Nghịch lý mua sắm trực tuyến ở Việt Nam hiện nay còn nằm ở chi phí vận chuyển và thời gian vận chuyển.
Mặc dù theo lý thuyết là do không phải thuê mướn mặt bằng thì giá bán trên mạng sẽ luôn rẻ hơn giá bán tại các cửa hàng/siêu thị, nhưng thực tế cho thấy nếu khách hàng yêu cầu giao hàng tại nhà thì thường giá sản phẩm sẽ cộng thêm chi phí giao hàng, đặc biệt là các đơn hàng giao đi các tỉnh khác nơi bán hàng, khiến cho giá sản phẩm không rẻ hơn được bao nhiêu so với giá ngoài cửa hàng, chính điều này làm giảm đi sự thu hút về giá của hình thức mua hàng này.
Thêm nữa, thời gian giao nhận hàng hóa là rất chậm. Một mặt, mua sắm trực tuyến ở Việt Nam giúp người dùng tiết kiệm được kha khá thời gian cho việc cất công tới cửa tiệm để xem xét và lựa chọn hàng hóa. Ngược lại, họ sẽ phải đợi lâu hơn mới được chạm tay vào món hàng mà họ đã mua. Hiện nay, hầu như các website bán hàng trực tuyến đều có 2 chính sách giao hàng: giao nhanh thì từ 1-3 ngày (phí giao hàng cao), còn giao chậm thì từ 4-7 ngày (phí giao hàng thấp), có thể thấy hình thức giao hàng này không thu hút được người tiêu dùng nếu giá sản phẩm không chênh lệch quá lớn so với ngoài cửa hàng. Bên cạnh đó, không ít khi món hàng đến nơi bị hư hại, gãy vỡ do va đập trên đường vận chuyển. Điều này, sẽ làm khách hàng phải mất công đi trả lại hàng và chờ thêm một khoảng thời gian nữa mới nhận được sản phẩm thay thế.