VNUA giáo trình sử dụng irristat 4 0

Xử Lý KếT QUả THí NGHIệM ứng dụng IRRISTAT 4.0 for Windows Analysis Experimental Data Using IRRISTAT 4.0 for Windows Phạm Tiến Dũng Su tm : Traithaibinh1610@yahoo.com Kasetsart University, Thailand, 2001 Thanks! Thank to the help of Thailand Governments finances in the Faculty Staff and Student Exchaenges Program between Kasetsart University (KU) and Hanoi Agricultural University (HAU), the arrangement of the KU International Programs, HAU International Office, the Individuals such as Professor Doctor Dang Vu Binh, Associate Professor Doctor Chitapa Ketewan, Doctor Tran Duc Vien, Associate Professor Doctor Suwapong Swasdiphanich, Associate Professor Doctor Rangsarid Kaveeta, Mr Choosak Jompuk, Mr Piya Kittipadakul and others that I had a good chance to study in Thailand and to compose this book On this occasion I have great thanks to the institutions and individuals mentioned above Pham Tien Dung Hanoi Agricultural University, Vietnam Cám ơn! Nhờ giúp đỡ tài Chính phủ Thai lan khuôn khổ chơng trình trao đổi cán học sinh khoa Đại học Kaetsart (KU) Thai lan Đại học Nông nghiệp Hà nội (HAU), Phòng Quan hệ Quốc tế KU, Phòng Quản lý Khoa học Quan hệ Quốc tế HAU, Giáo s Tiến sỹ Đặng Vũ Bình, Phó giáo s, Tiến sỹ Chitapa Ketewan, Tiến sỹ Trần Đức Viên, Phó Giáo s, Tiến sỹ Suwapong Swasdiphanich, Phó Giáo s, Tiến sỹ Rangsarid Kaveeta, ông Choosak Jomput, ông Piya Kittipadakul ngời giúp việc khác mà có hội tốt cho nghiên cứu Thái lan biên soạn sách Nhân dịp xin cảm ơn tất tổ chức cá nhân tạo điều kiện giúp đỡ Phạm Tiến Dũng Đại học Nông nghiệp I Hà nội Comments Considering about this book, I believe that Doctor Dung had worked very hard to have the book This is one of the products that Doctor Dung has gained in the period of three months working at Agronomy Department, Kasetsart University in the Faculty Staff and Student Exchange Program Between Kasetsart University and Hanoi Agricultural University Contents of the book are simple, understandable and very useful to the Agricultural Researchers using for their experimental data analysis Like in our Department of Agronomy, the book should be put into teaching practice to your agricultural students I wish you more successful November 5th, 2001 Associate Professor Doctor Suwapong Swasdiphanich Head of Department of Agronomy Faculty of Agriculture, Kasetsart University, Thailand Contents Nội dung Phần I: Giới thiệu ( Introduction to ) IRISTAT 4.0 I Các cửa sổ Window II Menus III Job Specification Components IV Ngẫu nhiên hoá tạo sơ đồ thí nghiệm ( Randomization and Layout ) Phần II Quản lý file số liệu ( Data and file Management ) I Bộ số liệu mẫu ( Sample data set ) II Tạo file số liệu ( Data creation ) Phần III Một số mẫu phân tích phơng sai ( Some samples of Analysis of variance ) I Thí nghiệm nhân tố ( Sigle factor Experiment ) 1.1 Mô hình kiểu hoàn toàn ngẫu nhiên ( Completely Randomized Design: CRD) 1.2 Mô hình kiểu khối ngẫu nhiên đầy đủ ( Randomized Complete Block Design, RCB ) 1.3 Thiết kế Ô vuông La tin ( Latin Square Design, LS ) 1.4 Thí nghiệm bố trí kiểu Lattice Lattice cân đối ( Lattice Design - Balanced Lattice ) II Thí nghiệm hai nhân tố ( Two factors Experiment ) 2.1 Thiết kế khối ngẫu nhiên đầy đủ Tran g 13 18 23 23 24 47 47 47 52 55 59 65 65 (Factorial experiment ) 2.2 Thí nghiệm thiết kế kiểu chia ô lớn, ô nhỏ (Split-plot) 2.3 Thí nghiệm kiểu chia băng ( Strip-Plot Design ) III Thí nghiệm yếu tố bố trí kiểu chia ô lớn, ô vừa, ô nhỏ (Split-split-plot) IV Phân tích số liệu qua nhiều nơi ( Analysis over Sites ) V Phân tích số liệu qua nhiều năm ( Analysis over Yeas ) Phần IV Phân tích hồi qui ( Regreesion Analysis ) 4.1 Hồi qui tuyến tính đơn ( Simple Liner Regreesion ) 4.2 Hồi qui bội tuyến tính ( Multiple Liner Regreesion ) 70 76 82 91 95 100 104 Giới thiệu Đây la sách thực hành để phân tích kết thực nghiệm IRRISTAT 4.0 Window Rất tiện lợi cho ngời sử dụng có hình ảnh minh hoạ bớc cụ thể cho ngời sử dụng làm theo Đặc biệt với ngời không am hiểu nhiều máy tính nh kiến thức thống kê sử dụng đợc Nội dung gồm phần: Giới thiệu khái quát nội dung chức IRRISTAT 4.0 Window Một số mẫu phân tích phơng sai, hồi qui thờng đợc sử dụng nghiên cứu nông nghiệp nh thí nghiệm nhân tố, nhiều nhân tố theo kiểu thiết kế khác nhau, thí nghiệm làm nhiều năm, thí nghiệm làm nhiều nơi, phân tích hồi qui đờng thẳng biến nhiều biến Sách hữu ích cho sinh viên nhà nghiên cứu lĩnh vực nông nghiệp INTRODUCTIONS This is a practising book for Analysis experimental data by IRRISTAT 4.0 for Windows It is very convinience and easy to users because it was written mainly by figures step by step Expecially, those who not know well about computer techniques and statistical knowledges can use The book has two parts: Some genaral introductions of the contents, funtions of IRRISTAT 4.0 for Windows Some sample models of analysing of variance and regression following different experimental designs that are often used in agricultural research such as: singlefactor experiment; two factor experiment; three factor experiment; experiment by sites; experiment by years and regression analysis This book will be very useful for students and researchers in agricultural fields References Biometrics Unit, International Rice Research Institute IRRISTAT 4.0 Window, Tutorial Manual KWANCHAI A GOMEZ, ARTURO A GOMEZ, 1984 Statistical Procedures for Agricultural Research Copyright 1984 by John Wiley& Sons, Inc Choosak Jompuk 1998 Computer Application in Agronomy Research Agronomy Department, Faculty of Agriculture, Kasetsart University 221 p (in Thai) Phần I Giới thiệu IRRISTAT 4.0 IRRISTAT chơng trình máy tính để quản lý số liệu phân tích thống kê số liệu thí nghiệm Nó chạy hệ thống hoạt động Window 32 bít Để cài đặt chơng trình vào máy tính, chạy file SETUP EXE đĩa cài đặt Khởi động chơng trình, chạy file IRRISTAT.EXE, nháy biểu tợng đợc cài đặt IRRISTAT đợc biên soạn chủ yếu để phân tích số liệu thu đợc từ thí nghiệm đồng ruộng, nhng có nhiều nội dung sử dụng để phân tích số liệu từ nguồn nghiên cứu khác Các mô hình phân tích chức khác bao gồm: Quản lý số liệu spreadsheet Trang ghi kết Phân tích phơng sai Phân tích hồi qui Phân tích ảnh hởng giống môi trờng Phân tích di truyền số lợng Phân tích riêng rẽ nơi nghiên cứu Phân tích mô hình chia nhóm Vẽ đồ thị 10 Ngẫu nhiên hoá sơ đồ thí nghiệm, phơng sai trung bình nhiều nhân tố, đa thức trực giao Môi trờng làm việc IRRISTAT Khi kết thúc chơng trình, ngời học phải biết làm quen với chức IRRISTAT nh cửa sổ Window, danh mục nội dung, Các hợp phần chức đặc biệt thao tác file I Các cửa sổ Window Trong IRRISTAT có cửa sổ Window A Cửa sổ window (Main window) Cửa sổ window IRRISTAT cung cấp cho ngời sử dụng menu công cụ nh hình dới đây; B Cửa sổ quản lý số liệu (Data Editor) Data editor trình bày số liệu dới dạng hàng cột Mỗi hàng trờng hợp cột biến Bạn ghi số liệu vào chỗ trống hàng số liệu nhập số liệu từ file trang văn file Excel file dbase Bạn mở đồng thời nhiều file số liệu Số file đợc mở nhiều hay phụ thuộc khả nhớ máy tính Thí nghiệm qua nhiều năm Kết thí nghiệm thu đợc nh bảng sau: Bảng Năng suất giống lúa thí nghiệm thiết kế RCB với lần nhắc lại thời vụ năm liên tiếp Giống Năm số nlai nlai nlai Tsố 3036 4177 8905 1369 1554 5311 5091 2559 3980 1291 1705 3452 3548 1812 2914 T.theo Năm Năm Tsố nlai nlai nlai 3884 11097 1981 3198 372 1899 4822 3751 2391 371 4839 15241 3868 3134 348 3853 10392 2729 2786 259 2130 5126 3222 3554 245 4640 11640 4250 4134 333 958 5684 3336 4073 288 64002 9856 1048 8113 9228 1172 1029 6860 Nguồn: Gomez, 1984 Ký hiệu: số năm: y; Nhắc lại: r; Công thức: t Bảng đề cơng phân tích phơng sai đợc hình thành nh sau: Source of variation Year(Y) Rep Within year Degree of freedom y = y (r ) = Treatment(T) TxY Pooled Error Total t = (y-1)(t-1) = y(r-1)(t-1) = 24 yrt-1 = 41 Vào số liệu IRRISTAT dới dạng sau: Các bớc phân tích phơng sai IRRISTAT Làm tơng tự nh phân tích ANOVA qua nhiều nơI nhng thay nơi năm thể nh bảng dới dây Tiếp tục làm bớc nh phân tích qua nhiều nơi có kết sau: BALANCED ANOVA FOR VARIATE NSUAT FILE NHIEUNAM 3/10/** 8:28 PAGE Thi nghiem nhieu nam VARIATE V004 NSUAT LN ER SOURCE OF VARIATION DF SUMS OF MEAN SQUARES SQUARES F RATIO PROB LN ============================================================================ = NAM 505124 505124 1.36 0.309 2 NLAI*NAM 148246E+07 370616 1.01 0.422 GIONG 191589E+08 319315E+07 1.24 0.401 4 GIONG*NAM 154960E+08 258267E+07 7.04 0.000 * RESIDUAL 24 879934E+07 366639 -* TOTAL (CORRECTED) 41 454418E+08 110834E+07 -_ TABLE OF MEANS FOR FACTORIAL EFFECTS FILE NHIEUNAM 3/10/** 8:28 PAGE Thi nghiem nhieu nam MEANS FOR EFFECT NAM -NAM NOS 21 21 SE(N= 5%LSD 21) 4DF NSUAT 3047.71 3267.05 132.847 520.732 -MEANS FOR EFFECT NLAI*NAM -NAM 1 2 SE(N= 5%LSD NLAI 3 7) 24DF NOS 7 7 7 NSUAT 2690.00 3281.29 3171.86 3305.29 3324.29 3171.57 228.860 667.979 -MEANS FOR EFFECT GIONG -GIONG NOS 6 6 6 6 SE(N= 5%LSD 6) 6DF NSUAT 3333.67 2446.33 4288.33 3084.17 2392.33 3893.83 2663.00 656.083 2269.49 -MEANS FOR EFFECT GIONG*NAM -NAM 1 1 1 2 2 2 SE(N= 5%LSD GIONG 7 NOS 3 3 3 3 3 3 3 3) 24DF NSUAT 3699.00 1607.33 5080.33 3464.00 1708.67 3880.00 1894.67 2968.33 3285.33 3496.33 2704.33 3076.00 3907.67 3431.33 349.590 1020.35 -_ ANALYSIS OF VARIANCE SUMMARY TABLE FILE NHIEUNAM 3/10/** 8:28 PAGE Thi nghiem nhieu nam F-PROBABLIITY VALUES FOR EACH EFFECT IN THE MODEL SECTION - VARIATE GRAND MEAN GIONG |GIONG*NA| (N= 42) |M | NO | | OBS | | NSUAT 42 3157.4 0.4013 0.0002 STANDARD DEVIATION C OF V |NAM SD/MEAN | BASED ON BASED ON TOTAL SS RESID SS 1052.8 605.51 % |NLAI*NAM| | | | | | | | | 19.2 0.3086 0.4224 Phần IV Phân tích hồi qui 4.1 Hồi qui tuyến tính đơn Có cặp số liệu sau Bảng: Kết theo dõi số dảnh (x) suất lúa (y) N Số dảnh suất(kg/ (dảnh/m2 ha) ) 4862 160 5244 175 5128 192 5052 195 5298 238 5410 240 5234 252 5608 282 Mô hình tuyến tính là: Y = ax + b Vào số liệu IRRISTAT dới dạng sau: Các bớc phân tích: Chọn Analysis Regression Làm tơng tự nh phân tích phơng sai có ảnh sau: Chọn x Y đa sang hộp Analysis Variates, sau chọn Regression Model để có ảnh sau Chọn New để có ảnh sau Đa Y vào hộp Response Variate; x vào hộp Independent Variate chọn Add to the Model hộp Selection để có ảnh sau: Kích chuột vào OK để chạy mô hình, có kết nh sau: 4.2 Hồi qui bội tuyến tính Có tập hợp số liệu theo dõi suất phân tích hàm lợng N, P, K hạt từ 45 mảnh ruộng nh sau: PLOT 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 Y14 G 1678 4265 2431 2431 4461 3110 4469 4194 3379 7132 4359 3646 6917 6692 7028 7196 4220 7250 4915 4185 7463 7367 7860 7624 2830 3705 3280 2906 4041 3295 4147 4102 3509 5087 4353 N% 0.9849 1.1714 1.0756 1.0435 1.2101 1.2084 1.1643 1.2369 1.0247 1.4624 0.9954 1.0404 1.5309 1.5001 1.6112 1.6009 0.9392 1.6738 0.9525 0.8468 1.602 1.6678 1.5521 1.5707 0.8732 1.0743 1.0124 0.9288 1.0279 1.1412 1.1594 1.0733 0.8955 1.2949 1.0541 P% 0.0901 0.0926 0.0886 0.0807 0.0852 0.0845 0.0972 0.085 0.2901 0.2467 0.2872 0.2487 0.2868 0.2776 0.2852 0.3104 0.2558 0.1985 0.2712 0.2474 0.3213 0.1793 0.3058 0.2969 0.2582 0.2396 0.2665 0.2705 0.2492 0.243 0.2867 0.2624 0.2395 0.2548 0.2604 K% 0.3987 0.3814 0.4134 0.4027 0.3851 0.3746 0.3794 0.4373 0.3108 0.2545 0.3095 0.3137 0.3071 0.2506 0.3091 0.3168 0.3039 0.2474 0.3116 0.3051 0.3144 0.2295 0.3296 0.3078 0.3204 0.239 0.3016 0.3078 0.2925 0.2475 0.2924 0.2736 0.3815 0.2978 0.3597 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 3915 5122 4660 5150 5730 3744 5363 4628 4212 5063 0.9689 1.4547 1.2749 1.3373 1.2832 0.9977 1.7496 1.0091 0.8938 1.6833 0.2469 0.3239 0.2454 0.3057 0.3059 0.2103 0.1617 0.2208 0.2008 0.2609 0.3806 0.3195 0.2556 0.3158 0.3104 0.2943 0.2353 0.2993 0.2919 0.2983 Vào số liệu bảng IRRSTAT dới dạng sau: Tạo thêm biến để ghi giá trị d thừa giá trị phù hợp sau tính hồi qui để có ảnh sau: Tạo xong, save file lại để chạy hồi qui Chọn Analysis Regression, viết lệnh cho Comand File xong Open để mở File số liệu nh ảnh dới: Từ ảnh trên, đa biến GY14,N%, P%, K% vào hộp Analysis Variates Xong chọn Regression Model, chọn New chuyển biến từ Analysis Variates vào hộp Response Variate Independent Variates, chọn Add to the Model hộp Selection để có ảnh sau: Chọn Option, Correclation, Compute and Test Residuals nh ảnh dới xong kích chuột vào OK để chạy mô hình Kết chạy mô hình: CORRELATION MATRIX AND STANDARD ERRORS FILE REG1 3/10/** 14:46 PAGE SECTION CORR AND RESID SES GY14 N% P% K% GY14 0.1584525E+04 N% 0.8156641E+00 0.2676436E+00 P% 0.4406525E+00 0.1723501E+00 0.7490746E-01 K% -0.4226677E+00 -0.3386678E+00 -0.5344221E+00 0.5054769E-01 _ REGRESSION OF GY14 (2 ) ON VARIATES FILE REG1 3/10/** 14:46 - PAGE TERM NO CONSTANT N% P% K% SOURCE REGRESSION RESIDUAL TOTAL COEFFICIENT -2284.148 4515.239 6554.451 38.24514 SS 0.8374954E+08 0.2672206E+08 0.1104716E+09 STD ERROR F-VALUE PRBF 1484.60 483.325 1922.42 2982.48 2.367 87.274 11.625 0.000 0.128 0.000 0.002 0.987 DF 41 44 MS 0.2791651E+08 651757.7 TOLERANCE 0.6571E-02 0.8852 0.7143 0.6517 F PRBF 42.833 0.0000 R-SQUARED - 75.8%, (ADJUSTED FOR D.F.- 74.0%) BOX PLOT OF STUDENTIZED RESIDUALS FROM LPLT= -2.570 NO.UPLT I + MEDIAN= 0.2026E+00 ANDERSON-DARLING STATISTIC= 0.516 TO ULPT= 1.522 I _ _ ... nghiệm IRRISTAT 4. 0 Window Rất tiện lợi cho ngời sử dụng có hình ảnh minh hoạ bớc cụ thể cho ngời sử dụng làm theo Đặc biệt với ngời không am hiểu nhiều máy tính nh kiến thức thống kê sử dụng đợc... Editor Menus Sử dụng menu File để tạo, mở, in cất gĩ text file , để tóm tắt kết thống kê lệnh Sử dụng Edit để sửa chữa file văn Sử dụng menu Format để thay đổi đặc điểm font file văn Sử dụng menu... liệu Sử dụng Tools để xếp trật tự số liệu, chuyển đổi dãy số liệu song song ngợc lại Sử dụng menu Window để xếp lại nhiều cửa Window khác Sử dụng menu Help để tìm kiếm hệ thống trợ giúp IRRISTAT