Dữ liệu được sử dụng trong luận văn được thu thập từ các báo cáo tài chính đã được kiểm toán và báo cáo thường niên của các NHTM. Từ đây, tác giả tiến hành lựa chọn các ngân hàng có đầy đủ báo cáo tài chính bao gồm bảng cân đối kế toán, báo cáo kết quả hoạt động kinh doanh, báo cáo lưu chuyển tiền tệ và thuyết minh báo cáo tài chính. Ngoài ra dữ liệu còn được thu thập từ website http://finance.vietstock.vn, http://cafef.vn, từ NHNN, website của các NHTM đang nghiên cứu, Tổng cục thống kê, Bộ tài chính... Dữ liệu sử dụng được so sánh và đối chiếu với nhiều nguồn khác nhau để đảm bảo độ tin cậy và chính xác.
Dữ liệu sau khi được thu thập sẽ được nhập vào file Excel và được hiệu chỉnh, mã hóa trên file này. Bước tiếp theo là nghiên cứu tiến hành làm sạch dữ liệu nhằm phát hiện các sai sót, các ô trống thiếu thông tin, sai thông tin và tiến hành hoàn thiện ma trận dữ liệu. Sau đó, luận văn sử dụng phần mềm STATA 15.1 để tính toán và xử lý dữ liệu theo mô hình.
Mau dữ liệu 25 ngân hàng nghiên cứu hầu hết là các NHTMCP có quy mô nhỏ, trung bình, lớn trong hệ thống các NHTM Việt Nam và đa phần đáp ứng số liệu cho việc thực hiện nghiên cứu trong giai đoạn từ 2011 đến 2019, do đó mẫu được sử dụng đại diện để nghiên cứu kiểm định các giả thuyết tác động của các nhân tố đến HQHĐ của các NHTM Việt Nam.
Mốc thời gian 2011 - 2019 được tác giả chọn để nghiên cứu, vì đây là giai đoạn HTNH Việt Nam đang trong tình trạng khủng hoảng tài chính. Những tình trạng khó khăn, tính thanh khoản thấp, nợ xấu tăng cao, HQHĐ kém và bắt đầu có dấu hiệu phục hồi thời gian gần đây. Và thời gian này là thời gian gần nhất với thời gian thực hiện luận văn để tác giả có căn cứ xác thực nhận định thực trạng hiện tại và đóng góp các khuyến nghị cho HTNH trong tương lai.