Hệ thống lọc trong trại sản xuất có vai trò cực kỳ quan trọng nó quyết định trực tiếp đến hiệu quả sản xuất. Nếu hệ thống lọc không đảm bảo thì trong quá trình sản xuất sẽ rất khó khăn do các mầm bệnh trong nước chưa được xử lý triệt để, và ngược lại nếu hệ thống lọc đảm bảo sẽ hạn chế được tối đa mầm bệnh dẫn đến hiệu quả sản xuất tăng lên. Trại sản xuất sử dụng hai hình thức lọc phổ biến trong đó bao gồm lọc cơ học và lọc vật lý.
Bể lọc cơ học (lọc cát): dựa theo nguyên lý tầng lọc ngược, trại sản xuất sử dụng các vật liệu như; cát, đá sỏi, than hoạt tính. Để lọc nước khi bơm trực tiếp từ biển vào qua bể lọc thô. Bể lọc có thể tích 9 m3, được xây bằng xi măng, đặt trên nền đế cao 1 m. Bể lọc này được đặt xa trại nhằm hạn chế tác nhân gây bệnh lây lan vào bể ương, bể được đặt gần với khu bể xử lý nước.
Hình 3.4. Bể lọc thô nước chưa qua xử lý
Bể lọc thô nước đã qua xử lý: cấu tạo của bể lọc thô nước đã qua xử lý chỉ khác ở độ dày của vật liệu lọc và có bổ sung thêm một lớp than hoạt tính còn lại đều
hoàn toàn giống với bể lọc thô nước chưa qua xử lý. Bể lọc được đặt ở trên góc của bể lắng nhằm tạo áp lực nước đi vào các thiết bị lọc tinh. Tác dụng của bể lọc này là một lần nữa loại bỏ các mùn bã hữu cơ có kích thước lớn sau khi đã qua xử lý ở bể lắng.
Hình 3.5. Bể lọc thô nước đã qua xử lý Hệ thống lọc tinh
Cấu tạo gồm 8 bình lọc lần lượt được sắp xếp như sau: bốn bình có lõi 0.5 µ và bốn bình có lõi lọc 0.2 µ. Bình lọc tinh được nối trục tiếp và thấp hơn với bể lọc thô nước đã qua xử lý nhằm đảm bảo nước có thể chảy qua và chảy vào hệ thống lọc tia cực tím. Tác dụng của hệ thống lọc tinh là một lần nữa loại bỏ mùn bã hữu cơ, trứng bào xác của vi khuẩn mà chưa được loại bỏ ở lần lọc trước.
Hình 3.6. Hệ thống lọc tinh
Hệ thống lọc vật lý: được lắp đặt cuối cùng trong hệ thống lọc của trại sản xuất là hệ thống lọc nước sử dụng tia cực tím bao gồm hai khối trụ được thiết kế dạng ống bọc, trong mỗi khối trụ gồm có 10 bóng đèn tia cực tím được xếp thành vòng tròn bao
quanh ống nước cấp, 2 khối trụ được nối tiếp với nhau nhằm kéo dài thời tiếp xúc của tia cực tím với nước. Hệ thống lọc này có khả năng tiêu diệt hoàn toàn vi khuẩn, mà không làm thay đổi tính chất lý học và hóa học của nước.
Hình 3.7. Hệ thống lọc bằng đèn tia cực tím