Tuy đã có đuợc những uu điểm trong việc phân tích báo cáo tài chính nhung Công ty VMEP vẫn còn tồn đọng những mặt hạn chế cần khắc phục để có đuợc sự hoàn thiện trong công tác phân tích báo cáo tài chính tại Công ty.
Thứ nhất là phuơng pháp phân tích và hệ thống chỉ tiêu chua đáp ứng yêu cầu quản trị của công ty. Các nội dung phân tích chỉ dừng lại ở mức độ tính toán và so sánh đơn giản, chua có sự liên kết giữa các chỉ tiêu, để đua ra tu vấn phù hợp nhất cho nhà quản lý.
Đối với phân tích tình hình tài sản và nguồn vốn, Công ty chỉ tập trung phân tích các chỉ tiêu chủ yếu mà chua đi sâu vào biến động của các khoản mục chi tiết.
Đối với phân tích tình hình công nợ, Công ty chưa sử dụng các chỉ tiêu phản ánh cơ cấu công nợ như: hệ số các khoản phải thu, hệ số các khoản phải trả, hệ số các khoản phải thu so với các khoản phải trả.
Đối với phân tích kết quả kinh doanh, Công ty tập trung phân tích các số liệu của Báo cáo kết quả hoạt động kinh doanh, chưa sử dụng các chỉ tiêu về tỷ suất chi phí bán hàng, tỷ suất chi phí quản lý doanh nghiệp, tỷ suất giá vốn hàng bán.
Đối với phân tích hiệu suất sử dụng vốn, Công ty đang sử dụng chỉ tiêu duy nhất là Số vòng luân chuyển hàng tồn kho
Đối với phân tích khả năng sinh lời và tăng trưởng, Công ty đang phân tích chung thông qua việc so sánh mức tăng giảm của các chỉ tiêu Tổng giá trị tài sản, doanh thu thuần bán hàng, lợi nhuận, chưa phân tách rõ phân tích khả năng sinh lời và khả năng tăng trưởng.
Thứ hai là Công ty chưa thực hiện phân tích tình hình tài trợ, phân tích khả năng thanh toán và phân tích tình hình lưu chuyển tiền tệ.
Thứ ba là chưa kết hợp và sử dụng nguồn thông tin bên ngoài vào phân tích. Công ty chưa tiếp cận được với thông tin từ các doanh nghiệp cùng ngành, các báo cáo thống kê đánh giá của Hiệp hội xe máy Việt Nam...