Công tác kiểm tra, thanh tra quản lý chi thường xuyên NS tỉnh được tiến hành theo hình thức thường xuyên, định k hay đột xuất khi cần thiết nhằm ngăn ngừa vi phạm và những biểu hiện tiêu cực trong quá trình quản lý chi NS tại tỉnh.
Công tác kiểm tra quản lý chi NS tỉnh được phòng chức năng về tài chính quan tâm và sát sao. Phòng chuyên môn luôn coi trọng công tác kiểm tra, giám sát việc thực hiện, chấp hành dự toán của các đơn vị nhằm hạn chế việc chi sai, chi thừa hay chi thiếu.
Theo điều tra hình thức kiểm tra “Định k ”, chiếm 74%; “Đột xuất”, chiếm 26%. Điều này cho thấy, công tác kiểm tra, thanh tra được tiến hành khá thường xuyên, tuy nhiên chất lượng kiểm tra thì không được đánh giá qua số lần kiểm tra. Do đó việc đột xuất kiểm tra sẽ phát hiện được các trường hợp chi sai quy định và sẽ giúp ngăn ngừa việc chi lãng phí, không tiết kiệm NS.
Qua đây cho thấy công tác thanh tra, kiểm tra quản lý chi thường xuyên NS tỉnh nhìn chung khá tốt. Việc kiểm tra trước khi chi NS từ khâu lập dự toán chi NSNN được cơ quan tài chính và KBNN kiểm tra, xét duyệt nghiêm ngặt theo chế độ, tiêu chuẩn, định mức do Nhà nước quy định. Tuy nhiên, việc kiểm tra khâu lập dự toán còn tính chủ quan, chưa quan tâm đúng mức dự toán thực tế của các đơn vị nên dự toán được duyệt của đơn vị thụ hưởng chưa phù hợp và hiệu quả. Có sự quan tâm tính hợp lệ, hợp pháp của chứng từ, thủ tục quyết toán, nhưng lại thiếu quan tâm đến hiệu quả của việc chi thường xuyên NS tỉnh. Đôi khi công tác kiểm tra, thanh tra còn làm phiền hà, ách tắc công việc của đơn vị. Hiệu quả của công tác kiểm tra đôi khi còn chưa đạt tới mục tiêu đã định.