Nhìn chung, chính sách khuyến khích, thúc đẩy khai thác, sử dụng tài nguyên nƣớc cho phát triển thủy điện ở Phú Yên thời gian qua đã có những tác động tích cực đáng kể trong việc phát triển nguồn điện, góp phần đáp ứng nhu cầu năng lƣợng ngày càng tăng đồng thời cũng đã giúp điều hòa nguồn nƣớc, ổn định tƣới tiêu ở một số khu vực. Sự đóng góp của thủy điện trong cán cân phân phối năng lƣợng của đất nƣớc là rất lớn, việc xây dựng các công trình thuỷ điện đã và đang tạo nguồn điện sạch, bảo đảm an ninh năng lƣợng quốc gia.
Những tác động tích cực chủ yêu là thúc đẩy tăng trƣởng kinh tế do nguồn điện giá thành rẻ và việc vận hành phát điện thƣờng không thƣơng hại đến môi trƣờng. Cụ thể là:
- Năng lƣợng điện từ nhà máy thủy điện là một dạng năng lƣợng tái sinh, năng lƣợng sạch vì không thải các khí có hại cho môi trƣờng. Các thủy điện tại Phú Yên nói riêng và cả nƣớc nói chung đã từng giữ vai trò hết sức quan trọng trong việc cung ứng điện cho đất nƣớc trong những năm đầu đổi mới đầy ắp khó khăn và thiếu điện nghiêm trọng.
- Nói chung, các tác động tích cực của nhà máy thủy điện nhƣ: chống lũ vào mùa mƣa, cung cấp nƣớc cho nông nghiệp, công nghiệp và sinh hoạt dân dụng, chống hạn và đẩy mặn vào mùa khô; sản xuất điện với sản lƣợng lớn và có khả năng tái tạo nên giá thành điện thƣơng phẩm tƣơng đối thấp so với các nguồn điện khác; góp phần mở rộng hình thức du lịch sinh thái và giao thông đƣờng thủy; phát triển nuôi trồng thủy sản…
- Đối với việc xây dựng và vận hành hệ thống các công trình thuỷ điện ở thƣợng nguồn, có thể tác động tích cực là dòng chảy sẽ đƣợc điều tiết bởi các hồ chứa thuỷ điện, lƣợng nƣớc mùa khô có thể tăng lên và giảm dòng chảy mùa lũ. Tuy nhiên, các mặt tích cực đó còn phụ thuộc vào chế độ vận hành, điều tiết của toàn bộ hệ thống hồ chứa thuỷ điện lớn trên lƣu vực, nhất là chế độ vận hành của hồ những
chứa nƣớc lớn, có ý nghĩa điều tiết và gần biên giới, và phụ thuộc ý chí chủ quan của các nƣớc. Vì vậy, các yếu tố tích cực nêu trên không vững chắc.