Một là, một số chính sách ban hành còn chậm, chưa đáp ứng được yêu cầu thực tế.
Trong quá trình bắt đầu thực hiện chính sách BHTN các văn bản triển khai còn được ban hành khá chậm do thiếu sự phối hợp giữa các ngành cấp. Các bước thực hiện chính sách BHTN cũng chưa đồng bộ, còn chồng chéo và thiếu sự liên kết giữa các ngành, các đơn vị liên quan. Các vướng mắc phát sinh trong thực hiện chính sách còn nhiều nhưng văn bản hướng dẫn chưa kịp thời tháo gỡ. Nhiều vấn đề về chính sách BHTN còn bất cập và đang trong quá trình tiếp tục hoàn thiện.
Do sự liên kết giữa các ngành chưa tốt dẫn đến việc giải quyết hưởng TCTN còn chậm và khi có vướng mắc hoặc sai sót thì NLĐ phải đi lại nhiều lần giữa hai cơ quan BHXH và lao động. Đã qua 6 năm thực hiện chính sách BHTN nhưng vẫn chưa có văn bản hướng dẫn chi cho hoạt động thực hiện tư vấn giới thiệu việc làm, do vậy việc triển khai tư vấn việc làm còn nhiều vướng mắc, nổi cộm giữa 2 ngành BHXH và lao động.
Một trong những hạn chế, bất cập của chính sách BHTN là đối tượng, phạm vi tham gia BHTN vẫn chưa được quy định rõ ràng. Việc xác định đối tượng tham gia BHTN ở đơn vị sự nghiệp của Nhà nước, phân biệt giữa cán bộ, công chức, viên chức... còn lúng túng do chưa có văn bản hướng dẫn thực hiện.
Chính sách BHTN quy định những đơn vị sử dụng lao động dưới 10 lao động không phải đóng BHTN, do vậy không ít doanh nghiệp cố tình khai giảm số lao động xuống dưới 10 người để trốn đóng BHTN, gây khó khăn cho công tác thu BHTN và bảo đảm quyền lợi cho NLĐ.
Hai là, một số hợp phần trong chính sách BHTN chưa được thực hiện tốt. Việc thực hiện tư vấn, giới thiệu việc làm và hỗ trợ học nghề được coi là một nhiệm vụ quan trọng của chính sách BHTN, giúp NLĐ nhanh chóng hòa nhập lại thị trường lao động, nhưng chưa được thực hiện tốt. Số người được hỗ trợ học nghề chiếm chưa đến 5% số người hưởng TCTN. NLĐ khi thất nghiệp mới chỉ quan tâm đến việc nhận tiền TCTN, chưa thực sự quan tâm đến vấn đề mấu chốt là hỗ trợ học nghề, tư vấn, giới thiệu việc làm mới, nên hiệu quả của công tác này quá thấp. Chưa có hệ thống thông tin việc làm để nâng cao công tác tư vấn giới thiệu việc làm.
Ba là, tình trạng nợ đóng BHTN còn khá lớn.
Nếu như năm 2011 số nợ đọng BHTN chỉ là 172 tỷ đồng thì đến năm 2014 số nợ đóng BHTN lên tới 336,354 tỷ đồng, đặc biệt trong năm 2012 số nợ đóng BHTN tương đối cao. Điều này cho thấy công tác QLNN về thu BHTN còn nhiều hạn chế, bất cập.
Bốn là, còn có sự chồng chéo, thiếu thống nhất trong tổ chức thực thi BHTN
Việc chi trả và tiếp nhận, giải quyết hưởng BHTN giao cho 2 cơ quan thực hiện. Vì vậy, để nhận tiền TCTN NLĐ phải đến 2 cơ quan, chưa thuận lợi cho NLĐ và việc chi trả TCTN theo tháng, phổ biến thực hiện vào một ngày nhất định trong tháng (áp dụng như chi trả chế độ hưu trí, mất sức lao động). Tuy nhiên, chế độ TCTN chi theo ngày, nên NLĐ thường nhận được TCTN chậm hơn nhiều so với thời gian nhận được Quyết định hưởng TCTN, nên không đảm bảo việc kịp thời hỗ trợ NLĐ một khoản kinh phí để ổn định cuộc sống trong thời gian tìm việc làm mới. Mặt khác, khi phát hiện các vấn đề vi phạm sẽ khó xử lý theo quy định của pháp luật, nhất là đối với các trường hợp tạm dừng, chấm dứt hưởng BHTN.
Năm là, hệ thống tổ chức, bộ máy quản lý chưa thực sự hoàn thiện
Bộ máy thực hiện BHTN chưa được tổ chức theo hệ thống ngành dọc, khó khăn cho việc chỉ đạo và triển khai thùc hiện.
Chưa triển khai kết nối phần mềm quản lý BHTN của ngành lao động- Thương binh và xã hội với cơ quan BHXH để phục vụ cho việc tiếp nhận và giải
quyết nhằm tạo điều kiện thuận lợi cho NLĐ trong việc hưởng các chế độ BHTN, giảm bớt thủ tục hành chính và kiểm tra, kiểm soát kịp thời khi thực hiện chính sách BHTN tránh tình trạng gian lận, trục lợi Quỹ BHTN.
Đội ngũ cán bộ, công chức làm công tác QLNN đối với BHTN còn thiếu về số lượng, hạn chế về chất lượng. Điều này được thể hiện qua trình độ chuyên môn đào tạo, khả năng nắm bắt và vận dụng hệ thống pháp luật, chính sách về BHTN còn yếu…