Giai đoạn thụ lý hồ sơ khiếu nại là giai đoạn khụng nhất thiết cú trong tất cả cỏc vụ việc cạnh tranh khụng lành mạnh. Điều 59 Luật Cạnh tranh quy định về việc thụ lý hồ sơ khiếu nại. Theo đú, thụ lý hồ sơ khiếu nại là một trong những điều kiện khởi nguồn để bắt đầu quỏ trỡnh tố tụng cạnh tranh. Vụ việc cạnh tranh khụng lành mạnh cú thể được khởi xướng từ hai nguồn: Cơ quan quản lý cạnh tranh hoặc tổ chức, cỏ nhõn cú quyền và lợi ớch hợp phỏp bị xõm phạm bởi vi hành vi cạnh tranh khụng lành mạnh.
Thụ lý hồ sơ khiếu nại đối với Cục quản lý cạnh tranh gồm hai giai đoạn: Tiếp nhận hồ sơ khiếu nại và thụng bỏo về việc thụ lý hồ sơ khiếu nại. Trong thời hạn 07 ngày kiểm tra đơn khiếu nại, tựy thuộc vào kết quả kiểm tra, Cơ quan quản lý cạnh tranh cú thể ra cỏc quyết định:
Yờu cầu bờn khiếu nại bổ sung hồ sơ trong thời hạn 30 ngày. Trong trường hợp cần thiết, cú thể gia hạn một lần nhưng khụng quỏ 15 ngày, nếu hồ sơ khiếu nại khụng cú đầy đủ đơn và chứng cứ.
Trả lại hồ sơ khiếu nại nếu hành vị bị khiếu nại đó hết thời hiệu khiếu nại, hoặc vụ việc khụng thuộc thẩm quyền của Cơ quan quản lý cạnh tranh hoặc bờn khiếu nại khụng bổ sung hồ sơ khiếu nại theo yờu cầu và thời gian quy định.
Thụ lý hồ sơ khiếu nại và thụng bỏo ngay cho bờn bị khiếu nại biết khi hồ sơ khiếu nại đầy đủ và hợp phỏp.
Bờn khiếu nại cú nghĩa vụ nộp tiền tạm ứng chi phớ cho việc xử lý vụ việc cạnh tranh trong thời hạn 15 ngày kể từ ngày nhận được thụng bỏo thụ lý hồ sơ khiếu nại.