Cách đây hơn 8 năm, một nhóm các nhà giáo và cán bộ quản lý tâm huyết đầu tư xây dựng một trường Đại học hướng tới đạt chất lượng quốc tế ở Việt nam đã gặp nhau dưới sự bảo trợ của Hội Hóa học Việt Nam. Địa điểm đầu tiên được giới thiệu lập trường là thành phố Vĩnh Yên, Vĩnh Phúc. Tên địa danh, nội dung đào tạo chính về công nghệ và xu thế thành lập trường có tổ chức bảo trợ đã tạo nên dự án xây dựng Trường Đại học Dân lập Công nghệ Vĩnh Phúc, gọi tắt là trường VPUT. Dự án đã được giới thiệu với một số trường quốc tế và được trình các cấp theo quy định.
Để phù hợp quy hoạch mạng lưới các trường đại học ngoài công lập trên cả nước, được sự giới thiệu định hướng của Chính Phủ, Bộ Giáo dục và Đào tạo và đặc biệt là được sự ủng hộ nhiệu tình của lãnh đạo Đảng và Chính quyền tỉnh Hòa Bình, tháng 4 năm 2006, Hội đồng sáng lập trường và Hội Hóa học Việt Nam đã trình Thủ tướng, Chính Phủ, Bộ Giáo dục và Đào tạo cho phép: chuyển địa điểm mở trường Đại học từ Vình Phúc sang tỉnh Hòa Bình, chuyển hình thức trường dân lập sang trường tư thục và đổi tên Dự án thành lập Dự án Trường Đại học tư thục Hòa Bình, gọi tắt là Dự án trường HBU. Hội đồng sáng lập VPUT chuyển thành Hội đồng sáng lập HBU.
Cuối năm 2006, Chính phủ đã đồng ý về nguyên tắc cho thành lập Trường Đại học Hòa Bình, và đến ngày 28/2/2008, Thủ tướng Chính Phủ đã cho phép Trường Đại học Hòa BÌnh thành lập theo Quyết định số 224/QĐ-TTg.
Ngày 5 tháng 5 năm 2008, Bộ Giáo dục và Đào tạo đã công nhận Chủ tịch Hội đồng Quản trị khóa I là KS.Bùi Quang Độ và Hiệu trưởng của trường Đại học Hòa Bình là GS.TSKH. Đặng Ứng Vận.