giải trình tự gen 16s arnr

... Phân tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự toàn gen HP1125 vừa giải mã so sánh với gen tương ứng chủng nước chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen tương ... Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch ... đại gen HP1125 phương pháp PCR M Thang chuẩn ADN 100 cặp bazơ Sản phẩm PCR có kích thướckhoảng 540 cặp bazo kiểm tra phương pháp điện di Kết giải trình tự Sản phẩm PCR, sau làm giải trình tự trực...

Ngày tải lên: 30/01/2013, 14:43

... Phân tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự toàn gen HP1125 vừa giải mã so sánh với gen tương ứng chủng nước chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen tương ... Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch ... đại gen HP1125 phương pháp PCR M Thang chuẩn ADN 100 cặp bazơ Sản phẩm PCR có kích thướckhoảng 540 cặp bazo kiểm tra phương pháp điện di Kết giải trình tự Sản phẩm PCR, sau làm giải trình tự trực...

Ngày tải lên: 15/03/2013, 17:19

... chương trình tin – sinh h c ng d ng nghiên c u x lý, phân tích so sánh chu i gen thu nh n - Chương trình so sánh phân tích chu i gen GeneDoc m t chương trình Nicholas Nicholas (1997) [48] l p trình ... ngu n gen 2.3.6 Gi i trình t x lý chu i gen 2.3.6.1 Gi i trình t DNA 2.3.6.2 Tinh s ch s n ph m c a ph n ng gi i trình t 2.3.6.3 Thu nh n, x lý phân tích d li u chu i gen ... c) Ghi chú: ñ dài gen h gen tính b ng bp; 5’UTR 3’UTR: ph n không mã hóa ñ u cu i h gen; Lelystad: ch ng ñ i di n dòng châu Âu (genotype I); VR-2332: ch ng ñ i di n dòng B c M (genotype II); GD*:...

Ngày tải lên: 14/12/2013, 16:10

... Các phương pháp giải trình tự gen Có phương pháp chính: Phương pháp hoá học Maxam Gilbert: phương pháp sử dụng để xác định trình tự gen không đựơc sử dụng phổ biến Phương ... phương pháp cải tiến Tạo điều kiện thuận lợi cho việc tự động hoá Giảm giá thành phản ứng Tăng tốc độ phản ứng => Nhiều trung tâm giải trình tự gen sử dụng phương pháp họ đọc hàng triệu bp ngày ... dTTP ddTTP C T A G Đoạn ADN cần giải trình tự Mồi Sequencing .CCTATGGAATGC- ống phản ứng A * * ** * phản ứng C ống * ** ống phản ứng G * * ống phản ứng T ** Phóng xạ tự ghi sợi AND đơn tổng hợp ống...

Ngày tải lên: 18/02/2014, 10:20

... Thịnh NỘI DUNG Khái niệm giải trình tự gen ý nghĩa GTTG Phương pháp giải trình tự gen: 2.1 Phương pháp Maxam – Gilbert 2.2 Phương pháp Sanger 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động So sánh phương ... giải trình tự gen tự động Bước 1: Chuẩn bị (DNA khuôn, dNTP ddNTP có gắn màu quỳnh quang, enzyme, mồi…) Bước 2: Nhân DNA PCR Bước 3: Nạp sản phẩm PCR vào máy giải trình tự gen chạy máy giải trình ... phát màu, màu ứng với nucleotide hiển thị đỉnh 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động Đọc kết 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động ABI Automated Sequencers (contd.) ABI 310 Capillary ABI...

Ngày tải lên: 06/03/2014, 05:22

... ADN đợc xử lý vào máy giải trình tự gen để đọc tự động trình tự nucleotide FliC Có thể đọc sợi đọc đồng thời hai sợi để tăng độ xác trình tự đợc đọc Kết trình giải trình tự gen FliC đợc lu máy ... paratyphi B GenBank (http: //www ncbi nlm nih gov) 27 TCNCYH phụ 32 (6) - 2004 Các gen FliC Salmonella khác đợc giải trình tự so sánh với để tìm vùng đặc trng cho loài, FliC - a gen FliC Salmonella ... loại có ngân hàng gen (GenBank, www ncbi nlm nih gov) đợc đăng ký công bố thức với số truy cập AY657000 AY657001 Sau xin giới thiệu gen FliC Salmonella paratyphi B (Hình 1) Hình Gen FliC - b Salmonella...

Ngày tải lên: 10/03/2014, 22:20

... dụng kỹ thuật PCR khuyếch đại vùng 16S – 23S rDNA ITS làm vật liệu giải trình tự gen hrpF đặc trƣng vi khuẩn gây bệnh Do hạn chế phƣơng pháp giải trình tự gen không mang lại kết Tuy nhiên, kết ... tác nhân gây bệnh đốm cải Tp HCM phƣơng pháp PCR giải trình tự vùng 16S – 23S rDNA” Đề tài phần chƣơng trình nghiên cứu bệnh vi khuẩn họ thập tự Bộ môn Bảo Vệ Thực Vật, Đại Học Nông Lâm Tp HCM ... đại vùng 16S – 23S rDNA 1: CC1, 2: CC2, 3: CC3, 4: Ladder 1,5kb, 5: HM1, 6: HM2, 7: Q12-1, 8: DC Sản phẩm PCR đƣợc tinh đọc trình tự Trình tự DNA có đƣợc so sánh với liệu ngân hàng gen để định...

Ngày tải lên: 19/03/2014, 18:20

... chủng C.perfringens giới, sử dụng chương trình Blast để tìm Ngân hàng gen quốc tế trình tự có mức tương đồng nucleotid cao với trình tự giải mã Kết blast cho hàng chục gen có trình tự tương đồng ... C.perfringens phân lập từ dê, cừu mắc bệnh viêm ruột tiêu chảy, giải trình tự gen 16S rRNA chủng phân lập Các đặc tính chủng thể bảng Bảng Đặc tính chủng C.perfringens lựa chọn giải mã 16S rRNA ... nhau, - Giữa typ A (trình tự A-CNt-58) typ D (trình tự D-DNt-135) typ C (trình tự C-DHn1) khác biệt nucleotid, hay độ tương đồng 99,8% Mức tương đồng tương tự nội typ D (giữa trình tự D-DNt-135 D-DKh1...

Ngày tải lên: 25/03/2014, 04:21

... đại vùng 16S – 23S rDNA 1: CC1, 2: CC2, 3: CC3, 4: Ladder 1,5kb, 5: HM1, 6: HM2, 7: Q12-1, 8: DC Sản phẩm PCR đƣợc tinh đọc trình tự Trình tự DNA có đƣợc so sánh với liệu ngân hàng gen để định ... họ thập tự Cụ thể mở rộng địa bàn (Đồng Bằng Sông Cửu Long, Lâm Đồng, Long An tỉnh có canh tác rau), nghiên cứu phổ kí chủ rộng (cây họ thập tự) Hoàn thành đề tài mức giải trình tự vùng 16S – 23S ... pháp PCR khuếch đại vùng 16S – 23S rDNA có kích thƣớc 1,1 kb sử dụng cặp primer Xan1330 Xan322 làm vật liệu giải trình tự Thực phản ứng với thành phần nêu Bảng 3.1 theo chu trình nhiệt Bảng 3.2 Phƣơng...

Ngày tải lên: 28/07/2014, 02:20

... Khuếch đại vùng 16S – 23S rDNA ITS vi khuẩn Phản ứng tiến hành với cặp mồi không chuyên biệt đƣợc thiết kế nhằm khuếch đại trình tự vùng ITS (intergenic spacer sequence) nằm vùng rDNA 16S 23S (Goncalves ... sequencer 3.5.7.4 Quy trình tóm tắt bƣớc đọc trình tự Sản phẩm PCR GFX PCR DNA and gel band Purification kit Tinh Chu kỳ nhiệt: Hóa chất: BDT mix Buffer 950C/5 phút Phản ứng đọc trình tự 950C/30 giây ... ứng phòng vệ kí chủ, thể hoại tử mô bị nhiễm (Klement, 1982) Tổ hợp gen bao gồm 21 gen gen điều tiết hrpX, hrpG nằm bên Các gen hrp mã hóa protein hrp Các protein thành phần hệ thống phóng tiết...

Ngày tải lên: 28/07/2014, 02:20

... dụng kỹ thuật PCR khuyếch đại vùng 16S – 23S rDNA ITS làm vật liệu giải trình tự gen hrpF đặc trƣng vi khuẩn gây bệnh Do hạn chế phƣơng pháp giải trình tự gen không mang lại kết Tuy nhiên, kết ... tác nhân gây bệnh đốm cải Tp HCM phƣơng pháp PCR giải trình tự vùng 16S – 23S rDNA” Đề tài phần chƣơng trình nghiên cứu bệnh vi khuẩn họ thập tự Bộ môn Bảo Vệ Thực Vật, Đại Học Nông Lâm Tp HCM ... 12 2.3 Vùng ITS (rDNA intergenic spacer) gen hrpF (hypersensitive reaction and pathogenicity) 13 2.3.1 Gen hrpF (hypersensitive reaction and pathogenicity) 13 iii 2.3.2 Ribosome...

Ngày tải lên: 28/07/2014, 02:20

... ảnh minh họa kỹ thuật giải trình tự theo phương pháp Sanger [13] Giải trình tự DNA chia làm bước lớn: PCR giải trình tự đọc trình tự máy tự động Bước 1: PCR giải trình tự Thành phần hỗn hợp phản ... nhân đoạn gen đặc hiệu với OI - Chạy điện di kiểm tra sản phẩm Bước 4: Giải trình tự sản phẩm PCR gồm bước: - Thực phản ứng PCR giải trình tự - Tinh sản phẩm PCR giải trình tự - Giải trình tự trực ... dài nucleotid Sản phẩm PCR giải trình tự điện di đọc kết máy Bước 2: Đọc trình tự máy tự động Để thực đọc trình tự máy tự động mạch DNA đơn sản sinh ống phản ứng giải trình phải đánh dấu huỳnh...

Ngày tải lên: 07/10/2014, 01:31

... 2010 Giải trình tự DNA  Mục đích: Xác định thứ tự nucleotide (A,C,G T) mạch DNA gen  Ứng dụng công nghệ sinh học: nghiên cứu, khám phá, chuẩn đoán điều tra  Vấn đề  Phương pháp giải trình tự ... Biotech, 2008 Giải trình tự gene hay gen cho nghiên cứu có liên quan Phát đột biến gene (liên quan đến ung thư, kháng thuốc), SNP (trong cá nhân hóa liệu pháp điều trị), kiểu gene (genotype virus ... ddNTP blocker Cắt periodate oligo Giải trình tự sinh tổng hợp Polony PCR Solid sequencing Tiến trình: Chuẩn bị thư viện DNA Emulsion/Wildfire PCR Giải trình tự ligation Wildfire PCR Sequencing:...

Ngày tải lên: 29/02/2016, 09:36

... 18) Hình 18 So sánh trình tự DNA với trình tự protein nhóm Nhóm gồm trình tự chủng LPH209 với trình tự protein dài gồm 413 axit amin Trình tự protein chủng sai khác với trình tự protein Thite_72629 ... gồm 16 axit amin trình tự protein (Hình 15) Mặc dù sai khác trình tự DNA, trình tự protein hay vị trí intron, exon chủng lớn trình tự peptide tín hiệu giống giống với trình tự Thielavia terrestris ... So sánh trình tự DNA với trình tự protein nhóm Nhóm có trình tự khác biệt lớn với trình tự ThCEL 72629 (khoảng 5%) đặc biệt 21 axit amin cuối từ axit amin 370 đến 391 Nguyên nhân trình tự Thite_72629...

Ngày tải lên: 01/07/2016, 13:02

... băng để giải trình tự Sản phẩm PCR sau tinh giải trình tự trực tiếp, sử dụng mồi ITS1 Xử lý trình tự chuỗi nucleotid phần mềm chuyên biệt, bao gồm SeqEd1.03, AsemblyLIGNv1.9c hệ chương trình MacVector8.2 ... băng thu phân tích giám định loài ADN tinh vào ống để đưa Một số sản phẩm PCR giải trình tự giải trình tự Sau giải trình tự, chuỗi cho chuỗi nucleotid lồng nhau, không nucleotid xử lý phân tích phần ... phân biệt để thu clon riêng giải sách mẫu, kết PCR, chuỗi gen giải trình tự trình tự, kết truy cập Ngân hàng Gen Kết truy cập Ngân hàng Gen chủ yếu liệt kê xác định loài số 51 mẫu truy cập, kết...

Ngày tải lên: 11/10/2016, 23:49

... pGEM -3Z mang gen novS 2.2.7 Giải trình tự gen Để giải trình tự gen ta tiến hành tách plasmid tái tổ hợp pGEMnovS tế bào vi khuẩn E.coli XL1 Blue biến nạp trên, sau gửi giải trình tự 2.2.8 Tạo ... 12: 10a So sánh trình tự axit amin gen novS với gen mã số AAF67512.1 10b So sánh trình tự axit amin gen novS với gen mã số AAN65241.1 10c So sánh trình tự axit amin gen novS với gen mã số AAG29801.1 ... Nghiệp K13 Viện Đại Học Mở Hà Nội 3.1.3 Kết xác định trình tự đoạn gen NovS Đoạn gen novS plasmid pGEM -3Z đuợc giải trình tự Kết giải trình tự gen novS sau: ATTGGAGCTCACCGCGGTGGCGGCCGCTCTAGAACTAGTGGATCCCCCGGGCTGCAG...

Ngày tải lên: 25/12/2013, 12:42

... bị giải trình tự hệ Roche 01 máy khối phổ để phân tích cấu trúc chức protein Thiết bị giải trình tự Roche giải trình tự đoạn DNA có kích thước đến 800 nucleotide Ngoài mục tiêu giải trình tự ... 10/1998 Trình tự DNA 95% vùng chứa gen 99% vùng chứa gen Tháng 4/2003 trình tự gen người trình tự gen người hoàn thành với độ hoàn thành với độ xác tới 99,99% xác 99,99% Công suất giá 500 Mb trình tự/ ... Để tìm trình tự hệ gen hoàn chỉnh người với hệ thống giải trình tự tại, cần phải giải trình tự DNA người tương đương với khoảng 30 lần (30X) Nếu trình tự thực trung bình lần dọc theo hệ gen (1X)...

Ngày tải lên: 20/04/2014, 13:32

... pháp giải trình tự chuỗi xem có nhiều ưu điểm bật bên cạnh việc xác định trình tự chuỗi Nucleotids gen HBV để từ so sánh với thư viện gen xác định HBV genotypes mà dựa vào kết giải trình tự xác ... Việc xác định thứ tự Nu gắn kết với dọc theo chiều dài gen (DNA) gọi việc giải trình tự chuỗi (Sequencing), trình tự gắn kết Nu gọi trình tự chuỗi (Sequence) Cấu tạo gen HBV HBV có gen phân tử DNA, ... Khi điện di gel có độ ly giải cao ta có trình tự Nu, dựa vào phần mềm máy cho trình tự chuỗi DNA HBV So sánh thư viện gen máy tính se cho ta biết kiểu gen vi rút kiểu gen đột biến công bố HBV...

Ngày tải lên: 22/07/2014, 07:21

... phân loại HBV genotypes cần dựa trình tự chuỗi (sequence) đoạn gen HBV phần trình tự chuỗi gen pre-S; S Có nhiều phương pháp nghiên cứu dùng việc xác định HBV genotypes giải trình tự chuỗi (sequencing), ... pháp giải trình tự chuỗi xem có nhiều ưu điểm bật bên cạnh việc xác định trình tự chuỗi Nucleotids gen HBV để từ so sánh với thư viện gen xác định HBV genotypes mà dựa vào kết giải trình tự xác ... xác định thứ tự Nu gắn kết với dọc theo chiều dài gen (DNA) gọi việc giải trình tự chuỗi (Sequencing), trình tự gắn kết Nu gọi trình tự chuỗi (Sequence) 2, CẤU TẠO BỘ GEN HBV: HBV có gen phân tử...

Ngày tải lên: 27/07/2014, 10:21