Analyse des mesures en continu de la température interne chez le porc recherché de prédicteurs des réponses des animaux face à un stress thermique

UNIVERSITẫ NATIONALE DU VIETNAM, HANOăI INSTITUT FRANCOPHONE INTERNATIONAL Emmanuel GNOFAM Analyse des mesures en continu de la température interne chez le porc : recherche de prédicteurs des réponses des animaux face un stress thermique Phân tích phép đo liên tục nhiệt độ bên lợn : tìm kiếm mơ hình dự đốn phản ứng động vật ứng suất nhiệt MÉMOIRE DE FIN D’ÉTUDES DU MASTER INFORMATIQUE Sous la direction de : M David RENAUDEAU HANOI – 2020 Emmanuel GNOFAM Analyse des mesures en continu de la température interne chez le porc : recherche de prédicteurs des réponses des animaux face un stress thermique Phân tích phép đo liên tục nhiệt độ bên lợn : tìm kiếm mơ hình dự đoán phản ứng động vật ứng suất nhiệt MÉMOIRE DE FIN D’ÉTUDES DU MASTER INFORMATIQUE Sous la direction de : M David RENAUDEAU HANOI – 2020 Attestation sur l’honneur J’atteste sur l’honneur que ce mémoire a été réalisé par moi-même et que les données et les résultats qui y sont présentés sont exacts et n’ont jamais été publiés ailleurs La source des informations citées dans ce mémoire a bien été précisée Signature de l’étudiant Emmanuel GNOFAM Dédicaces ♥ A mes très chers parents Autant de phrases et d’expressions aussi éloquentes soient-elles ne sauraient exprimer ma gratitude et ma reconnaissance Vous avez toujours été présents mes côtés pour me soutenir,m’encourager, me conseiller et m’orienter au bon chemin Que DIEU le tout puissant vous préserve, vous accorde santé, bonheur, quiétude de l’esprit et vous protège de tout mal ♥ A mes très chères familles Vous n’avez jamais cessé de me réconforter, de m’aider et de me diriger ♥ A tous mes professeurs C’est une grande fierté pour moi d’être votre étudiant En témoignage de mon respect et de ma grande affection ♥ A mon encadrant de stage Je voudrais vous adresser ma gratitude, mes sincères reconnaissances pour tout ce que vous aviez fait pour moi durant mon stage.Votre patience, votre disponibilité et surtout la confiance que vous avez porté mon égard m’a beaucoup aidé dans l’avancement de mes travaux En trois mots, je dirai : vous m’aviez formé ♥ A tous mes amis J’ai l’honneur d’avoir des amis si gentils, fidèles, sincères et qui n’ont jamais hésité de partager avec moi mes soucis, mon malheur et mon bonheur ♥ Je dédie ce travail i Remerciements Il m’a été très difficile de rédiger cette partie par souci d’oublier les personnes qui m’ont été très chères Je tiens exprimer dans un premier temps mes profondes gratitudes Dieu qui m’a donné la santé, la force et le courage de pouvoir réaliser ce document Aussi, mes remerciements vont : • Nos parents M GNOFAM N Bilighan et Mlle ALI BOUAI Afoua pour leurs conseils, leur soutien moral, financier et spirituel ; • Monsieur Ngơ Tu Lap, Docteur et Directeur de l’Institut Francophone International (IFI), pour sa foi en ce centre et les efforts qu’il y déploie ; • Monsieur Ho Tưong Vinh, Enseignant chercheur et Directeur Adjoint et Responsable des Etudes du Master Systèmes Intélligents et Multimédia IFI, pour sa foi en ce centre et efforts qu’il y déploie ; • Monsieur Nguyen Hong Quang, Enseignant chercheur et Responsable du Etudes du Master Réseaux et Systèmes communicants d’IFI, pour sa foi en ce centre et efforts qu’il y déploie ; • Madame Florence Gondret, Directrice de l’INRA Saint Gilles pour sa foi en cet Institut et efforts qu’il y déploie ; • Monsieur David RENAUDEAU, Docteur et Responsable d’équipe "Alimentation et Nutrition" pour les efforts qu’il y déploie ; • Tout le personnel Enseignant, Administratif et Technique de l’IFI pour leur disponibilité et soutien durant notre période de formation ; • Tous nos camarades de l’Institut Francophone International Je réalise chaque jour que c’est une chance de partager ma vie avec des gens aussi formidables, qui m’ont tous aidés, parfois même de manière inconsciente, franchir les différentes étapes jusqu’à aujourd’hui ii iii Résumé Le stage est une période de concrétisation des acquis et des connaissances requises pendant des années de formation Il reste un facteur essentiel qui contribue l’amélioration et au développement de la personnalité du stagiaire Aussi, lui permet-il de devenir un praticien après avoir été un théoricien Dans ce sens, j’ai effectué mon stage de mémoire pour l’obtention du diplôme de master recherche en systèmes intelligents et multimédia au sein de INRA (Institut National de la Recherche Agronomique ) Le présent document est le fruit d’une expérience de mois au sein de l’INRA dont la thématique porte sur : l’analyse des mesures en continu de la température interne chez le porc : recherche de prédicteurs des réponses des animaux face un stress thermique Après une brève étude sur l’analyse mathématique des rythmes nycthéméraux de la température corporelle du porc, j’ai choisi l’équation mathématique utiliser pour construire le modèle Pour cela, j’ai utilisé un modèle mixte contenant la régression non linéaire et les modèles cosinor une, deux , trois et quatre composantes Après l’ajustement du modèle mixte sur un animal, j’ai retenu le meilleur modèle (cosinor composantes + nls) pour le reste des animaux Pour la validation du modèle, j’ai utilisé le RSS "Residual Sum Square" comme méthode de validation Pour terminer, j’ai regardé sur les paramètres du modèle, l’impact du facteur sexe et l’influence de ces paramètres sur la réponse de l’animal par la technique de l’analyse de la sensitivité iv Abstract The internship is a period of realization of the acquired knowledge and skills required during years of training It remains an essential factor that contributes to the improvement and development of the trainee’s personality It therefore allows him to become a practitioner after having been a theorist In this sense, I completed my thesis internship for the master’s degree in research in intelligent systems and multimedia at INRA (Institut National de la Recherche Agronomique) This document is the result of a months experience at INRA whose theme is : Analysis of continuous measurements of internal temperature in pigs : search for predictors of animal responses to heat stress After a brief study on the mathematical analysis of the nycthemeral rhythms of pig body temperature, I choose the mathematical equation which i use to construct the model To this, I used a mixed model containing non-linear regression and cosine models with one, two, three and four components on a single animal After adjusting the mixed model to an animal, I choose the best model for the rest of the animals For the validation of the model, I used the validation method : the RSS "Residual Sum Square" Finally, I looked on the parameters of the model, the impact of the gender factor and the influence of these parameters on the animal’s response using the sensitivity analysis technique v vi Table des matières I Introduction générale 1.1 Contexte 1.2 Problématique 1.3 Objectifs 1.4 Plan Présentation de l’IFI et de l’INRA Introduction Présentation du cadre d’étude : IFI 2.1 Objectifs 2.2 Conditions d’accès et mode de recrutement 2.3 Organigramme de l’IFI 2.4 Formation 2.4.1 Parcours systèmes intelligents et multimédia 2.4.2 Parcours systèmes et réseaux communicants 2.4.3 Master en Banque, Finance et Fintech 2.4.4 Master en Information - Communication, Spécialité Communi- cation digitale et éditoriale Présentation du cadre de stage : INRA 3.1 Objectifs 3.2 Organisation de PEGASE 3.3 Syslait – Les systèmes laitiers 3.4 Sysporc – Le porc dans les systèmes d’élevage 3.5 Lactation – Physiologie de la lactation 3.6 Adaptation – Physiologie de l’adaptation, nutrition et santé 3.7 Croissance – Physiologie de la croissance et qualité des produit 3.8 GG – Génétique et génomique 3.9 Alinut – Alimentation et nutrition Conclusion II Etat de l’art Introduction 10 Procédures d’analyses des rythmes nycthéméraux 10 vii ph2=-117.785,pe3=8,A4=0.05,ph5=-85.832,pe6=24, A7=0.05,ph9=85.832,pe8=12,A10=0.05,ph12=-38.294,pe11=6) ###################### Work on one animal whose id is 3343 ###################### #hour# one_Animal