Sự biểu đạt thông tin tổ gen virus thờng có 2 mặt: một mặt là quá trình tổ gen virus chuyển sao mARN, hai là phiên dịch mARN. Điểm khác nhau của sự biểu đạt chủ yếu là tổng hợp mARN có nhiều con đờng, phiên mã mARN cũng có nhiều cách khác nhau.
(1) Sao chép acid nucleic virus. Dù virus có loại acid nucleic nào đều phải trải qua quá trình dịch ra protein nhờ mARN. Virus ARN chuỗi dơng có thể trực tiếp cho mARN sử dụng, các virus thực vật khác lại sao chép bằng con đờng khác. Sự sao chép ARN virus cũng cần có cây chủ và tài liệu nguyên bản, sao chép acid nucleic virus thực vật phải đợc tiến hành trong tế bào chất, một phần tiến hành trong nhân tế bào. Virus ADN ( chuỗi đơn và chuỗi đôi) khi sao chép mARN phải có enzym sao chép của vật chủ cung cấp. Đối với virus ARN chuỗi âm vì acid nucleic không thể trực tiếp phiên dịch protein, acid nucleic chuỗi âm chuyên sao thành chuỗi dơng thông qua enzym tái tạo nhờ virus đi vào tế bào cây chủ cũng mang thể hạt virus vào, cho nên chỉ acid nucleic thuần tinh chế không thể hoàn thành đợc quá trình tái tạo. Mặt khác tổ gen ARN chuỗi đơn của một số bệnh nh khô héo cà chua (Tospovirrus) một phần chuỗi ARN có thể thông qua sao chép tổng hợp ARN cho mARN sử dụng phiên dịch ra protein; còn một phần khác phải thông qua tái tạo sản sinh chuỗi bổ sung, rồi từ chuỗi bổ sung sao chuyển ra ARN, mới cho mARN sử dụng.. Loại ARN này gọi là ARN song nghĩa ( ambisense ARN)
(2)Biểu đạt ARN virus thực vật. Sau khi chuyển sao ra mARN muốn phiên mã cũng cần phải cơ chế đặc biệt. Do cơ chế tổng hopự protein trong sinh vật nhân thật- thể ribosom chỉ có thẻ nhận biết khung đọc mở ra (open reading frame, ORF)trên mARN, biểu đạt gen khác trên chuỗi cùng ARN phải nhờ sách lợc phiên dịch đặc biệt của virus.
Gen phiên mã tổ gen virus thực vật rất ít, chỉ 4-5 gen, nhiều có thể chỉ đến 12 gen. Những sản phẩm của gen đó bao gồm enzym tái tạo phiên mã
hoặc enzym chuyển dịch, các enzym proteaza vỏ áo, proteaza di dộng, proteaza bổ trợ lây lan; có một số sản phẩm protein virus và acid nucleic, protein cây chủ tụ tập lại hình thành thể nội hàm ( inclusion body) có thể tích và hình dạng nhất định. Chúng đợc chia ra thể nội hàm nhân và thể nội hàm tế bào chất. Thể nội hàm tế bào chất có hình dạng, kích thớc, kết cấu khác nhau và đợc chia ra 5 loại : thể nội hàm bất định hình, tinh thể giả, thể nội hàm tinh thể và thể nội hàm dạng vòng. Virus thực vật khác nhau sẽ hình thành thể nội hàm khác nhau, lợi dụng sự khác nhau đó mf ngời ta đa ra ph- ơng pháp phân loại virus khác nhau.
(3) Chức năng kết cấu tổ gen virus thực vật. Việc nghiên cứu sinh học phân tử càng tiến triển, kết cấu tổ gen virus càng đợc phát hiện thứ tự nucleotide của chúng, thứ tự acid amin của sản phẩm gen và chức năng sinh học của chúng đã đợc tìm hiểu.
Do số lợng gen phiên mã tổ gen virus thực vật rất ít, chúng ta chỉ có thể vẽ ra sơ đồ di truyền của chúng thể hiện các vị trí của gen.