BIDV Từ Sơn hàng năm đề ra kế hoạch thanh tra, kiểm tra quá trình cho vay được thực hiện hiện định kỳ 2 lần/ năm chưa bao gồm các lần kiểm tra đột xuất. Lần 1 được thực hiện vào tháng 7 thực hiện thanh tra kiểm tra 6 tháng đầu năm như các hồ sơ, hợp đồng, tài sản, các giấy tờ liên quan ... toàn bộ quá trình cho vay phát sinh từ 1/1 đến hết 30/06. Lần 2 được thực hiện vào tháng 1 của năm kế tiếp thực hiện thanh tra, kiểm tra 6 tháng cuối năm từ 1/7 đến hết 31/12 của năm kiểm tra. Trong năm ban lãnh đạo chi nhánh có thể thực hiện kiểm tra chọn mẫu đột xuất một vài khoản vay nếu thấy có sai sót trong quá trình cho vay.
Ban lãnh đạo BIDV Từ Sơn thường xuyên đôn đốc và chỉ đạo phòng QTTD và QLRR thực hiện kiểm tra các bước trong quá trình cho vay cũng như sau khi cho vay để phát hiện ra những lỗi hồ sơ, vi phạm để có những điều chỉnh kịp thời và kiểm soát việc cho vay theo đúng cơ chế hiện hành của NHNN và của BIDV. Từ đó đúc rút kinh nghiệm để xây dựng kế hoạch quản lý những kỳ sau được tốt hơn và căn cứ những lỗi phát hiện ra ban lãnh đạo BIDV Từ Sơn có những chế tài áp dụng các hình thức khen thưởng, kỷ luật kịp thời tại hội đồng bình xét thi đua hàng quý, hàng năm của BIDV Từ Sơn.
Trong những năm 2016-2018, hoạt động thanh tra, kiểm tra quá trình cho vay KHCN SXKD được ban lãnh đạo quan tâm chú trọng cùng sự phối hợp của P. QTTD và QLRR của chi nhánh thực hiện rất nghiêm túc, minh bạch nên sau những lần thanh tra, kiểm tra định kỳ 2 lần/năm và kiểm tra đột xuất chưa xảy ra vi phạm nào trong hoạt động cho vay KHCN SXKD trong giai đoạn 2016-2018.