giải mã trình tự gen

... PCR tinh giải trình tự MACROGEN Phân tích trình tự gen chương trình Seqman DNASTAR Kiểm tra trình tự chương trình ClustalX (Thompson et al, 1997) Nhận dạng trình tự tính toán chương trình BioEdit ... rút vàng xoăn Trình tự đoạn gen CP giải mã từ sản phẩm PCR TYLCV mẫu cà chua thu huyện Đơn Dương tỉnh Lâm Đồng sau: Bảng So sánh tính đồng hai đoạn trình tự phiên mã xuôi /ngược gen CP vi vi rút ... trình tự đoạn gen CP từ sản phẩm PCR tinh mang gen vi rút gây bệnh TYLCV ly trích từ mẫu cà chua huyện Đức Trọng, tỉnh Lâm Đồng sau: Bảng So sánh tính đồng hai đoạn trình tự phiên mã xuôi /ngược gen...

Ngày tải lên: 18/05/2015, 10:01

... sánh trình tự gen Phân tích trình tự nucleotide gen thu được: So sánh trình tự thu đƣợc với trình tự gen BLAST NCBI để xác nhận gen tách dòng đƣợc đoạn gen quan tâm Sau so sánh trình tự gen tỉnh ... giải trình tự Số hóa trung tâm học liệu http://www.lrc.tnu.edu.vn/ Comment [SCD15]: plasmid 33 2.2.10 Xác định trình tự so sánh trình tự gen thu đƣợc với trình tự tƣơng ứng GenBank Xác định trình ... 2.2.10 Xác định trình tự so sánh trình tự gen thu đƣợc với trình tự tƣơng ứng GenBank 33 CHƢƠNG III: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 35 3.1 KẾT QUẢ TÁCH DÒNG GEN VÀ XÁC ĐỊNH TRÌNH TỰ NUCLEOTIDE...

Ngày tải lên: 19/11/2014, 19:46

... vi khuẩn giải mã máy giải mã trình tự tự động Để đảm bảo nucleotit hệ gen giải mã, người ta phải tiến hành giải mã riêng rẽ khoảng triệu phân đoạn ADN khác Với kích thước phân đoạn giải mã xác ... thành trình tự phân đoạn ADN ngắn cuối có trình tự liên tục nhất, gọi contig Kỹ thuật giải mã trình tự kiểu shotgun cho phép ”ráp nối” phần hệ gen lớn Như trình bày việc giải mã đoạn trình tự ADN ... phân đoạn ADN tái tổ hợp riêng rẽ giải mã trình tự riêng rẽ máy giải mã trình tự tự động sử dụng phương pháp ddNTP Phương pháp gọi phương pháp giải mã trình tự kiểu ”shotgun” (bắn ngẫu nhiên)...

Ngày tải lên: 24/10/2013, 12:15

... vi khuẩn giải mã máy giải mã trình tự tự động Để đảm bảo nucleotit hệ gen giải mã, người ta phải tiến hành giải mã riêng rẽ khoảng triệu phân đoạn ADN khác Với kích thước phân đoạn giải mã xác ... thành trình tự phân đoạn ADN ngắn cuối có trình tự liên tục nhất, gọi contig Kỹ thuật giải mã trình tự kiểu shotgun cho phép ”ráp nối” phần hệ gen lớn Như trình bày việc giải mã đoạn trình tự ADN ... phân đoạn ADN tái tổ hợp riêng rẽ giải mã trình tự riêng rẽ máy giải mã trình tự tự động sử dụng phương pháp ddNTP Phương pháp gọi phương pháp giải mã trình tự kiểu ”shotgun” (bắn ngẫu nhiên)...

Ngày tải lên: 25/03/2014, 22:20

... vi khuẩn giải mã máy giải mã trình tự tự động Để đảm bảo nucleotit hệ gen giải mã, người ta phải tiến hành giải mã riêng rẽ khoảng triệu phân đoạn ADN khác Với kích thước phân đoạn giải mã xác ... thành trình tự phân đoạn ADN ngắn cuối có trình tự liên tục nhất, gọi contig Kỹ thuật giải mã trình tự kiểu shotgun cho phép ”ráp nối” phần hệ gen lớn Như trình bày việc giải mã đoạn trình tự ADN ... trích từ trình tự cADN biết Các trình tự cADN ngẫu nhiên (có thể trình tự đầy đủ hay trình tự phần EST) xác định sử dụng phương pháp giải mã trình tự ngẫu nhiên đối chiếu với đoạn khung hệ gen Các...

Ngày tải lên: 12/07/2014, 04:21

... Phân tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự toàn gen HP1125 vừa giải mã so sánh với gen tương ứng chủng nước chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen tương ... tiếp không qua giai đoạn tạo dòng phân tử Kết trình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số mã AY513613 Hình Trình tự nucleotide gen HP1125(A) thành phần protein tương ứng (B) ... Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch...

Ngày tải lên: 30/01/2013, 14:43

... Phân tích gen mức độ ADN protein A) Ở mức độ ADN Trình tự toàn gen HP1125 vừa giải mã so sánh với gen tương ứng chủng nước chương trình Blast Nhìn chung, gen Việt nam có tương đồng cao với gen tương ... tiếp không qua giai đoạn tạo dòng phân tử Kết trình bầy hình A B Gen HP1125 Việt Nam đệ trình vào quĩ gen có số mã AY513613 Hình Trình tự nucleotide gen HP1125(A) thành phần protein tương ứng (B) ... Hultman (6a) Phân tích trình tự đoạn ADN: Chương trình Blast trang Web sử dụng để phân tích trình tự protein cuar gen KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN Khuếch đại gen HP1125 phương pháp PCR Toàn gen HP1125 khuyếch...

Ngày tải lên: 15/03/2013, 17:19

... 18) Hình 18 So sánh trình tự DNA với trình tự protein nhóm Nhóm gồm trình tự chủng LPH209 với trình tự protein dài gồm 413 axit amin Trình tự protein chủng sai khác với trình tự protein Thite_72629 ... Khóa luận tốt nghiệp vực gen, nhiều gen mã hóa cho cellulase nhân dòng giải trình tự DNA Một số gen mã hóa cho cellulase có trình tự khác biệt chứng tỏ đa dạng cellulase tự nhiên Các họ cellulase ... gồm 16 axit amin trình tự protein (Hình 15) Mặc dù sai khác trình tự DNA, trình tự protein hay vị trí intron, exon chủng lớn trình tự peptide tín hiệu giống giống với trình tự Thielavia terrestris...

Ngày tải lên: 01/07/2016, 13:02

... tìm trình tự chung hai 39 trình tự gene tổng hợp từ hai mồi để nối ghép thành trình tự gene hoàn chỉnh 3.4.9 So sánh trình tự DNA ngân hàng gene NCBI Gene fcs sau giải trình tự so sánh với trình ... -fcs Giải trình tự So sánh, phân tích trình tự gene 33 3.4.1 Khuếch đại đoạn DNA phương pháp PCR - Phản ứng PCR Thực phản ứng PCR nhân gene fcs với cặp mồi thiết kế đặc hiệu với trình tự gene ... cạnh sai khác nhỏ hệ gene phần lớn chúng có tương đồng trình tự gene Do để khuếch đại gene fcs từ chủng Amycolatopsis sp HR104, sử dụng cặp mồi thiết kế dựa trình tự gene gene fcs từ chủng Amycolatopsis...

Ngày tải lên: 31/10/2016, 14:22

... sánh gene giải trình tự gene công bố Gen bank Query: Trình tự gene aprE sau giải trình tự Sbjct: Trình tự gene aprE mã số AB 734700 từ Gen bank 999 1059 780 1119 37 Kết so sánh cho thấy, hai gene ... 3: Xác định trình tự gene aprE tách dòng - Giải trình tự gene aprE tách dòng máy giải trình tự tự động Applied Biosystems - So sánh thành phần thiết yếu trình tự gene aprE giải trình tự với thiết ... dịch mã đoạn gene giải trình tự - So sánh trình tự gene aprE tách dòng với trình tự công bố ngân hàng gene NCBI (Gene bank) thông qua chƣơng trình Blast 18 3.4 Phƣơng pháp nghiên cứu 3.4.1 Quy trình...

Ngày tải lên: 23/11/2016, 08:52

... sánh trình tự gen thu đợc Các bớc tiến hành nh sau: + So sánh trình tự gen đợc đọc từ hai đầu xuôi đầu ngợc để xác định trình tự đầy đủ gen + Xác định đợc vị trí, số lợng enzym hạn chế trình tự ... + Giải mã trình tự nucleotit sang trình tự axit amin theo khung đọc mở, xác định vị trí mở đầu kết thúc dịch mã + Lập phân loại bảng hệ số đồng dạng so sánh mức độ tơng đồng di truyền trình tự ... đoạn gen 16 trình tự gen Nib đợc khai thác NCBI Các trình tự đợc so sánh với nhờ chơng trình phần mềm DNAstar Với mục đích sử dụng cặp mồi nhân đợc nhiều dòng virus khác nhau, chọn vùng trình tự...

Ngày tải lên: 30/10/2012, 15:03

... chương trình tin – sinh h c ng d ng nghiên c u x lý, phân tích so sánh chu i gen thu nh n - Chương trình so sánh phân tích chu i gen GeneDoc m t chương trình Nicholas Nicholas (1997) [48] l p trình ... c) Ghi chú: ñ dài gen h gen tính b ng bp; 5’UTR 3’UTR: ph n không mã hóa ñ u cu i h gen; Lelystad: ch ng ñ i di n dòng châu Âu (genotype I); VR-2332: ch ng ñ i di n dòng B c M (genotype II); GD*: ... ngu n gen 2.3.6 Gi i trình t x lý chu i gen 2.3.6.1 Gi i trình t DNA 2.3.6.2 Tinh s ch s n ph m c a ph n ng gi i trình t 2.3.6.3 Thu nh n, x lý phân tích d li u chu i gen...

Ngày tải lên: 14/12/2013, 16:10

... Các phương pháp giải trình tự gen Có phương pháp chính: Phương pháp hoá học Maxam Gilbert: phương pháp sử dụng để xác định trình tự gen không đựơc sử dụng phổ biến Phương ... phương pháp cải tiến Tạo điều kiện thuận lợi cho việc tự động hoá Giảm giá thành phản ứng Tăng tốc độ phản ứng => Nhiều trung tâm giải trình tự gen sử dụng phương pháp họ đọc hàng triệu bp ngày ... dTTP ddTTP C T A G Đoạn ADN cần giải trình tự Mồi Sequencing .CCTATGGAATGC- ống phản ứng A * * ** * phản ứng C ống * ** ống phản ứng G * * ống phản ứng T ** Phóng xạ tự ghi sợi AND đơn tổng hợp ống...

Ngày tải lên: 18/02/2014, 10:20

... Thịnh NỘI DUNG Khái niệm giải trình tự gen ý nghĩa GTTG Phương pháp giải trình tự gen: 2.1 Phương pháp Maxam – Gilbert 2.2 Phương pháp Sanger 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động So sánh phương ... giải trình tự gen tự động Bước 1: Chuẩn bị (DNA khuôn, dNTP ddNTP có gắn màu quỳnh quang, enzyme, mồi…) Bước 2: Nhân DNA PCR Bước 3: Nạp sản phẩm PCR vào máy giải trình tự gen chạy máy giải trình ... phát màu, màu ứng với nucleotide hiển thị đỉnh 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động Đọc kết 2.3 Phương pháp giải trình tự gen tự động ABI Automated Sequencers (contd.) ABI 310 Capillary ABI...

Ngày tải lên: 06/03/2014, 05:22

... ADN đợc xử lý vào máy giải trình tự gen để đọc tự động trình tự nucleotide FliC Có thể đọc sợi đọc đồng thời hai sợi để tăng độ xác trình tự đợc đọc Kết trình giải trình tự gen FliC đợc lu máy ... paratyphi B GenBank (http: //www ncbi nlm nih gov) 27 TCNCYH phụ 32 (6) - 2004 Các gen FliC Salmonella khác đợc giải trình tự so sánh với để tìm vùng đặc trng cho loài, FliC - a gen FliC Salmonella ... loại có ngân hàng gen (GenBank, www ncbi nlm nih gov) đợc đăng ký công bố thức với số truy cập AY657000 AY657001 Sau xin giới thiệu gen FliC Salmonella paratyphi B (Hình 1) Hình Gen FliC - b Salmonella...

Ngày tải lên: 10/03/2014, 22:20

Ngày tải lên: 20/03/2014, 11:20

... bước đầu giải trình tự gene virus cúm gia cầm subtype H5N1 tỉnh Cà Mau Sóc Trăng” nhằm đạt mục tiêu khảo sát lưu hành virus cúm gia cầm tỉnh Cà Mau Sóc Trăng, bước đầu nghiên cứu trình tự gene HA ... chiết xuất RNA Qiagen Kit thu nhận toàn gene H5 N1 phương pháp RT-PCR, tách dòng giải trình trình tự, phân tích thu nhận chuỗi Tạp chí Khoa học 2011:20a 7-17 Trường Đại học Cần Thơ gene H5 thu Các ... 98% chuỗi gene H5 92 - 99% thành phần nucleotide, 91 - 99% amino acid chuỗi gene N1 so sánh với chủng phân lập Việt Nam trước số nước Châu Á Trình tự gene H5 N1 biến đổi lớn trình tự nucleotide...

Ngày tải lên: 25/03/2014, 07:22

... Brenner tờ Nature 449 ông cổ vũ cho dự án giải mã trình tự genome James Watson Viện J Craig Venter Nhóm tác giả cho việc thu thập nhiều tốt trình tự gene tỏ quan trọng cảnh báo khác mà người ... sức vào giải mã trình tự gene theo đề xuất Brenner phí phạm vô nghĩa không tính đến nhân tố ngoại cảnh Điều không vấn đề hàn lâm lý thuyết Ngày nhiều nhà khoa học tập trung vào dự án genome Quỹ ... phần thưởng X công bố trao 10 triệu USD cho nhóm giải mã xác 100 genome người 10 ngày Liệu người trúng giải hiểu khám phá khoa học đằng sau trình tự lại vấn đề hoàn toàn độc lập? ...

Ngày tải lên: 07/07/2014, 09:20

... ảnh minh họa kỹ thuật giải trình tự theo phương pháp Sanger [13] Giải trình tự DNA chia làm bước lớn: PCR giải trình tự đọc trình tự máy tự động Bước 1: PCR giải trình tự Thành phần hỗn hợp phản ... nhân đoạn gen đặc hiệu với OI - Chạy điện di kiểm tra sản phẩm Bước 4: Giải trình tự sản phẩm PCR gồm bước: - Thực phản ứng PCR giải trình tự - Tinh sản phẩm PCR giải trình tự - Giải trình tự trực ... dài nucleotid Sản phẩm PCR giải trình tự điện di đọc kết máy Bước 2: Đọc trình tự máy tự động Để thực đọc trình tự máy tự động mạch DNA đơn sản sinh ống phản ứng giải trình phải đánh dấu huỳnh...

Ngày tải lên: 07/10/2014, 01:31

... cú ti hn 300 gen ó c tỏch dũng v ng kớ trờn ngõn hng d liu gen (Gene Database) [7] 1.2.6.4 c im riờng ca mt s nhúm gen v c t ca chỳng Nhúm gen cry1: gm trờn 130 gen thuc cỏc nhúm gen cry1A-cry1L ... cỏc bn ca gen hoc trỡnh t DNA cn thit Tỏch dũng gen cũn c gi l phõn lp gen, cú nhiu phng phỏp tỏch dũng gen khỏc Tỏch dũng invitro (in vitro gene cloning), tỏch dũng silico (in silico gene cloning) ... tng hp Gen ny khụng xp vo h gen cry vỡ khụng sinh tinh th S húa bi Trung tõm Hc liu i hc Thỏi Nguyờn http://www.lrc-tnu.edu.vn 16 1.2.6.5 c im v gen cry1Ab, cry1Ac Gen cry1Ab kớch thc gen 3468...

Ngày tải lên: 07/10/2014, 09:14