Với mạng lưới hoạt động gồm :
Trụ sở chính NHNN&PTNT Việt Nam - chi nhánh thành phố Điện Biên Phủ là chi nhánh cấp III trực thuộc NHNN&PTNT Việt Nam - chi nhánh tỉnh Điện Biên bao gồm ban giám đốc và hai phòng chuyên môn nghiệp vụ: Phòng kế hoạch kinh doanh và Phòng kế toán - ngân quỹ.
Phòng kế hoạch kinh doanh: Là nơi nghiên cứu và đề xuất các chiến lược khách hàng, huy động vốn tại địa phương cũng như xây dựng kế hoạch kinh doanh ngắn, trung và dài hạn theo định hướng kinh doanh của ngân hàng, tiến hành theo dõi các kế hoạch và quyết toán, cân đối vốn; sử dụng và điều hoà vốn kinh doanh của chi nhánh.
Phòng kế toán- ngân quỹ: Trực tiếp hạch toán kế toán, thống kê và thanh toán theo đúng quy định, xây dựng kế hoạch tài chính, quyết toán thu, chi quỹ tiền lương. Đồng thời tổng hợp và lưu trữ hồ sơ tài liệu và các báo cáo, cũng như thực hiện các khoản nộp Ngân sách Nhà Nước theo quy định
Chi nhánh có 5 Phòng giao dịch trực thuộc NHNN&PTNT Việt Nam - chi nhánh thành phố Điện Biên Phủ :
+ Phòng giao dịch Him Lam. + Phòng giao dịch Mường Thanh. + Phòng giao dịch Thanh Bình. + Phòng giao dịch Noong Bua + Phòng giao dịch số 02.
Cơ sở vật chất hạ tầng
Trụ sở đóng tại đường 7/5 P.Tân Thanh thành phố Điện Biên Phủ. Tại trụ sở chính và các phòng giao dịch đều được trang bị hệ thống máy móc mới nhất để thực hiện nhiệm vụ phát sinh một cách nhanh nhất và hiệu quả nhất.
Nhìn chung, cơ sở vật chất thiết bị đã được ngân hàng cấp và trang bị đầy đủ, hiện đại để đáp ứng một cách nhanh nhất cho một hoạt động của chi nhánh.