phân lập vi khuẩn nội sinh trong cây sài đất (wedelia chinensis merr.) trồng ở thành phố cần thơ

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC CẦN THƠ VIỆN NGHIÊN CỨU VÀ PHÁT TRIỂN CÔNG NGHỆ SINH HỌC - - LUẬN VĂN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC CHUYÊN NGÀNH VI SINH VẬT HỌC PHÂN LẬP VI KHUẨN NỘI SINH TRONG CÂY SÀI ĐẤT (Wedelia chinensis Merr.) TRỒNG Ở THÀNH PHỐ CẦN THƠ CÁN BỘ HƯỚNG DẪN PGS.TS NGUYỄN HỮU HIỆP SINH VIÊN THỰC HIỆN NGUYỄN PHÚC HUY MSSV: 3113716 Lớp: Vi Sinh Vật Học K37 Cần Thơ, Tháng 11/2014 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC CẦN THƠ VIỆN NGHIÊN CỨU VÀ PHÁT TRIỂN CÔNG NGHỆ SINH HỌC - - LUẬN VĂN TỐT NGHIỆP ĐẠI HỌC CHUYÊN NGÀNH VI SINH VẬT HỌC PHÂN LẬP VI KHUẨN NỘI SINH TRONG CÂY SÀI ĐẤT (Wedelia chinensis Merr.) TRỒNG Ở THÀNH PHỐ CẦN THƠ CÁN BỘ HƯỚNG DẪN PGS.TS NGUYỄN HỮU HIỆP SINH VIÊN THỰC HIỆN NGUYỄN PHÚC HUY MSSV: 3113716 Lớp: Vi Sinh Vật Học K37 Cần Thơ, Tháng 11/2014 PHẦN KÝ DUYỆT CÁN BỘ HƯỚNG DẪN SINH VIÊN THỰC HIỆN (Ký tên) (Ký tên) PGS.TS Nguyễn Hữu Hiệp Nguyễn Phúc Huy DUYỆT CỦA HỘI ĐỒNG BẢO VỆ LUẬN VĂN ………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………… ………………………………………………………………………………………… …………………………………………………………………………… Cần Thơ, ngày tháng năm 2014 CHỦ TỊCH HỘI ĐỒNG (Ký tên) LỜI CẢM TẠ Sau năm học tập nghiên cứu, đến hoàn thành Luận văn tốt nghiệp Đại học, chuyên ngành Vi SinhVật Học Trong thời gian này, bên cạnh cố gắng tìm tòi thân, luôn nhận hỗ trợ, động viên từ phía gia đình, quý Thầy Cô bạn bè giúp vượt qua khó khăn, thử thách để hoàn thành Luận văn tốt nghiệp Với lòng biết ơn sâu sắc, xin chân thành gửi lời cảm ơn đến: Ban lãnh đạo Viện Nghiên cứu Phát triển Công nghệ Sinh học - trường Đại học Cần Thơ, tất quý Thầy Cô Viện NC&PT Công nghệ Sinh học - trường Đại học Cần Thơ nhiệt tình giảng dạy truyền đạt kiến thức chuyên môn cho suốt trình học tập nghiên cứu trường PGs.TS Nguyễn Hữu Hiệp – phó trưởng môn Công nghệ Sinh học Vi sinh vật tận tình hướng dẫn, bổ sung kiến thức tạo điều kiện thuận lợi cho suốt thời gian thực đề tài Cán quản lý phòng thí nghiệm Vi sinh vật –Viện NC & PT Công nghệ Sinh học Trường Đại học Cần Thơ tạo điều kiện thuận lợi cho thực đề tài Cuối cùng, xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến cha, mẹ ủng hộ phương diện, sức mạnh tinh thần giúp vươn lên sống Tôi xin kính chúc quý Thầy Cô bạn sinh viên dồi sức khoẻ công tác tốt Chân thành cảm ơn! Cần thơ, ngày 20 tháng 11 năm 2014 Nguyễn Phúc Huy Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Trường ĐHCT TÓM TẮT Sài đất (Wedelia chinensis), thuộc họ Cúc (Asteraceae) biết đến loại dược liệu quý có tính kháng khuẩn mạnh, nghiên cứu trước sử dụng dịch trích mà chưa quan tâm nhiều đến vi khuẩn nội sinh Sài đất Vì vậy, việc phân lập dòng vi khuẩn nội sinh Sài đất thực Từ ba mẫu Sài đất trồng hai quận Cái Răng Ninh Kiều thành phố Cần Thơ phân lập 21 dòng vi khuẩn môi trường PDA đặc Phần lớn dòng vi khuẩn có dạng hình que có khả di động, số có dạng hình cầu cầu đôi Trong có 18 dòng vi khuẩn Gram âm dòng vi khuẩn Gram dương.Tất dòng vi khuẩn có khả tổng hợp NH4+ IAA chủng vào trường NFb lỏng, không đạm, không Yeast extract Chín dòng có khả hòa tan lân khó tan môi trường NBRIP đặc Khảo sát khả kháng khuẩn với dòng vi khuẩn gây bệnh Escherichia coli Aeromonas hydrophila, kết có dòng có khả kháng E coli dòng có khả kháng A hydrophila Điều đáng ngạc nhiên là, có hai dòng kháng E coli A hydrophila Tuyển chọn dòng CT1, CL2 CL5 có hiệu kháng khuẩn tốt nhất, kết hợp với tiêu chí khả cố định đạm, tổng hợp IAA hòa tan lân để tiến hành định danh Kết giải trình tự gene 16S-rRNA ba dòng CT1, CL2 CL5 nhận diện Pseudomonas viridiflava dòng ATCC 13223, Rhodobacter capsulatus dòng KC2137 Bacillus cereus ATCC 14579 với độ tương đồng 95%, 94% 93% Từ khóa: Sài đất, hòa tan lân, kháng khuẩn, tổng hợp AmmoniumIAA, vi khuẩn nội sinh Chuyên ngành Vi sinh vật học i Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Trường ĐHCT MỤC LỤC Trang KÝ TÊN HỘI ĐỒNG LỜI CẢM TẠ TÓM TẮT i MỤC LỤC ii DANH SÁCH BẢNG ix DANH SÁCH HÌNH x CÁC TỪ VIẾT TẮT xi CHƯƠNG GIỚI THIỆU .1 1.1 Đặt vấn đề 1.2 Mục tiêu đề tài .2 CHƯƠNG LƯỢC KHẢO TÀI LIỆU 2.1 Điều kiện tự nhiên thành phố Cần Thơ .3 2.1.1 Vị trí địa lý 2.1.2 Địa hình .3 2.1.3 Khí hậu 2.1.4 Thủy văn 2.2 Sơ lược Sài đất 2.2.1 Tên gọi phân loại 2.2.2 Đặc điểm 2.2.3 Phân bố 2.2.4 Thành phần hóa học 2.2.5 Công dụng Sài đất Đông y 2.2.6 Tác dụng Sài đất y học đại a Tác dụng kháng khuẩn b Tác dụng bảo vệ gan Chuyên ngành Vi sinh vật học ii Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Trường ĐHCT c Tác dụng giảm căng thẳng d Tác dụng chữa lành vết thương e Tác dụng chống loãng xương f Tác dụng chống ung thư 2.3 Vi khuẩn nội sinh 2.3.1 Định nghĩa vi khuẩn nội sinh 2.3.2 Sơ lược vi khuẩn nội sinh .9 2.3.3 Một số nhóm vi khuẩn nội sinh thường gặp 11 a Vi khuẩn Bacillus 11 b Vi khuẩn Pseudomonas 12 c Vi khuẩn Rhodobacter 14 d Vi khuẩn Azotobacter .15 e Vi khuẩn Azospirillum 15 2.3.4 Sự xâm nhập nội sinh mô thực vật vi khuẩn nội sinh 16 a Nguồn gốc 16 b Di chuyển 16 c Tiếp cận .16 d Sinh sản .17 e Xâm nhập hay xuyên thấu .17 f Định cư 17 2.3.5 Một số đặc tính vi khuẩn nội sinh 18 a Khả cố định đạm 18 b Khả hòa tan lân khó tan 20 c Khả tổng hợp IAA 21 d Khả đối kháng sinh học 22 2.4 Tình hình nghiên cứu Sài đất nước 25 2.4.1 Trong nước 25 2.4.2 Ngoài nước 25 2.5 Kỹ thuật PCR (Polymerase Chain Reaction) 26 Chuyên ngành Vi sinh vật học iii Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Trường ĐHCT 2.5.1 Nguyên lý chung kỹ thuật PCR 26 2.5.2 Mồi (primer) sử dụng kỹ thuật PCR 27 2.6 Điện di gel agarose 28 2.6.1 Nguyên tắc kỹ thuật điện di 28 2.6.2 Kỹ thuật điện di gel agarose 28 2.7 Phương pháp giải trình tự DNA 29 2.7.1 Giải trình tự gen theo phương pháp dideoxy 29 2.7.2 Giải trình tự gen máy giải trình tự gen tự động 29 2.7.3 Phần mềm phân tích trình tự DNA giải mã 29 2.8 Xử lý số liệu .30 CHƯƠNG PHƯƠNG TIỆN VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .31 3.1 Phương tiện nghiên cứu 31 3.1.1 Thời gian – Địa điểm thực 31 3.1.2 Vật liệu 31 3.1.3 Dụng cụ - Thiết bị 31 3.1.4 Hóa chất 32 a Hóa chất dùng để xử lý mẫu .32 b Hóa chất nhuộm Gram vi khuẩn .32 c Hóa chất trích DNA 32 d Hóa chất thực phản ứng PCR 32 e Môi trường phân lập vi khuẩn nội sinh .33 f Môi trường khảo sát khả tổng hợp NH4+ 33 g Môi trường khảo sát khả hòa tan lân 34 h Môi trường khảo sát khả kháng khuẩn 34 3.2 Phương pháp nghiên cứu 35 3.2.1 Thu thập xử lý mẫu 35 3.2.2 Phân lập vi khuẩn nội sinh từ rễ, thân Sài đất 36 3.2.3 Quan sát hình dạng, khả chuyển động kích thước vi khuẩn 36 3.2.4 Nhuộm Gram vi khuẩn 38 Chuyên ngành Vi sinh vật học iv Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Trường ĐHCT 3.2.5 Khảo sát khả tổng hợp NH4+ 39 a Nguyên tắc 39 b Hóa chất 39 c Tiến hành thí nghiệm 39 d Định lượng đạm vi khuẩn sinh ngày 2, (sau chủng) 40 3.2.6 Khảo sát khả hòa tan lân khó tan 41 3.2.7 Khảo sát khả tổng hợp IAA 41 a Chuẩn bị 41 b Hóa chất 42 c Phương pháp .42 3.2.8 Thử nghiệm khả kháng khuẩn 43 3.2.9 Nhận diện số dòng vi khuẩn nội sinh .43 CHƯƠNG KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 46 4.1 Kết phân lập vi khuẩn nội sinh 46 4.1.2 Đặc điểm khuẩn lạc dòng vi khuẩn phân lập 47 4.1.3 Đặc điểm tế bào vi khuẩn nội sinh phân lập 50 4.2 Kết khảo sát khả cố định đạm dòng vi khuẩn phân lập dựa lượng ammonium (NH4+) tổng hợp 51 4.2.1 So sánh khả tổng hợp ammonium dòng vi khuẩn nội sinh phân lập rễ Sài đất 53 4.2.2 So sánh khả tổng hợp ammonium dòng vi khuẩn nội sinh phân lập thân Sài đất 54 4.2.3 So sánh khả tổng hợp ammonium dòng vi khuẩn nội sinh phân lập Sài đất 56 4.2.4 So sánh khả tổng hợp ammonium dòng vi khuẩn nội sinh triển vọng 58 4.3 Kết khảo sát khả hòa tan lân khó tan dòng vi khuẩn phân lập Sài đất 60 Chuyên ngành Vi sinh vật học v Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Trường ĐHCT 4.4 Kết khảo sát khả tổng hợp IAA dòng vi khuẩn phân lập Sài đất 63 4.4.1 So sánh khả tổng hợp IAA dòng vi khuẩn phân lập rễ Sài đất 64 4.4.2 So sánh khả tổng hợp IAA dòng vi khuẩn phân lập thân Sài đất 66 4.4.3 So sánh khả tổng hợp IAA dòng vi khuẩn phân lập Sài đất 68 4.4.4 So sánh khả tổng hợp IAA dòng vi khuẩn nội sinh triển vọng Sài đất 70 4.5 Kết khảo sát khả kháng khuẩn dòng vi khuẩn nội sinh phân lập Sài đất 71 4.5.1 Khả kháng vi khuẩn E coli gây bệnh đường ruột 72 4.5.2 Khả kháng vi khuẩn Aeromonas hydrophila gây bệnh cá 74 4.6 Kết nhận diện số dòng vi khuẩn kỹ thuật PCR .78 4.6.1 Kết mã hóa gen 16S-rRNA dòng CT1 79 4.6.2 Kết mã hóa gen 16S-rRNA dòng CL2 80 4.6.3 Kết mã hóa gen 16S-rRNA dòng CL5 80 CHƯƠNG KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 82 5.1 Kết luận 82 5.2 Đề nghị .82 TÀI LIỆU THAM KHẢO .83 PHỤ LỤC Phụ lục 1: Kết thí nghiệm Kết khảo sát hàm lượng ammonium (NH4+) tạo dòng vi khuẩn nội sinh phân lập Kết khảo sát khả hòa tan lân khó tan dòng vi khuẩn nội sinh phân lập Kết khảo sát hàm lượng IAA tạo dòng vi khuẩn nội sinh phân lập Chuyên ngành Vi sinh vật học vi Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 CL2 CL1 CT1 CT5 CT4 CR6 CR3 3 3 3 161,310 158,929 152,222 136,633 132,778 123,878 115,684 Trường ĐHCT B B B C C D D E E Means that not share a letter are significantly different Ngày One-way ANOVA: Hiệu hòa tan lân (E) ngày versus Dòng vi khuẩn Source Dòng vi khuẩn Error Total S = 16,55 Level CL1 CL2 CL9 CR3 CR4 CR6 CT1 CT4 CT5 N 3 3 3 3 DF 18 26 SS 13529 4928 18458 R-Sq = 73,30% Mean 182,14 187,99 168,33 126,75 207,10 143,71 160,46 173,33 171,75 StDev 9,28 11,77 38,84 1,79 2,59 1,91 9,11 2,89 25,02 MS 1691 274 F 6,18 P 0,001 R-Sq(adj) = 61,43% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev + -+ -+ -+ ( -* -) ( -* ) ( -* -) ( -* -) ( -* -) ( -* -) ( -* -) ( -* ) ( -* -) + -+ -+ -+ 105 140 175 210 Pooled StDev = 16,55 Grouping Information Using Fisher Method Dòng vi khuẩn CR4 CL2 CL1 CT4 CT5 CL9 CT1 CR6 CR3 N 3 3 3 3 Mean 207,10 187,99 182,14 173,33 171,75 168,33 160,46 143,71 126,75 Grouping A A B A B B B C B C B C C D D Means that not share a letter are significantly different Kết thống kê lượng IAA dòng vi khuẩn phân lập 3.1 Lượng IAA dòng vi khuẩn phân lập tổng hợp theo thời gian Ngày One-way ANOVA: IAA Ngày versus Tên dòng vi khuẩn Source Tên dòng vi khuẩn Error Total DF 20 42 62 Chuyên ngành Vi sinh vật học SS 46,0168 1,7407 47,7575 MS 2,3008 0,0414 F 55,51 P 0,000 Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 S = 0,2036 Level CL1 CL2 CL3 CL4 CL5 CL6 CL7 CL8 CL9 CR1 CR2 CR3 CR4 CR5 CR6 CR7 CT1 CT2 CT3 CT4 CT5 N 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 R-Sq = 96,36% Mean 2,9444 1,5556 1,2778 0,0000 0,2778 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 1,5000 0,6111 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,3889 0,0000 1,0556 0,0000 2,3333 StDev 0,3469 0,0962 0,4194 0,0000 0,2546 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,3333 0,3469 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,0962 0,0000 0,2546 0,0000 0,4410 Trường ĐHCT R-Sq(adj) = 94,62% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev + -+ -+ -+ (-* ) ( *-) ( *-) (-*-) ( *-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) ( *-) (-*-) (-* ) + -+ -+ -+ 0,0 1,0 2,0 3,0 Pooled StDev = 0,2036 Grouping Information Using Fisher Method Tên dòng vi khuẩn CL1 CT5 CL2 CR1 CL3 CT3 CR2 CT1 CL5 CT4 CT2 CR7 CR6 CR5 CR4 CR3 CL9 CL8 CL7 CL6 CL4 N 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 Mean 2,9444 2,3333 1,5556 1,5000 1,2778 1,0556 0,6111 0,3889 0,2778 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 Grouping A B C C C D D E E E F F F F F F F F F F F F F Means that not share a letter are significantly different Ngày One-way ANOVA: IAA Ngày versus Tên dòng vi khuẩn Source Tên dòng vi khuẩn Error Total DF 20 42 62 Chuyên ngành Vi sinh vật học SS 11,3409 0,7313 12,0722 MS 0,5670 0,0174 F 32,57 P 0,000 Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 S = 0,1320 Level CL1 CL2 CL3 CL4 CL5 CL6 CL7 CL8 CL9 CR1 CR2 CR3 CR4 CR5 CR6 CR7 CT1 CT2 CT3 CT4 CT5 N 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 R-Sq = 93,94% Mean 2,3922 1,9216 1,9804 1,0588 1,7647 1,2941 1,6863 1,4902 1,2157 1,3529 1,5490 2,0196 0,6471 0,9804 1,6863 1,9020 1,8235 0,8824 1,9412 1,7647 1,6471 StDev 0,1797 0,0679 0,2066 0,1556 0,2121 0,1019 0,2377 0,0679 0,0899 0,1176 0,0340 0,0679 0,0588 0,1225 0,0340 0,1480 0,1019 0,1176 0,0588 0,0588 0,2121 Trường ĐHCT R-Sq(adj) = 91,06% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev + -+ -+ -+ ( *-) ( * ) ( * ) ( *-) (-* ) ( *-) (-* ) ( *-) (-* ) ( *-) ( *-) ( *-) ( *-) (-* ) (-* ) ( *-) (-* ) ( *-) (-* ) (-* ) (-* ) + -+ -+ -+ 0,60 1,20 1,80 2,40 Pooled StDev = 0,1320 Grouping Information Using Fisher Method Tên dòng vi khuẩn CL1 CR3 CL3 CT3 CL2 CR7 CT1 CT4 CL5 CR6 CL7 CT5 CR2 CL8 CR1 CL6 CL9 CL4 CR5 CT2 CR4 N 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 Mean 2,3922 2,0196 1,9804 1,9412 1,9216 1,9020 1,8235 1,7647 1,7647 1,6863 1,6863 1,6471 1,5490 1,4902 1,3529 1,2941 1,2157 1,0588 0,9804 0,8824 0,6471 Grouping A B B C B C B C B C D B C D E C D E C D E D E D E E F F F F F F G G G G H G H I H I J I J J K K L L L M Means that not share a letter are significantly different Ngày One-way ANOVA: IAA Ngày versus Tên dòng vi khuẩn Source Tên dòng vi khuẩn Error Total DF 20 42 62 Chuyên ngành Vi sinh vật học SS 14,53397 0,37304 14,90700 MS 0,72670 0,00888 F 81,82 P 0,000 Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Trường ĐHCT S = 0,09424 Level CL1 CL2 CL3 CL4 CL5 CL6 CL7 CL8 CL9 CR1 CR2 CR3 CR4 CR5 CR6 CR7 CT1 CT2 CT3 CT4 CT5 N 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 R-Sq = 97,50% R-Sq(adj) = 96,31% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev Mean StDev + -+ -+ -+ 1,2807 0,1325 (*-) 2,1404 0,0304 (-*-) 1,3333 0,1096 (-*-) 0,0175 0,0304 (-*-) 0,8246 0,0608 (-*-) 0,6491 0,0608 (-*-) 0,8070 0,1325 (*-) 0,2807 0,1096 (-*-) 0,6842 0,1393 (*-) 1,2281 0,0608 (*-) 0,2982 0,0304 (-*-) 1,1930 0,1096 (-*-) 0,6842 0,1393 (*-) 0,8947 0,0526 (-*-) 0,4386 0,0608 (-*-) 0,1754 0,1096 (-*-) 0,6140 0,1096 (-*-) 0,9123 0,0608 (-*-) 1,3333 0,0804 (-*-) 0,5263 0,1393 (-*-) 1,1053 0,0526 (*-) + -+ -+ -+ 0,00 0,60 1,20 1,80 Pooled StDev = 0,0942 Grouping Information Using Fisher Method Tên dòng vi khuẩn CL2 CT3 CL3 CL1 CR1 CR3 CT5 CT2 CR5 CL5 CL7 CR4 CL9 CL6 CT1 CT4 CR6 CR2 CL8 CR7 CL4 N 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 Mean 2,1404 1,3333 1,3333 1,2807 1,2281 1,1930 1,1053 0,9123 0,8947 0,8246 0,8070 0,6842 0,6842 0,6491 0,6140 0,5263 0,4386 0,2982 0,2807 0,1754 0,0175 Grouping A B B B B C B C C D D D E D E E F E F F G F G G H H I I J J J K Means that not share a letter are significantly different 3.2 Lượng IAA dòng vi khuẩn nội sinh rễ tổng hợp tổng hợp theo thời gian Ngày One-way ANOVA: IAA Ngày versus Tên dòng Source Tên dòng Error DF 14 SS 5,9603 0,4630 Chuyên ngành Vi sinh vật học MS 0,9934 0,0331 F 30,04 P 0,000 Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Total 20 S = 0,1818 Level CR1 CR2 CR3 CR4 CR5 CR6 CR7 6,4233 R-Sq = 92,79% N 3 3 3 Trường ĐHCT Mean 1,5000 0,6111 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 StDev 0,3333 0,3469 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 R-Sq(adj) = 89,70% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev -+ -+ -+ -+ -( * ) ( -* ) ( * ) ( * ) ( * ) ( * ) ( * ) -+ -+ -+ -+ -0,00 0,50 1,00 1,50 Pooled StDev = 0,1818 Grouping Information Using Fisher Method Tên dòng CR1 CR2 CR7 CR6 CR5 CR4 CR3 N 3 3 3 Mean 1,5000 0,6111 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 Grouping A B C C C C C Means that not share a letter are significantly different Ngày One-way ANOVA: IAA Ngày versus Tên dòng Source Tên dòng Error Total DF 14 20 S = 0,09345 Level CR1 CR2 CR3 CR4 CR5 CR6 CR7 N 3 3 3 SS 4,40699 0,12226 4,52925 MS 0,73450 0,00873 R-Sq = 97,30% Mean 1,3529 1,5490 2,0196 0,6471 0,9804 1,6863 1,9020 StDev 0,1176 0,0340 0,0679 0,0588 0,1225 0,0340 0,1480 F 84,11 P 0,000 R-Sq(adj) = 96,14% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev -+ -+ -+ -+ (-*-) (-*-) (-* ) (-*-) ( *-) ( *-) (-*-) -+ -+ -+ -+ 1,00 1,50 2,00 2,50 Pooled StDev = 0,0935 Grouping Information Using Fisher Method Tên dòng CR3 CR7 CR6 CR2 CR1 CR5 N 3 3 3 Mean 2,0196 1,9020 1,6863 1,5490 1,3529 0,9804 Grouping A A B B C D Chuyên ngành Vi sinh vật học Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Trường ĐHCT CR4 0,6471 E Means that not share a letter are significantly different Ngày One-way ANOVA: IAA Ngày versus Tên dòng Source Tên dòng Error Total DF 14 20 SS 3,19483 0,10896 3,30379 S = 0,08822 Level CR1 CR2 CR3 CR4 CR5 CR6 CR7 N 3 3 3 MS 0,53247 0,00778 R-Sq = 96,70% Mean 1,2281 0,2982 1,1930 0,6842 0,8947 0,4386 0,1754 StDev 0,0608 0,0304 0,1096 0,1393 0,0526 0,0608 0,1096 F 68,42 P 0,000 R-Sq(adj) = 95,29% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev + -+ -+ -+( * ) ( -* ) ( * ) ( -* ) ( -* ) ( -* ) ( * ) + -+ -+ -+0,35 0,70 1,05 1,40 Pooled StDev = 0,0882 Grouping Information Using Fisher Method Tên dòng CR1 CR3 CR5 CR4 CR6 CR2 CR7 N 3 3 3 Mean 1,2281 1,1930 0,8947 0,6842 0,4386 0,2982 0,1754 Grouping A A B C D D E E Means that not share a letter are significantly different 3.3 Lượng IAA dòng vi khuẩn nội sinh thân tổng hợp theo thời gian Ngày One-way ANOVA: IAA Ngày 2_1 versus Tên dòng_1 Source Tên dòng_1 Error Total S = 0,2317 Level CT1 CT2 CT3 CT4 CT5 N 3 3 DF 10 14 SS 11,5667 0,5370 12,1037 MS 2,8917 0,0537 R-Sq = 95,56% Mean 0,3889 0,0000 1,0556 0,0000 2,3333 StDev 0,0962 0,0000 0,2546 0,0000 0,4410 F 53,84 P 0,000 R-Sq(adj) = 93,79% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev + -+ -+ -+ ( -* -) ( -* -) ( -* -) ( -* -) ( -* -) + -+ -+ -+ 0,00 0,80 1,60 2,40 Pooled StDev = 0,2317 Chuyên ngành Vi sinh vật học Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Trường ĐHCT Grouping Information Using Fisher Method Tên dòng_1 CT5 CT3 CT1 CT4 CT2 N 3 3 Mean 2,3333 1,0556 0,3889 0,0000 0,0000 Grouping A B C C C Means that not share a letter are significantly different Ngày One-way ANOVA: IAA Ngày 4_1 versus Tên dòng_1 Source Tên dòng_1 Error Total S = 0,1234 Level CT1 CT2 CT3 CT4 CT5 N 3 3 DF 10 14 SS 2,1301 0,1522 2,2824 MS 0,5325 0,0152 R-Sq = 93,33% Mean 1,8235 0,8824 1,9412 1,7647 1,6471 StDev 0,1019 0,1176 0,0588 0,0588 0,2121 F 34,98 P 0,000 R-Sq(adj) = 90,66% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev -+ -+ -+ -+ ( -* ) ( -* ) ( -* ) ( -* ) ( -* ) -+ -+ -+ -+ 1,05 1,40 1,75 2,10 Pooled StDev = 0,1234 Grouping Information Using Fisher Method Tên dòng_1 CT3 CT1 CT4 CT5 CT2 N 3 3 Mean 1,9412 1,8235 1,7647 1,6471 0,8824 Grouping A A B A B B C Means that not share a letter are significantly different Ngày One-way ANOVA: IAA Ngày 6_1 versus Tên dòng_1 Source Tên dòng_1 Error Total S = 0,09415 Level CT1 CT2 CT3 CT4 CT5 N 3 3 DF 10 14 SS 1,35439 0,08864 1,44303 MS 0,33860 0,00886 R-Sq = 93,86% Mean 0,6140 0,9123 1,3333 0,5263 1,1053 StDev 0,1096 0,0608 0,0804 0,1393 0,0526 Chuyên ngành Vi sinh vật học F 38,20 P 0,000 R-Sq(adj) = 91,40% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev + -+ -+ -+ ( -* ) ( -* -) ( -* -) ( -* -) ( -* -) + -+ -+ -+ - Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Trường ĐHCT 0,60 0,90 1,20 1,50 Pooled StDev = 0,0942 Grouping Information Using Fisher Method Tên dòng_1 N Mean Grouping CT3 1,33333 A CT5 1,10526 B CT2 0,91228 C CT1 0,61404 D CT4 0,52632 D Means that not share a letter are significantly different 3.4 Lượng IAA dòng vi khuẩn nội sinh tổng hợp theo thời gian Ngày One-way ANOVA: IAA Ngày 2_1_1 versus Tên dòng_1_1 Source Tên dòng_1_1 Error Total S = 0,2029 Level CL1 CL2 CL3 CL4 CL5 CL6 CL7 CL8 CL9 N 3 3 3 3 DF 18 26 SS 26,1749 0,7407 26,9156 R-Sq = 97,25% Mean 2,9444 1,5556 1,2778 0,0000 0,2778 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 StDev 0,3469 0,0962 0,4194 0,0000 0,2546 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 MS 3,2719 0,0412 F 79,51 P 0,000 R-Sq(adj) = 96,02% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev + -+ -+ -+ (-* ) ( *-) ( *-) (-*-) ( *-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) + -+ -+ -+ 0,0 1,0 2,0 3,0 Pooled StDev = 0,2029 Grouping Information Using Fisher Method Tên dòng_1_1 CL1 CL2 CL3 CL5 CL9 CL8 CL7 CL6 CL4 N 3 3 3 3 Mean 2,9444 1,5556 1,2778 0,2778 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 0,0000 Grouping A B B C C C C C C Means that not share a letter are significantly different Ngày One-way ANOVA: IAA Ngày 4_1_1 versus Tên dòng_1_1 Source Tên dòng_1_1 Error Total S = 0,1593 DF 18 26 SS 4,3148 0,4567 4,7715 R-Sq = 90,43% Chuyên ngành Vi sinh vật học MS 0,5393 0,0254 F 21,26 P 0,000 R-Sq(adj) = 86,17% Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Level CL1 CL2 CL3 CL4 CL5 CL6 CL7 CL8 CL9 Trường ĐHCT Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev N Mean StDev -+ -+ -+ -+ -3 2,3922 0,1797 ( -* -) 1,9216 0,0679 ( * -) 1,9804 0,2066 ( -* ) 1,0588 0,1556 ( -* -) 1,7647 0,2121 ( -* -) 1,2941 0,1019 ( -* -) 1,6863 0,2377 ( -* -) 1,4902 0,0679 ( -* -) 1,2157 0,0899 ( -* -) -+ -+ -+ -+ -1,00 1,50 2,00 2,50 Pooled StDev = 0,1593 Grouping Information Using Fisher Method Tên dòng_1_1 CL1 CL3 CL2 CL5 CL7 CL8 CL6 CL9 CL4 N 3 3 3 3 Mean 2,3922 1,9804 1,9216 1,7647 1,6863 1,4902 1,2941 1,2157 1,0588 Grouping A B B C B C C D D E E F F F Means that not share a letter are significantly different Ngày One-way ANOVA: IAA Ngày 6_1_1 versus Tên dòng_1_1 Source Tên dòng_1_1 Error Total DF 18 26 S = 0,09872 R-Sq = 98,18% Level CL1 CL2 CL3 CL4 CL5 CL6 CL7 CL8 CL9 N 3 3 3 3 Mean 1,2807 2,1404 1,3333 0,0175 0,8246 0,6491 0,8070 0,2807 0,6842 SS 9,46958 0,17544 9,64502 StDev 0,1325 0,0304 0,1096 0,0304 0,0608 0,0608 0,1325 0,1096 0,1393 MS 1,18370 0,00975 F 121,45 P 0,000 R-Sq(adj) = 97,37% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev + -+ -+ -+ (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) + -+ -+ -+ 0,00 0,60 1,20 1,80 Pooled StDev = 0,0987 Grouping Information Using Fisher Method Tên dòng_1_1 N Mean Chuyên ngành Vi sinh vật học Grouping Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 CL2 CL3 CL1 CL5 CL7 CL9 CL6 CL8 CL4 3 3 3 3 2,1404 1,3333 1,2807 0,8246 0,8070 0,6842 0,6491 0,2807 0,0175 Trường ĐHCT A B B C C D C D D E F Means that not share a letter are significantly different 3.5 Lượng IAA của dòng vi khuẩn nội sinh triển vọng tổng hợp tổng hợp theo thời gian Ngày One-way ANOVA: IAA Ngày 2_1 versus Tên dòng vi khuẩn_1 Source Tên dòng vi khuẩn_1 Error Total S = 0,2841 Level CL1 CL2 CL3 CR3 CR7 CT3 CT5 N 3 3 3 DF 14 20 SS 21,8307 1,1296 22,9603 R-Sq = 95,08% Mean 2,9444 1,5556 1,2778 0,0000 0,0000 1,0556 2,3333 StDev 0,3469 0,0962 0,4194 0,0000 0,0000 0,2546 0,4410 MS 3,6384 0,0807 F 45,09 P 0,000 R-Sq(adj) = 92,97% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev + -+ -+ -+ ( * -) ( -* ) ( -* ) ( -* -) ( -* -) ( -* ) ( * -) + -+ -+ -+ 0,0 1,0 2,0 3,0 Pooled StDev = 0,2841 Grouping Information Using Fisher Method Tên dòng vi khuẩn_1 CL1 CT5 CL2 CL3 CT3 CR7 CR3 N 3 3 3 Mean 2,9444 2,3333 1,5556 1,2778 1,0556 0,0000 0,0000 Grouping A B C C D D E E Means that not share a letter are significantly different Ngày One-way ANOVA: IAA Ngày 4_1 versus Tên dòng vi khuẩn_1 Source Tên dòng vi khuẩn_1 Error Total S = 0,1486 DF 14 20 SS 0,8786 0,3091 1,1877 R-Sq = 73,97% Chuyên ngành Vi sinh vật học MS 0,1464 0,0221 F 6,63 P 0,002 R-Sq(adj) = 62,82% Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Level CL1 CL2 CL3 CR3 CR7 CT3 CT5 N 3 3 3 Mean 2,3922 1,9216 1,9804 2,0196 1,9020 1,9412 1,6471 StDev 0,1797 0,0679 0,2066 0,0679 0,1480 0,0588 0,2121 Trường ĐHCT Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev -+ -+ -+ -+ -( -* -) ( -* -) ( -* -) ( -* -) ( -* ) ( -* -) ( -* -) -+ -+ -+ -+ -1,50 1,80 2,10 2,40 Pooled StDev = 0,1486 Grouping Information Using Fisher Method Tên dòng vi khuẩn_1 CL1 CR3 CL3 CT3 CL2 CR7 CT5 N 3 3 3 Mean 2,3922 2,0196 1,9804 1,9412 1,9216 1,9020 1,6471 Grouping A B B B B B C C Means that not share a letter are significantly different Ngày One-way ANOVA: IAA Ngày 6_1 versus Tên dòng vi khuẩn_1 Source Tên dòng vi khuẩn_1 Error Total S = 0,09540 Level CL1 CL2 CL3 CR3 CR7 CT3 CT5 N 3 3 3 DF 14 20 SS 5,94407 0,12742 6,07149 R-Sq = 97,90% Mean 1,2807 2,1404 1,3333 1,1930 0,1754 1,3333 1,1053 StDev 0,1325 0,0304 0,1096 0,1096 0,1096 0,0804 0,0526 MS 0,99068 0,00910 F 108,85 P 0,000 R-Sq(adj) = 97,00% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev -+ -+ -+ -+ (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) -+ -+ -+ -+ 0,60 1,20 1,80 2,40 Pooled StDev = 0,0954 Grouping Information Using Fisher Method Tên dòng vi khuẩn_1 CL2 CT3 CL3 CL1 CR3 N 3 3 Mean 2,1404 1,3333 1,3333 1,2807 1,1930 Chuyên ngành Vi sinh vật học Grouping A B B B B C Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 CT5 CR7 3 1,1053 0,1754 Trường ĐHCT C D Means that not share a letter are significantly different Khả kháng khuẩn dòng vi khuẩn nội sinh phân lập 4.1 Khả kháng E coli dòng vi khuẩn nội sinh phân lập Ngày One-way ANOVA: Ngày versus Dòng vi khuẩn Source Dòng vi khuẩn Error Total S = 0,2806 Level CL5 CL9 CR1 CR4 CR5 CR6 CT1 CT4 DF 15 SS 47,7675 0,6300 48,3975 N 2 2 2 2 R-Sq = 98,70% Mean 6,2500 0,5000 1,9500 1,2500 1,0500 1,2500 3,3000 1,7500 StDev 0,3536 0,0000 0,0707 0,3536 0,2121 0,3536 0,2828 0,3536 MS 6,8239 0,0787 F 86,65 P 0,000 R-Sq(adj) = 97,56% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev + -+ -+ -+ (-* ) (-* ) ( *-) (-* ) (-* ) (-* ) ( *-) ( *-) + -+ -+ -+ 0,0 2,0 4,0 6,0 Pooled StDev = 0,2806 Grouping Information Using Fisher Method Dòng vi khuẩn CL5 CT1 CR1 CT4 CR6 CR4 CR5 CL9 N 2 2 2 2 Mean 6,2500 3,3000 1,9500 1,7500 1,2500 1,2500 1,0500 0,5000 Grouping A B C C D D E D E E F F Means that not share a letter are significantly different Ngày One-way ANOVA: Ngày versus Dòng vi khuẩn Source Dòng vi khuẩn Error Total S = 0,2062 Level CL5 CL9 CR1 CR4 CR5 N 2 2 DF 15 SS 76,7775 0,3400 77,1175 R-Sq = 99,56% Mean 8,0000 1,0500 2,4000 1,3500 0,6000 StDev 0,2828 0,3536 0,1414 0,2121 0,1414 Chuyên ngành Vi sinh vật học MS 10,9682 0,0425 F 258,08 P 0,000 R-Sq(adj) = 99,17% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev -+ -+ -+ -+ (*) (*-) (-*) (*-) (*-) Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 CR6 CT1 CT4 2 2,0000 2,8500 1,6500 0,0000 0,0707 0,2121 Trường ĐHCT (*) (*-) (-*) -+ -+ -+ -+ 2,5 5,0 7,5 10,0 Pooled StDev = 0,2062 Grouping Information Using Fisher Method Dòng vi khuẩn CL5 CT1 CR1 CR6 CT4 CR4 CL9 CR5 N 2 2 2 2 Mean 8,0000 2,8500 2,4000 2,0000 1,6500 1,3500 1,0500 0,6000 Grouping A B B C C D D E E F F G G Means that not share a letter are significantly different Ngày One-way ANOVA: Ngày versus Dòng vi khuẩn Source Dòng vi khuẩn Error Total S = 0,2861 Level CL5 CL9 CR1 CR4 CR5 CR6 CT1 CT4 N 2 2 2 2 DF 15 SS 48,5944 0,6550 49,2494 R-Sq = 98,67% Mean 5,5000 0,5500 0,0000 0,0000 0,0000 0,3500 1,7500 1,4000 StDev 0,7071 0,0707 0,0000 0,0000 0,0000 0,0707 0,3536 0,1414 MS 6,9421 0,0819 F 84,79 P 0,000 R-Sq(adj) = 97,51% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev + -+ -+ -+ ( *-) ( *-) (-*-) (-*-) (-*-) ( *-) ( *-) (-*-) + -+ -+ -+ 0,0 2,0 4,0 6,0 Pooled StDev = 0,2861 Grouping Information Using Fisher Method Dòng vi khuẩn CL5 CT1 CT4 CL9 CR6 CR5 CR4 CR1 N 2 2 2 2 Mean 5,5000 1,7500 1,4000 0,5500 0,3500 0,0000 0,0000 0,0000 Grouping A B B C C C C C Means that not share a letter are significantly different Chuyên ngành Vi sinh vật học Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Trường ĐHCT 4.2 Khả kháng Aeromonas hydrophila dòng vi khuẩn nội sinh phân lập Ngày One-way ANOVA: Vòng sáng vô khuẩn ngày versus Dòng vi khuẩn Source Dòng vi khuẩn Error Total S = 0,2291 Level CL2 CL5 CR2 CT1 DF SS 70,1100 0,2100 70,3200 N 2 2 R-Sq = 99,70% Mean 9,0500 7,2000 2,7500 2,0000 MS 23,3700 0,0525 F 445,14 P 0,000 R-Sq(adj) = 99,48% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev + -+ -+ -+ (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) + -+ -+ -+ 2,0 4,0 6,0 8,0 StDev 0,3536 0,2828 0,0707 0,0000 Pooled StDev = 0,2291 Grouping Information Using Fisher Method Dòng vi khuẩn CL2 CL5 CR2 CT1 N 2 2 Mean 9,0500 7,2000 2,7500 2,0000 Grouping A B C D Means that not share a letter are significantly different Ngày One-way ANOVA: Vòng sáng vô khuẩn ngày versus Dòng vi khuẩn Source Dòng vi khuẩn Error Total S = 0,3279 Level CL2 CL5 CR2 CT1 N 2 2 DF SS 352,205 0,430 352,635 R-Sq = 99,88% Mean 14,200 15,750 2,350 1,200 StDev 0,000 0,071 0,495 0,424 MS 117,402 0,108 F 1092,11 P 0,000 R-Sq(adj) = 99,79% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev -+ -+ -+ -+ (-*) (*-) (-*) (-*-) -+ -+ -+ -+ 4,0 8,0 12,0 16,0 Pooled StDev = 0,328 Chuyên ngành Vi sinh vật học Viện NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Trường ĐHCT Grouping Information Using Fisher Method Dòng vi khuẩn CL5 CL2 CR2 CT1 N 2 2 Mean 15,750 14,200 2,350 1,200 Grouping A B C D Means that not share a letter are significantly different Ngày One-way ANOVA: Vòng sáng vô khuẩn ngày versus Dòng vi khuẩn Source Dòng vi khuẩn Error Total S = 0,5196 Level CL2 CL5 CR2 CT1 DF SS 405,535 1,080 406,615 N 2 2 R-Sq = 99,73% Mean 14,400 16,600 1,600 1,100 StDev 0,141 0,141 0,566 0,849 MS 135,178 0,270 F 500,66 P 0,000 R-Sq(adj) = 99,54% Individual 95% CIs For Mean Based on Pooled StDev + -+ -+ -+ (-*-) (-*-) (-*-) (-*-) + -+ -+ -+ 0,0 5,0 10,0 15,0 Pooled StDev = 0,520 Grouping Information Using Fisher Method Dòng vi khuẩn CL5 CL2 CR2 CT1 N 2 2 Mean 16,600 14,400 1,600 1,100 Grouping A B C C Means that not share a letter are significantly different Chuyên ngành Vi sinh vật học Viện NC & PT Công nghệ sinh học [...]... dòng vi khuẩn nội sinh trong cây Sài đất nên đề tài: Phân lập vi khuẩn nội sinh trong cây Sài đất (Wedelia chinensis M.) trồng ở thành phố Cần Thơ được thực hiện sẽ mang nhiều ý nghĩa thực tiễn 1.2 Mục tiêu đề tài Phân lập và khảo sát được một số đặc tính tốt như: tính kháng khuẩn, khả năng cố định đạm, tổng hợp IAA và khả năng hòa tan lân của các dòng vi khuẩn sống nội sinh trong cây Sài đất (Wedelia. .. : Kết quả phân lập các dòng vi khuẩn nội sinh trong cây Sài đất .47 Bảng 10: Đặc điểm khuẩn lạc của các dòng vi khuẩn nội sinh phân lập được 48 Bảng 11: Đặc điểm tế bào của các dòng vi khuẩn phân lập được .50 Bảng 12: Lượng ammonium (µg/mL) do các dòng vi khuẩn phân lập ở cây Sài đất tổng hợp theo thời gian 52 Bảng 13: Lượng ammonium (µg/mL) do các dòng vi khuẩn phân lập ở rễ tổng hợp... của các dòng vi khuẩn nội sinh phân lập được 3 Kết quả thống kê lượng IAA của các dòng vi khuẩn phân lập được 3.1 Lượng IAA của các dòng vi khuẩn phân lập được tổng hợp theo thời gian 3.2 Lượng IAA của các dòng vi khuẩn nội sinh ở rễ tổng hợp tổng hợp theo thời gian 3.3 Lượng IAA của các dòng vi khuẩn nội sinh ở thân tổng hợp theo thời gian 3.4 Lượng IAA của các dòng vi khuẩn nội sinh ở lá tổng hợp... dòng vi khuẩn phân lập ở lá tổng hợp theo thời gian .57 Bảng 15: Hiệu quả hòa tan lân theo thời gian của các dòng vi khuẩn nội sinh trên môi trường NBRIP đặc……………………………………………………….…………61 Bảng 16: Lượng IAA (µg/mL) do các dòng vi khuẩn nội sinh phân lập được ở cây Sài đất tổng hợp theo thời gian 64 Bảng 17: Lượng IAA (µg/mL) của các dòng vi khuẩn nội sinh được phân lập ở rễ cây Sài. .. gian 3.5 Lượng IAA của các dòng vi khuẩn nội sinh triển vọng tổng hợp tổng hợp theo thời gian 4 Khả năng kháng khuẩn của các dòng vi khuẩn nội sinh phân lập được 4.1 Khả năng kháng E coli của các dòng vi khuẩn nội sinh phân lập được 4.2 Khả năng kháng Aeromonas hydrophila của các dòng vi khuẩn nội sinh phân lập được Chuyên ngành Vi sinh vật học viii Vi n NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp... Lượng ammonium (µg/mL) do các dòng vi khuẩn phân lập ở thân của cây Sài đất tổng hợp theo thời gian 1.2 Lượng ammonium (µg/mL) do các dòng vi khuẩn triển vọng tổng hợp theo thời gian 2 Kết quả khảo sát khả năng tổng hợp IAA 2.1 Lượng IAA (µg/ml) do các dòng vi khuẩn phân lập ở thân của cây Sài đất tổng hợp theo thời gian 2.2 Lượng IAA (µg/ml) do các dòng vi khuẩn nội sinh triển vọng tổng hợp theo thời... không những nội sinh ở cây họ đậu mà còn xâm nhiễm vào cả cây hòa bản và cố định đạm sinh học cho cây Chuyên ngành Vi sinh vật học 10 Vi n NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Trường ĐHCT 2.3.3 Một số nhóm vi khuẩn nội sinh thường gặp Theo nghiên cứu khoa học của các nhà khoa học, hiện nay người ta đã phân lập và nhận diện được nhiều chủng vi khuẩn nội sinh trong thực... sinh là đất vùng rễ Kết hợp nhiều kết quả phân lập vi khuẩn nội sinh từ rễ cây lúa mì, bông vải, bắp ngọt, bắp đá và cải canola đều kết luận vi khuẩn nội sinh xuất phát từ đất Vai trò của hạt như là một nguồn của vi khuẩn nội sinh vẫn là một điều còn tranh cãi (Hallmann et al., 1997) c Di chuyển Theo Hallmann (2001), thường vi khuẩn nội sinh được thu hút hay di chuyển từ môi trường bên ngoài đến cây chủ... sinh trong cây Sài đất (Wedelia chinensis M.) trồng ở thành phố Cần Thơ Chuyên ngành Vi sinh vật học 2 Vi n NC & PT Công nghệ sinh học Luận văn tốt nghiệp Đại học Khóa 37 - 2014 Trường ĐHCT CHƯƠNG 2 LƯỢC KHẢO TÀI LIỆU 2.1 Điều kiện tự nhiên của thành phố Cần Thơ 2.1.1 Vị trí địa lý Cần Thơ là một thành phố trực thuộc trung ương nằm ở vùng hạ lưu của Sông Mê Kông và ở vị trí trung tâm đồng bằng châu... hành chính thành phố Cần Thơ 3 Hình 2: Cây Sài đất (Wedelia chinensis) 5 Hình 3: Sự thay đổi màu của dãy dung dịch NH4+ theo phương pháp Indolphenol Blue 41 Hình 4: Sự thay đổi màu của dãy dung dịch IAA theo phương pháp Salkowski 43 Hình 5: Vòng pellicle của vi khuẩn nội sinh trong môi trường NFb bán đặc 46 Hình 6: Một số dạng khuẩn lạc vi khuẩn nội sinh phân lập được