1.2.2.1. Rủi ro về mặt pháp lý
Là những rủi ro xuất phát từ sự không đầy đủ, chặt chẽ của hệ thống các văn bản pháp luật có liên quan đến dịch vụ thanh toán.Những người tham gia về các hoạt động TTKDTM luôn cần thiết phải được đảm bảo lợi ích bằng các phương tiện pháp lý rằng quyền lợi của họ được tôn trọng và họ phải biết trước về các điều kiện mà họ phải đương đầu khi có các tình huống bất thường xảy ra. Dựa vào hệ thống các văn bản pháp luật, khi có sự cố xảy ra, ngân hàng sẽ xem xét mức độ thiệt hại và yêu cầu xử lý theo quy định. Vì vậy, một hệ thống pháp luật chặt chẽ, rõ ràng, đầy đủ phần nào hạn chế được rủi ro cho dịch vụ TTKDTM. Tuy nhiên, tại Việt Nam, hệ thống các văn bản quy phạm pháp luật cho lĩnh vực TTKDTM còn chồng chéo, không rõ ràng đối với các thành phần kinh tế.
1.2.2.2.Rủi ro hoạt động
Là những rủi ro xảy ra do chính các bên tham gia trong quá trình TTKDTM gây nên trong quá trình thanh toán. Do đặc thù của nghiệp vụ này
là ngân hàng chỉ làm việc dựa trên số tiền ghi sổ, không phải tiền mặt do đó đòi hỏi phải có sự khắt khe nhất trong cả quá trình. Rủi ro hoạt động xuất phát từ những trục trặc của hệ thống thanh toán do lỗi kỹ thuật, thông tin hoặc do máy móc bị hỏng hóc hoặc do nhầm lẫn, sai sót từ phía con người khi thanh toán quyết toán. Nếu phát hiện ra dù một lỗi nhỏ, rất có thể thanh toán sẽ không được thực hiện hoặc gây thất thoát cho khách hàng cũng như ngân hàng. Quá trình TTKDTM đòi hỏi phải có sự phối hợp chặt chẽ giữa khách hàng và ngân hàng, khách hàng theo chỉ dẫn của các cán bộ nhân viên ngân hàng để hoàn tất các chứng từ thanh toán đúng với quy định đã đề ra, các cán bộ công nhân viên liên quan tới dịch vụ thanh toán có trách nhiệm hướng dẫn khách hàng tỉ mỉ các thủ tục liên quan cũng như thực hiện các thao tác nghiệp vụ cẩn thận, chính xác tránh để sai sót xảy ra. Nếu sự phối hợp này kém rất dễ gây ra sai sót trong quá trình thanh toán, ảnh hưởng tới số dư tài khoản tiền gửi của khách hàng và uy tín của ngân hàng.
1.2.2.3. Rủi ro tín dụng
Một cách khái quát, rủi ro tín dụng là tình trạng một người tham gia thanh toán không hoàn tất được nghĩa vụ trả nợ của mình, chẳng hạn bị phá sản, trước khi kết thúc quá trình thanh toán. Rủi ro tín dụng xảy ra và thường gây thiệt hại lớn cho các bên tham gia trong quá trình thanh toán. Đối với khách hàng, rủi ro tín dụng có thể khiến cho khách hàng không thu hồi được tiền hàng hóa, dịch vụ, nợ mất trắng… Rủi ro tín dụng thuộc về ngân hàng khi khách hàng chi tiêu quá hạn mức tín dụng nhưng không chi trả hay chậm trả số tiền gốc và lãi như đã thỏa thuận trong hợp đồng.
1.2.2.4. Rủi ro thanh khoản
Rủi ro này phát sinh từ việc mất khả năng thanh toán tạm thời của chủ thể tham gia thanh toán. Điều này có thể xảy ra nếu có sự cố kỹ thuật của hệ thống khiến cho người nhận tiền không nhận được khoản tiền mà mình đã dự
tính, hoặc nhân viên tác nghiệp chuyển tiền sai đối tượng, hoặc do trục trặc tạm thời về mặt thanh khoản của người có nghĩa vụ thanh toán.
1.2.2.5.Rủi ro đạo đức
Là những rủi ro khi một bên tham gia cố tình không thực hiện đúng nghĩa vụ của mình, làm ảnh hưởng đến quyền lợi của các bên liên quan. Trong quá trình thanh toán, nếu các bên đối tác thường ở cách xa nhau, thậm chí không hề gặp nhau trong quá trình mua bán thì rất khó nắm rõ những thông tin về uy tín, đạo đức kinh doanh, năng lực tài chính của đối tác. Trong điều kiện như vậy, các rủi ro đạo đức xảy ra gây hậu quả nghiêm trọng đối với cả khách hàng lẫn ngân hàng, dẫn đến những quyết định sai lầm, gây nên rủi ro trong thanh toán. Nếu một trong các bên tham gia thanh toán có phẩm chất đạo đức kém, có dấu hiệu lừa đảo, gian lận, làm giả các chứng từ hay các yếu tố khác có liên quan trong quá trình thanh toán sẽ gây thiệt hại cho các bên liên quan.
1.2.2.6.Rủi ro kỹ thuật
TTKDTM là dịch vụ thanh toán sử dụng chủ yếu các công nghệ kỹ thuật hiện đại. Việc đưa các công nghệ kỹ thuật như máy ATM, máy POS tham gia vào hoạt động thanh toán cần có sự thống nhất trong quản lý giữa các NHTM. Nếu mỗi ngân hàng đưa ra một quy trình thanh toán khác nhau cũng như một hệ thống quản lý kĩ thuật khác nhau thì sẽ rất khó khăn cho khách hàng tham gia TTKDTM và có thể sẽ dẫn đến sai sót trong nghiệp vụ thanh toán bù trừ giữa các ngân hàng. Vì vậy, việc xây dựng hệ thống quản lý kĩ thuật thống nhất sẽ giúp các NHTM dễ dàng thu hút được khách hàng tham gia thanh toán qua ngân hàng, phát triển hoạt động TTKDTM.