2. Đặc điểm của chi Begomovirus
4.2.4.1. Hai mẫu Dudu31 và Cachua89
Việc xác định vị trí phân loại của 2 mẫu virus Dudu31 và Cachua89 khá dễ dàng vì mức đồng nhất nucleotide rất cao trên toàn bộ gen của chúng đối với 1 virus mới được công bố gần đây bởi Zhang và cộng sự (2010) là ToLCHV (lần lượt 95.9 và 93.7 %, Bảng 4.6, phần 4.3.2).
Theo tiêu chuNn phân loại begomovirus, mẫu Dudu31 và Cachua89 là thành viên của loài Tomato leaf curl Hainan virus (ToLCHV). Theo công bố của Zhang và cộng sự
(2010) ToLCHV là một begomovirus có bộ gien đơn. Nhiều begomovirus có bộ gien đơn thường được phát hiện kèm theo 2 loại phân tử DNA vệ tinh là alphasatellite và betasatellite (còn được gọi là DNA-1 và DNA-β), trong đó betasatellite có thể cần cho quá trình gây bệnh của virus trên cây. Zhang và cộng sự (2010) đã không thể phát hiện
được betasatellite trên các mẫu cây nhiễm ToLCHV. Tương tự, chúng tôi cũng không phát hiện thấy cả 2 loại phân tử DNA vệ tinh trên mẫu đu đủ 31 và cà chua 89 bằng PCR dùng mồi chung.
Theo hướng dẫn đặt tên begomovirrus ở mức dưới loài của ICTV (Fauquet và cộng sự, 2005), chúng tôi ký hiệu 2 virus như sau:
Mẫu Dudu31:
Đầy đủ: Tomato leaf curl Hainan virus [Vietnam:Hungyen:papaya:2010] Viết tắt: ToLCHV [VN:Huy:Pap:2010]
Mẫu Cachua89:
Đầy đủ: Tomato leaf curl Hainan virus [Vietnam:Hanoi:tomato:2010] Viết tắt: ToLCHV [VN:Han:To:2010]
Ý nghĩa của phát hiện 2 virus này ở chỗđây là lần đầu tiên ToLCHV được phát hiện ở
Việt Nam. Đặc biệt, đây là lần đầu tiên, 1 bệnh do begomovirrus gây ra đã được phát hiện thấy trên đu đủ tại Việt Nam (ToLCHV [VN:Huy:Pap:2010] = Dudu31). Bệnh xoăn lá đu
đủ do begomovirrus gây ra khá phổ biến tại nhiều tỉnh phía nam Trung Quốc như Quảng
Đông, Quảng Tây, Vân Nam, đảo Hải Nam (thể hiện bằng số begomovirus được phát hiện và công bố). Tại Việt Nam, bệnh dường như rất hiếm (ngoài trừ mẫu đu đủ 31 trong nghiên cứu này) mặc dù virus gây bệnh (PaLCCNV) đã được phát hiện thấy trên thuốc lá tại tỉnh Hà Tây cũ năm 2005 (Ha và cộng sự, 2008).