Bên cạnh những kết quả đã đạt đƣợc, công tác quản lý nhà nƣớc về thu BHXH bắt buộc quận Gò Vấp thời gian qua vẫn còn một số hạn chế sau:
- Số lƣợng các DN ngoài quốc doanh và NLĐ tham gia BHXH: Số lƣợng này vẫn còn khá thấp. Theo thống kê của Phòng LĐTB & XH quận Gò Vấp, tính
đến hết tháng 12/2014 số DN đang hoạt động trên địa bàn quận Gò Vấp là 10.337 DN tuy nhiên mới chỉ có 4.556 DN đã đăng ký tham gia BHXH, chiểm 44,7%. Số lao động đang làm việc tại các DN ngoài quốc doanh năm 2016 là 84.552 lao động, tuy nhiên mới chỉ có 60.455 lao động tham gia BHXH, chiếm 71,5%; số lao động chƣa đƣợc tham gia BHXH là 24.097 lao động.
- Về nợ đọng BHXH: Mặc dù BHXH quận Gò Vấp luôn hoàn thành kế hoạch thu hằng năm do BHXH Tp.HCM giao nhƣng vẫn để xảy ra tình trạng nợ đọng, và có chiều hƣớng gia tăng tỷ lệ nợ. Tính đến hết năm 2015, số nợ BHXH khoảng 27,57 tỷ đồng (chiếm 3,86% số phải thu), nhƣng đến năm 2016 số nợ BHXH tăng lên 36,33 tỷ đồng (chiếm 4,3% số phải thu). Với số tiền nợ đọng đó thì NLĐ trong chính các đơn vị nợ đọng sẽ chịu thiệt thòi vì quyền lợi của họ bị ảnh hƣởng.
- Công tác đôn đốc, quản lý nợ: Công tác quản lý, phân loại nợ là tiền đề cho công tác đôn đốc, thanh tra, kiểm tra đơn vị nợ. Tại BHXH Tp.HCM, trƣớc đây phòng Thu đảm nhận công việc chính là quản lý thu và khai thác thu nợ thì nay đƣợc tách thành 2 phòng riêng biệt theo nhiệm vụ công việc cụ thể là phòng Quản lý thu và phòng Khai thác thu nợ. Còn công tác đôn đốc, quản lý nợ thì đƣợc chịu trách nhiệm bởi 2 phòng là phòng Khai thác thu nợ và phòng Thanh tra kiểm tra. Công tác tuyên truyền thì do phòng Tuyên truyền đảm nhiệm. Trong khi đó, tại quận Gò Vấp, tổ Thu với 13 nhân sự (01 phó Giám đốc, 12 chuyên viên chuyên trách) phải kiêm nhiệm tất cả công việc liên quan đến thu BHXH gồm quản lý thu, đôn đốc thu nợ, thanh tra kiểm tra và tuyên truyền nên hiệu quả chƣa cao.