Xác định tỉ lệ vi khuẩn đường ruột mang gen KPC và NDM 1 tại bệnh viện hữu nghị việt đức từ tháng 12 2016 đến tháng 4 2017

VIỆN ĐẠI HỌC MỞ HÀ NỘI KHOA CÔNG NGHỆ SINH HỌC KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐỀ TÀI: “XÁC ĐỊNH TỈ LỆ VI KHUẨN ĐƯỜNG RUỘT MANG GEN KPC VÀ NDM-1 TẠI BỆNH VIỆN HỮU NGHỊ VIỆT ĐỨC TỪ THÁNG 12/2016 ĐẾN THÁNG 4/2017” Ngƣời hƣớng dẫn: Th.s Nguyễn Thị Vân Sinh viên thực hiện: Phan Ngọc Hà Lớp: 13-01 Hà Nội – 2017 LỜI CẢM ƠN Trong suốt trình học tập, nghiên cứu hồn thành khóa luận tốt nghiệp dã nhận nhiều giúp đỡ quý báu, xin bày tỏ lòng biết ơn sau sắc tới giúp đỡ Lời đầu tiên, tơi xin bày tỏ lịng kính trọng biết ơn sâu sắc tới Th.s Nguyễn Thị Vân – Trưởng khoa Vi sinh, Bệnh viện Hữu nghị Việt Đức, người tận tình hướng dẫn, tạo điều kiện thuận lợi giúp đỡ suốt thời gian thực hồn thành khóa luận tốt nghiệp Tơi xin chân thành cảm ơn KTV Nguyễn Thành Đô KTV Đoàn Anh Tuấn cán khoa Vi sinh, tận tình bảo giúp đỡ tơi hồn thành khóa luận Tơi xin chân thành bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc tới thầy khoa Công nghệ sinh học, Viện Đại học Mở Hà Nội, tận tình giúp đỡ, bảo suốt q trình học tập Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc tới gia đình bạn bè, người bênh cạnh động viên, ủng hộ, tạo điều kiện tuận lợi giúp học tập hồn thành khóa luận tốt nghiệp Hà Nội, ngày 15 tháng năm 2017 Sinh viên Phan Ngọc Hà MỤC LỤC DANH MỤC CÁC BẢNG DANH MỤC CÁC HÌNH ẢNH DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT MỞ ĐẦU: PHẦN I: TỔNG QUAN 1.1 Nhiễm khuẩn bệnh viện: 1.2 Kháng sinh đề kháng kháng sinh 10 1.2.1 Lịch sử phát triển kháng sinh: 10 1.2.2 Sự đề kháng kháng sinh vi khuẩn: 11 1.2.2.1 Sự phát triển đặc tính kháng kháng sinh vi khuẩn: 11 1.2.2.2 Phân loại đề kháng 11 1.2.3 Cơ chế kháng kháng sinh vi khuẩn 12 1.2.3.1 Thay đổi đích tác động 12 1.2.3.2 Tạo enzym 13 1.2.3.3 Giảm tính thấm màng nguyên sinh chất 13 1.3 Carbapenem chế kháng Carbapenem: 13 1.3.1 Carbapenem: 13 1.3.2 Cơ chế kháng cabapenem: 14 1.4 Tổng quan KPC NDM-1: 15 1.4.1 Tên loài phân loại: 15 1.4.2 Lịch sử phân bố: 17 1.4.3 Đặc điểm hình thái, sinh lý, sinh hóa số vi khuẩn mang gen KPC NDM-1: 18 1.4.4 Đặc điểm dịch tễ học: 23 1.4.5 Đặc điểm lâm sàng: 26 1.4.6 Đặc tính sinh học phân tử vi khuẩn mang gen KPC NDM-1 28 1.5 Tình hình nghiên cứu tính đề kháng Carbapenem vi khuẩn mang gen KPC NDM-1 30 1.5.1 Tình hình đề kháng Carbapenem vi khuẩn mang gen KPC NDM-1 Thế giới 31 1.5.2 Tình hình đề kháng Carbapenem vi khuẩn mang gen KPC NDM-1 Việt Nam: 32 1.6 Ứng dụng CNSH vào xác định gen kháng kháng sinh Cabapenem: 33 1.6.1 Phƣơng pháp PCR: 33 1.6.2 Phƣơng pháp Realtime PCR: 35 1.6.3 Cách xác định KPC NDM-1: 36 1.6.4 Quy trình sử dụng hệ thống realtime PCR ABI Mỹ: 36 PHẦN II: PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU: 40 2.1 Đối tƣợng phƣơng pháp nghiên cứu: 40 2.1.1.Địa điểm nghiên cứu: Bệnh viện Hữu nghị Hà Nội Việt Đức làm địa điểm nghiên cứu 40 2.1.2 Đối tƣợng nghiên cứu: 40 2.1.3 Lấy mẫu thuận tiện 40 2.2 Vật liệu nghiên cứu: 40 2.3 Phƣơng pháp: 41 2.3.1: Ni cấy vi khuẩn khí: 41 2.3.2 Thử nghiệm kháng sinh đồ với vi khuẩn khí: 41 2.3.3 Xác định gen KPC NDM-1bằng hệ thống Realtime ABI Mỹ: 41 2.3.3.1.Chuẩn bị cho phƣơng pháp realtime PCR xác định gen KPC NDM1 41 2.3.3.3 Tiến hành: 42 2.4 Phân tích xử lý số liệu: 45 2.4.1 Phân tích xử lý số liệu: 46 2.4.2 Kiểm sốt sai số xảy trình nghiên cứu: 46 PHẦN III: KẾT QUẢ 48 1.Tổng số bệnh nhân: 41 48 Phân loại bệnh phẩm theo khoa 48 3.Tỉ lệ bệnh nhân theo chẩn đoán 49 Tỉ lệ loại bệnh phẩm 50 Tỉ lệ chủng vi khuẩn toàn kháng phân lập đƣợc 50 Mức độ nhạy cảm kháng sinh 50 6.1 Mức độ nhạy cảm kháng sinh 41 chủng 50 6.2 K.pneumoniae (26 chủng) 51 6.3 E.coli (6 chủng) 51 Tỷ lệ KPC/NDM1 52 Phân bố tỉ lệ gen kháng thuốc theo loại vi khuẩn 52 Phân bố tỉ lệ gen kháng thuốc theo bệnh phẩm 53 10 Phân bố tỉ lệ gen kháng thuốc theo khoa 54 BÀN LUẬN 55 KẾT LUẬN 56 TÀI LIỆU THAM KHẢO 57 DANH MỤC BỆNH NHÂN DANH MỤC BỆNH NHÂN STT TÊN BỆNH NHÂN NGÀY NHẬN NGÀY TRẢ BỆNH PHẨM KẾT QUẢ BẾ XUÂN A 6/12/2016 8/12/2016 HOÀNG VĂN B 5/12/2016 8/12/2016 NGUYỄN BÁ C 4/12/2016 8/12/2016 ĐÀO VĂN D 15/12/2016 19/12/2016 TÔ VĂN E 13/12/2016 19/12/2016 TRẦN THỊ F 19/12/2016 23/12/2016 VŨ HỒNG G 21/12/2016 26/12/2016 LÊ THANH H 28/12/2016 31/12/2016 NGUYỄN KHẮC K 27/12/2016 31/12/2016 10 VŨ VĂN L 28/12/2016 31/12/2016 11 BÙI HỒNG Z 29/12/2016 3/1/2017 12 HOÀNG VIỆT T 29/12/2016 3/1/2017 13 NGUYỄN THANH V 30/12/2016 3/1/2017 14 ĐINH VĂN N 9/1/2017 12/1/2017 15 NGUYỄN HỮU M 9/1/2017 12/1/2017 16 NGUYỄN MẠNH S 9/1/2017 16/1/2017 17 BÙI NGỌC Q 12/1/2017 16/1/2017 18 ĐỖ THỊ K 13/2/2017 13/2/2017 19 VI VĂN P 13/2/2017 13/2/2017 20 PHẠM VĂN T 13/2/2017 13/2/2017 21 NGUYỄN ĐỨC R 16/2/2017 17/2/2017 22 NGUYỄN THỊ I 16/2/2017 17/2/2017 23 NGÔ THỊ Y 20/2/2017 20/2/2017 24 LÊ THỊ U 24/2/2017 27/2/2017 25 HỒ THỊ T 6/3/2017 6/3/2017 26 TRẦN THỊ P 6/3/2017 6/3/2017 27 TO VĂN R 31/3/2017 3/4/2017 28 HOÀNG THỊ B 7/4/2017 11/4/2017 29 NGUYỄN KIM D 5/4/2017 10/4/2017 30 LÊ THỊ H 12/4/2017 17/4/2017 31 NGUYỄN VĂN H 18/4/2017 21/4/2017 32 ĐÀO TIẾN A 12/4/2017 14/4/2017 33 TẠ VĂN M 12/4/2017 14/4/2017 34 NGUYỄN ĐĂNG N 12/4/2017 17/4/2017 35 CAO ĐẮC R 12/4/2017 14/4/2017 36 PHẠM VĂN K 17/4/2017 21/4/2017 37 NGUYỄN TIẾN A 18/4/2017 21/4/2017 38 CẤN XUÂN V 20/4/2017 24/4/2017 39 ĐÀO ĐỨC Q 20/4/2017 24/4/2017 40 NGUYỄN THỊ L 25/4/2017 28/4/2017 41 NGUYỄN THÁI Z 26/4/2017 28/4/2017 DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng Tên bảng Trang 1.1 Đặc điểm phân tử KPC- sản xuấ phân lập Ontario 2008/2011 29 2.1 Trang thiết bị dùng thí nghiệm 40 2.2 Trình tự mồi để phát gen KPC NDM-1 42 3.1 Phân loại bệnh phẩm theo khoa 47 3.2 Tỉ lệ bệnh nhân theo chuẩn đoán 48 3.3 Tỉ lệ loại bệnh phẩm 49 3.4 Tỉ lệ chủng vi khuẩn toàn kháng phân lập 49 3.5 Mức độ nhayn cảm kháng sinh 50 3.6 Các chủng K pneumonia 50 3.7 Các chủng E coli 51 3.8 Tỷ lệ KPC/ NDM-1 51 3.9 Tỷ lệ phân bố gen kháng thuốc theo loại vi khuẩn 51 3.10 Tỷ lệ phân bố gen kháng thuốc theo bệnh phẩm 52 3.11 Tỷ lệ phân bố gen kháng thuốc theo khoa 53 DANH MỤC CÁC HÌNH ẢNH Hình Tên hình Trang 1.1 Sơ đồ nhiễm khuẩn bệnh viện 1.2 Tỷ lệ phân bố nhiễm khuẩn bệnh viện nước có thu nhập cao 1.3 Tỷ lệ phân bố nhiễm khuẩn bệnh viện nước có thu nhập thấp trung bình 1.4 Cơ chế kháng kháng sinh vi khuẩn Gram âm 11 1.5 Cấu trúc phân tử Carbapenem 13 1.6 Đặc điểm vùng mang gen kháng kháng sinh chủng K pneumonia 16 1.7 So sánh trình tự amino acid NDM-1 với trình tự amino acid IMP1, IMP2, IMP-8,… 16 1.8 Hình ảnh chụp hiển vi hình thái siêu cấu trúc K pneumonia 18 1.9 Hình ảnh vi khuẩn K pneumonia nuôi thạch máu 18 1.10 Hình ảnh k.pneumoniae thử canh thang 19 1.11 Một số phản ứng hóa học K pneumonia 19 1.12 Hình thái vi khuẩn E coli 20 1.13 E coli nuôi cấy số môi trường thạch 21 1.14 Hình ảnh số phản ứng hóa học củ E coli 21 1.15 Tỷ lệ phân bố vi khuẩn mang gen NDM-1 giới 23 Hình ảnh chạy PCR chứng mẫu tìm KPC NDM-1 Hình ảnh chạy chứng (+): Hình ảnh chạy chứng (-): 45 PHẦN III: KẾT QUẢ 1.Tổng số bệnh nhân: 41 Nam: 29BN Nữ: 12BN 29,27% Nam Nữ 70,73% Nhận xét: Số lượng bệnh nhân nam chiếm tỉ lệ 70,73%, bệnh nhân nữ chiếm 29, 27% Phân loại bệnh phẩm theo khoa Bảng 3.1: bảng phân loại bệnh phẩm theo khoa: STT Số lƣợng bệnh Khoa phòng Tỉ lệ % phẩm Hồi sức tích cực 13 31,7% Hồi sức tích cực 12 29,2% Khoa tiết niệu 9,6% Khoa gan mật 7,3% Thận nhân tạo 7,3% Khoa phẫu thuật nhiễm khuẩn 4,9% Nam Học 2,5% Chấn thương 1 2,5% Khoa tim mạch 2,5% 10 Khoa khác 2,5% 46 Nhận xét: Trong tổng số 41 chủng vi khuẩn kháng kháng sinh nhóm carbapenem từ 41 mẫu bệnh phẩm khoa Hồi sức tích cực chiếm tỉ lệ cao 31.7% khoa Hồi sức tích cực chiếm tỉ lệ 29.2% Khoa tiết niệu chiếm 9.6% Khoa Thận nhân tạo khoa Gan mật chiếm tỉ lệ 7.3% Các khoa khác chiểm tỉ lệ 2.5% Như vậy, có 10 khoa bệnh viện có xuất chủng vi khuẩn kháng hầu hết kháng sinh thử nghiệm 3.Tỉ lệ bệnh nhân theo chẩn đoán Bảng 3.2: tỷ lệ bệnh nhân theo chuẩn đoán Chẩn đoán STT Số BN Tỉ lệ Đa chấn thương 19,5% Nhiễm trùng đường mật 17.1% Sỏi thận/mủ thận 12.2% Chấn thương sọ não 9.75% U phì đại TLT/u bàng quang 9.75% Viêm phúc mạc ruột thừa 7.3% Xuất huyết tiêu hóa 4,9% Viêm xương , phần mềm 4.9% ESRD/ghép thận 2,4% 10 Áp xe tồn dư sm 2,4% 11 Sa lồi thành bụng/bệnh van tim 2,4% 12 Đau bụng CRNN 2,4% 13 Áp xe phổi/ Sm thoát vị hành 2,4% Nhận xét: Trong số bệnh nhân nằm viện bệnh nhân đa chấn thương mang vi kháng thuốc carbapenem nhiều chiếm tỉ lệ 19.5% Tiếp theo bệnh nhân sỏi mật, sỏi thận, viêm phúc mạc ruột thừa chiếm % Các nguyên nhân lại chiếm tỉ lệ 2.4% 47 Tỉ lệ loại bệnh phẩm Bảng 3.3: Tỷ lệ loại bệnh phẩm: Bệnh Dịch phẩm phế Mủ Nƣớc Dich Máu Đờm Dịch Dịch Khác tiểu ổ mật quản Số lượng Tỉ lệ % 16 vết bụng mổ 2 1 39% 17,1% 12,2% 9,8% 7,3% 4,9% 4,9% 2,4% 2,4% Nhận xét: Trong tổng số 41 loại bệnh phẩm dịch phế quản chiếm 39% tiếp đến tỉ lệ mủ chiếm 17.1%, nước tiểu chiếm 12.2 %, dịch mật chiếm 9.8% Các bệnh phẩm khác chiếm từ 2.4 đến 7.3 % Tỉ lệ chủng vi khuẩn toàn kháng phân lập đƣợc Bảng 3.4: tỷ lệ chủng vi khuẩn toàn kháng phân lập đƣợc: Vi khuẩn Tổng số Tỉ lệ % ESBL + ESBL - K.pneumoniae 26 63,4% E.coli 14,6% E.aerogenes 9,7% C.freundii 4,9% C.diversus 2,5% E.cloace 2,5% P.aeruginosa 2,5% Nhận xét: Trong số 41 chủng vi khuẩn kháng kháng sinh nhóm carbapenem phân lập từ 41 bệnh phẩm loại K peumoniae chiếm tỉ lệ cao 63,4% Sau E coli chiếm 14.6%, E.aerogeneschiếm 9.7% C.freundii chiếm 4.9% C.diversusvà E.cloace, P.aeruginosa chiếm tỉ lệ 2.5% Bằng kỹ thuật xác định ESBL hình thái tạo vùng ức chế khoanh kháng sinh amoxicyclin/acid clavunalic cefotaxim đĩa thạch Muler Hinton trải vi khuẩn có chủng K pneumoniae xác định có ESBL (+) Mức độ nhạy cảm kháng sinh 6.1 Mức độ nhạy cảm kháng sinh 41 chủng 48 Bảng 3.5: mức độ nhạy cảm kháng sinh AM TC TZ CA S CX CT ET CI C C P Z M X 0 0 0 P P 0 0 M 2.4 2.5 30 74 (%) I G AK IP 0 2.5 7.7 ME SX TG M M T C 0 18 77.8 0 22.2 81 (%) 100 100 100 100 100 100 97 R( 95 69 17 100 100 %) Nhận xét: 41 chủng thu thập tháng kháng 100% với amoxicicllin/acidclavulanic, piperacilin/Tazobactam, nhóm cefalosporin, riêng với nhóm carbapenem kháng 100% với imipenem meropenem, kháng 97.6% với ertapenem Với nhóm aminoglycosid nhạy 74.4% với amikacin, nhạy cảm với gentamycin 30.6 % Riêng tigecyclin chủng nhạy cảm 77.8% 6.2 K.pneumoniae (26 chủng) Bảng 3.6: Các chủng K.pneumoniae AM TC TZ CA S S CX CT ET CI C C P Z M X 0 0 0 G A IP M K M M T 3.8 11 30 61 0 15 80.8 P (%) I I 0 0 0 P 3.8 7.7 ME SX TG C 0 19.2 84 (%) R R 100 100 100 100 100 100 96 84 69 7.7 100 100 (%) 6 Nhận xét: số 26/41 chủng K pneumoniae 96.2% chủng kháng kháng sinh Ertapenem 100 % chủng kháng với kháng sinh imipenem meropenem Đối với nhóm kháng sinh Aminoglysid chủng nhạy cảm tương đối từ 30.8 đến 61.4% 6.3 E.coli (6 chủng) 49 Bảng 3.7: chủng E.coli AM TC TZ CA CX CT ET CI S(% S G A IP ME SX TG C C P Z M X P P M K M M T 0 0 0 0 50 83 0 66 83.3 ) I(% I 0 0 0 0 0 C 0 16.7 33 ) R 100 100 100 100 100 100 100 10 50 16 100 100 R( %) Nhận xét: Trong số chủng E.coli phân lập 100% kháng vói nhóm kháng sinh lựa chọn cuối (Ertapenem 100 % chủng kháng với kháng sinh imipenem meropenem.) điều trị vi khuẩn đường ruột Nhận xét: Trong số chủng E aerogenes phân lập 100% kháng vói nhóm kháng sinh lựa chọn cuối (Ertapenem 100 % chủng kháng với kháng sinh imipenem meropenem.) điều trị vi khuẩn đường ruột Tỷ lệ KPC/NDM1 Bảng 3.8: tỷ lệ KPC/NDM-1: Gen kháng KPC + NDM1+ KPC/NDM1 - Số lượng 15 21 Tỉ lệ 36,6% 51,2% 12,2% Nhận xét: Tỉ lệ số chủng phân lập gen KPC chiếm 36.6% , NDM-1 chiếm 51.2% 12.2 % không mang gen KPC NDM-1 Phân bố tỉ lệ gen kháng thuốc theo loại vi khuẩn Bảng 3.9: tỷ lệ phân bố gen kháng thuốc theo loại vi khuẩn: KPC(+) K.pn E.coli 12 E.arogenes C.freudii C.diversus E.cloace Tổng 50 15 (46,2%) (16,7%) NDM1(+) (50%) (100%) (50%) (50%) 0 0 1 (34,6%) (66,6%) KPC (50%) 1 21 (100%) NDM1 (- (19,2%) (16,7%) ) Tông 26 Nhận xét: Trong tổng số 26 chủng K pneumoniae có 46.2%(n=12) số chủng mang gen KPC 34.6%(n=9) số chủng mang gen NDM-1 19.2% (n=5) chủng không mang hai loại gen chủng E.coli 16.7%(n=1) mang gen KPC 66.6% (n=4)mang gen NDM-1, có chủng chiếm 16.7% không mang hai loại gen Phân bố tỉ lệ gen kháng thuốc theo bệnh phẩm Bảng 3.10: tỷ lệ phân bố gen kháng thuốc theo bệnh phẩm: DPQ KPC (+) Mủ 11 (68.8 %) NDM1 (+) KPC (18,8 (100 %) %) NT (-) %) Tổng 16 Máu Đờm DOB mật bl sp ab 2 (13.3 (13.3 %) %) (60%) NDM1 (17,5 Dịch (50%) DVM dịch Tổng khác 15 0 0 1 (100 (66,7 (100 (100 (100 %) %) %) %) %) (33,3 21 0 1 %) 51 41 Nhận xét: Trong số 16 bệnh phẩm dịch phế quản xác định 11 bệnh phẩm chiếm tỉ lệ 73.4 nhiễm vi khuẩn mang gen KPC 73.4% mẫu bệnh phẩm dịch phế quản mang vi khuẩn có gen KPC Nước tiểu dịch mật chiếm 13.3% 10 Phân bố tỉ lệ gen kháng thuốc theo khoa Bảng 3.11: tỷ lệ phân bố gen kháng thuốc theo khoa: Khoa KPC(+) HSTC HSTC P.14 (61,5% (33,3 NDM1 (+) KPC NDM1 (-) Tông ) %) P.1617 TNT P.13 1 Nam 15B 0 0 1 (100 (100 (100 %) %) %) 0 1 Học ) ) ) %) ) ) ) 1 (23,1% (8,3%) ) 12 khác (33,3% (33,3% (50%) (15,4% (58,4 (100% (33,3% (66,7% (50%) 13 Khoa CT1 (33,3% (100 ) %) 3 Nhận xét: Trong 15 chủng mang gen KPC 21 chủng mang gen NDM-1 khoa Hồi sức tích cực có vi khuẩn mang gen KPC chiếm 61.5% NDM-1 chiếm 15.4% Khoa Hồi sức tích cực có vi khuẩn mang gen KPC chiếm 33.3% NDM-1 chiếm 58.4% 52 BÀN LUẬN Năm 1996 KPC phát lần Mỹ NDM-1 phát lần Ấn Độ năm 2008[35] [42] Kumarasaky cộng phân tích 180 chủng vi khuẩn đường ruột mang NDM-1 Anh, Ấn Độ Pakistan [1][12-13] Tại châu Âu : 2008-2010 có 77 bệnh nhân nhiễm vi khuẩn mang gen NDM1 kháng hồn tồn nhóm kháng sinh carbapenem 13 quốc gia với số ca bệnh là: ca (2008)30 ca (2009) 39 ca (9 tháng năm 2010) Đến NDM-1 có mặt Autraylia, Canada, Trung Quốc, Hoa Kỳ nhiều nước khác Trong số phân lập NDM-1 31 chủng K pneumoniae, E coli 36 chủng , Enterobacter spp chủng C freundii chủng Theo nghiên cứu Jeong et all 12 tháng thu 393 chủng 27 chủng mang gen KPC chủng mang gen NDM-1 Cũng theo ơng 100% chủng kháng nhóm carbapenem Theo Vanegas et al 59 chủng phân lập K pneumoniae chiếm 47.4% 24 chủng mang gen KPC Theo De Lavelaye et al nghiên cứu tháng thu thập 13 chủng K pneumoniae mang KPC [36] Theo O’Connor et al nhóm vi khuẩn đường ruột gây nhiễm trùng bệnh viện có lệ tử vong cao liên quan tới lan truyền gen kháng NDM1.[35] Theo ConteV cộng 13 tháng thu thập 461 chủng K pneumoniae có 167 chủng mang gen KPC [36] 53 Tại Đài Loan theo Wu PF et al 24 tháng 105 trường hợp nhiễm K pneumiae 28 chủng mang gen KPc MIC imipenem >= 16 microgam/mililit Tại bệnh viện HN Việt Đức năm 2012 phát 5/35 trường hợp mang NDM-1 [35] Hiện tại, Bệnh viện HN Việt Đức phát bước đầu phân tích đặc điểm sinh học phân tử cần tiếp tục mở rộng nghiên cứu đặc điểm lâm sàng, tồn lây lan bệnh viện xa cộng đồng KẾT LUẬN Trong tháng (từ 12/2016- 4/2017) xuất 41 chủng vi khuân toàn kháng (kháng hầu hết kháng sinh thử nghiệm) Đối với nhóm Carbapenem chúng kháng 100 % , nhóm lựa chọn kháng sinh cuối cho vi khuẩn đường ruột 41 chủng phân lập 15 chủng phân lập gen KPC chiếm 36.6% , 21 chủng phân lập NDM-1 chiếm 51.2% 12.2 % chủng không không mang gen KPC NDM-1 Trong đó, tổng số 26 chủng K pneumoniae có 46.2% số chủng mang gen KPC 34.6% số chủng mang gen NDM-1 19.2 chủng không mang hai loại gen chủng E.coli 16.7% mang gen KPC 66.6% mang gen NDM-1, có chủng chiếm 16.7% khơng mang hai loại gen 54 TÀI LIỆU THAM KHẢO Tiếng Việt: Nguyễn Hữu Hồng, Nguyễn Thị Vinh (2007), Sự đề kháng kháng sinh vi khuẩn, Hướng dẫn sử dụng kháng sinh, Vol 3, Nhà xuất Y học, Hà Nội Tiếng Anh: Abellanosa I., Nichter M (1996), "Antibiotic prophylaxis among commercial sex workers in Cebu City, Philippines Patterns of use and perceptions of efficacy", sex transm disease journal 23, pp 407-412 Adjepon Y., K (1980), "Drugs for the tropics their uses and abuses", Africa Health(14-16) Advani S., Reich N G., Sengupta A., Gosey L., Milstone A M (2011), "Central line-associated bloodstream infection in hospitalized children with peripherally inserted central venous catheters: Extending risk analyses outside the intensive care unit", Clinical Infectious diseases 52(9), pp 1108-1115 Anderson K F., Lonsway D R., Rasheed J K et al (2007), "Evaluation of methods to identify the Klebsiella pneumoniae carbapenemase in Enterobacteriaceae", Journal of Clinical Microbiology 45, pp 2723-2725 Bates J., Jordens J., Griffith D T (1994), "Farm animal as putative reservoir for vancomycin resistant Enterococcal infections in man", Journal Antimicrob Chemother 35, pp 507-516 Bojalil R., Galva J J (1994), "Antibiotic misuse in diarrhea A household survey in a Mexican community", Journal Clinical Epidemiology 47, pp 147-156 Brown, R C (1996), "Antibiotic sensitivity testing for infections in developing countries: lacking the basics", Jama Journal 276, pp 952-953 55 Bush K., Jacoby G A (2010), "Update functional classification of βlactamases", Antimicrob Agents Chemother 54, pp 969-976 10 Chopra I., Hesse L., O'Neill A (2002), "Discovery and development of new anti-bacterial drugs, in Pharmacochemistry Library", Trends in Drug Research III, ed van der Goot H., editor Amsterdam: Elsevier 32, pp 213225 11 Denis, K B (2009), Mechanisms of Antimicrobial Resistance, Springer New York, New York 12 Dua V., Kunin C M., White L V (1994), "The use of antimicrobial drugs in Nagpur, India A window on medical care in a developing country", Social Science & Medicine - Journal 38, pp 717-724 13 ECDC (2010), "Annual Epidemiological Report on Communicable Diseases in Europe", European Centre for Disease Prevention, pp 174-178 14 Esezobo, O E (1986), "In vitro studies on some brands of oxytetracycline capsules available in Nigeria", Nigerian Journal of Pharmacology 17, pp 24-28 15 GARP-Vietnam (2010), "Situation Analysis on Antibiotic Use and resistance in Vietnam", Global Antibiotic Resistance Partnership (GARP)Vietnam, Hanoi, Vietnam 16 Goel P., Ross-Degnan D., Berman P., Soumerai S (1996), "Retail pharmacies in developing countries: a behavior and intervention framework", Social Science & Medicine - Journal 42, pp 1155-1161 17 Guyon A B., Barman A., Ahmed J U., Ahmed A U., Alam M S (1994), "A baseline survey on use of drugs at the primary health care level in Bangladesh", Bull World Health Organ 72, pp 265-271 56 18 Haak, H (1988), "Pharmaceuticals in two Brazilian villages: lay practices and perceptions", Social Science & Medicine - Journal 27, pp 1415-1427 19 Jale Moradi, Farhad B., Abbas Bahador (2015), "Antibiotic Resistance of Acinetobacter baumannii in Iran: A Systemic Review of the Published Literature", Osong Public Health Res Perspect 6(2), pp 79–86 20 Klevens, R.M etal (2007), "Estimating health care associated infections and deaths in U.S hospitals, 2002", Public Health Reports 122, pp 160166 21 Kumarasamy K K., Toleman M A., Walsh T R., Bagaria J., Butt F., Balakrishnan R et al (2010), "Emergence of a new antibiotic resistance mechanism in India, Pakistan, and the UK: a 41 Land, T (1992), "Combating counterfeit drugs", Nature 355, p 192 22 Land, T (1992), "Combating counterfeit drugs", Nature 355, p 192 23 McGregor, A (1997), "Counterfeit drugs flood developing world", Lancet 350, p 1690 24 Nizami S Q., Khan I A., Bhutta Z A (1996), "Drug prescribing practices of general practitioners and paediatricians for childhood diarrhoea in Karachi 25 Nordmann P., Dortet L., Poirel L (2012), "Carbapenem resistance in Enterobacteriaceae: here is the storm", Trends in Molecular Medicine 18 (5), pp 263-272 26 Okeke I., Lamikanra A (1995), "Quality and bioavailability of tetracycline capsules in a Nigerian semi-urban community", International Journal of Antimicrobial Agents 5, pp 245-250 27 Paredes P., Pena M., Flores-Guerra E., Diaz J., Trostle J (1996), "Factors influencing physicians’ prescribing behavior in the treatment of childhood 57 diarrhoea: knowledge may not be the clue", Social Science & Medicine Journal 42, pp 1141-1153 28 Peleg A Y., Hooper D C (2010), "Hospital-Acquired Infections Due to Gram-Negative Bacteria", New England Journal of Medicine 362(19), pp 1804-1813 29 Peleg A Y., Hooper D C (2010), "Hospital-Acquired Infections Due to Gram-Negative Bacteria", New England Journal of Medicine 362 (19), pp 1804-1813 30 Report, ECDC Technical (2011), "Updated ECDC risk assessment on the spread of New Delhi metallo-β-lactamase (NDM) and its variants within Europe" 31 Rice, L B (2009), "The clinical consequences of antimicrobial resistance", Current Opinion in Microbiology 12, pp 476-481 32 Rustam, I A (2010), "A brief history of the antibiotic era: lessons learned and challenges for the future", Front Microbiology 1(134), pp 17 33 Schouten M A., Voss A., Hoogkamp-Korstanje J A A (1997), "VRE and meat", Lancet 349, p 1258 34 Wain J., Hoa N T., Chinh N T., Vinh H., Everett M J., Diep T S et al (1997), "Quinolone-resistant Salmonella typhi in Viet Nam: molecular basis of resistance and clinical response to treatment", Clin Infect Dis 25(6), pp 1404-1410 35 Walsh, T R (2003), "Section III: Antibiotic Resistance, In: Antibiotics: Action, Origins, Resistance", American Society for Microbiology, pp 89-155 36 Walsh T R., Weeks J., Livermore D M., Toleman M A (2011), "Dissemination of NDM-1 positive bacteria in the New Delhi environment 58 and its implications for human health: an environmental point prevalence study", Lancet 11(5), pp 355-62 37 Wegener H C., Aarestrup F M., Jensen L B et al (1999), "Use of antimicrobial growth promoter in food animals and Enterococcus faecium resistance to therapeutic antimicrobial drugs in Europe", Emerging Infectious Disease 5, pp 329-332 38 Weinberg J., Grimaud O., Newton L (1999), "Establishing priorities for European collaboration in communicable disease surveillance", European 39 World Health Organization (2002), "Prevention of Hospital Acquired Infections A Practical Guide, 2nd ed Geneva: WHO Press" 40.World Health Organization (2011), Report on the Burden of Endemic Health Care-Associated Infection Worldwide 41 Yong D., Toleman M A., Giske C G., Cho H S., Sundman K., Lee K., Walsh T R (2009), "Characterization of a new metallo-beta-lactamase gene, bla (NDM-1), and a novel erythromycin esterase gene carried on a unique genetic structure in Klebsiella pneumoniae sequence type 14 from India", Antimicrob Agents Chemother 53 (12), pp 5046-5054 42 Yiğit H, Queenan AM, Anderson GJ, Domenech-Sanchez A, Biddle JW, Steward CD, et al Novel carbapenem thủy phân beta-lactamase, KPC-1, từ chủng kháng carbapenem Klebsiella pneumoniae.Antimicrob Đại lý Chemother năm 2001; 45: 1151-1161 10,1128 / AAC.45.4.1151-1161.2001 43 LS Munoz-Giá, Poirel L, Bonomo RA, Schwaber MJ, Daikos GL, Cormican M, et al Dịch tễ học lâm sàng việc mở rộng toàn cầu carbapenemases Klebsiella pneumoniae Lancet lây nhiễm Dis năm 2013; 13: 785-96 10,1016 / S1473-3099 (13) 70.190 59 ... H 18 /4/ 2 017 21/ 4/ 2 017 32 ĐÀO TIẾN A 12 /4/ 2 017 14 /4/ 2 017 33 TẠ VĂN M 12 /4/ 2 017 14 /4/ 2 017 34 NGUYỄN ĐĂNG N 12 /4/ 2 017 17 /4/ 2 017 35 CAO ĐẮC R 12 /4/ 2 017 14 /4/ 2 017 36 PHẠM VĂN K 17 /4/ 2 017 21/ 4/ 2 017 ... 6 /12 /2 016 8 /12 /2 016 HOÀNG VĂN B 5 /12 /2 016 8 /12 /2 016 NGUYỄN BÁ C 4 /12 /2 016 8 /12 /2 016 ĐÀO VĂN D 15 /12 /2 016 19 /12 /2 016 TÔ VĂN E 13 /12 /2 016 19 /12 /2 016 TRẦN THỊ F 19 /12 /2 016 23 /12 /2 016 VŨ HỒNG G 21/ 12/ 2 016 ... 30 /12 /2 016 3 /1/ 2 017 14 ĐINH VĂN N 9 /1/ 2 017 12 /1/ 2 017 15 NGUYỄN HỮU M 9 /1/ 2 017 12 /1/ 2 017 16 NGUYỄN MẠNH S 9 /1/ 2 017 16 /1/ 2 017 17 BÙI NGỌC Q 12 /1/ 2 017 16 /1/ 2 017 18 ĐỖ THỊ K 13 /2/2 017 13 /2/2 017 19 VI