... thuật xácđịnhtrìnhtự cao (highthroughput) đột ngột làm giảm chi phí xácđịnhtrìnhtự ADN, đem tới hy vọng cho nhiều nhà nghiên cứu thực việc với giá thành 1000 la [95] Mỹ Lượng lớn trìnhtựxác ... trìnhtựxácđịnh hình thành nên lĩnh vực hệgenhọc (genomics) - khoa học nghiên cứu (hệ) gen, sử dụng cơng cụ tính tốn để tìm kiếm phân tích mơ hình gen đầy đủ sinh vật Hệgenhọc coi lĩnh ... này, nhà khoa học nghiên cứu trìnhtự phân tử liên quan tới nhiều bệnh di truyền người Khi xácđịnhtrìnhtự trở nên đỡ tốn hơn, với trợ giúp cơng cụ tính tốn, nhà nghiên cứu xácđịnhgen nhiều sinh...
... Phương pháp xácđịnhtrìnhtựADN •Là phương pháp dùng để xácđịnhtrìnhtự xếp nucleotides chuỗi đoạn DNA •Sử dụng phương pháp : Maxam-Gilbert (1977) Sanger (1977) Xácđịnhtrìnhtựtự động I.Phương ... tích Manual sequencing method III .Xác địnhtrình t bng phng phỏp t ng Nguyên tắc chung giải trìnhtựgentự động dựa theo sở phương pháp Sanger Nhưng : Quá trình tỉng hỵp AND thùc hiƯn nhê kú ... Phng phỏp enzym (do Frederick Sanger đề xuÊt 1977 ) • Dựa vào hoạt động enzym ADN polymerase trình tổng hợp ADN Enzym xúc tác gắn nucleotid vào mạch đơn tổng hợp vị trí 3'OH, gặp nucleotid khơng...
... PCR đoạn ADN đặc hiệu gen cry1Ab vi khuẩn E coli nhân lên theo mong muốn Tuy nhiên để khẳng định cách chắn điều này, cần xácđịnhtrìnhtự đoạn ADN gắn vào vectơ II.4 Xácđịnhtrìnhtự nucleotid ... vectơ tái tổ hợp từ tế bào chủ, genxácđịnhtrìnhtự theo phương pháp enzim học Sanger nhờ kit Hãng Amersham-Pharmacia Biotech với máy xácđịnhtrìnhtựADNtự động ALFExpress Hãng Pharmacia ... dòng xácđịnhtrìnhtự đoạn ADN đặc hiệu thuộc gen cry 1Ab so sánh với trìnhtự đoạn gen công bố Ngân hàng liệu gen Quốc tế I.VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU: I.1 Tách chiết ADN tổng số: Tiến...
... giải trìnhtựtrình bày phần phương pháp nghiên cứu Quá trình giải trìnhtự thực máy giải trìnhtựtự động ABI 3100 Sau giải trìnhtựgen mã hóa kháng ngun HA virus H5N1, trìnhtự phân tích gen ... sử dụng chương trình phần mềm PC/Gene để phân tích trìnhtựgen HA chủng tách dòng kết cho thấy trìnhtựgen hồn tồn khơng thay đổi so với chủng gốc Bên cạnh so sánh trìnhtựgen HA với chủng ... phóng virus Trên sở trìnhtựgen xếp genhệ gen, hệgen virus cúm A có độ dài tổng số khoảng 13.500 nucleotit [16] 14 Các gen mã hóa cho protein chức chúng sau: - Phân đoạn 1: Là gen mã hóa cho protein...
... agarose 1% (Hinh 1) thi dupc tinh sach blng QIAquick Gel exfraction JCit (QIAGEN) Xacdinhtrinh ty gen 18S-rDNA Trinh ty gen 18S-rDNA dupc xacdinh theo phuomg phap tdng hop cua Sanger va dong tac ... used to analysis of phylogeny of Cunninghamia lanceolata by MP method, together with another species of the same genus, Cunninghamia konishii Hayata, and species of another genera of the same family ... vao nifrogen long trade dua ve luu giir ttong tti lanh ttong vdi loai thupc cac chi khac (Bang 1)fronghp sau -80°C tai phdng thi nghiem cho tdi tien hanh Hoang dan tit dii lieu fren GenBank bang...
... phát có mặt mRNA gen E6, E7 sau hoà nhập vào hệgen tế bào chủ Thực chất phương pháp dựa sở gen E6, E7 có khả đột nhập vào hệgen tế bào chủ trở thành thành phần hệgen tế bào chủ Gen E6, E7 HPV ... 1.2.2.4 Sinh học phân tử xếp hệgen EBV Hệgen EBV cấu trúc DNA vòng, sợi đơi (dsDNA), chứa gen mã hóa cho protein virus định vị sợi DNA hệgen Trong Hình 1.8 sơ đồ cấu trúc vòng DNA hệgen EBV, ... tái tổ hợp 47 2.4.5 Giải trìnhtrìnhtự xử lý số liệu 48 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 51 3.1 Kết thu nhận, giải trìnhtrìnhtựxácđịnhgen E6 HPV-16 L1 HPV-18 ...
... 0,5µl dH2O 2.5µl Tổng thể tích 10µl 2.3.8 Phương pháp xácđịnhtrìnhtự nucleotid đoạn gen tách dòng Trìnhtự nucleotid đoạn gen tách dòng xácđịnh theo phương pháp tổng hợp Sanger cs [1], [12], ... đại gen cry1C chủng Bacillus thuringiensis subsp aizawai phương pháp PCR 43 3.2 Tách dòng đọc trìnhtựgen cry1C .44 3.2.1 Tách dòng gen cry1C 44 3.2.2 Xácđịnhtrìnhtự ... 600 gen tách dòng đăng kí ngân hàng liệu gen (Gene Database) [29], [42] 1.4.2 Phân nhóm gen mã hóa độc tố Hệ thống phân loại gen cry HÖfte Whiteley xây dựng dựa vào trùng đích độc tố mà gen mã...
... tái tổ hợp 47 2.4.5 Giải trìnhtrìnhtự xử lý số liệu 48 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 51 3.1 Kết thu nhận, giải trìnhtrìnhtựxácđịnhgen E6 HPV-16 L1 HPV-18 ... giải trìnhtự sản phẩm HPV-16 HPV-18 từ mẫu kiểm tra 53 3.1.4 Kết giải trìnhtự thu nhận chuỗi gen E6 HPV-16 chuỗi gen L1 HPV-18 54 3.1.5 Kết truy cập Ngân hàng genxácđịnh chuỗi ... giải trìnhtrìnhtựxácđịnhgen EBNA – EBV 60 3.2.1 Kết kiểm tra DNA tổng số từ mẫu bệnh phẩm 60 3.2.2 Kết thực phản ứng PCR 61 3.2.3 Kết giải trìnhtự thu nhận chuỗi gen...
... đại gen cry1C chủng Bacillus thuringiensis subsp aizawai phương pháp PCR 43 3.2 Tách dòng đọc trìnhtựgen cry1C .44 3.2.1 Tách dòng gen cry1C 44 3.2.2 Xácđịnhtrìnhtự ... 2.3.7 Phương pháp tách dòng gen cry1C 31 2.3.8 Phương pháp xácđịnhtrìnhtự nucleotid đoạn gen tách dòng 34 2.4 Địa điểm nghiên cứu 35 Chƣơng KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN .36 3.1 ... ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN TRƢỜNG ĐẠI HỌC SƢ PHẠM LÊ THỊ NGỌC THƢƠNG TUYỂN CHỌN, TÁCH DÒNG VÀ XÁC ĐỊNHTRÌNHTỰGEN cry1C MÃ HÓA PROTEIN TINH THỂ DIỆT CÔN...
... 10µl 2.3.10 Xácđịnhtrìnhtự so sánh trìnhtựgen thu đƣợc với trìnhtự tƣơng ứng GenBank Tách dòng xácđịnhtrìnhtự gen: Sản phẩm PCR đƣợc gắn vào vector tách dòng pBT [4] biến nạp vào tế bào ... gen quan tâm i) Thu thập trìnhtựgen quan tâm từ GenBank: Trƣớc thiết kế đoạn mồi đặc hiệu cho gentrìnhtự cần phân lập chủng virut nghiên cứu (Ví dụ: trìnhtựgen CP RGSV), trìnhtự đoạn gen ... đồng trìnhtự đem so sánh với trìnhtựgen CP RGSV GenBank cao (96,5- 99%) Kết chứng tỏ trìnhtựgen CP-RGSV Các trìnhtự thu đƣợc đƣợc đăng ký vào GenBank với mã số nhƣ bảng 3.2 3.4 SO SÁNH TRÌNH...
... Viện công nghệ sinh học – Trung tâm công nghệ khoa học quốc gia, em làm quen thao tác với thiết bị sử dụng sinh học phân tử để tiến hành làm đề tài : “ Tách dòng xácđịnhtrìnhtự gene mã hoá ... qua cột S.N.A.P TM (ivitrogen) DNA plasmid giữ lại cột, rửa cột đệm rửa, cuối plasmid đẩy khỏi cột nước khử ion vơ trùng 2.3.8 Xácđịnhtrìnhtự nucleic Trìnhtự DNA xácđịnh phương pháp enzyme ... kết khác biệt với kết Trìnhtự gene mã hố cho kháng thể kháng lại tế bào lympho bệnh nhân ung thư vú chưa xác định, nên việc mong đợi sản phẩm PCR đặc hiệu gene có trìnhtự khó Để khắc phục vấn...
... 10µl 2.3.10 Xácđịnhtrìnhtự so sánh trìnhtựgen thu đƣợc với trìnhtự tƣơng ứng GenBank Tách dòng xácđịnhtrìnhtự gen: Sản phẩm PCR đƣợc gắn vào vector tách dòng pBT [4] biến nạp vào tế bào ... gen quan tâm i) Thu thập trìnhtựgen quan tâm từ GenBank: Trƣớc thiết kế đoạn mồi đặc hiệu cho gentrìnhtự cần phân lập chủng virut nghiên cứu (Ví dụ: trìnhtựgen CP RGSV), trìnhtự đoạn gen ... đồng trìnhtự đem so sánh với trìnhtựgen CP RGSV GenBank cao (96,5- 99%) Kết chứng tỏ trìnhtựgen CP-RGSV Các trìnhtự thu đƣợc đƣợc đăng ký vào GenBank với mã số nhƣ bảng 3.2 3.4 SO SÁNH TRÌNH...
... tiến hành phân tích glycerin quy trìnhxácđịnh glycerin tự 1.5.2 Xácđịnh glycerin tự phương pháp quang phổ [14] 1.5.2.1 Phạm vi áp dụng Phương pháp áp dụng xácđịnh hàm lượng glycerin dầu, chất ... TRƯỜNG ĐẠI HỌC CƠNG NGHIỆP THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH KHOA CƠNG NGHỆ HĨA HỌC ĐỒ ÁN CHUN NGÀNH TỐI ƯU HĨA QUY TRÌNHXÁCĐỊNH GLYCERIN TỰ DO VÀ TỔNG GLYCERIN BẰNG PHƯƠNG PHÁP ... tạo cặn động cơ, tắt nghẽn đầu phun… Do đó, việc xácđịnh chất lượng biodiesel việc xácđịnh thành phần cách xác Có nhiều phương pháp để xácđịnh chất lượng biodiesel thường sử dụng tiêu chuẩn...
... trìnhtựtự động Applied Biosystems - So sánh thành phần thiết yếu trìnhtự gene gltA giải trìnhtự với thiết kế in silico - Phân tích kết dịch mã đoạn gene giải trìnhtự - So sánh trìnhtự gene ... với trìnhtự công bố ngân hàng gene NCBI (Gene bank) thơng qua chương trình Blast 37 3.4 Phương pháp nghiên cứu 3.4.1 Quy trình tách dòng xácđịnhtrìnhtự gene gltA từ vi khuẩn E coli Trìnhtự ... hiệu để nhân gene gltA Trìnhtự mồi thiết kế dựa vào trìnhtự gene cơng bố ngân hàng gene NCBI Cặp mồi mua từ hãng Alpha DNA Bảng 5: Cặp mồi sử dụng nhân gene gltA Tên mồi Trìnhtự mồi ( 5’ -...
... tích kết 3.4.8 Phương pháp xácđịnhtrìnhtự gene crtY máy tự động Trìnhtự nucleotide gene crtY xácđịnh phương pháp xácđịnhtrìnhtự gene tự động máy xácđịnhtrìnhtự gene hãng Applied Biosystems ... dung : Xácđịnhtrìnhtự gene crtY so sánh với trìnhtự cơng bố ngân hàng gene quốc tế + Xácđịnhtrìnhtự gene phương pháp giải trìnhtựtự động + So sánh trìnhtự gene crtY với trìnhtự công ... hạnHindIII Xácđịnhtrìnhtự gene phương pháp giải trìnhtựtự động So sánh trìnhtự phần mềm Blast Hình 2: Quy trình tách dòng xácđịnhtự gene crtY 19 3.4.2 Phương pháp thiết kế mồi cho gene crtY...
... 10µl 2.3.10 Xácđịnhtrìnhtự so sánh trìnhtựgen thu đƣợc với trìnhtự tƣơng ứng GenBank Tách dòng xácđịnhtrìnhtự gen: Sản phẩm PCR đƣợc gắn vào vector tách dòng pBT [4] biến nạp vào tế bào ... chƣơng trình Blast (NCBI), hệ số tƣơng đồng trìnhtự đem so sánh với trìnhtựgen CP RGSV GenBank cao (96,5- 99%) Kết chứng tỏ trìnhtựgen CP-RGSV Các trìnhtự thu đƣợc đƣợc đăng ký vào GenBank ... RGSV gắn vào vectơ ban đầu trìnhtự đem so sánh với trìnhtự phân đoạn RGSV GenBank cao (96- 99%) Kết chứng tỏ hai trìnhtựtrìnhtự phân đoạn RGSV Các trìnhtự thu đƣợc đƣợc đăng ký vào GenBank...
... chọn dòng xácđịnhtrìnhtựgen IFS1 giống đậu tương nghiên cứu - So sánh trìnhtựgen IFS1 phân lập giống đậu tương nghiên cứu với trìnhtự cơng bố ngân hàng GenBank - So sánh trìnhtự amino ... Phƣơng pháp xácđịnhtrìnhtự nucleotide Các mẫu plasmid mang gen quan tâm có kích thước phù hợp với lý thuyết sử dụng để giải trìnhtự máy xácđịnhtrìnhtựtự động ABI PRISM® 3100-Avant Genetic ... mang gen IFS1 đạt kết tốt, đảm bảo chất lượng số lượng để tiến hành đọc trìnhtự nucleotide gen IFS1 3.4 KẾT QUẢ GIẢI TRÌNHTỰGENTrìnhtự nucleotide gen IFS1 tách dòng đọc thiết bị giải trình tự...