Ngân hàng TMCP Đầu tư và Phát triển Việt Nam - Chi nhánh Bắc Hà Nội được thành lập ngày 31/10/1963, trên cơ sở tiền thân là phòng cấp phát cấp 3, sau chuyển thành chi điếm 3 Ngân hàng Kiến Thiết TP Hà Nội, thuộc Ngân hàng Kiến Thiết Việt Nam. Đến năm 1981, Chi nhánh được đổi tên thành Chi nhánh Ngân hàng Đầu tư và Xây dựng khu vực 3 - Thành phố Hà Nội trực thuộc NHNN Việt Nam.
Tháng 8/2000, Chi nhánh được chuyển sang trực thuộc Chi nhánh Ngân hàng Đầu tư và Phát triển Việt Nam - Sở giao dịch 1.
Ngày 15/10/2002, Chi nhánh tách khỏi Chi nhánh Ngân hàng Đầu tư và Phát triển Việt Nam - Sở Giao dịch 1 để trở thành chi nhánh cấp 1 trực thuộc Ngân hàng Đầu tư và Phát triển Việt Nam và đổi tên thành Ngân hàng Đầu tư và Phát triển Việt Nam - Chi nhánh Bắc Hà Nội.
Ngày 30/11/2011, Thủ tướng Chính phủ đã ban hành Quyết định số 2124/QĐ-TTG v/v phê duyệt phương án cổ phần hóa Ngân hàng Đầu tư và Phát triển Việt Nam. Ngày 23/04/2012, Thống đốc Ngân hàng Nhà nước Việt Nam đã có Giấy phép số 84/GP-NHNN v/v thành lập và hoạt động Ngân hàng thương mại cổ phần (TMCP) Đầu tư và Phát triển Việt Nam. Trên cơ sở chuyển đổi mô hình hoạt động, Hội đồng Quản trị đã ban hành Quyết định số 30/QĐ-HĐQT ngày 01/05/2012 về việc thành lập chi nhánh, sở giao dịch
thuộc Ngân hàng TMCP Đầu tu và Phát triển Việt Nam và Chi nhánh được chính thức đổi tên thành Ngân hàng TMCP Đầu tư và Phát triển Việt Nam - Chi nhánh Bắc Hà Nội.