5 0.2 0.3 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn 65 C. cf. siamensis Cr72 Lao Zoo CS25 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Lào, Viêng Chăn
66 C. siamensis Cr95 S1 99.6 0.2 0.2 Vƣờn thú Plzen, Séc
67 C. siamensis Cr96 S2 99.5 0.2 0.2 Vƣờn thú Plzen, Séc
68 C. siamensis Cr97 S3 99.5 0.2 0.2 Vƣờn thú Plzen, Séc
69 C. siamensis Cr98 COS002 99.5 0.2 0.2 Vƣờn thú Benidorm, Tây Ban Nha
70 C. cf. siamensis Cr100 COS003 97.4 1.7 1.0 Vƣờn thú Benidorm, Tây Ban Nha
71 C. siamensis Cr77 CT.2018.1 99.5 0.2 0.3 Vƣờn quốc gia Cát Tiên 72 C. siamensis Cr78 CT.2018.2 99.5 0.2 0.3 Vƣờn quốc gia Cát Tiên
74 C. siamensis Cr80 CT.2018.4 99.5 0.2 0.2 Vƣờn quốc gia Cát Tiên 75 C. cf. siamensis Cr99 COS004 99.4 0.3 0.3 Vƣờn thú Benidorm, Tây Ban Nha
76 C. porosus Cp1 0.3 99.4 0.3 Vƣờn thú Wilhelma, Đức
77 C. porosus Cp2 0.3 99.4 0.3 Vƣờn thú Wilhelma, Đức
78 C. porosus Cp3 0.3 99.4 0.3 Vƣờn thú Wilhelma, Đức
79 C. porosus Cp4 0.2 99.4 0.4 Vƣờn thú Wilhelma, Đức
80 C. porosus Cp5 0.2 99.5 0.3 Vƣờn thú Wilhelma, Đức
81 C. rhombifer Crb1 0.3 1.2 98.6 Vƣờn thúZagreb, Croatia
82 C. rhombifer Crb2 0.2 2.1 97.7 Terrariet Vissenbjerg, Đan Mạch
83 C. rhombifer Crb3 0.2 0.2 99.5 Vƣờn thú Hoyerswerda, Đức
84 C. rhombifer Crb4 0.2 0.3 99.5 Vƣờn thú Hoyerswerda, Đức
85 C. rhombifer Crb5 0.5 0.8 98.6 Vƣờn thú Hoyerswerda, Đức
Dựa trên kết quả chạy STRUCTUREv2.3.4, mẫu Cr60 tại vƣờn thú Lào là mẫu có tỷ lệ cá sấu Xiêm (C. siamensis) thấp nhất 88,6%. Đây là mẫu con cái và đƣợc ghi nhận là thuần chủng bởi chủ trang trại. Tuy nhiên kết luận này chƣa có cơ sở khoa học và cần tách ra khỏi chƣơng trình ni sinh sản phục vụ bảo tồn.
Mẫu tại trạm Hòn Me, Kiên Giang của tổ chức WAR (Cr1) là một cá thể ngoài tự nhiên ở con kênh gần cửa sông đổ ra vịnh Thái Lan và bị bắt bởi ngƣời dân. Với những số liệu hiện tại, cá thể này có khả năng cao là thuần chủng. Do vậy đây có thể một trong số ít những cá thể thuần chủng ngoài tự nhiên ở Việt Nam còn tồn tại. Tuy nhiên cá thể này đã bị chính quyền tỉnh Kiên Giang chuyển đến khu nghỉ dƣỡng Vin Pearl trên đảo Phú Quốc trƣớc khi đƣợc gắn chíp. Do đó khơng cịn khả năng sử dụng cá thể này làm nguồn tái thả.
Các cá thể có khả năng cao là mẫu thuần chủng (tỷ lệ C. siamensis trên 99%) cần đƣợc tách biệt với các thể còn lại và đƣa vào danh sách làm nguồn cho các chƣơng trình tái thả.