Bên cạnh những đóng góp của các làng nghề cho sự phát triển kinh tế, xã hội của Mỹ Hào là những bất cập gây ảnh hưởng trực tiếp đến quá trình thực hiện phát triển bền vững, đó là:
- Chất lượng lao động còn nhiều hạn chế, hầu hết lao động trong các làng nghề có trình độ thấp, đầu chưa học hết phổ thông. Đội ngũ những ông chủ, những giám đốc doanh nghiệp chưa qua một lớp bồi dưỡng kiến thức về quản lý hay kỹ
thuật chuyên ngành nào. Những kiến thức mà người lao động có được chủ yếu là thông qua học truyền miệng, vừa học vừa làm và kinh nghiêm thực tiễn.
- Thiếu vốn và công nghệ sản xuất lạc hậu vẫn là phổ biến. Nguồn vốn tự có của người dân trong các làng nghề hiện đang rất hạn chế, bên cạnh khả năng vay
Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Kinh tế Page 54 vốn từ các tổ chức tín dụng không được nhiều đã làm cho tình trạng thiếu vốn càng trở nên trầm trọng. Nhu cầu vốn của các cơ sở sản xuất là rất cao nhưng do khan vốn nên đã hạn chế phần nào việc mở rộng sản xuất kinh doanh của họ. Các cơ sở
sản xuất tại các làng nghề hiện vẫn đang sử dụng những công nghệ sản xuất lạc hậu,
đã qua thanh lý của các cơ sở công nghiệp trong nước hoặc là nhập khẩu công nghệ
thải của nước ngoài. Do không đủ vốn nên họ không có khả năng đầu tư cho những dây truyền sản xuất hiện đại, cho năng suất và chất lượng sản phẩm cao hơn.
- Mặt bằng sản xuất thiếu, hầu hết các cơ sở sản xuất trong các làng nghềđều nằm trong khu dân cư, diện tích cho sản xuất chật hẹp, chủ yếu là một phần diện tích khu nhà ở của mình, thậm chí tại một số hộ sản xuất nhà ở và nhà sản xuất chung nhau. Từ chỗ thiếu mặt bằng dẫn đến rất khó bố trí máy móc cho sản xuất và khả năng đổi mới công nghệ. Tuy đã có những chính sách hỗ trợ từ phía chính quyền địa phương như thành lập các cụm công nghiệp làng nghề, chính sách dãn dân... để mở rộng diện tích cho sản xuất và tách khu sản xuất ra khỏi khu dân cư
nhưng tình trạng thiếu mặt bằng cho sản xuất vẫn chưa được giải quyết thoảđáng so với nhu cầu hiện tại.
- Tình trạng ô nhiễm môi trường ngày càng nghiêm trọng, có những làng nghề
tình trạng ô nhiễm môi trường đã ở mức báo động như các làng nghề sản xuất đồng, nhôm, sắt thép gây ảnh hưởng rất lớn đến tình hình sức khoẻ, sản xuất kinh doanh của người dân và ảnh hưởng trực tiếp đến phát triển bền vững các làng nghề.