- Giám đốc: Đại diện pháp nhân của ngân hàng Eximbank chi nhánh Cần Thơ, chịu trách nhiệm về kết quả kinh doanh của chi nhánh và việc chi tiêu tài chính, trích lập quỹ theo quy định của Nhà nƣớc, của Hội đồng quản trị và của Tổng giám đốc.
- Phó giám đốc: hỗ trợ giám đốc trong việc chuẩn bị, xây dựng và quyết định về chƣơng trình công tác, kế hoạch kinh doanh và các phƣơng hƣờng hoạt động. Thay mặt Giám đốc giải quyết và ký các văn bản thuộc lĩnh vực đƣợc phân công. Điều hành mọi công tác của chi nhánh khi Giám đốc vắng mặt và có sự ủy nhiệm chính thức của Giám đốc.
- Phòng Ngân quỹ: thực hiện công tác thu chi tiền mặt, kiểm ngân, giữ kho, kế toán chuyển ngân, giao dịch.
- Phòng Dịch vụ khách hành: chịu trách nhiện trong việc giao dịch với khách hàng, phân tích tình hình khách hàng, cảm nhận phản hồi của khách hàng về sản phẩm, dịch vụ, thực hiện công tác thu tiền tiết kiệm, thực hiện công tác kế toán giao dịch, kế toán tài vụ, kế toán tập trung và thống kê kế hoạch.
- Phòng Khách hàng doanh nghiệp: có nhiệm vụ tìm kiếm khách hàng thông qua công tác tiếp thị bán hàng, tìm hiểu thu thập thông tin của khách hàng tiềm năng. Lập kế hoạch tiếp thị, trực tiếp tiếp xúc với khách hàng để giới thiểu sản phẩm, dịch vụ ngân hàng. Thẩm định khách hàng, lập tờ trình, đề xuất cấp tín dụng và các vấn đề liên quan. Thực hiện công tác hàng xuất, nhập khẩu, quan hệ quốc tế, dịch thuật, thông dịch. Ngoài ra, phòng còn thực hiện nghiệp vụ kế toán tín dụng khách hàng doanh nghiệp, kế toán thanh toán quốc tế.
- Phòng Khách hàng cá nhân: có nhiệm vụ chủ động tìm kiếm đối tƣợng khách hàng mục tiêu có nhu cầu sử dụng sản phẩm, dịch vụ thuộc đối tƣợng khách hàng cá nhân. Duy trì khách hàng tiềm năng bằng cách cung cấp thông tin, tiện ích sản phâm của Ngân hàng. Tiến hành thẩm định, lập hồ sơ thẩm định. Nhận xét và đƣa ra đề xuất với nhu cầu tìn dụng của khách hàng. Phát hành và thanh toán các loại thẻ quốc tế, thẻ nội địa…Đồng thời thực hiện công tác kế toán tín dụng cá nhân và kế toán phát hành và sử dụng thẻ.
- Phòng IT (Phòng Công nghệ Thông tin): là phòng tham mƣu, giúp việc cho Giám đốc về lĩnh vực Công nghệ Thông tin của toàn NH (bao gồm: hệ thống hạ tầng công nghệ thông tin, hệ thống phần mềm, giải pháp công nghệ thông tin) nhằm tối ƣu hóa hệ thống, bảo mật, an toàn dữ liệu.
- Phòng Kiểm soát nội bộ: có chức năng hỗ trợ cho giám đốc, giám sát mọi hoạt động trong NH, đảm bảo mọi nhân viên thực hiện đúng nội quy, quy chế của NH. Ngoài ra, bộ phận này còn có nhiệm vụ phải báo cáo kịp thời kết quả kiểm tra, kiểm soát nội bộ và đề xuất các giải pháp kiến nghị cần thiết nhằm đảm bảo cho mọi hoạt động an toàn đúng pháp luật.
- Phòng thẩm định giá: có nhiệm vụ hỗ trợ cán bộ tín dụng trong việc thẩm định giá tài sản nhầm trách những gian lận, sai sót của cán bộ tín dụng.