Vùng biển Cô Tô có 127 loài thực vật phù du thuộc 31 chi, 3 ngành tảo. Động vật phù du có 54 loài thuộc 2 giống của 4 nhóm vỏ giáp, chân chèo. Động vật đáy ở độ sâu 5 đến 20m; đã phát hiện được 100 loài chủ yếu là giun tơ, giáp xác, thân mềm, da gaiẦ. Các loài có giá trị kinh tế cao bắt gặp như bào ngư, trai ngọc, ốc nón, tôm hùm, hải sâm [43].
Cô Tô rất phong phú và đẹp nổi tiếng với rừng san hô Bắc Vàn, phát triển rộng lớn ở độ sâu 10-20m có 70 loài, 28 giống, 12 họ; trong đó có nhiều loài quý hiếm như san hô đỏ, san hô sừng. Rong biển có 74 loài, thuộc 51 giống, 30 họ, 18 bộ, 5 lớp, 4 ngành; trong đó có nhiều loại làm thực phẩm, phân bón với diện tắch phân bố khoảng 250 ha, sản lượng có thể khai thác vào khoảng 2.100 tấn/năm.
Nguồn lợi cá có 120 loài, trong đó có 13 loài có giá trị kinh tế cao, bao gồm cá nổi và cá đáy.
Cá nổi phân thành 2 nhóm: nhóm cá ắt di chuyển và nhóm cá di cư xa. Trong
đó cá ắt di chuyển có cá trắch xương (Sardinella jusieu), cá lầm (Dussumieri hasseltii), cá cơm (Engraulidate), cá nục (Decapterus)... chúng tạo thành những đàn cá địa phương. Cá di cư xa như cá ngừ, cá bạc má, cá nhám... Từng loài cá di chuyển theo các mùa khác nhau. Cá trắch xương có thời gian xuất hiện rộ vào vụ Nam. Cá lầm, cá nục có thời gian xuất hiện gần như quanh năm và xuất hiện rộ vào cuối vụ Bắc đến đầu vụ Nam. Cá bạc má, cá dầu, cá chỉ vàng, cá lẹp thời gian xuất hiện chắnh là vào vụ Nam. Cá ngừ có hiện tượng di cư xa nhất, mùa đông chúng sống ở những khu vực phắa Nam biển Đông, tháng 4 các đàn cá ngừ di chuyển vào vịnh Bắc Bộ và đi lên phắa Bắc vịnh. Cá chuồn và một số loài thuộc họ cá khế khi nhiệt độ hạ thấp vào mùa đông, chúng rời khỏi vịnh Bắc Bộ.
Cá đáy có nhiều loài như họ cá phèn (Mullidae), họ cá mối (Symodidae), họ
cá lượng (Nemipteridae), họ cá trác (Pricanthis), họ cá miễn sành (Spridae), họ cá hồng (Lutjanidae), họ cá sạo (Pomadasyidae), v.v.
Ngoài ra còn có Cá mực gồm 6 loài, mực ống chủ yếu là mực Trung Hoa tập trung nhiều ở đông nam đảo Thanh Lam, sản lượng khai thác có thể đạt 50 tấn/năm. Cô
53
Tô có bãi tôm với diện tắch khoảng 200 hải lý vuông, độ sâu 11-23m, đáy tương đối
bằng phẳng, chất đáy cát pha bùn. Tôm bị khai thác quá mức nên nguồn lợi suy giảm nhanh, hiện tại tôm còn rất ắt. Cô Tô có trai ngọc là một đặc sản quý, phù hợp với điều kiện tự nhiên của Cô Tô nên trong tự nhiên trai ngọc phát triển tốt. Hiện nay trai ngọc tự nhiên vẫn tồn tại ở Cô Tô, nhưng trữ lượng chưa được điều tra để xác định. Hải sâm và bào ngư cũng là hai loài đặc sản của Cô Tô. Ở phắa Đông quần đảo có điều kiện tự nhiên phù hợp với sự phát triển của cả 2 loại hải sản này. Tuy nhiên, trữ lượng tự nhiên chưa được điều tra xác định [43].
Ở vùng biển Cô Tô và xung quanh có 3 bãi cá điển hình là: bãi cá đáy và bãi cá nổi Bạch Long Vĩ, bãi cá nổi ven bờ Quảng Ninh [43].
Bãi cá đáy Bạch Long Vĩ có phạm vi từ 19030ỖN - 20030ỖN và 1070
00E - 108030ỖE độ sâu trên dưới 50m chất đáy là bùn cát, cát bùn. Diện tắch bãi 7.254,2km2, trữ lượng 39.128 tấn, khả năng khai thác 19.562 tấn, mật độ 5,39 tấn/km2. Các loại cá tầng đáy chủ yếu: cá miễn sành, (Paragryrops edita), cá mối thường (Saruidatum), cá lượng (Nemipterus), cá phèn khoai (Upeneusbensasi), cá nục sồ (Desapterus maruadsi), cá trác (Priacanthus).
Bãi cá nổi Bạch Long Vĩ nằm chủ yếu ở Đông và Đông Bắc đảo Bạch Long Vĩ ở độ sâu 35-55m và đây là bãi cá nổi tốt nhất cho vụ Bắc ở vịnh Bắc Bộ. Các loại cá nổi chủ yếu: cá nục sồ, cá trắch, cá lầm; mật độ cá phân bố dầy ở phắa Bắc bãi cá.
Bãi cá nổi ven bờ Quảng Ninh có phạm vi từ Nam quần đảo Long Châu kéo đến khu vực Thượng Mai, Hạ Mai và Thanh Lam - Cô Tô lên tới đảo Vĩnh Thực. Cá tập trung tương đối dày trong vụ Nam, ở độ sâu từ 10-30m. Trong vụ Nam ở khu vực liền bờ thường gặp các đàn cá nổi. Các loại cá nổi chủ yếu: cá mực sồ (Decapterus hasselti), cá cơm (Engraolidea), cá trắch xương (Sardinella jussieu).