Sự biến đổi của gió mùa xảy ra trong thời gian từ nội bộ từng mùa tới nhiều thập kỷ. Từ TAR, AOGCMs có khả năng mô phỏng sự biến đổi mùa trong từng mùa và trong phạm vi nhiều năm đã được kiểm định. Lambert và Boer (2001) so sánh AOGCMs tham gia vào CMIP, tìm ra những sai số lớn trong việc mô phỏng sự precipitation trong vùng các xích đạo và ở khu vực gió mùa châu Á. Lin và những người khác đã đánh giá sự biến đổi theo mùa của sự precipitation trong MMD ở PCMDI. Họ đã tìm ra rằng sự biến đổi theo mùa của việc mô phỏng precipitation bởi hầu hết các AOGCMs là nhỏ hơn các giá trị quan sát được. Hình ảnh không gian thời gian của hầu hết những mô phỏng mô hình đều ít hơn nhiều so với hình ảnh quan sát được, đặt biệt là khong quản thời gian ít hơn 6 ngày. Trong hầu hết các mô phỏng AOGCM, tốc độ của những cơn sóng xích đạo thì quá nhanh và sự liên tục của sự precipitation quá dài. Annamalai và cộng sự đã kiểm tra độ trung thực của mô phỏng precipitation ở vùng gió mùa châu Á trong MMD ở PCMDI. Chỉ 6 trong 18 AOGCMs có tính toán đến mô phỏng sự ngưng tụ gió mùa khí hậu cho thế kỷ 20. Cho tập hợp bộ mô hình, sự tương quan không gian của những phần của sự ngưng tụ gió mùa giữa những mô hình lớn hơn 0.6, và chu trình mùa của những cơn mưa do gió mùa đã được mô phỏng rất tốt. Giữa những mô hình này, chỉ có bốn sự thể hiện một sự kết nối đồng thời gió mùa và ENSO một cách linh hoạt. Cook và Vizy (2006) đánh giá mô hình khí hậu của thế kỷ 20 ở phía bắc Châu Phi trong MMD ở PCMDI. Họ tìm ra sự mô phỏng sự ngưng tụ trong mùa hè ở bắc Phi Châu là hiện hơn sự mô phỏng ở Mỹ hoặc châu Âu. Tóm lại, hầu hết AOGCMs không mô phỏng được sự biến đổi của sự kết tụ gió mùa theo không gian hoặc trong từng mùa một cách chính xác. Xem chương 11 để có thêm các chi tiết về sự đánh giá theo vùng của sự mô phỏng biến đổi của gió mùa.