Cơ cấu bộ máy của công ty chia theo các phòng ngành kinh doanh mà công ty hoạt động như phòng Hóa chất, phòng Thực phẩm,... và các phòng chức năng vận hành hoạt động của công ty như phòng Nhân sự,.
Quản lý toàn bộ công ty là Tổng giám đốc. Tổng giám đốc là người Nhật, được công ty mẹ tại Nhật điều sang theo nhiệm kỳ 3 năm một lần. Có nhiệm vụ quản lý toàn bộ hoạt động kinh doanh và vận hành của công ty trong nhiệm kỳ đó. Là người sẽ đặt ta mục tiêu kinh doanh trong nhiệm kỳ và đảm bảo hoàn thành mục tiêp đó.
Trưởng phòng kinh doanh phụ trách toàn bộ mảng kinh doanh đó - là người chịu trách nhiệm về toàn bộ doanh thu, chi phí và lợi nhuận kinh doanh của phòng theo mục tiêu từ Tổng giám đốc.
Dưới các trưởng phòng là phó phòng tùy quy mô nhân sự các phòng - là nhân viên chính thức của công ty và đã làm việc được ít nhất 3 năm, có chức năng giúp việc cho Trưởng phòng và nhận ủy quyền từ Trưởng phòng.
Các nhân viên kinh doanh trong các phòng chức năng (trừ phòng hành chính tổng hợp) - là nhân viên chính thức của công ty có nhiệm vụ trực tiếp tham gia vào các hoạt động vận hành và kinh doanh của công ty. Có trách nhiệm hoàn thành mục tiêu do Trưởng phòng đặt ra cho phòng.
Các điều phối viên kinh doanh - Là nhân viên mới chính thức của công ty. Thực hiện các yêu cầu từ Trưởng phòng trực thuộc.
Sờ đồ 1.1 - Cơ cấu tổ chức bộ máy công ty TNHHMitsui Việt Nam
Phòng
Hóa chất Trưởng phòng Nhân viên kinh doanh
Điều phối viên kinh doanh Phòng
Thép Trưởng phòng Nhân viên kinh doanh
Điều phối viên kinh doanh
Nhân viên kinh doanh Điều phối viên kinhdoanh
Tổng giám đống (người Nhật) Phòng Thực phẩm Trưởng phòng Phòng Dự án và Cơ sở hạ tầng