Tôn giáo là một thực thể của xã hội, tồn tại khách quan, lâu dài cùng với sự phát triển của xã hội. Quá trình tồn tại, phát triển của tôn giáo có ảnh hưởng không nhỏ đối với sự phát triển của mỗi quốc gia, mỗi dân tộc. Tôn giáo tồn tại vừa mang những ưu điểm vửa mang những hạn chế tiêu cực, thực tế cho thấy, ở bất cứ quốc gia nào, nhà nước nào, ở đâu có hoạt động tôn giáo thì ở đó có sự quản lý của nhà nước, vì lợi ích của quốc gia dân tộc và trật tự an toàn xã hội nên việc quản lý, điều chỉnh của nhà nước đối với hoạt động tôn giáo là cần thiết, khách quan.
Trong công cuộc đổi mới ở nước ta hiện nay, không những cần thiết phải quản lý nhà nước đối với hoạt động tôn giáo mà còn cần phải tăng cường QLNN đối với lĩnh vực này, vì:
Thứ nhất: Quan điểm của Đảng và Nhà nước đối với tôn giáo có nhiều đổi mới, bởi vậy công tác QLNN đối với tôn giáo c ng cần phải có những đổi mới cho phù hợp. Trong lĩnh vực tôn giáo từ khi thành lập nhà nước đến nay, mặc dù quan điểm tự do tín ngưỡng, tôn giáo của Đảng và nhà nước ta luôn nhất quán song những năm gần đây quan điểm đó ngày càng mang tính minh bạch, rõ ràng và có nhiều nội dung mới.
Nghị quyết Hội nghị lần thứ VII, Ban Chấp hành Trung ương khóa IX năm 2003 đánh giá: “Tín ngưỡng, tôn giáo là nhu cầu tinh thần của một bộ ph n nhân dân, đang và sẽ tồn tại cùng dân tộc trong quá trình xây dựng chủ nghĩa xã hội ở nước ta. Đồng bào các tôn giáo là bộ ph n
của khối đại đoàn kết toàn dân tộc’ Đảng, nhà nước thực hiện nhất quán chính sách đại đoàn kết dân tộc, đoàn kết đồng bào theo tôn giáo và đồng bào không theo tôn giáo.
Thứ hai: Thực tiễn quản lý nhà nước đối với hoạt động tôn giáo vừa qua cho thấy, một số nơi chủ quan, nóng vội, khi giải quyết vấn đề liên quan đến tôn giáo có nơi lại thụ động, buông lỏng quản lý. Đây là một trong những lý do cơ bản đ i hỏi phải tăng cường QLNN đối với hoạt động tôn giáo.
Thứ ba: Yêu cầu của cải cách hành chính nhà nước nói chung và quản lý hành chính nhà nước đối với hoạt động tôn giáo nói riêng đặt ra nhiều vấn đề về hệ thống pháp luật điều chỉnh các hoạt động tôn giáo, về bộ máy quản lý nhà nước về tôn giáo. Các quy định về trình tự thủ tục hành chính trong QLNN đối với các hoạt động tôn giáo còn thiếu, nhiều nội dung quản lý thiếu các quy định cụ thể do đó gây khó khăn cho cả người quản lý và người thực hiện, những vấn đề thực tiễn phát sinh chưa được điều chỉnh và thiếu các biện pháp bảo đảm thực hiện, chưa đáp ứng được nhiều về yêu cầu cải cách hành chính hiện nay.
Thứ tư: Trong công cuộc đổi mới hội nhập, mở cửa ở nước ta bên cạnh những điểm tích cực, phù hợp, tôn giáo là một trong những đối tượng để các thế lực thù địch lợi dụng mở cửa, hội nhập thực hiện âm mưu diễn biến hòa bình, can thiệp vào công cuộc nội bộ của nước ta.