Yếu tố về năng lực và trình độ chuyên môn của cán bộ quản lý dự án có ảnh hưởng không nhỏ đến quá trình quản lý, điều hành và giám sát dự án đầu tư xây dựng. Đây là yếu tố quyết định đến kết quả của công tác quản lý xây dựng CSHT. Nếu năng lực, trình độ chuyên môn của các cán bộ quản lý yếu kém thì các khâu trong quản lý (lập kế hoạch, kiểm tra, giám sát, thanh toán..) gặp tình trạng trì trệ, chậm trễ khi tiến hành thi công dự án. Việc buông lỏng
quản lý trong quá trình thi công, xây dựng hay giám sát sẽ dẫn đến hậu quả nghiêm trọng trong quản lý ngân sách đầu tư, sẽ xảy ra tình trạng thất thoát NSNN gây lãng phí.
Thực tế hiện nay, ở nhiều địa phương năng lực cán bộ xã, một số cán bộ cấp huyện chưa đáp ứng được yêu cầu, nhiệm vụ đặt ra trong quá trình CNH-HĐH để xây dựng nông thôn mới. Có nhiều cán bộ lợi dụng chức vụ để tham nhũng, xảy ra tình trạng tiêu cực... Như năm 2011 tại địa phương, công trình xây dựng trụ sở HĐND-UBND huyện Quỳnh Phụ có vốn đầu tư trên 30 tỷ đồng bị “ rút ruột”, ảnh hưởng đến chất lượng công trình. Qua điều tra đã bắt giam một phó chủ tịch UBND vì tội “Cố ý làm trái quy định của nhà nước gây hậu quả nghiêm trọng”, gây thất thoát tiền xây dựng công trình lên tới hàng tỷ đồng.
Các cán bộ cần nắm bắt được nội dung: công tác đền bù bồi thường đất, huy động vốn đầu tư, công tác chọn nhà thầu, công tác giám sát công trình...Theo đánh giá có tới 100% ý kiến cho rằng đây là yếu tố ảnh hưởng đến công tác quản lý dự án xây dựng kết cấu hạ tầng nông thôn và là yếu tố quan trọng nhất.