Đất là nơi qua động và qua hạ của vật gây bệnh. Các vật gây bệnh th- ờng dùng phơng thức hoại sinh và hình thức ngủ nghỉ trong đất. Các nang bào tử, bào tử noãn, bào tử đông, tuyến trùng đều tồn tại trong đất, khi gặp điều kiện độ ẩm cao mới hoạt động. Cho nên điều kiện đất khô thời gian ngủ nghỉ dài. Thông thờng vật gây bệnh sống trong đất đợc chia ra 2 loại: sống nhờ và sống định c. Loại sống nhờ tồn tại cùng với sự tồn tại của xác cây bệnh, khi xác cây bệnh bị phân giải thì chúng không thể sống độc lập đợc. Các loài nấm và vi khuẩn kiêm hoại sinh ( ký sinh mạnh) thuộc loại này. Những loài sống định c có tính thích ứng mạnh với đất có thể sống độc lập và lâu dài đồng thời có thể sinh sản, nh các nấm hoại sinh,nấm hạch sợi, nấm lỡi liềm, chúng phân bố rộng trong đất gây ra các bệnh thối cây con và khô héo cây.
Cùng trên một mảnh đất nếu liên canh 1 loài cây, số lợng vật gây bệnh sẽ tích luỹ nhiều làm cho bệnh phát sinh nghiêm trọng hơn. nh bệnh thối cổ rễ, bệnh tuyến trùng. Nếu tiến hành luân canh hoặc trồng xen hợp lý sẽ giảm nhẹ bệnh.
Các bào tử ngủ nghỉ có thể trực tiếp rơi vào trong phân, có thể lẫn vào xác cây. Cho nên sử dụng phân cha hoai có thể có nhiều loài Nấm qua đông hoặc qua hạ, làm nguồn xâm nhiễm cho cây. Một số xác cây bệnh dùng làm thức ăn gia súc sau khi thông qua đờng tiêu hoá vẫn có thể còn sức sống, từ đó tăng vật gây bệnh trong phân, nấm bệnh trong phân hữu cơ ủ hoai mới có thể chết, đây là biện pháp quan trọng trong phòng trừ bệnh cây.