kết quả giải trình tự gen 16s rrna

Ngày tải lên: 01/04/2013, 14:04

... chủng C.perfringens giới, sử dụng chương trình Blast để tìm Ngân hàng gen quốc tế trình tự có mức tương đồng nucleotid cao với trình tự giải mã Kết blast cho hàng chục gen có trình tự tương đồng ... có trình tự hoàn toàn giống với đọan 645 bp 16S rRNA chủng đại diện cho typ độc tố: CV58 (typA), CV135 (typD), Typ C (typC) Kết trình bày bảng Bảng Chủng C.perfringens có trình tự gen 16S rRNA ... C.perfringens phân lập từ dê, cừu mắc bệnh viêm ruột tiêu chảy, giải trình tự gen 16S rRNA chủng phân lập Các đặc tính chủng thể bảng Bảng Đặc tính chủng C.perfringens lựa chọn giải mã 16S rRNA TT...

Ngày tải lên: 25/03/2014, 04:21

... TRÊN GEN LDLR 77 PHỤ LỤC – MỘT SỐ DẠNG ĐỘT BIẾN TRÊN GEN APOB 85 PHỤ LỤC – KẾT QUẢ GIẢI TRÌNH TỰ EXON TRÊN GEN LDLR Ở MỘT SỐ MẪU BỆNH PHẨM 86 PHỤ LỤC – KẾT QUẢ GIẢI TRÌNH TỰ ALLELE ... đột biến gen gây bệnh FH như: kỹ thuật PCR kết hợp giải trình tự, PCR – SSCP, DGGE v.v… I.6.1 Phương pháp giải trình tự (Sequencing) Giải trình tự gen phương pháp xác để phát đột biến điểm Phương ... khuếch đại vùng gen chứa đột biến R3500Q gen ApoB Khảo sát thực nghiệm: Thực quy trình PCR - giải trình tự exon gen LDLR quy trình AS – PCR phát đột biến R3500Q gen ApoB với mẫu DNA gen người từ...

Ngày tải lên: 01/07/2017, 21:22

... Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch ... Phân tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự toàn gen HP1125 vừa giải mã so sánh với gen tương ứng chủng nước chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen tương ... tiếp không qua giai đoạn tạo dòng phân tử Kết trình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số mã AY513613 Hình Trình tự nucleotide gen HP1125(A) thành phần protein tương ứng...

Ngày tải lên: 30/01/2013, 14:43

... Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch ... Phân tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự toàn gen HP1125 vừa giải mã so sánh với gen tương ứng chủng nước chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen tương ... tiếp không qua giai đoạn tạo dòng phân tử Kết trình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số mã AY513613 Hình Trình tự nucleotide gen HP1125(A) thành phần protein tương ứng...

Ngày tải lên: 15/03/2013, 17:19

... chương trình tin – sinh h c ng d ng nghiên c u x lý, phân tích so sánh chu i gen thu nh n - Chương trình so sánh phân tích chu i gen GeneDoc m t chương trình Nicholas Nicholas (1997) [48] l p trình ... ngu n gen 2.3.6 Gi i trình t x lý chu i gen 2.3.6.1 Gi i trình t DNA 2.3.6.2 Tinh s ch s n ph m c a ph n ng gi i trình t 2.3.6.3 Thu nh n, x lý phân tích d li u chu i gen ... c) Ghi chú: ñ dài gen h gen tính b ng bp; 5’UTR 3’UTR: ph n không mã hóa ñ u cu i h gen; Lelystad: ch ng ñ i di n dòng châu Âu (genotype I); VR-2332: ch ng ñ i di n dòng B c M (genotype II); GD*:...

Ngày tải lên: 14/12/2013, 16:10

... Các phương pháp giải trình tự gen Có phương pháp chính: Phương pháp hoá học Maxam Gilbert: phương pháp sử dụng để xác định trình tự gen không đựơc sử dụng phổ biến Phương ... phương pháp cải tiến Tạo điều kiện thuận lợi cho việc tự động hoá Giảm giá thành phản ứng Tăng tốc độ phản ứng => Nhiều trung tâm giải trình tự gen sử dụng phương pháp họ đọc hàng triệu bp ngày ... dTTP ddTTP C T A G Đoạn ADN cần giải trình tự Mồi Sequencing .CCTATGGAATGC- ống phản ứng A * * ** * phản ứng C ống * ** ống phản ứng G * * ống phản ứng T ** Phóng xạ tự ghi sợi AND đơn tổng hợp ống...

Ngày tải lên: 18/02/2014, 10:20

... Thịnh NỘI DUNG Khái niệm giải trình tự gen ý nghĩa GTTG Phương pháp giải trình tự gen: 2.1 Phương pháp Maxam – Gilbert 2.2 Phương pháp Sanger 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động So sánh phương ... Nạp sản phẩm PCR vào máy giải trình tự gen chạy máy giải trình tự gen Bước 4: Phân tích kết từ liệu máy tính cung cấp 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động Đầu đọc laser máy kích hoạt chất ... phát màu, màu ứng với nucleotide hiển thị đỉnh 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động Đọc kết 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động ABI Automated Sequencers (contd.) ABI 310 Capillary ABI...

Ngày tải lên: 06/03/2014, 05:22

... ADN đợc xử lý vào máy giải trình tự gen để đọc tự động trình tự nucleotide FliC Có thể đọc sợi đọc đồng thời hai sợi để tăng độ xác trình tự đợc đọc Kết trình giải trình tự gen FliC đợc lu máy ... paratyphi B (Hình 1) Hình Gen FliC - b Salmonella paratyphi B GenBank (http: //www ncbi nlm nih gov) 27 TCNCYH phụ 32 (6) - 2004 Các gen FliC Salmonella khác đợc giải trình tự so sánh với để tìm ... dạng (hình ảnh chữ) Kết đợc so sánh với liệu loại có ngân hàng gen (GenBank, www ncbi nlm nih gov) đợc đăng ký công bố thức với số truy cập AY657000 AY657001 Sau xin giới thiệu gen FliC Salmonella...

Ngày tải lên: 10/03/2014, 22:20

... PCR khuyếch đại vùng 16S – 23S rDNA ITS làm vật liệu giải trình tự gen hrpF đặc trƣng vi khuẩn gây bệnh Do hạn chế phƣơng pháp giải trình tự gen không mang lại kết Tuy nhiên, kết PCR cho phép xác ... 3.5.7.5 Quy trình tóm tắt bƣớc đọc trình tự 26 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 27 4.1 Kết thu thập phân lập mẫu vi khuẩn gây bệnh 27 4.2 Kết chủng bệnh rau cải trồng nhà lƣới 28 4.3 Kết ly ... đọan DNA gen hrpF 22 3.5.6 Phƣơng pháp điện di đọc kết qủa 22 3.5.6.1 Điện di gel agarose 22 3.5.6.2 Đọc kết điện di 22 3.5.7 Phƣơng pháp xác định trình tự gen từ sản...

Ngày tải lên: 19/03/2014, 18:20

... Rosato, Y.B 1,1kb Hình 4.8 Kết khuếch đại vùng 16S – 23S rDNA 1: CC1, 2: CC2, 3: CC3, 4: Ladder 1,5kb, 5: HM1, 6: HM2, 7: Q12-1, 8: DC Sản phẩm PCR đƣợc tinh đọc trình tự Trình tự DNA có đƣợc so sánh ... họ thập tự Cụ thể mở rộng địa bàn (Đồng Bằng Sông Cửu Long, Lâm Đồng, Long An tỉnh có canh tác rau), nghiên cứu phổ kí chủ rộng (cây họ thập tự) Hoàn thành đề tài mức giải trình tự vùng 16S – 23S ... Kit (Amersham Company) Cf1 HM2 Hình 4.9 Kết tinh sản phẩm PCR 4.4.3 Kết PCR vùng hrpF Theo Young Jin Park ctv (2004), primer XCR XCF thiết kế dựa trình tự gen hrpF có tính chuyên biệt cao, dùng...

Ngày tải lên: 28/07/2014, 02:20

... sáng dƣới tia UV, kết xuất băng sáng gel 3.5.7 Phƣơng pháp xác định trình tự gen từ sản phẩm PCR 3.5.7.1 Chuẩn bị khuôn DNA * Tinh sản phẩm PCR Sản phẩm PCR đƣợc tinh theo quy trình GFX PCR and ... dẫn chứa polymer để điện di phân tích kết Kết thu đƣợc từ tín hiệu huỳnh quang đƣợc ghi nhận phần mềm máy sequencer 3.5.7.4 Quy trình tóm tắt bƣớc đọc trình tự Sản phẩm PCR GFX PCR DNA and gel ... 950C/5 phút Phản ứng đọc trình tự 950C/30 giây DNA khuôn 550C/10 giây Primer 600C/4 phút Nƣớc khử ion Tinh Điện di, ghi nhận tín hiệu Hình 3.1 Sơ đồ tóm tắt quy trình đọc trình tự sản phẩm PCR 25 chu...

Ngày tải lên: 28/07/2014, 02:20

... PCR khuyếch đại vùng 16S – 23S rDNA ITS làm vật liệu giải trình tự gen hrpF đặc trƣng vi khuẩn gây bệnh Do hạn chế phƣơng pháp giải trình tự gen không mang lại kết Tuy nhiên, kết PCR cho phép xác ... 3.5.7.5 Quy trình tóm tắt bƣớc đọc trình tự 26 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 27 4.1 Kết thu thập phân lập mẫu vi khuẩn gây bệnh 27 4.2 Kết chủng bệnh rau cải trồng nhà lƣới 28 4.3 Kết ly ... đọan DNA gen hrpF 22 3.5.6 Phƣơng pháp điện di đọc kết qủa 22 3.5.6.1 Điện di gel agarose 22 3.5.6.2 Đọc kết điện di 22 3.5.7 Phƣơng pháp xác định trình tự gen từ sản...

Ngày tải lên: 28/07/2014, 02:20

... ảnh minh họa kỹ thuật giải trình tự theo phương pháp Sanger [13] Giải trình tự DNA chia làm bước lớn: PCR giải trình tự đọc trình tự máy tự động Bước 1: PCR giải trình tự Thành phần hỗn hợp phản ... nhân đoạn gen đặc hiệu với OI - Chạy điện di kiểm tra sản phẩm Bước 4: Giải trình tự sản phẩm PCR gồm bước: - Thực phản ứng PCR giải trình tự - Tinh sản phẩm PCR giải trình tự - Giải trình tự trực ... dài nucleotid Sản phẩm PCR giải trình tự điện di đọc kết máy Bước 2: Đọc trình tự máy tự động Để thực đọc trình tự máy tự động mạch DNA đơn sản sinh ống phản ứng giải trình phải đánh dấu huỳnh...

Ngày tải lên: 07/10/2014, 01:31

... đọc trình tự Tuy nhiên, với hai cặp mồi F11&R16 LM637 & LM638, cặp mồi F11&R16 không tơng đồng với trình tự NBS- LRR sau đọc trình tự đem so sánh BLAST Trình tự chúng giả thiết nh trình tự mã ... rỗng rãi cho việc đọc trình tự lúa (Sasaki cs, 1994; Yamamoro, 1997) Cho tới có khoảng 12000 ESTs vùng liệu ngân hàng gen (Tarchini 2002) 4.3 Đọc trình tự genome Trình tự genom đa đầy đủ thông ... Kết tạo 18 Website: http://www.docs.vn Email : lienhe@docs.vn Tel : 0918.775.368 đoạn oligonucleotit dài ngắn nucleotit, nhận biết đợc phơng pháp điện di Giải trình tự gen máy giải trình tự gen...

Ngày tải lên: 22/12/2014, 22:25

... 2010 Giải trình tự DNA  Mục đích: Xác định thứ tự nucleotide (A,C,G T) mạch DNA gen  Ứng dụng công nghệ sinh học: nghiên cứu, khám phá, chuẩn đoán điều tra  Vấn đề  Phương pháp giải trình tự ... Biotech, 2008 Giải trình tự gene hay gen cho nghiên cứu có liên quan Phát đột biến gene (liên quan đến ung thư, kháng thuốc), SNP (trong cá nhân hóa liệu pháp điều trị), kiểu gene (genotype virus ... ddNTP blocker Cắt periodate oligo Giải trình tự sinh tổng hợp Polony PCR Solid sequencing Tiến trình: Chuẩn bị thư viện DNA Emulsion/Wildfire PCR Giải trình tự ligation Wildfire PCR Sequencing:...

Ngày tải lên: 29/02/2016, 09:36

... Quảng Phương, Quảng Bình Quảng Xuân, Quảng Bình Quảng Đông, Quảng Bình Quảng Phương, Quảng Bình Quảng Phương, Quảng Bình Quảng Đông, Quảng Bình Quảng Đông, Quảng Bình Quảng Đông, Quảng Bình Quảng ... Đông, Quảng Bình Quảng Đông, Quảng Bình Quảng Long, Quảng Bình Quảng Phương, Quảng Bình Quảng Phương, Quảng Bình Quảng Phương, Quảng Bình Phong Nha, Quảng Bình Phong Nha, Quảng Bình Phong Nha, Quảng ... 18) Hình 18 So sánh trình tự DNA với trình tự protein nhóm Nhóm gồm trình tự chủng LPH209 với trình tự protein dài gồm 413 axit amin Trình tự protein chủng sai khác với trình tự protein Thite_72629...

Ngày tải lên: 01/07/2016, 13:02

... giải sách mẫu, kết PCR, chuỗi gen giải trình tự trình tự, kết truy cập Ngân hàng Gen Kết truy cập Ngân hàng Gen chủ yếu liệt kê xác định loài số 51 mẫu truy cập, kết sau: xác định kết cuối thống ... băng thu phân tích giám định loài ADN tinh vào ống để đưa Một số sản phẩm PCR giải trình tự giải trình tự Sau giải trình tự, chuỗi cho chuỗi nucleotid lồng nhau, không nucleotid xử lý phân tích phần ... băng để giải trình tự Sản phẩm PCR sau tinh giải trình tự trực tiếp, sử dụng mồi ITS1 Xử lý trình tự chuỗi nucleotid phần mềm chuyên biệt, bao gồm SeqEd1.03, AsemblyLIGNv1.9c hệ chương trình MacVector8.2...

Ngày tải lên: 11/10/2016, 23:49

... tự gen COI 70 trình tự 16S rRNA 128 loài thuộc họ Braconidae Trong đó, có 39 trình tự gen COI 42 trình tự 16S rRNA thuộc nhóm Microgastroid, 24 trình tự gen COI trình tự gen 16S rRNA thuộc nhóm ... liệu cụ bộ, gồm trình tự gen COI trình tự gen 16S rRNA loài ong ký sinh sở liệu GenBank (NCBI) Sau tiến hành hiệu chỉnh trình tự mục tiêu (sản phẩm giải trình tự gen COI gen 16S rRNA) để tiến hành ... Kết Blast trình tự gen 16S rRNA mẫu IS1 GenBank 64 Hình III.24 Kết Blast trình tự gen 16S rRNA mẫu IS2 GenBank 65 Hình III.25 Hiệu chỉnh vùng trình tự IS1_COI_FA sản phẩm giải trình tự IS1 67...

Ngày tải lên: 01/07/2017, 21:26

... Bình, Quảng Bình, Quảng Trị, Quảng Nam, Kon Tum, Long An Trà Vinh tồn trình triển khai Chương trình nhiều Website: http://www.docs.vn Email : lienhe@docs.vn Tel (: 0918.775.368 Chương trình 135 ... tâm CT 135 Quy chế quản lý đầu tư xây dựng quy định: song nghiệm thu bàn giao kết thúc trình đầu tư, trách nhiệm quản lý vận hành giao cho chủ đầu tư quản lý sử dụng, công trình hạ tầng CT 135 ... 0918.775.368 Chất lượng nhiều công trình hạ tầng thấp Một số địa phương để xảy vi phạm chất lượng công trình: công trình chất lượng kém, công trình không phát huy hiệu quả, hư hỏng phải sửa chữa tốn...

Ngày tải lên: 25/04/2013, 14:45