Công tác quản lý nợ thuế và cưỡng chế nợ thuế là một trong những chức năng cơ bản của công tác quản lý thuế. Thực hiện tốt công tác quản lý nợ và giảm thiểu nợ thuế là nhiệm vụ trọng tâm của cơ quan Thuế các cấp, là tiêu chí quan trọng để đánh giá chất lượng, hiệu quả công tác quản lý thuế của các Đội thuế, công chức thuế; đồng thời là tiêu chí phản ánh mức đô tuân thủ của NNT.
Trong những năm qua, Cục Thuế Quảng Ngãi đã xây dựng kế hoạch, giao chỉ tiêu thu nợ thuế đến các đơn vị trong ngành trong đó có thuế TNCN, chỉ đạo các đơn vị tăng cường áp dụng các biện pháp đôn đốc thu nợ và cưỡng chế nợ thuế: Thực hiện việc phân loại và phân tích nguyên nhân nợ để có biện pháp xử lý phù hợp và kịp thời theo quy định của pháp luật. Trên cơ sở số liệu nợ thuế đã được xác nhận, chốt nợ, bộ phận thu nợ và cưỡng chế thuế đã thực hiện thông báo nợ thuế, mời lên làm việc, yêu cầu đơn vị đăng ký thời hạn nộp thuế, Cục Thuế coi đây là biện pháp hàng đầu trong công tác quản lý nợ; xử phạt chậm nộp; báo cáo Uỷ ban nhân dân để chỉ đạo các cơ quan chức năng phối hợp đôn đốc, thu hồi nợ đọng và thực hiện các biện pháp cưỡng chế nợ thuế.
Theo chỉ tiêu đánh giá nghĩa vụ nộp thuế, tỷ lệ nợ thuế của đơn vị Cục Thuế Quảng Ngãi là 7,1% vào năm 2010 nhưng khoản nợ thuế TNCN là không có, đến năm 2013 tỷ lệ nợ thuế TNCN đã tăng lên với tỷ lệ NNT nợ thuế là 5,1% . Điều này phản ánh tính tuân thủ Pháp luật về nghĩa vụ nộp thuế của NNT trên địa bàn là tương đối nhưng vẫn cần điều chỉnh. Tỷ lệ này cũng cho thấy công tác quản lý ĐTNT, công tác tuyên truyền chính sách thuế; thanh tra, kiểm tra thuế đến các biện pháp xử lý vi phạm pháp luật của Cục Thuế là chưa nghiêm, chưa quyết liệt, công tác phối kết hợp giữa các ban, ngành trong toàn tỉnh chưa được quan tâm, chỉ đạo theo đúng hướng dẫn đến số đối tượng nợ thuế vẫn còn cao, đã làm giảm tính nghiêm minh của pháp luật. Đồng thời gây phản ứng không tốt đối với những người chấp hành tốt chính sách pháp luật thuế.
Từ khi Luật Quản lý thuế có hiệu lực, cùng với việc thực hiện quản lý theo chức năng, công tác quản lý nợ đã được tập trung về một đầu mối, tạo thuận lợi trong việc đôn đóc thu hồi nợ, tránh nợ đọng kéo dài. Việc theo dõi, quản lý nợ thuế đã được thực hiện trên các ứng dụng tin học, kể cả cấp Chi cục Thuế cũng đã được triển khai từ giữa năm 2010. Trong giai đoạn 2010 – 2013, Cục Thuế Quảng Ngãi đã tích cực triển khai các biện pháp quản lý nợ, từ việc giao chỉ tiêu nợ cho từng đơn vị; rà soát, phân loại nợ kịp thời, nhắc nhở người nợ thuế cho đến các biện pháp nghiệp vụ cưỡng chế nợ thuế. Công tác quản lý nợ tuy có chuyển biến tích cực, tỷ lệ nợ đọng trên số thuế thực thu đạt (thấp hơn) so chỉ tiêu được giao nhưng vẫn còn tăng qua các giai đoạn. Để thực hiện nhiệm vụ chính trị và thực hiện chỉ tiêu giao nợ thuế của Tổng Cục thuế đến các Cục Thuế, Cục Thuế phấn đấu chỉ tiêu nợ đọng tiền xuống dưới 5% trên tổng thu NSNN.