•Giao diện làm việc của phần mềm•Các tính năng của thanh công cụ chính•Vẽ công thức hóa học, viết phản ứng hóa họcI.Giao diện của ChemDrawCửa sổ ChemDraw 11 khi khởi động lần đầu có các thành phần như sau:1.Thanh tiêu đề.2.Thanh menu.3.Thanh công cụ tổng quát.4. Thanh công cụ định dạng văn bản.5. Vùng làm việc6.Thanh trạng thái.7.Thanh công cụ chính.II.Các thuộc tính Tool barNgoài các công cụ tương tự CW, còn có:. Structure perspective : Xoay tự do đối tượng được chọn. Mass Framentation tool : Phân mảnh đối tượng. Pent: Vẽ mũi tên và orbital tuỳ theo lựa chọn. Hashed Bond : Vẽ liên kết dạng lập thể. Hashed Wedget Bond: Vẽ liên kết lập thể. Bold Bond: Vẽ liên kết đơn nét đậm. Drawing elements : Vẽ những chú thích có ý nghĩa hoá học như những hộp, dòng kẻ. Bold Wedget Bond và Hollow Wedget Bond: Vẽ liên kết lập thể. Chemical symbols : Hộp công cụ vẽ các biểu tượng có ý nghĩa hoá học như điện tích, gốc tự do, cặp electron … Wavy Bond: Vẽ các liên kết dạng đường cong. Arc: Hộp công cụ vẽ cung, góc.Table: Vẽ bảng với số dòng và số cột tùy chọn. TLC plate: Vẽ sắc kí các chất
Trang 1Bài 13 PHẦN MỀM CHEMDRAW
Giao diện làm việc của phần mềm
Các tính năng của thanh công cụ chính
Vẽ công thức hóa học, viết phản ứng hóa học
I. Giao diện của ChemDraw
Cửa sổ ChemDraw 11 khi khởi động lần đầu có các thành phần như sau:
1 Thanh tiêu đề
2 Thanh menu
3 Thanh công cụ tổng
quát
4 Thanh công cụ định
dạng văn bản
5 Vùng làm việc
6 Thanh trạng thái
7 Thanh công cụ chính
II. Các thuộc tính Tool bar
Ngoài các công cụ tương tự CW, còn có:
Structure perspective : Xoay tự do đối tượng
được chọn
Mass Framentation tool : Phân mảnh đối
tượng
Pent: Vẽ mũi tên và orbital tuỳ theo lựa chọn
Hashed Bond : Vẽ liên kết dạng lập thể
Hashed Wedget Bond: Vẽ liên kết lập thể
Bold Bond: Vẽ liên kết đơn nét đậm
Drawing elements : Vẽ những chú thích có ý
nghĩa hoá học như những hộp, dòng kẻ
Trang 2Bold Wedget Bond và Hollow Wedget Bond: Vẽ liên kết lập thể.
Chemical symbols : Hộp công cụ vẽ các biểu tượng có ý nghĩa hoá học như điện
tích, gốc tự do, cặp electron …
Wavy Bond: Vẽ các liên kết dạng đường cong.
Arc: Hộp công cụ vẽ cung, góc.
Table: Vẽ bảng với số dòng và số cột tùy chọn.
TLC plate: Vẽ sắc kí các chất
III Thiết kế phân tử
Chức năng thiết kế phân tử có nhiều điểm tương tự Chem Window
Ví dụ 1.Trình bày các cấu trúc của vitamin B6, gọi tên
+ Vẽ vòng benzene và thêm nhánh
+ Thêm các nhóm chức bằng công cụ chú thích
+ Sao chép thêm 2 cấu trúc nữa
+ thay các nhóm thế mới,dùng công cụ chú thích
+ Chọn các công thức,dùng lệnh để đọc tên
Trang 3Ví dụ 2 Vẽ và trình bày cấu trúc không gian của Phenyl Alanin
+ Vẽ công thức của Phenyl alanin hoặc vào thẻ Structure → Convert name to structure, gõ Phenyl alanin
hình vẽ như sau:
+ Chuyển cấu trúc sang 3 chiều: Vào thẻ Edit→3D mode
Có thể dùng công cụ để xoay phân tử
+ Thay đổi mô hình phân tử theo ý muốn
Các thuật ngữ đã gặp ở HyperChemp
Ví dụ 3 Vẽ CTCT của phenol phtalein và cho biết % các nguyên tố
+ Tìm vòng benzen trong thư viện và vẽ vào màn hình
Trang 4+ Dùng công cụ liên kết đơn + phím Alt để vẽ liên kết dài tùy ý, thêm vòng
+ Thêm nhãn cho phân tử, sau đó vào thẻ View – Show Analysis Window - Paste
Ví dụ 4 Viết phương trình phản ứng điều chế Clo trong phòng thí nghiệm + Dùng công cụ viết như sau:
+ Chọn toàn bộ các phân tử, sau đó nhấp vào , ta được
+ Dùng công cụ để thêm hệ số và điều kiện, để thêm mũi tên
Trang 5Bài 14 PHẦN MỀM CHEMDRAW (Tiếp)
Viết cơ chế phản ứng
Vẽ dụng cụ thí nghiệm
Phân mảnh phổ MS, dự đoán phổ NMR
IV.Viết cơ chế của phản ứng
Ví dụ 1 Viết cơ chế phản ứng cộng electrophin
+ H2SO4 d
H2O - NO2 NO2
HO - NO2
- HSO4
H2O
NO2
+
NO2
+ Viết CTPT và CTCT của các hợp chất theo thứ tự
+
+ Dùng biểu tượng để thay đổi kiểu ghi công thức hóa học
+ Hoàn thành các biểu tượng còn lại
Trang 6Ví dụ 2 Viết cơ chế phản ứng lưỡng phân tử sau
V Vẽ dụng cụ thí nghiệm
Ví dụ 3 Vẽ dụng cụ chuẩn độ
+ Lấy các dụng cụ thí nghiệm, sử dụng công cụ đối xứng thẳng đứng ở Object – Flip Horizontal
+ Lắp dụng cụ thí nghiệm như hình vẽ, dùng công cụ để chú thích
Trang 7Ví dụ 4 Vẽ dụng cụ đun hồi lưu sau
VI Phân mảnh và dự đoán phổ
Ví dụ 3 Phân mảnh phổ MS của meta xilen CH 3 - C 6 H 4 - CH 3
+ Vẽ phân tử metaxilen
+ Dùng công cụ phân mảnh và quan sát
Trang 8Ví dụ 4 Dự đoán phổ H – NMR và C13 – NMR của axit salisylic
+ Vẽ CTCT của axit salysilic, sau đó vào thẻ Structure – Predict 1H – NMR shifts