Xác định sự hiện diện của các gen avirulence trên các mẫu nấm gây bệnh đạo ôn lúa Magnaporthe oryzae ở vùng đồng bằng sông Cửu Long

Bài viết xác định sự hiện diện và phân bố của các nhóm gen Avirulence trên các mẫu nấm gây bệnh đạo ôn M. oryzae trên các giống lúa được trồng phổ biến tại đồng bằng sông Cửu Long. Mời các bạn cùng tham khảo bài viết để nắm chi tiết nội dung nghiên cứu.

Kết nghiên cứu khoa học BVTV - Sè 5/2018 IPCC, 2009 https://www.ipcc.ch/report/ar5/ 10 Kalode, MB, 1976 Brown plant-hopper in rice and its control Journal Indian Farming, 27 (5):3-5 11 MONRE, 2012 Kịch biến đổi khí hậu nước biển dâng cho Việt Nam Bộ Tài nguyên Môi trường 12 Pielow E.C, 1977 Mathematical ecology, John Wileyson, New York, p 385 13 Prasannakumar NR, Subhash C, Madan PS, 2012 Assessment of Impact of climate change with reference to elevated CO2 on rice brown plant hopper, Nilaparvata lugens (Stal) and crop yield Journal of Current science 103(10):1201-1205 14 Rao YC, Li YY, Qian Q Recent progress on molecular breeding of rice in China Plant Cell Rep 2014;33:551–564 15 Zeng Yunyun, Wenkun H, Li S, 2012 Effects of elevated CO2 on the nutrient compositions and enzymes activities of Nilaparvata lugens nymphs fed on rice plants Journal of Science China Life sciences 55(10):920-6 Phản biện: TS Đào Thị Hằng XÁC ĐỊNH SỰ HIỆN DIỆN CỦA CÁC GEN AVIRULENCE TRÊN CÁC MẪU NẤM GÂY BỆNH ĐẠO ƠN LƯA Magnaporthe oryzae Ở VÙNG ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG Determining the Presence of Avirulence Genes from Rice Blast Fungus Samples of Magnaporthe oryzae in the Mekong River Delta, Viet Nam Nguyễn Thị Hiền , Nguyễn Bảo Quốc Ngày nhận bài: 24.08.2018 Ngày chấp nhận: 17.09.2018 Abstract Blast disease caused by Magnaporthe oryzae is one of the most devastating diseases of rice worldwide One of the most effective control strategies to this disease is against recognized AVR genes following the “gene for gene concept” As the result, evaluation of AVR genes distribution and diversification in M oryzae population has an important role in understanding gene for gene interaction to find solution for rice blast control The screening results of 20 fungal isolates showed that AVR- Pik, ACE1- at, ACE1- ks were present on the most of isolated samples; and AVR-Pia, AVR-Pii, AVR-PWL2 had lowest appearance The resuls shoewd that the distribution of Avirulence genes on M oryzae in the Mekong River Delta provinces indicated that the distribution of the AVR gene group was most diverse in Tien Giang province, especially on Nang hoa rice cultivar with 6/7 AVR (ACE1at, ACE1- ks, Pik, Pita, Pia Pii) This result plays a very important role in understanding the diversity of AVR genes that can facilitate the breeding and selection of blast disease resistant rice varieties and effective measures to control the rice blast disease Keywords: Rice blast disease, Magnaporthe oryzae, AVR distribution, Mekong River Delta, Viet Nam ĐẶT VẤN ĐỀ * Bệnh đạo ơn bệnh hại có ý nghĩa kinh tế lớn nước trồng lúa giới Việt Nam Bệnh nấm Magnaporthe oryzae gây (Dai et al., 2010) Bệnh xuất lá, đốt thân, cổ phần khác bông, hạt gây hại tất giai đoạn sinh Viện Bảo vệ thực vật; Học viên cao học Trường Đại học Nông Lâm Thành phố Hồ Chí Minh2 Trường Đại học Nơng Lâm Thành phố Hồ Chí Minh trưởng lúa Mức độ phát sinh, gây hại nấm gây bệnh đạo ôn M oryzae phân bố gen Avirulence phụ thuộc vào điều kiện sinh thái, cấu giống, chế độ canh tác vùng điều kiện thời tiết khí hậu Triệu chứng bệnh có biểu sau bị lây nhi m nấm gây bệnh đạo ôn M oryzae với điều kiện trì tình trạng ướt 20 liên tục (Asai et al., 1967) Theo kết nghiên cứu Kuribayashi et al (1952), ẩm độ khơng khí 90% kéo dài điều kiện thích hợp cho phát tán bào tử nấm Những nghiên cứu đa dạng chủng 51 BVTV - Sè 5/2018 Kết nghiên cứu khoa học đạo ôn từ loại mầm bệnh gây vết bệnh, gen AVR nhân bao gồm AVRPita, AVR- CO39, PWL1, PWL2, ACE1, AVRPizt, AVR- Pia, AVR- Pii AVR- Pik /km /kp (Sweigard et al., 1995; Farman et al., 1998; Orbach et al., 2000; Fudal et al., 2005; Li et al., 2009) Từ nghiên cứu AVR, người ta cho khác biệt gen AVR dẫn đến tỷ lệ thích ứng khác dựa vai trò chọn lọc xảy tự nhiên Đó lý giải thích diện thường xuyên/vắng mặt đa hình chuyển dịch gen phát gen AVR Những kết nghiên cứu việc thường xuyên xóa gen avirulence chế thích ứng nhanh chóng độc tính tác nhân gây bệnh ký chủ Các dịch chuyển gen AVR liên quan đến phục hồi thường xuyên thông qua chuyển giao từ cá thể khác, cho thấy tính di động rõ rệt AVR chế quan trọng dựa thích ứng nhanh chóng gen R thực vật (Thanyaluk S et al., 2017) Tuy nhiên, Việt Nam chưa có nhiều khảo sát phân bố gen AVR mẫu nấm gây bệnh đạo ôn Chính vậy, mục tiêu nghiên cứu xác định diện phân bố nhóm gen Avirulence mẫu nấm gây bệnh đạo ôn M oryzae giống lúa trồng phổ biến đồng sông Cửu Long VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 2.1 Mẫu nấm mẫu bệnh Tổng cộng 20 mẫu nấm gây bệnh đạo ôn phân lập Các mẫu nấm gây bệnh đạo ôn thu giống lúa gieo sạ phổ biến vụ Đông xuân 2017- 2018 đồng sông Cửu Long Thông tin mẫu nấm phân lập thể bảng Phương pháp phân lập mẫu nấm gây bệnh đạo ôn theo phương pháp đơn bào tử Từ vết bệnh lúa bao gồm: mẫu (lá lúa, cổ cổ bơng) có vết bệnh điển hình rửa nước vòi, sau nước cất vô trùng Lá bệnh, cổ bệnh, cổ bị bệnh thấm khô giấy thấm vơ trùng, ủ đĩa petri có sẵn nước cất vô trùng Sau 15 - 18 giờ, bào tử nấm đạo ơn hình thành nhiều vết bệnh Chạm nhẹ vết bệnh bề mặt môi trường WA úp ngược Với hỗ trợ kính hiển vi, đơn bào tử chuyển kim thủy tinh sang đĩa môi trường WA Sau ngày, bào tử nấm nảy mầm chuyển sang môi trường PDA để mẫu nấm Bảng Danh sách mẫu nấm phân lập gây bệnh đạo ôn lúa STT 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 52 Ký mẫu nấm LCM-AG CLTT- LA CLGC- TG CLTN- CT CBTN- CT CBTC- AG CBCP- AG CBCP- AG CBTH- LA CLTH- LA LTT- LA LTT- LA LBM- VL CBTB- VL CBTP- TG CLTP- TG CBTN- ĐT LGCĐ- TG CLTM- ĐT CBGC- TG Giống lúa OM4900 IR46-25 OM5451 IR50404 IR50404 JASMINE85 RVT ĐTM126 IR46-25 IR46-25 IR46-25 IR46-25 OM5451 OM4900 IR46-25 IR46-25 OM4900 Nàng Hoa OM4900 Nàng Hoa Khu vực thu mẫu Chợ Mới - An Giang Thủ Thừa- Long An Gò Cơng- Tiền Giang Thốt Nốt- Cần Thơ Thốt Nốt- Cần Thơ Tân Châu- An Giang Châu Phú - An Giang Châu Phú - An Giang Thạnh Hóa- Long An Thạnh Hóa- Long An Thủ Thừa- Long An Tân Trụ- Long An Bình Minh- Vĩnh Long Tam Bình - Vĩnh Long Tân Phước- Tiền Giang Tân Phước- Tiền Giang Tam Nông - Đồng Tháp G Công Đông- Tiền Giang Tháp Mười- Đồng Tháp Gò Cơng- Tiền Giang Vị trí lấy mẫu cổ cổ cổ cổ cổ cổ cổ cổ cổ lá lá cổ cổ cổ cổ cổ cổ Kết nghiên cứu khoa học 2.2 Chiết DNA từ nấm đạo ôn Sợi nấm bề mặt đĩa thạch cạo cho vào ống Eppendorf Sau cho dung dịch nitơ lỏng vào dùng chày nghiền tơ nấm thành bột để sử dụng ly trích DNA Các bước ly trích DNA sợi nấm thực sau: Bước 1: cạo 0,5 gam sợi nấm Bước 2: Thêm vào 200 µl lysis buffer trước o vortex 10 s, ủ 65 C/ Bước 3: Bổ sung 300 µl PCR sau ly tâm 13.000 v/8 phút Bước 4: Hút 300 µl dịch + 100 µl chloroform ly tâm 1400v/ phút Bước 5: Hút 200 µl dịch tủa DNA 100 µl isopropanol, lắc nhẹ, ly tâm 14000 v/10 phút Bước 6: Cho 480 µl Ethanol (70%) lần vào hỗn hợp Sau ly tâm 13000 v/10 phút loại bỏ BVTV - Sè 5/2018 dịch để khô tự nhiên o Bước 7: Đổ 50 µl TE buffer bảo quản -20 C 2.3 Xác định diện nhóm gen Avirulence mẫu nấm gây bệnh đạo ôn Magnaporthe oryzae Phương pháp PCR với mồi RAPD thực máy PCR (Eppendorf, Đức) với tổng thể tích 20 µL/mẫu gồm thành phần sau: DNA (100 ng/µL)- 1µL; mồi RAPD (10 pmol)- 1,2µL, Master Mix 2X- 10 µL; ddH2O- 7,8 µL Trong đề tài sử dụng nghiên cứu công bố trước bảng Các sản phẩm PCR sử dụng gel agarose 1% dung dịch TBE có chứa redsafe quan sát máy chụp ảnh gel Bảng Trình tự gen AVR sử dụng nghiên cứu Tên gen Trình tự mồi 5’GAC CCG TTT CCG CCT TTA TT-3’ AVR-Pita 5’GAT TCC CTC CAT TCC AAC AC-3’ 5’CTC CGC CAC TTT TCT CAT TC-3’ AVR-PWL2 5’GCC CTC TTC TCG CTG TTC AC-3’ 5’GTC AAC CAA GCG TAA ACC TC-3’ AVR-Pik 5’CGA TTC AGA AGT TAG GCA TT-3’ 5’GAG GCC GAT ATG TTA CGA TT-3’ AVR-Pii 5’CTC TGC TCT CAC GCT TTA CC-3’ 5’GCC GCT AGC TGT ATA GAC AA-3’ AVR-Pia 5’TCA TCG TCG AGT GGT GTA GG-3’ 5’GAG GTG CCA GAT ATG TCG TC-3’ ACE1-at 5’GGA TGA GCA GAT GAG CAA CA-3’ 5’GCA CCT TGA CGT TTG AAC AG-3’ ACE1-Ks 5’TGA GTT TGC ATT GAG CGA GT-3’ KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 3.1 Xác định phân bố nhóm gen Avirulence mẫu phân lập nấm gây bệnh đạo ôn M oryzae đồng sông Cửu Long Mặc dù có 80 gen kháng bệnh đạo ôn xác định nhiều giống lúa khác nhau, nhiều gen kháng tính kháng thời gian ngắn có biến đổi cao gen không độc AVR chủng nấm đạo ôn (Ballini et al., 2008) Điều thích ứng nhanh thực tế Kích thước Tài liệu tham khảo 881 bp Huang et al., 2014 438 bp Huang et al., 2014 342 bp Huang et al., 2014 213 bp Huang et al., 2014 276 bp Huang et al., 2014 12694 bp Huang et al., 2014 12694 bp Huang et al., 2014 chủng nấm gây bệnh đạo ôn lúa (Jia et al., 2000) Lý để giải thích điều tự nhiên gen AVR thường xuyên bị đột biến bao gồm số nucleotide, thay nucleotide v.v…ảnh hưởng đến hoạt động gen AVR (Dai et al., 2010) Trong nghiên cứu này, việc khảo sát diện gen AVR mẫu nấm gây bệnh đạo ôn phân lập thực phương pháp PCR với cặp mồi gen AVR- Pita, AVR- PWL2, AVR- Pik, AVR- Pii AVR- Pia, AVR- ACE1- at, AVR ACE1- ks (Huang et al., 2014) Các gen AVR dùng 53 BVTV - Sè 5/2018 Kết nghiên cứu khoa học để khảo sát chúng có mức độ đa dạng mặt di truyền cao có khả biến đổi theo hồn cảnh mơi trường (Yoshida et al., 2009) Ví dụ gen AVR- Pii nằm vùng di truyền khơng ổn định dẫn đến đoạn gen bị xảy q trình “chuyển gen ngang” Kết phân tích PCR cho thấy tỷ lệ xuất khác gen AVR tất mẫu nấm gây bệnh đạo ơn phân lập (Hình 1) Ba gen AVR- Pik, AVR- ACE1- at AVRACE1- ks có mặt 18/ 20 mẫu nấm gây bệnh đạo ôn phân lập thu đồng sông Cửu Long Kết xác nhận lại nghiên cứu (Huang et al., 2014) đa dạng di truyền nhóm gen AVR-Pik ln cao so với gen AVR lại Các gen AVR- Pita, AVRPWL2, AVR- Pii, AVR- Pia có số mẫu nấm gây bệnh đạo ơn xuất theo thứ tự tương ứng (2/20; 1/20; 1/20; 1/20) mẫu Điều cho thấy gen AVR- Pia AVR- Pii có mặt mẫu nấm gây bệnh đạo ôn lấy mẫu mức độ xuất Kết phù hợp với kết nghiên cứu (Huang et al., 2014) Điều đa dạng diện khơng diện xảy vị trí locus AVR mẫu nấm gây bệnh đạo ơn phân lập Từ kết phân tích mẫu nấm gây bệnh đạo ôn cho thấy phân bố nhóm gen AVR sau: AVR- Pik nhóm gen có số mẫu nấm gây bệnh đạo ơn xuất nhiều với 18/20 mẫu Sự phân bố nhóm gen xuất hầu hết mẫu nấm phân lập tất tỉnh thành, có mẫu nấm gây bệnh đạo ôn cổ không xuất nhóm gen AVR- Pik huyện Thốt Nốt- tỉnh Cần Thơ huyện Thạnh Hóa- tỉnh Long An AVR- Pita, AVR- Pii, AVR- Pia AVR- PWL2 nhóm gen xuất mẫu nấm gây bệnh đạo ôn Kết khảo sát nhóm gen AVR- Pita có mẫu nấm gây bệnh đạo ôn xuất cổ bơng huyện (Gò Cơng Đơng Gò Cơng)- tỉnh Tiền Giang AVRPii xuất mẫu nấm gây bệnh đạo ơn huyện Gò Cơng- tỉnh Tiền Giang AVR- Pia có mẫu nấm gây bệnh đạo ôn xuất cổ huyện Gò Cơng- tỉnh Tiền Giang Còn gen AVR- PWL2 xuất mẫu nấm gây bệnh đạo ôn cổ huyện Thủ Thừa- tỉnh Long An Hình AVR- PCR mẫu nấm gây bệnh đạo ôn thu đồng sông Cửu Long Ghi chú: Ký hiệu mẫu tƣơng ứng với ký hiệu bảng Ladder thang DNA 1kb (GeneRuler 1kb, Thermo Scientific) 3.3 Đánh giá phân bố gen Avirulence mẫu nấm gây bệnh đạo ôn địa phƣơng Đánh giá biến đổi di truyền chế phân tử để hiểu tiến hóa gen AVR tiến hóa M oryzae lúa Các nghiên cứu trước báo cáo khơng ổn định số gen AVR, có vị trí gần với nhi m sắc thể 54 khơng ổn định vùng telomere bao gồm AVR- Pita, AVR- Pik, AVR- Pia AVR- Pii (Yoshida et al., 2009; Dai et al., 2010; Chuma et al., 2011) Hơn nữa, phần tử chuyển tiếp hai promoter vùng mã hóa tạo alen có độc tính Ví dụ, chất vận chuyển Retrontransposon 1,9 kb chèn vào exon cuối gen ACE1 (Fudal et al., Kết nghiên cứu khoa học BVTV - Sè 5/2018 2005) Yếu tố Pot3 chèn vào vùng promoter AVR- Piz-t AVR- Pita vùng promoter mã hóa (Li et al., 2009) Tuy nhiên, kết cho thấy gen PWL2 khơng có biến đổi di truyền hay đa dạng di truyền Kết tương tự nghiên cứu từ 62 chủng nấm gây bệnh đạo ôn Trung Quốc cho thấy đa dạng di truyền gần khác biệt vị trí địa lý (Huang et al., 2014) Gen PWL2 có mức biến đổi di truyền thấp chức quan trọng sản phẩm đóng vai trò quan trọng xâm nhi m tế bào lúa tế bào nấm từ tế bào bị nhi m sang tế bào không xâm lấn lân cận (Khang et al., 2010) Tần suất AVR- Pii mẫu bệnh đạo ôn hại lúa Thái Lan cho thấy thay đổi rõ rệt gen quần thể nấm Các nghiên cứu trước cho thấy gen AVR- Pii có mức độ biến đổi di truyền cao chèn nhiều dịch chuyển (Chuma et al., 2011) AVR- Piz-t cho mát/ đạt tần số gen q trình tiến hóa, cho thấy AVR- Piz-t tiến hóa gen kháng phản ứng với khái niệm “gen đối gen” Từ việc phân tích trình tự mã hóa ba gen AVR- PWL2, AVR- Pii AVR- Piz-t, kết cho thấy giống lúa Thái Lan có mức độ đa dạng di truyền thấp Điều tương tự báo cáo (Chen et al., 2013) cho thấy đa dạng thấp vùng AVR- Piz-t ORF bệnh đạo ôn Trung Quốc Mặc dù AVR- Pii AVR- Piz-t tiết lộ có mức độ đa hình nucleotide thấp, AVR- Pii cho thấy chọn lọc cao biến thể tạo tính thích nghi Kết cho thấy áp lực chọn lọc chế phổ biến cho thích nghi biến đổi nhanh gen AVR Tương tự nghiên cứu gần (Kasetsomboon et al., 2013) báo cáo tính đa dạng di truyền cao vùng mã hóa AVR- Pita có 15 haplotypes số 30 chủng phân lập Thái Lan áp lực lựa chọn dương Kết khảo sát phân bố gen Avirulence mẫu nấm gây bệnh đạo ôn bảng tỉnh có số nhận xét sau: Mẫu nấm gây bệnh đạo ôn tỉnh (An Giang, Đồng Tháp Vĩnh Long) có xuất nhóm gen Avirulence (ACE1- at, ACE1- ks Pik) với tất mẫu phân lập (2, 4, mẫu) Tại tỉnh Cần Thơ với mẫu nấm có xuất nhóm gen nhóm gen AVR- Pik xuất mẫu phân lập Tại tỉnh Long An: ghi nhận với mẫu nấm gây bệnh đạo ơn có 4/7 nhóm gen Avirulence có mẫu nấm gây bệnh đạo ơn xuất gen AVR- PWL2 Các nhóm gen lại AVR (ACE1- at, ACE1- ks, Pik) có 4/5 mẫu nấm gây bệnh đạo ôn Tại tỉnh Tiền Giang: ghi nhận với mẫu nấm gây bệnh đạo ôn có 6/7 nhóm gen Avirulence Đây tỉnh có phân bố nhóm gen đa dạng tỉnh thu thập phân tích mẫu Tuy nhiên, nhóm gen gây bệnh đạo ơn nhiều xuất tập chung nhóm gen AVR (ACE1- at, ACE1- ks Pik) với số mẫu xuất (4, 4, 5) Các nhóm gen AVR- Pita số mẫu xuất 2, AVR- Pia, AVR- Pii xuất mẫu Ba nhóm gen không xuất tỉnh khác Bảng Sự phân bố gen AVR mẫu nấm gây bệnh đạo ôn địa phƣơng Tỉnh An Giang Cần Thơ Đồng Tháp Long An Tiền Giang Vĩnh Long Số mẫu phân lập 2 5 ACE1-at 2 4 Phân bố AVR địa phương ACE1-ks Pia pii pik 0 0 0 0 4 1 0 3.4 Đánh giá phân bố gen Avirulence mẫu nấm gây bệnh đạo ôn giống lúa pita 0 0 PWL2 0 0 Kết khảo sát phân bố gen Avirulence mẫu nấm gây bệnh đạo ôn hình giống lúa trồng phổ biến đồng sông Cửu Long sau: 55 BVTV - Sè 5/2018 Kết nghiên cứu khoa học Mẫu nấm gây bệnh đạo ôn giống lúa (ĐTM126, IR50404, JASMINE 85, OM4900, OM5451, RVT) có xuất nhóm gen Avirulence (ACE1- at, ACE1- ks Pik) với tất mẫu nấm gây bệnh đạo ôn phân lập có xuất nhóm gen Trên giống lúa IR46-25: ghi nhận bảy mẫu đạo ơn có 4/7 gen Avirulence Trong đó: có gen AVR- PWL2 xuất mẫu nấm gây bệnh đạo ôn cổ Các gen AVR (ACE1- at, ACE1- ks) xuất sáu mẫu, AVRPik có xuất năm mẫu Các nhóm gen xuất lá, cổ cổ Trên giống lúa Nàng hoa 9: có mẫu nấm gây bệnh đạo ơn với 6/7 gen Avirulence Đây giống lúa có phân bố nhóm gen đa dạng giống lúa thu thập phân tích mẫu Tuy nhiên, nhóm gen gây bệnh đạo ơn xuất 1/2 mẫu nhóm gen AVR (ACE1- at, ACE1- ks, Pia Pii) Các nhóm gen AVR- Pita Pik xuất 2/ mẫu nấm gây bệnh đạo ơn Ba nhóm gen AVR (Pia, Pii, Pita) không xuất giống lúa khác Từ kết cho thấy: diện nhóm gen Avirulence đa dạng nằm rải rác giống lúa Hiểu phân bố, thành phần tính AVR genes quần thể tự nhiên từ giống lúa trồng phổ biến có phương án quản lý bệnh đạo ơn cách hữu hiệu Hình Phân bố gen AVR giống lúa KẾT LUẬN Ứng dụng Avirulence đánh giá phân tích mức độ đa dạng mẫu nấm gây bệnh đạo ôn thu đồng sông Cửu Long Ba gen AVR-Pik, AVR- ACE1- at AVR- ACE1- ks xuất 18/ 20 mẫu nấm gây bệnh đạo ôn phân lập, điều cho thấy phổ biến nhóm gen mẫu nấm gây bệnh đạo ôn khảo sát Ngoài gen AVR (Pita, Pia, Pii PWL2) có xuất cho thấy đa dạng chủng đạo ôn Sự phân bố nhóm gen Avirulence 56 địa phương cho thấy: Tỉnh Tiền Giang tỉnh có phân bố nhóm gen Avirulence phức tạp với 6/7 nhóm gen (AVR- ACE1- at, AVR- ACE1- ks, AVR- Pik, AVR- Pita, AVR- Pia AVR- Pii) Tiếp đến tỉnh Long An với 4/7 nhóm gen (AVR- ACE1at, AVR- ACE1- ks, AVR- Pik AVRPWL2,) Các tỉnh lại có 3/7 nhóm gen xuất phổ biến (AVR- ACE1- at, AVRACE1- ks, AVR- Pik) Sự phân bố nhóm gen Avirulence giống lúa cho thấy: giống lúa Nàng Hoa Kết nghiên cứu khoa học giống lúa có phân bố nhóm gen Avirulence phức tạp với 6/7 nhóm gen (AVR- ACE1- at, AVR- ACE1- ks, AVR- Pik, AVR- Pita, AVR- Pia AVR- Pii) Tiếp đến giống lúa IR46-25 với 4/7 nhóm gen (AVRACE1- at, AVR- ACE1- ks, AVR- Pik AVRPWL2,) Các giống lúa lại có 3/7 nhóm gen xuất phổ biến (AVR- ACE1- at, AVRACE1- ks, AVR- Pik) TÀI LIỆU THAM KHẢO Asai G.N., Jones M.W., Rorie F.G., 1967 Influence of certain environmental factors in the field on infection of rice by Pyricularia oryzae Phytopathology: 237 - 241 Chen H., He H., Zhou F., Yu H., Deng X.W., 2013b Development of genomics-based genotyping platforms and their applications in rice breeding Curr Opin Plant Biol 16: 247-254 Chuma I., Isobe C., Hotta Y., Ibaragi K., Futamata N., Kusaba M., Yoshida K., Terauchi R., Fujita Y., Nakayashiki H., Valent B., Tosa Y., 2011 Multiple Translocation of the AVR-Pita Effector Gene among Chromosomes of the Rice Blast Fungus Magnaporthe oryzae and Related Species PLoS Pathogens Dai et al., 2010 Diversification and evolution of the avirulence gene AVR-Pita1 in field isolates of Magnaporthe oryzae Fungal Genet Biol 47: 973- 980 Farman M.L., Leong S.A., 1998 Chromosome walking to the AVR1-CO39 avirulence gene of Magnaporthe oryzae Discrepancy between the physical and genetic maps Genetics 150(3):1049 - 1058 Flor H.H., 1971 Current status of the gene-for-gene concept Annu.Rev Phytopathol 9: 275 - 296 Fudal I., Bohnert H.U., Tharreau D., Lebrun M.H., 2005 Transposition of MINE, a composite retrotransposon, in the avirulence gene ACE1 of the rice blast fungus Magnaporthe oryzae Fungal BVTV - Sè 5/2018 Genet Biol 2005, 42(9): 761 - 772 Huang j., Weina Si, Qiming Deng, Ping Li and Sihai Yang, 2014 Rapid evolution of avirulence genes in rice blast fungus Magnaporthe oryzae: 1471- 2156 Kasetsomboon T., Kate-Ngam S., Sriwongchai T., Zhou B., Jantasuriyarat C., 2013 Sequence variation of avirulence gene AVR-Pital in rice blast fungus Magnaporthe oryzae 12: 617 - 628 10 Khang C.H., Berruyer R., Giraldo M.C., et al., 2010 Translocation of Magnaporthe oryzae effectors into rice cells and their subsequent cell- tocell movement Plant Cell 22: 1388 - 1403 11 Kuribayashi K., Ichikawa H., 1952 Studies on the forecasting of the rice blast disease in Japanese: 229 12 Li W., Wang B., Wu J., Lu G., Hu Y., Zhang X., Zhang Z., Zhao Q., Feng Q., Zhang H., 2009 The Magnaporthe oryzae avirulence gene AVR Pizt encodes a predicted secreted protein that triggers the immunity in rice mediated by the blast resistance gene Piz-t Mol Plant-Microbe Interact 22(4): 411 - 420 13 Orbach M.J., Farrall L., Sweigard J.A., Chumley F.G., Valent B., 2000 A telomeric avirulence gene determines efficacy for the rice blast resistance gene Pi-ta Plant Cell 12(11): 2019 - 2032 14 Sweigard J.A., Carroll A.M., Kang S., Farrall L., Chumley F.G., Valent B., 1995 Identification, cloning, and characterization of PWL2, a gene for host species specificity in the rice blast fungus Plant Cell 7: 1221 - 1233 15 Yoshida K., Saitoh H., Fujisawa S., Kanzaki H., Matsumura H., Yoshida K., Tosa Y., Chuma I., Takano Y., Win J., 2009 Association genetics reveals three novel avirulence genes from the rice blast fungal pathogen Magnaporthe oryzae Plant Cell 21(5): 1573 - 1591 Phản biện: TS Nguyễn Huy Chung TS Trịnh Xuân Hoạt 57 ... Avirulence mẫu nấm gây bệnh đạo ôn M oryzae giống lúa trồng phổ biến đồng sông Cửu Long VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 2.1 Mẫu nấm mẫu bệnh Tổng cộng 20 mẫu nấm gây bệnh đạo ôn phân lập Các mẫu nấm. .. LUẬN 3.1 Xác định phân bố nhóm gen Avirulence mẫu phân lập nấm gây bệnh đạo ôn M oryzae đồng sông Cửu Long Mặc dù có 80 gen kháng bệnh đạo ôn xác định nhiều giống lúa khác nhau, nhiều gen kháng... gây bệnh đạo ôn xuất cổ huyện Gò Cơng- tỉnh Tiền Giang Còn gen AVR- PWL2 xuất mẫu nấm gây bệnh đạo ôn cổ huyện Thủ Thừa- tỉnh Long An Hình AVR- PCR mẫu nấm gây bệnh đạo ôn thu đồng sông Cửu Long