Tổng quan về các đột biến gen mã hóa CYP2D6

BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC DƯỢC HÀ NỘI HỒ MINH TẤN TỔNG QUAN VỀ CÁC ĐỘT BIẾN GEN MÃ HÓA CYP2D6 KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP DƯỢC SĨ HÀ NỘI – 2013 Ket-noi.com Ket-noi.com kho kho tai tai lieu lieu mien mien phi phi BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC DƯỢC HÀ NỘI HỒ MINH TẤN TỔNG QUAN VỀ CÁC ĐỘT BIẾN GEN MÃ HÓA CYP2D6 KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP DƯỢC SĨ Người hướng dẫn: ThS Nguyễn Xuân Bắc Nơi thực hiện: Bộ mơn Hóa Sinh HÀ NỘI – 2013 LỜI CẢM ƠN Đầu tiên cho xin gửi tới Ths Nguyễn Xuân Bắc lời biết ơn chân thành sâu sắc Thầy người tận tình bảo, giúp đỡ tơi q trình nghiên cứu hồn thành khóa luận Tơi xin cảm ơn thầy mơn Hóa Sinh Trường Đại học Dược Hà Nội, dược sỹ bác sỹ bệnh viện Trung Ương Quân Đội 108 giúp đỡ tạo điều kiện thuận lợi cho tơi suốt q trình thực đề tài Cuối xin dành lời tri ân tới người thân gia đình bạn bè luôn động viên, cổ vũ tơi vượt qua khó khăn mà có lúc tưởng chừng muốn bỏ cuộc, giúp tơi hồn thành tốt khóa luận Hà Nội, ngày 21/5/2013 Hồ Minh Tấn Ket-noi.com Ket-noi.com kho kho tai tai lieu lieu mien mien phi phi MỤC LỤC Trang Danh mục ký hiệu, chữ viết tắt Danh mục bảng Danh mục hình ĐẶT VẤN ĐỀ CHƯƠNG ĐẠI CƯƠNG VỀ CYP2D6 1.1 CYTOCHROM − P450 1.1.1 Phân bố 1.1.2 Phân loại danh pháp 1.1.3 Cơ chế xúc tác CYP .4 1.2 CYP2D6 1.2.1 Cấu trúc CYP2D6 1.2.2 Cơ chế tác dụng CYP2D6 1.2.3 Cơ chất CYP2D6 1.3 GEN MÃ HÓA CYP2D6 15 CHƯƠNG ĐỘT BIẾN GEN MÃ HÓA CYP2D6 16 2.1 KHÁI NIỆM CƠ BẢN VỀ ĐỘT BIẾN GEN 16 2.1.1 Các loại đột biến 17 2.1.2 Nguyên nhân đột biến 20 2.2 NHỮNG ĐỘT BIẾN GEN CYP2D6 25 2.2.1 Những allen gen CYP2D6 25 2.2.2.Kiểu hình kiểu gen CYP2D6 chủng tộc giới .37 2.3 HẬU QUẢ LÂM SÀNG CỦA TƯƠNG TÁC KIỂU GEN – KIỂU HÌNH CỦA CYP2D6 38 CHƯƠNG PHƯƠNG PHÁP PHÁT HIỆN ĐỘT BIẾN GEN CYP2D6 .43 3.1 KỸ THUẬT ADN CHIP 43 3.1.1 Nguyên tắc: 43 3.1.2 Ưu điểm: 44 3.1.3 Nhược điểm: 45 3.2 KỸ THUẬT LONG-PCR 45 3.2.1 Nguyên tắc .45 3.2.2 Ưu điểm 45 3.3.3 Nhược điểm 45 3.3.4 Áp dụng xác định nhân đôi gen CYP2D6 .46 3.3 KỸ THUẬT REAL-TIME PCR 47 3.3.1 Nguyên tắc: 47 3.3.2 Ưu điểm 48 3.3.3 Nhược điểm .48 3.3.4 Áp dụng xác định đột biến CYP2D6 48 3.4 KỸ THUẬT PCR-RFLP 49 Ket-noi.com Ket-noi.com kho kho tai tai lieu lieu mien mien phi phi 3.4.1 Nguyên tắc .49 3.4.2 Ưu điểm 51 3.4.3 Nhược điểm: 51 3.4.4 Áp dụng CYP2D6 .51 3.5 KỸ THUẬT PCR PHỨC HỢP .52 3.5.1 Nguyên tắc: 52 3.5.2 Ưu điểm 53 3.5.3 Nhược điểm .53 3.5.4 Áp dụng CYP2D6 giúp chẩn đoán allen *5 allen*10 53 3.6 MỘT SỐ KỸ THUẬT KHÁC GIÚP XÁC ĐỊNH ĐỘT BIẾN CYP2D6 56 CHƯƠNG BÀN LUẬN 56 4.1 HIỆN TƯỢNG ĐỘT BIẾN GEN CYP2D6 56 4.2 CÁC NGHIÊN CỨU VỀ ĐA HÌNH CYP2D6 TRÊN THẾ GIỚI 57 4.3 ĐỀ XUẤT HƯỚNG NGHIÊN CỨU CYP2D6 Ở VIỆT NAM 58 CHƯƠNG KẾT LUẬN 59 DANH MỤC KÝ HIỆU, CHỮ VIẾT TẮT TÊN TIẾNG VIỆT (nếu có) KÝ HIỆU/CHỮ TÊN TIẾNG ANH ADN Deoxyribonucleic Acid ADR Adverse Drug Reaction ARN Ribonucleotic Acid CLint Clearance instrict CYP Cytochrom P450 EM Extensive metabolism FADH2 Flavin Adenine Dinucleotide FDA Food and Drug Administration Cục quản lý thực phẩm dược phẩm Hoa Kỳ IM Intermediate metabolism Chuyển hóa chậm kb Kilo base MR Metabolic ratio NADPH Nicotinamide Adenine Dinucleotide Phosphate PCR Polymerase Chain Reaction Phản ứng khuếch đại gen PM Poor metabolizer Chuyển hóa chậm SNP Single nucleotide polymorphism Đa hình đơn nucleotid UM Ultra metabolism Chuyển hóa siêu nhanh Phản ứng bất lợi thuốc Độ thải nội gan Chuyển hóa nhanh Tỷ lệ chuyển hóa Ket-noi.com Ket-noi.com kho kho tai tai lieu lieu mien mien phi phi DANH MỤC BẢNG Trang Bảng 2.1 Ảnh hưởng đa hình di truyền CYP2D6 lên số thuốc điều trị 38 Bảng 3.1 Các mồi enzym cắt tương ứng allen [79] 50 DANH MỤC HÌNH Trang Hình Tỷ lệ chuyển hóa thuốc CYP [65] Hình 2: Cơ chế xúc tác CYP [1] Hình Mơ hình phân tử CY2D6 [100] Hình Cấu trúc vùng hoạt động CYP2D6 [100] Hình Cơ chế xúc tác CYP2D6 [68] Hình Chuyển hóa dextromethorphan CYP2D6 [105] 12 Hình Vị trí CYP2D6 nhiễm sắc thể [37] 15 Hình Mơ tả loại đột biến điểm [2] 19 Hình Gen EGFR ung thư phổi: p.T751_I759>N [2] 20 Hình 10 Hình thành gen lai [33] 29 Hình 11 Sự lặp lại hay nhiều lần xóa tồn gen CYP2D6 [43] .36 Hình 12 Kiểu gen CYP2D6 vùng địa lý khác [109] 37 Hình 13 Kiểu hình CYP2D6 vùng địa lý khác [109] 38 Hình 14 Phân loại kiểu hình dựa kiểu gen hậu lâm sàng dựa vào kiểu xúc tác tượng đa hình enzym [109] 39 Hình 15 Sơ đồ minh họa AND chip [118] 44 Hình 16 Sản phẩm Long-PCR [95] 46 Hình 17 Phổ điện di [95] .47 Hình 18 Mồi trình tự mồi [82] .49 Hình 19 PCR-RFLP chẩn đốn đột biến 360C>G gen mã hóa enzym deoxycytidin kinase [144] 50 Hình 20 Các allen CYP2D6 [84] 53 Hình 21 Chẩn đốn kiểu gen kỹ thuật PCR truyền thống PCR phức hợp [84] 55 Ket-noi.com Ket-noi.com kho kho tai tai lieu lieu mien mien phi phi ĐẶT VẤN ĐỀ Vào cuối năm 50 kỷ 20, nhà khoa học phát tập trung nghiên cứu hệ thống enzym có vai trò vơ quan trọng người, hệ thống cytochrom P450 hay gọi CYP450 Hệ thống enzym tác nhân xúc tác chuyển hóa cho chất nội sinh steroid, cholesterol, acid mật…cũng chất ngoại sinh có cấu trúc khác có chất độc, chất gây ung thư đặc biệt chuyển hóa thuốc Hiện người ta phát 57 isozym hệ thống CYP450 người chia thành họ phân họ khác Trong số isozym này, CYP2D6 giành quan tâm đặc biệt Bởi lẽ, dù đứng thứ hai mặt số lượng thuốc chuyển hóa CYP2D6 lại enzym có tượng đa hình phổ biến Và hậu tượng nhiều nghiêm trọng Hơn nhóm thuốc điều trị enzym chuyển hóa tim mạch, giảm đau, thần kinh, ung thư nhóm thuốc phổ biến có cửa sổ điều trị hẹp Do đó, việc hiểu biết CYP2D6 phương diện: đột biến gen, biến đổi kiểu hình, hậu lâm sàng kèm theo phương pháp phát đột biến cần thiết, góp phần vào việc “tối ưu hóa điều trị” Xuất phát từ thực tế trên, tiến hành đề tài: “Tổng quan đột biến gen mã hóa CYP2D6” với mục tiêu sau: Tìm hiểu đột biến gen mã hóa CYP2D6 phát Tìm hiểu phương pháp phát đột biến gen CYP2D6 31 Gaedigk A., Bradford L D., Alander S W., Leeder J S (2006), "CYP2D6*36 gene arrangements within the cyp2d6 locus: association of CYP2D6*36 with poor metabolizer status", Drug Metab Dispos, 34(4), pp 563-9 32 Gaedigk A., Hernandez J., Garcia-Solaesa V., Sanchez S., Isidoro-Garcia M (2011), "Detection and characterization of the CYP2D6*9x2 gene duplication in two Spanish populations: resolution of AmpliChip CYP450 test no-calls", Pharmacogenomics, 12(11), pp 1617-22 33 Gaedigk A., Jaime L K., Bertino J S., Jr., Berard A., Pratt V M., Bradfordand L D., Leeder J S (2010), "Identification of Novel CYP2D72D6 Hybrids: Non-Functional and Functional Variants", Front Pharmacol, 1, pp 121 34 Gaedigk A., Ndjountche L., Divakaran K., Dianne Bradford L., Zineh I., Oberlander T F., Brousseau D C., McCarver D G., Johnson J A., Alander S W., Wayne Riggs K., Steven Leeder J (2007), "Cytochrome P4502D6 (CYP2D6) gene locus heterogeneity: characterization of gene duplication events", Clin Pharmacol Ther, 81(2), pp 242-51 35 Garcia-Barcelo M., Chow L Y., Lam K L., Chiu H F., Wing Y K., Waye M M (2000), "Occurrence of CYP2D6 gene duplication in Hong Kong Chinese", Clin Chem, 46(9), pp 1411-3 36 Gardiner S J., Begg E J (2006), "Pharmacogenetics, drug-metabolizing enzymes, and clinical practice", Pharmacol Rev, 58(3), pp 521-90 37 Gough A C., Smith C A., Howell S M., Wolf C R., Bryant S P., Spurr N K (1993), "Localization of the CYP2D gene locus to human chromosome 22q13.1 by polymerase chain reaction, in situ hybridization, and linkage analysis", Genomics, 15(2), pp 430-2 38 Gras J., Llenas J., Jansat J M., Jauregui J., Cabarrocas X., Palacios J M (2002), "Almotriptan, a new anti-migraine agent: a review", CNS Drug Rev, 8(3), pp 217-34 Ket-noi.com Ket-noi.com kho kho tai tai lieu lieu mien mien phi phi 39 Greenblatt D J., Von Moltke L L., Giancarlo G M., Garteiz D A (2003), "Human cytochromes mediating gepirone biotransformation at low substrate concentrations", Biopharm Drug Dispos, 24(2), pp 87-94 40 Griese E U., Asante-Poku S., Ofori-Adjei D., Mikus G., Eichelbaum M (1999), "Analysis of the CYP2D6 gene mutations and their consequences for enzyme function in a West African population", Pharmacogenetics, 9(6), pp 715-23 41 Guengerich F P (2001), "Common and uncommon cytochrome P450 reactions related to metabolism and chemical toxicity", Chem Res Toxicol, 14(6), pp 611-50 42 Hartter S., Tybring G., Friedberg T., Weigmann H., Hiemke C (2002), "The N-demethylation of the doxepin isomers is mainly catalyzed by the polymorphic CYP2C19", Pharm Res, 19(7), pp 1034-7 43 He Y., Hoskins J M., McLeod H L (2011), "Copy number variants in pharmacogenetic genes", Trends Mol Med, 17(5), pp 244-51 44 Hidestrand M., Oscarson M., Salonen J S., Nyman L., Pelkonen O., Turpeinen M., Ingelman-Sundberg M (2001), "CYP2B6 and CYP2C19 as the major enzymes responsible for the metabolism of selegiline, a drug used in the treatment of Parkinson's disease, as revealed from experiments with recombinant enzymes", Drug Metab Dispos, 29(11), pp 1480-4 45 Huang J., Chuang S K., Cheng C L., Lai M L (1999), "Pharmacokinetics of metoprolol enantiomers in Chinese subjects of major CYP2D6 genotypes", Clin Pharmacol Ther, 65(4), pp 402-7 46 Ingelman-Sundberg M (2005), "Genetic polymorphisms of cytochrome P450 2D6 (CYP2D6): clinical consequences, evolutionary aspects and functional diversity", Pharmacogenomics J, 5(1), pp 6-13 47 Ingelman-Sundberg M., Rodriguez-Antona C (2005), "Pharmacogenetics of drug-metabolizing enzymes: implications for a safer and more effective drug therapy", Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci, 360(1460), pp 1563-70 48 Ishiguro A., Kubota T., Sasaki H., Iga T (2004), "A long PCR assay to distinguish CYP2D6*5 and a novel CYP2D6 mutant allele associated with an 11-kb EcoRI haplotype", Clin Chim Acta, 347(1-2), pp 217-21 49 Jacqz-Aigrain E., Funck-Brentano C., Cresteil T (1993), "CYP2D6- and CYP3A-dependent metabolism of dextromethorphan in humans", Pharmacogenetics, 3(4), pp 197-204 50 Ji L., Pan S., Marti-Jaun J., Hanseler E., Rentsch K., Hersberger M (2002), "Single-step assays to analyze CYP2D6 gene polymorphisms in Asians: allele frequencies and a novel *14B allele in mainland Chinese", Clin Chem, 48(7), pp 983-8 51 Johansson I., Lundqvist E., Bertilsson L., Dahl M L., Sjoqvist F., IngelmanSundberg M (1993), "Inherited amplification of an active gene in the cytochrome P450 CYP2D locus as a cause of ultrarapid metabolism of debrisoquine", Proc Natl Acad Sci U S A, 90(24), pp 11825-9 52 Kagimoto M., Heim M., Kagimoto K., Zeugin T., Meyer U A (1990), "Multiple mutations of the human cytochrome P450IID6 gene (CYP2D6) in poor metabolizers of debrisoquine Study of the functional significance of individual mutations by expression of chimeric genes", J Biol Chem, 265(28), pp 17209-14 53 Keilin J., Orlans E (1969), "Chemical and immunological properties of cytochrome h and helicorubin", Nature, 223(5203), pp 304-6 54 Keizers P H., Lussenburg B M., de Graaf C., Mentink L M., Vermeulen N P., Commandeur J N (2004), "Influence of phenylalanine 120 on cytochrome P450 2D6 catalytic selectivity and regiospecificity: crucial role in 7-methoxy-4-(aminomethyl)-coumarin metabolism", Biochem Pharmacol, 68(11), pp 2263-71 55 Kim J J., Roberts D L., Djordjevic S., Wang M., Shea T M., Masters B S (1996), "Crystallization studies of NADPH-cytochrome P450 reductase", Methods Enzymol, 272, pp 368-77 Ket-noi.com Ket-noi.com kho kho tai tai lieu lieu mien mien phi phi 56 Kinoshita T., Horie S., Shimazono N., Yohro T (1966), "Studies on P-450 I Preparation and properties of a submitochondrial particulate fraction from bovine adrenal cortex", J Biochem, 60(4), pp 391-404 57 Kirchheiner J., Nickchen K., Bauer M., Wong M L., Licinio J., Roots I., Brockmoller J (2004), "Pharmacogenetics of antidepressants and antipsychotics: the contribution of allelic variations to the phenotype of drug response", Mol Psychiatry, 9(5), pp 442-73 58 Klein K., Tatzel S., Raimundo S., Saussele T., Hustert E., Pleiss J., Eichelbaum M., Zanger U M (2007), "A natural variant of the hemebinding signature (R441C) resulting in complete loss of function of CYP2D6", Drug Metab Dispos, 35(8), pp 1247-50 59 Klingenberg M (1958), "Pigments of rat liver microsomes", Arch Biochem Biophys, 75(2), pp 376-86 60 Kohler D., Hartter S., Fuchs K., Sieghart W., Hiemke C (1997), "CYP2D6 genotype and phenotyping by determination of dextromethorphan and metabolites in serum of healthy controls and of patients under psychotropic medication", Pharmacogenetics, 7(6), pp 453-61 61 Kubota T., Yamaura Y., Ohkawa N., Hara H., Chiba K (2000), "Frequencies of CYP2D6 mutant alleles in a normal Japanese population and metabolic activity of dextromethorphan O-demethylation in different CYP2D6 genotypes", Br J Clin Pharmacol, 50(1), pp 31-4 62 Lay M J., Wittwer C T (1997), "Real-time fluorescence genotyping of factor V Leiden during rapid-cycle PCR", Clin Chem, 43(12), pp 2262-7 63 Leathart J B., London S J., Steward A., Adams J D., Idle J R., Daly A K (1998), "CYP2D6 phenotype-genotype relationships in African-Americans and Caucasians in Los Angeles", Pharmacogenetics, 8(6), pp 529-41 64 Li L., Pan R M., Porter T D., Jensen N S., Silber P., Russo G., Tine J A., Heim J., Ring B., Wedlund P J (2006), "New cytochrome P450 2D6*56 allele identified by genotype/phenotype analysis of cryopreserved human hepatocytes", Drug Metab Dispos, 34(8), pp 1411-6 65 Lynch T., Price A (2007), "The effect of cytochrome P450 metabolism on drug response, interactions, and adverse effects", Am Fam Physician, 76(3), pp 391-6 66 Madan A., Graham R A., Carroll K M., Mudra D R., Burton L A., Krueger L A., Downey A D., Czerwinski M., Forster J., Ribadeneira M D., Gan L S., LeCluyse E L., Zech K., Robertson P., Jr., Koch P., Antonian L., Wagner G., Yu L., Parkinson A (2003), "Effects of prototypical microsomal enzyme inducers on cytochrome P450 expression in cultured human hepatocytes", Drug Metab Dispos, 31(4), pp 421-31 67 Mahgoub A., Idle J R., Dring L G., Lancaster R., Smith R L (1977), "Polymorphic hydroxylation of Debrisoquine in man", Lancet, 2(8038), pp 584-6 68 Makris T M., von Koenig K., Schlichting I., Sligar S G (2006), "The status of high-valent metal oxo complexes in the P450 cytochromes", J Inorg Biochem, 100(4), pp 507-18 69 Marechal J D., Kemp C A., Roberts G C., Paine M J., Wolf C R., Sutcliffe M J (2008), "Insights into drug metabolism by cytochromes P450 from modelling studies of CYP2D6-drug interactions", Br J Pharmacol, 153 Suppl 1, pp S82-9 70 Marez-Allorge D., Ellis S W., Lo Guidice J M., Tucker G T., Broly F (1999), "A rare G2061 insertion affecting the open reading frame of CYP2D6 and responsible for the poor metabolizer phenotype", Pharmacogenetics, 9(3), pp 393-6 71 Marez D., Legrand M., Sabbagh N., Lo-Guidice J M., Boone P., Broly F (1996), "An additional allelic variant of the CYP2D6 gene causing impaired metabolism of sparteine", Hum Genet, 97(5), pp 668-70 Ket-noi.com Ket-noi.com kho kho tai tai lieu lieu mien mien phi phi 72 Marez D., Legrand M., Sabbagh N., Lo Guidice J M., Spire C., Lafitte J J., Meyer U A., Broly F (1997), "Polymorphism of the cytochrome P450 CYP2D6 gene in a European population: characterization of 48 mutations and 53 alleles, their frequencies and evolution", Pharmacogenetics, 7(3), pp 193-202 73 Marez D., Sabbagh N., Legrand M., Lo-Guidice J M., Boone P., Broly F (1995), "A novel CYP2D6 allele with an abolished splice recognition site associated with the poor metabolizer phenotype", Pharmacogenetics, 5(5), pp 305-11 74 Masimirembwa C., Hasler J., Bertilssons L., Johansson I., Ekberg O., Ingelman-Sundberg M (1996), "Phenotype and genotype analysis of debrisoquine hydroxylase (CYP2D6) in a black Zimbabwean population Reduced enzyme activity and evaluation of metabolic correlation of CYP2D6 probe drugs", Eur J Clin Pharmacol, 51(2), pp 117-22 75 Masimirembwa C., Persson I., Bertilsson L., Hasler J., Ingelman-Sundberg M (1996), "A novel mutant variant of the CYP2D6 gene (CYP2D6*17) common in a black African population: association with diminished debrisoquine hydroxylase activity", Br J Clin Pharmacol, 42(6), pp 713-9 76 McLaughlin L A., Paine M J., Kemp C A., Marechal J D., Flanagan J U., Ward C J., Sutcliffe M J., Roberts G C., Wolf C R (2005), "Why is quinidine an inhibitor of cytochrome P450 2D6? The role of key active-site residues in quinidine binding", J Biol Chem, 280(46), pp 38617-24 77 Meunier B., de Visser S P., Shaik S (2004), "Mechanism of oxidation reactions catalyzed by cytochrome p450 enzymes", Chem Rev, 104(9), pp 3947-80 78 Mitsunaga Y., Kubota T., Ishiguro A., Yamada Y., Sasaki H., Chiba K., Iga T (2002), "Frequent occurrence of CYP2D6*10 duplication allele in a Japanese population", Mutat Res, 505(1-2), pp 83-5 79 Naveen A T., Adithan C., Soya S S., Gerard N., Krishnamoorthy R (2006), "CYP2D6 genetic polymorphism in South Indian populations", Biol Pharm Bull, 29(8), pp 1655-8 80 Neafsey P., Ginsberg G., Hattis D., Sonawane B (2009), "Genetic polymorphism in cytochrome P450 2D6 (CYP2D6): Population distribution of CYP2D6 activity", J Toxicol Environ Health B Crit Rev, 12(5-6), pp 33461 81 Nelson D R., Zeldin D C., Hoffman S M., Maltais L J., Wain H M., Nebert D W (2004), "Comparison of cytochrome P450 (CYP) genes from the mouse and human genomes, including nomenclature recommendations for genes, pseudogenes and alternative-splice variants", Pharmacogenetics, 14(1), pp 1-18 82 Nguyen D L., Staeker J., Laika B., Steimer W (2009), "TaqMan real-time PCR quantification strategy of CYP2D6 gene copy number for the LightCycler 2.0", Clin Chim Acta, 403(1-2), pp 207-11 83 Nielsen K K., Flinois J P., Beaune P., Brosen K (1996), "The biotransformation of clomipramine in vitro, identification of the cytochrome P450s responsible for the separate metabolic pathways", J Pharmacol Exp Ther, 277(3), pp 1659-64 84 Okubo M., Murayama N., Miura J., Shimizu M., Yamazaki H (2012), "A rapid multiplex PCR assay that can reliably discriminate the cytochrome P450 2D6 whole-gene deletion allele from 2D6*10 alleles", Clin Chim Acta, 413(19-20), pp 1675-7 85 Omura T., Sato R (1964), "The Carbon Monoxide-Binding Pigment of Liver Microsomes I Evidence for Its Hemoprotein Nature", J Biol Chem, 239, pp 2370-8 86 Omura T., Sato R (1964), "The Carbon Monoxide-Binding Pigment of Liver Microsomes Ii Solubilization, Purification, and Properties", J Biol Chem, 239, pp 2379-85 Ket-noi.com Ket-noi.com kho kho tai tai lieu lieu mien mien phi phi 87 Oprian D D., Coon M J (1982), "Oxidation-reduction states of FMN and FAD in NADPH-cytochrome P-450 reductase during reduction by NADPH", J Biol Chem, 257(15), pp 8935-44 88 Oscarson M., Hidestrand M., Johansson I., Ingelman-Sundberg M (1997), "A combination of mutations in the CYP2D6*17 (CYP2D6Z) allele causes alterations in enzyme function", Mol Pharmacol, 52(6), pp 1034-40 89 Osikowska-Evers B., Dayer P., Meyer U A., Robertz G M., Eichelbaum M (1987), "Evidence for altered catalytic properties of the cytochrome P-450 involved in sparteine oxidation in poor metabolizers", Clin Pharmacol Ther, 41(3), pp 320-5 90 Paar W D., Poche S., Gerloff J., Dengler H J (1997), "Polymorphic CYP2D6 mediates O-demethylation of the opioid analgesic tramadol", Eur J Clin Pharmacol, 53(3-4), pp 235-9 91 Paine M J., McLaughlin L A., Flanagan J U., Kemp C A., Sutcliffe M J., Roberts G C., Wolf C R (2003), "Residues glutamate 216 and aspartate 301 are key determinants of substrate specificity and product regioselectivity in cytochrome P450 2D6", J Biol Chem, 278(6), pp 4021-7 92 Panserat S., Mura C., Gerard N., Vincent-Viry M., Galteau M M., JacozAigrain E., Krishnamoorthy R (1995), "An unequal cross-over event within the CYP2D gene cluster generates a chimeric CYP2D7/CYP2D6 gene which is associated with the poor metabolizer phenotype", Br J Clin Pharmacol, 40(4), pp 361-7 93 Pierik A., Zwanenburg C., Moerland E., Broer D., Stapert H., van den Brule A J (2011), "Rapid genotyping of human papillomavirus by post-PCR array-based hybridization techniques", J Clin Microbiol, 49(4), pp 1395402 94 Pilgrim J L., Gerostamoulos D., Drummer O H (2011), "Review: Pharmacogenetic aspects of the effect of cytochrome P450 polymorphisms on serotonergic drug metabolism, response, interactions, and adverse effects", Forensic Sci Med Pathol, 7(2), pp 162-84 95 Pulczynska A., Lukaszkiewicz J., Wojnar M., Tomaszewski P., KubiakTomaszewska G., Pachecka J (2011), "Cytochrome P450 polymorphism-molecular, metabolic, and pharmacogenetic aspects IV Application of long polymerase chain reaction for identification of CYP2D6 gene duplication", Acta Pol Pharm, 68(1), pp 9-13 96 Raimundo S., Fischer J., Eichelbaum M., Griese E U., Schwab M., Zanger U M (2000), "Elucidation of the genetic basis of the common 'intermediate metabolizer' phenotype for drug oxidation by CYP2D6", Pharmacogenetics, 10(7), pp 577-81 97 Raimundo S., Toscano C., Klein K., Fischer J., Griese E U., Eichelbaum M., Schwab M., Zanger U M (2004), "A novel intronic mutation, 2988G>A, with high predictivity for impaired function of cytochrome P450 2D6 in white subjects", Clin Pharmacol Ther, 76(2), pp 128-38 98 Rebsamen M C., Desmeules J., Daali Y., Chiappe A., Diemand A., Rey C., Chabert J., Dayer P., Hochstrasser D., Rossier M F (2009), "The AmpliChip CYP450 test: cytochrome P450 2D6 genotype assessment and phenotype prediction", Pharmacogenomics J, 9(1), pp 34-41 99 Ring B J., Gillespie J S., Eckstein J A., Wrighton S A (2002), "Identification of the human cytochromes P450 responsible for atomoxetine metabolism", Drug Metab Dispos, 30(3), pp 319-23 100 Rowland P., Blaney F E., Smyth M G., Jones J J., Leydon V R., Oxbrow A K., Lewis C J., Tennant M G., Modi S., Eggleston D S., Chenery R J., Bridges A M (2006), "Crystal structure of human cytochrome P450 2D6", J Biol Chem, 281(11), pp 7614-22 101 Sachse C., Brockmoller J., Bauer S., Roots I (1997), "Cytochrome P450 2D6 variants in a Caucasian population: allele frequencies and phenotypic consequences", Am J Hum Genet, 60(2), pp 284-95 Ket-noi.com Ket-noi.com kho kho tai tai lieu lieu mien mien phi phi 102 Sakuyama K., Sasaki T., Ujiie S., Obata K., Mizugaki M., Ishikawa M., Hiratsuka M (2008), "Functional characterization of 17 CYP2D6 allelic variants (CYP2D6.2, 10, 14A-B, 18, 27, 36, 39, 47-51, 53-55, and 57)", Drug Metab Dispos, 36(12), pp 2460-7 103 Sawhney S M., Taylor D W., Russell G C (2001), "Polymorphism of bovine major histocompatibility complex (MHC) class I genes revealed by polymerase chain reaction (PCR) and restriction enzyme analysis", Anim Genet, 32(1), pp 27-31 104 Schlichting I., Berendzen J., Chu K., Stock A M., Maves S A., Benson D E., Sweet R M., Ringe D., Petsko G A., Sligar S G (2000), "The catalytic pathway of cytochrome p450cam at atomic resolution", Science, 287(5458), pp 1615-22 105 Schmid B., Bircher J., Preisig R., Kupfer A (1985), "Polymorphic dextromethorphan metabolism: co-segregation of oxidative O-demethylation with debrisoquin hydroxylation", Clin Pharmacol Ther, 38(6), pp 618-24 106 Shen H., He M M., Liu H., Wrighton S A., Wang L., Guo B., Li C (2007), "Comparative metabolic capabilities and inhibitory profiles of CYP2D6.1, CYP2D6.10, and CYP2D6.17", Drug Metab Dispos, 35(8), pp 1292-300 107 Sim S C., Ingelman-Sundberg M (2013), "Update on allele nomenclature for human cytochromes P450 and the Human Cytochrome P450 Allele (CYP-allele) Nomenclature Database", Methods Mol Biol, 987, pp 251-9 108 Simooya O O., Njunju E., Hodjegan A R., Lennard M S., Tucker G T (1993), "Debrisoquine and metoprolol oxidation in Zambians: a population study", Pharmacogenetics, 3(4), pp 205-8 109 Sistonen J., Fuselli S., Palo J U., Chauhan N., Padh H., Sajantila A (2009), "Pharmacogenetic variation at CYP2C9, CYP2C19, and CYP2D6 at global and microgeographic scales", Pharmacogenet Genomics, 19(2), pp 170-9 110 Skinner M H., Kuan H Y., Pan A., Sathirakul K., Knadler M P., Gonzales C R., Yeo K P., Reddy S., Lim M., Ayan-Oshodi M., Wise S D (2003), "Duloxetine is both an inhibitor and a substrate of cytochrome P4502D6 in healthy volunteers", Clin Pharmacol Ther, 73(3), pp 170-7 111 Skoda R C., Gonzalez F J., Demierre A., Meyer U A (1988), "Two mutant alleles of the human cytochrome P-450db1 gene (P450C2D1) associated with genetically deficient metabolism of debrisoquine and other drugs", Proc Natl Acad Sci U S A, 85(14), pp 5240-3 112 Solus J F., Arietta B J., Harris J R., Sexton D P., Steward J Q., McMunn C., Ihrie P., Mehall J M., Edwards T L., Dawson E P (2004), "Genetic variation in eleven phase I drug metabolism genes in an ethnically diverse population", Pharmacogenomics, 5(7), pp 895-931 113 Sorensen L B., Sorensen R N., Miners J O., Somogyi A A., Grgurinovich N., Birkett D J (2003), "Polymorphic hydroxylation of perhexiline in vitro", Br J Clin Pharmacol, 55(6), pp 635-8 114 Soyama A., Kubo T., Miyajima A., Saito Y., Shiseki K., Komamura K., Ueno K., Kamakura S., Kitakaze M., Tomoike H., Ozawa S., Sawada J (2004), "Novel nonsynonymous single nucleotide polymorphisms in the CYP2D6 gene", Drug Metab Pharmacokinet, 19(4), pp 313-9 115 Soyama A., Saito Y., Kubo T., Miyajima A., Ohno Y., Komamura K., Ueno K., Kamakura S., Kitakaze M., Tomoike H., Ozawa S., Sawada J (2006), "Sequence-based analysis of the CYP2D6*36-CYP2D6*10 tandem-type arrangement, a major CYP2D6*10 haplotype in the Japanese population", Drug Metab Pharmacokinet, 21(3), pp 208-16 116 Steen V M., Andreassen O A., Daly A K., Tefre T., Borresen A L., Idle J R., Gulbrandsen A K (1995), "Detection of the poor metabolizer-associated CYP2D6(D) gene deletion allele by long-PCR technology", Pharmacogenetics, 5(4), pp 215-23 117 Subrahmanyam V., Renwick A B., Walters D G., Young P J., Price R J., Tonelli A P., Lake B G (2001), "Identification of cytochrome P-450 Ket-noi.com Ket-noi.com kho kho tai tai lieu lieu mien mien phi phi isoforms responsible for cis-tramadol metabolism in human liver microsomes", Drug Metab Dispos, 29(8), pp 1146-55 118 Sukumaran S M., Potsaid B., Lee M Y., Clark D S., Dordick J S (2009), "Development of a fluorescence-based, ultra high-throughput screening platform for nanoliter-scale cytochrome p450 microarrays", J Biomol Screen, 14(6), pp 668-78 119 Sun H., Scott D O (2010), "Structure-based drug metabolism predictions for drug design", Chem Biol Drug Des, 75(1), pp 3-17 120 Tomaszewski "Cytochrome P., Kubiak-Tomaszewska P450 G., Pachecka polymorphism molecular, J metabolic, (2008), and pharmacogenetic aspects II Participation of CYP isoenzymes in the metabolism of endogenous substances and drugs", Acta Pol Pharm, 65(3), pp 307-18 121 Toscano C., Klein K., Blievernicht J., Schaeffeler E., Saussele T., Raimundo S., Eichelbaum M., Schwab M., Zanger U M (2006), "Impaired expression of CYP2D6 in intermediate metabolizers carrying the *41 allele caused by the intronic SNP 2988G>A: evidence for modulation of splicing events", Pharmacogenet Genomics, 16(10), pp 755-66 122 Veiga M I., Asimus S., Ferreira P E., Martins J P., Cavaco I., Ribeiro V., Hai T N., Petzold M G., Bjorkman A., Ashton M., Gil J P (2009), "Pharmacogenomics of CYP2A6, CYP2B6, CYP2C19, CYP2D6, CYP3A4, CYP3A5 and MDR1 in Vietnam", Eur J Clin Pharmacol, 65(4), pp 355-63 123 Venkatakrishnan K., Greenblatt D J., von Moltke L L., Schmider J., Harmatz J S., Shader R I (1998), "Five distinct human cytochromes mediate amitriptyline N-demethylation in vitro: dominance of CYP 2C19 and 3A4", J Clin Pharmacol, 38(2), pp 112-21 124 Venkatakrishnan K., Schmider J., Harmatz J S., Ehrenberg B L., von Moltke L L., Graf J A., Mertzanis P., Corbett K E., Rodriguez M C., Shader R I., Greenblatt D J (2001), "Relative contribution of CYP3A to amitriptyline clearance in humans: in vitro and in vivo studies", J Clin Pharmacol, 41(10), pp 1043-54 125 von Moltke L L., Greenblatt D J., Giancarlo G M., Granda B W., Harmatz J S., Shader R I (2001), "Escitalopram (S-citalopram) and its metabolites in vitro: cytochromes mediating biotransformation, inhibitory effects, and comparison to R-citalopram", Drug Metab Dispos, 29(8), pp 1102-9 126 Walko C M., McLeod H (2012), "Use of CYP2D6 genotyping in practice: tamoxifen dose adjustment", Pharmacogenomics, 13(6), pp 691-7 127 Wang J S., DeVane C L (2003), "Involvement of CYP3A4, CYP2C8, and CYP2D6 in the metabolism of (R)- and (S)-methadone in vitro", Drug Metab Dispos, 31(6), pp 742-7 128 Wang L L., Li Y., Zhou S F (2009), "A bioinformatics approach for the phenotype prediction of nonsynonymous single nucleotide polymorphisms in human cytochromes P450", Drug Metab Dispos, 37(5), pp 977-91 129 Wang S L., Huang J D., Lai M D., Liu B H., Lai M L (1993), "Molecular basis of genetic variation in debrisoquin hydroxylation in Chinese subjects: polymorphism in RFLP and DNA sequence of CYP2D6", Clin Pharmacol Ther, 53(4), pp 410-8 130 Wang S L., Lai M D., Huang J D (1999), "G169R mutation diminishes the metabolic activity of CYP2D6 in Chinese", Drug Metab Dispos, 27(3), pp 385-8 131 Wennerholm A., Johansson I., Massele A Y., Lande M., Alm C., Aden-Abdi Y., Dahl M L., Ingelman-Sundberg M., Bertilsson L., Gustafsson L L (1999), "Decreased capacity for debrisoquine metabolism among black Tanzanians: analyses of the CYP2D6 genotype and phenotype", Pharmacogenetics, 9(6), pp 707-14 132 Wilson L D., Oldham S B., Harding B W (1968), "Cytochrome P450 and steroid 11beta-hydroxylation in mitochondria from human adrenal cortex", J Clin Endocrinol Metab, 28(8), pp 1143-52 Ket-noi.com Ket-noi.com kho kho tai tai lieu lieu mien mien phi phi 133 Yamazaki H., Guo Z., Persmark M., Mimura M., Inoue K., Guengerich F P., Shimada T (1994), "Bufuralol hydroxylation by cytochrome P450 2D6 and 1A2 enzymes in human liver microsomes", Mol Pharmacol, 46(3), pp 56877 134 Yokoi T., Kosaka Y., Chida M., Chiba K., Nakamura H., Ishizaki T., Kinoshita M., Sato K., Gonzalez F J., Kamataki T (1996), "A new CYP2D6 allele with a nine base insertion in exon in a Japanese population associated with poor metabolizer phenotype", Pharmacogenetics, 6(5), pp 395-401 135 Yokota H., Tamura S., Furuya H., Kimura S., Watanabe M., Kanazawa I., Kondo I., Gonzalez F J (1993), "Evidence for a new variant CYP2D6 allele CYP2D6J in a Japanese population associated with lower in vivo rates of sparteine metabolism", Pharmacogenetics, 3(5), pp 256-63 136 Yuan R., Madani S., Wei X X., Reynolds K., Huang S M (2002), "Evaluation of cytochrome P450 probe substrates commonly used by the pharmaceutical industry to study in vitro drug interactions", Drug Metab Dispos, 30(12), pp 1311-9 137 Yue Q Y., Zhong Z H., Tybring G., Dalen P., Dahl M L., Bertilsson L., Sjoqvist F (1998), "Pharmacokinetics of nortriptyline and its 10-hydroxy metabolite in Chinese subjects of different CYP2D6 genotypes", Clin Pharmacol Ther, 64(4), pp 384-90 138 Zanger U M., Raimundo S., Eichelbaum M (2004), "Cytochrome P450 2D6: overview and update on pharmacology, genetics, biochemistry", Naunyn Schmiedebergs Arch Pharmacol, 369(1), pp 23-37 139 Zhang W Y., Tu Y B., Haining R L., Yu A M (2009), "Expression and functional analysis of CYP2D6.24, CYP2D6.26, CYP2D6.27, and CYP2D7 isozymes", Drug Metab Dispos, 37(1), pp 1-4 140 Zhou S F (2009), "Polymorphism of human cytochrome P450 2D6 and its clinical significance: Part I", Clin Pharmacokinet, 48(11), pp 689-723 141 Zhou S F., Di Y M., Chan E., Du Y M., Chow V D., Xue C C., Lai X., Wang J C., Li C G., Tian M., Duan W (2008), "Clinical pharmacogenetics and potential application in personalized medicine", Curr Drug Metab, 9(8), pp 738-84 142 Zhou S F., Liu J P., Lai X S (2009), "Substrate specificity, inhibitors and regulation of human cytochrome P450 2D6 and implications in drug development", Curr Med Chem, 16(21), pp 2661-805 143 Zuo L J., Guo T., Xia D Y., Jia L H (2012), "Allele and genotype frequencies of CYP3A4, CYP2C19, and CYP2D6 in Han, Uighur, Hui, and Mongolian Chinese populations", Genet Test Mol Biomarkers, 16(2), pp 102-8 144 Magdeldin Sameh (2012), Gel Electrophoresis - Principles and Basics, InTech, pp 346 ... hành đề tài: Tổng quan đột biến gen mã hóa CYP2D6 với mục tiêu sau: Tìm hiểu đột biến gen mã hóa CYP2D6 phát Tìm hiểu phương pháp phát đột biến gen CYP2D6 2 CHƯƠNG ĐẠI CƯƠNG VỀ CYP2D6 1.1 CYTOCHROM... dụng CYP2D6 1.2.3 Cơ chất CYP2D6 1.3 GEN MÃ HÓA CYP2D6 15 CHƯƠNG ĐỘT BIẾN GEN MÃ HÓA CYP2D6 16 2.1 KHÁI NIỆM CƠ BẢN VỀ ĐỘT BIẾN GEN 16 2.1.1 Các loại đột biến. .. pseudogen CYP2D8P CYP2D7P [37] Hình Vị trí CYP2D6 nhiễm sắc thể [37] 16 CHƯƠNG ĐỘT BIẾN GEN MÃ HÓA CYP2D6 2.1 KHÁI NIỆM CƠ BẢN VỀ ĐỘT BIẾN GEN Đột biến theo nghĩa rộng biến đổi di truyền xảy đột