Nguồn tài nguyên nước ở Quận 2 rất phong phú do được bao bọc bởi 2 con sơng lớn là sơng Sài Gịn và sơng Đồng Nai.
Sơng Sài Gịn
Sơng Sài Gịn bắt nguồn từ vùng đồi núi Tây Bắc Lộc Ninh (ở độ cao bình quân 250m) chảy theo biên giới Việt Nam - Campuchia, sau đĩ theo ranh giới tự nhiên của 2 tỉnh Tây Ninh và Bình Dương. Sơng dài 221 km tính đến vị trí hợp lưu sơng Đồng Nai; từ vị trí Dầu Tiếng (sau đập) đến hợp lưu dài 98 km. Đoạn sơng Sài Gịn qua khu vực Quận 2 cĩ nhiều chi lưu lớn. Ngồi ra, trên hệ thống sơng Sài Gịn cịn cĩ một số kênh rạch cĩ ý nghĩa cấp thốt nước trên địa bàn Quận 2 như rạch Đá, rạch Ơng Đầu và rạch Chiếc.
Sơng Đồng Nai
Sơng Đồng Nai bắt nguồn từ vùng núi phía Bắc thuộc cao nguyên Lang Biang ở độ cao 1.770m, hướng chảy chính là Đơng Bắc - Tây Nam, sau đĩ cĩ hướng Nam, đổ ra sơng Nhà Bè ra cửa Cần Giờ và Sồi Rạp. Tồn bộ chiều dài sơng Đồng Nai đến cửa Sồi Rạp khoảng 586km, diện tích lưu vực cho đến ngã ba hợp lưu khoảng 29.520km2. Độ rộng sơng biến đổi từ vài chục mét đến 1000 m, độ sâu bình quân của các sơng biến đổi từ vài mét cho đến trên 10 m. Sơng Đồng Nai cĩ hệ thống nhiều nhánh và cĩ nhiều hồ chứa trên thượng nguồn của hệ thống, trong đĩ đoạn sơng chảy qua Quận 2, Quận 9 cĩ ảnh hưởng hầu như diện tích của vùng này.
Hệ thống kênh rạch nội đồng
Ngồi hệ thống sơng lớn là sơng Sài Gịn và sơng Đồng Nai, Quận 2 cịn cĩ hệ thống kênh rạch nội đồng tập trung ở các phường như :
Phường Cát Lái: rạch Bà Cua, rạch Cỏ Chi.
Phường Thảo Điền: rạch khu phố 1, rạch Ơng Cua, rạch Báo Chí, rạch Ơng Hĩa, rạch Ơng Dí, rạch khu phố 4.
Phường Bình Khánh: rạch Cá Trê lớn, rạch Đình Bình Khánh, rạch Cá Trê nhỏ.
Phường Thạnh Mỹ Lợi: rạch Kỳ Hà, rạch Mương, rạch Bà Rường, kênh Thủy Lợi, rạch Bến Dĩc, rạch Thủ Mỹ.
Phường An Phú: rạch Đá Đỏ.
Phường Bình An: rạch tổ 21 ấp Bình Khánh, rạch tổ 19 ấp Bình Khánh, rạch khu phố 1, rạch Bà Cả.