Bài giảng EPI I NFO thống kê Y học

TRNG I HC Y T CÔNG CNG  MÔN THNG KÊ – TIN HC Phân tích s liu bng Epi Info 2002 HÀ NI - 2004 2 Epi Info là mt phn mm máy tính c s dng rt ph bin trong lnh vc Y t . Chng trình này giúp cho các nhà dch t hc, cán b nghiên cu, nhân viên y t có th nhp, qun lý s liu mt cách d dàng, ng thi gíup cho h có c mt công c rt t  phân tích thng kê, trình bày kt qu phân tích di dng bng biu,  th và biu . Phn mm Epi Info phiên bn dùng trên môi trng Windows ang ngày càng c hoàn thin vi các kh nng phân tích, qun lý s liu hn nhiu so vi phiên bn Epi Info trên môi trng DOS trc ây. i Vit nam, Epi Info cng c s dng khá ph bin trong rt nhiu nm qua. Phiên n Epi Info 6.04V là phiên bn ting Vit do Trng i hc Y t công cng phát trin i s tr giúp ca t chc CDC. Hin nay trng cng ang tin hành hoàn thin phiên n Epi Info 2002 - ting Vit và s ra mt vào gia nm 2004. Mi thông tin liên quan n phn mm Epi Info 2002 xin liên h vi a ch di ây. a ch liên h  MÔN THNG KÊ – TIN HC i hc Y t công cng 138 Ging võ – Hà ni - Vit nam n thoi: (844) 846-3560 Fax: (844) 845-2738 Thn t: epiinfovn@hsph.edu.vn Trang Web: http://www.hsph.edu.vn/epiinfo 3 Nhóm biên son Ths. Phm Vit Cng CN. Trn Th Hng KS. Nguyn Th Trang Nhung c lc c lc 4 o b câu hi 1 1.To mt project, to mt view 1 1.1To mt view mi 1 1.2 To các trng trong view 1 1.3Canh l 4 1.4 Di chuyn và t li kích thc các trng 4 1.4 Canh l các trng 4 1.6 Thay i th t nhp s liu các trng (Tab Order) 5 1.7Thêm mt trang mi vào bng câu hi 6 1.8Th ê m mt nhóm các tr ng 6 1.9To các giá tr và các giá tr ghi chú hp l và bng mã 7 1.10Thay i màu nn 9 1.11i tên trang 9 2.Lu view và bng d liu vào a 9 t mã kim tra nhp liu 10 1.S dng lnh Assign 10 2.To câu lnh kim tra bng chng trình Program Editor 13 o nút liên kt 15 4.Di chuyn, thay i kích thc và sp xp nút liên kt 16 5.To view liên kt 16 6.Xem xét li công vi c ca bn 17 Nhp d liu cho b câ u hi 18 1 .Nhp s li u vào bng hi 18 2.Tìm kim bn ghi 18 3.Mnh u kin trong lnh Find 19 Qun lý s liu 27 Gii thiu 27 1 c mt project trong Epi Info 27 1.1M mt project có kiu d liu là kiu d liu Epi Info 2002 27 1.2.M mt project có kiu d liu là kiu Excel 28 1.3 c file .DBF 28 1.4c Reading (importing) mt bng  mt trang HTML 29 1.5 c các nh dng khác trong Analysis 30 1.6 Trn d liu t nhiu ngun và t nhiu nh dng khác nhau 30 2.Làm sch s liu 30 2.1K hoch làm sch s liu 30 2.2Kim tra tính duy nht ca mã 31 2.3Hin th các giá tr trong mt bin ca b s liu 33 2.4 Mã hoá li b s liu 34 2.4.5Mã hoá li các trng dng s (numberic) 35 2.5 Kim tra li nhng giá tr phù hp cho bin phân loi 36 2.6 Kim tra các giá tr bt thng (outliner) cho bin liên tc 36 2.7Kim tra ngày tháng  phát hin các sai sót khi nhp d liu ngày tháng 36 2.8 Kim tra các thông tin b mt 37 2.9 Kim tra tính không nht quán trong s liu 37 3.Qun lý s liu 38 3.1To mt d án riêng bit 38 3.2 Ghi li mt h thng lnh di dng file .pgm 39 3.3M mt chng trình ã ghi li 39 5 3.4Chy chng trình 40 Phân tích s liu 41 1.Sp xp các giá tr ca mt bin 43 2.V th 44 3. a ra bng phân phi tn s 45 4.Tính giá tr trung bình 48 5.To mt bng so sánh 49 6.So sánh t l ca hai nhóm 52 7.So sánh hai giá tr trung bình 54 8 .Nhiu và phân tíc h phân tng 56 Phân tích hi quy 63 1. Mô hình hi quy tuyn tính 64 1.1Xây dng mô hình hi quy 64 1.2 Các bc tin hành mt phân tích hi quy 65 1.3 Biu  c hm m 65 1.4ng bình phng ti thiu (least-square line) 67 1.5 H s xác nh R 2 (R square) 68 1.6 ánh giá phng trình hi quy 69 1.7 S dng mô hình hi quy c lng và doán 71 2. Hi quy logistics 71 2 .1 Mô hình hi quy logis tic s 72 Ph lc 75 Phân tích s liu bng Epi Info 1 o b câu hi c tiêu: Sau khi hoàn thành bài hc này, sinh viên có kh nng: 1. o c bng nhp liu trong Epi Info 2002 2. Gán c các bin cho d liu và các thuc tính ca bin 3. t các giá tr hp l cho các trng nhp liu 4. nh dng và gán các thuc tính cho bng nhp liu Bài tp: To mt màn hình nh p liu cho mt Trung Tâm chm sóc sc kho Ph . H thng này s thu thp s liu v tng bnh nhân ti khám  Trung tâm. Màn hình nhp liu phi c m bo dòng giá tr nhp vào cho mi câu hi phi c chun hoá 1.To mt project, to mt view 1.1To mt view mi Epi Info t chc các c s d liu trong các project. Mt project cha nhiu view, và mi mt view hin th thông tin v mt bng d liu. Mt project mi có th to lp ng thi vi vic to mt bng câu hi. Vic to mt project mi c tin hành theo các bc sau ây: 1.  trình n chính ca Epi Info nhn vào phím Makeview, s xut hin mt ca s có mt thanh trình n và mt view  trng. 2. Mun to mt VIEW mi, nhn vào trình n File và chn New. 3. Khi hp thoi Create or Open PROJECT hin ra, chuyn n th mc C:\Epi- _Info. ánh tên ca project (STI) vào khong trng có ghi File Name và nhn Open. Mt d án có tên là STI ã c to 4. Sau ó, Epi Info s yêu cu bn to mt view mi. Nhp tên view “Thông tin bnh nhân” vào hp thoi có cùng ng dn và tên file va c to  trên, C:\Epi_Info\ STI.mdb. Nhn OK. Bn va to c mt view gi là Thông tin nh nhân, m trong d án . 1.2 To các trng trong view  to các trng trong view: Phân tích s liu bng Epi Info 2 1.Nhn vào trình n Insert, sau ó nhn vào trình n Field, hoc nhn chut phi vào ch trng,  chèn các bin cho View ca bn. Hp thoi Field Definition xut hin. Bng cách nhn chut phi vào view, trng mi, câu hi/gi ý ca mt hp nhp  liu s hin ra ti v trí mà bn nhn chut Các thut ng "trng" và "bin" c dùng thay th cho nhau trong toàn b giáo trình này. Các thut ng này dùng  ch câu hi/gi ý và/hoc hp nhp d liu, hoc  ch chung các d liu có cha trong câu hi/gi ý và/hoc hp d liu nhp vào. 2.Gõ vào ni dung các câu hi/gi ý. Chn kiu bin và làm theo các ch dn (nu có)  bên di. Sau ó nhn OK. Câu hi/gi ý Kiu trng Kiu nh dng Tên trng Trung tâm chm sóc sc kho ph n Label/Title Bold/Italic, c 12 [Mc nh] u trng có kiu d liu là label/Title (nhãn/tiêu ) thì không cho nhp d liu vào. Gõ vào câu hi/gi ý bn mun có  trong View. Phím nh "Font for Prompt" cho phép bn có c font ch,  ch và kiu ch tu ý cho câu hi/gi ý Chn kiu tr ng (kiu bin) cho câu hi/gi ý. Phím l nh "Font" cho phép thay  i nh d ng font ch cho phn ni dung c gõ trong câu h i/gi ý. Phn tên trng s là tên câu i/gi ý. Tuy nhiên, chúng ta có th thay i tên trng bng cách nhn kép chut  bôi en dòng kí t và gõ mt tên khác thích hp hn. Phân tích s liu bng Epi Info 3 Mun thay i hình thc ca mt nhãn hoc mt câu hi/gi ý, nhn chut vào phím Font for Prompt nm  bên phi hp nhp Question or Prompt. t hp thoi nh dng font ch s hin ra. Mun thay i dng d liu hin ra bên ngoài s nhp vào h thng, nhn chut vào phím Font trong khung Field or Variable. Ln này, mt hp thoi nh dng font ch cng s xut hin. i vi các trng kiu s, kiu mc nh là 2 ch s, biu th bi 2 kí hiu ## (Mi kí hiu # biu th mt ch s). Bn cng có th gõ thêm bao nhiêu kí hiu # tu ý, tu thuc vào s ch s cn chèn thêm vào trng. ng i vi các trng kiu s, có th chèn du thp phân vào v trí nào cn thit. p li bc 1 và 2 cho tt c các bin trong danh sách sau: Câu hi/gi ý Kiu trng Kiu nh dng Tên trng Thông tin v BN Label/Title Bold, Size 18 [Default] Ngày khám ln u Date DD-MM-YYYY Date1Visit Mã bnh nhân Text PatientID Tên Text Name a ch Text Address nh/Thành ph Text City Huyn Text Country n thoi Phone Number ###-#### PhoneNum Ngày sinh Date DD-MM-YYYY BirthDate Tui Number ánh du vào “Read Only” Age i sinh Text BirthPlace  hc vn Text Education Tình trng hôn nhân Text MarStat Có nhng trng bt buc cha các d liu quan trng mà các trng này phi có ít nht mt giá tr. Trng Tui là trng có th tính toán c, ch xem, không cho phép nhp s liu vào trc tip t bng hi. t s la chn khác bao gm: Soundex, có cha mt mã s tng hp các tên Ting Anh ng âm nhng khác cách vit, và Repeat Last, trng này s tng nhc li giá tr cui cùng c nhp vào Phân tích s liu bng Epi Info 4 1.3Canh l 1.  chnh các ng k, nhn chut vào trình n Format, sau ó nhn vào Settings. 2. Mun xoá các ô, s dng hp chn Visible grid on screen  xoá bng cách nhn chut vào hp chn, ô cn xoá s bin mt. Cng tt luôn mc Snap to Grid. Chú ý các mc chn khác na 3. Nhn OK. 1.4 Di chuyn và t li kích thc các trng 1.Kích chut trái vào tiêu  Trung tâm chm sóc sc kho ph n. Nhn chut trái, a gi va di chuyn tiêu  trên vào chính gia, phía trên trang giy. Ch có các trng kiu Text (vn bn) và kiu Multiline (nhiu dòng) mi có th t li kích thc các trng.  dài ca các trng kiu Number (S) và Date (Ngày) ph thuc vào kiu ca mi trng. Trng vn bn ch có thc nh dng chun theo chiu ngang. Các trng có nhiu dòng k có tht li kích thc các trng theo chiu ngang hay chiu dc u c. 2.Kích chut vào ô nhp liu cho Tên, các du màu xanh s xut hin, kích chut trái và gi vào bt kì mt du màu xanh nào, di chuyn chut  thay i  rng a trng. 1.4 Canh l các trng Mun canh l cho các trng, phi có mt hp chn bao xung quanh trng cn chnh l.  thc hin vic này, nhn chut trái và va gi chut, va di chuyn con tr t l phía trái ca trng u tiên cn canh ln l phía phi ca trng cui cung cn canh l. Sau ó, th chut ra. S xut hin mt ng chm vin xung quanh các trng này. 1. Trong trang này, trng Ngày sinh và trng Tui nên canh l theo chiu ngang. u tiên, to ng vin bao xung quanh các trng c chn bng cách nhn chut trái và di con tr qua các trng ó. Khi ng vin c to, nhn chut vào trình n Format, sau ó nhn vào Alignment và cui cùng là Horizontal. 2. Tip theo, chn trng Ngày khám ln u và trng Mã bnh nhân và khoanh vùng c chn. Khi ng vin khoanh vùng chn c to, kích chut vào trình n Format, sau ó vào Alignment, và cui cùng là Vertical. ng câu hi ca bn s tng t mu di ây: Phân tích s liu bng Epi Info 5 1.6 Thay i th t nhp s liu các trng (Tab Order) 1. Mun thay i th t nhp s liu ca các trng mt cách th công, nhn chut vào trình n Edit, ri vào Order of Field Entry (Tab Order). 2. Nhn chut vào trng mun chn, ri chn hoc nút Up, hoc nút Down. Nhn OK. Các bc này có thc lp li vi các trng khác cho n khi các trng nhp c sp xp theo úng th t mong mun. Thay i th t theo dõi ch là thay i th t các trng nhp, không phi là di chuyn c hc các trng trên trang nhp liu  thích ng vi thay i bt k là h qu ca chc nng này. Sau khi t các th t nhp s liu ca trng nu chúng ta di chuyn các trng trên trang nhp liu s làm cho th t nhp ca các trng tr v th t mc nh ban u. Các trng vn bn nhn các d liu bng s hoc bng ch. Trng a ch có th là kiu trng nhiu dòng hoc là trng n bn có mt hoc mt s dòng n. Trng Ngày là mt kiu trng c bit, có thnh dng ngày tháng theo kiu M hoc kiu Anh, hoc mt kiu ngày tháng c th nào ó . Giá tr Ngày ( c bôi en) có th  c chuyn lên trên ho c xung d i theo v trí tùy ý . [...]... hi n m t h p báo l i Mu n ti p t c thì a l i và nh n Save i l n n a 11.Nh n OK thoát kh i c a s Program 14 Phân tích s li u b ng Epi Info o nút liên k t S liên k t t- m t (1:1), n i hai b ng v i nhau M i liên k t n y th n ghi b ng n y v i m t b n ghi b ng khác ng n i m t liên k t t-nhi u n i m t b n ghi b ng n y v i nhi u b n ghi b ng khác, i liên k t n y còn c g i là liên k t “m -con” y là s liên... có thai không Cân n ng (Kg): 54 Ghi chú: 26 Qu n lý s li u c tiêu Sau khi k t thúc b i h c n y, sinh viên có th : 1 d ng Epi Info 2 d ng c các s li u t các ch c các câu l nh trong Epi Info ng trình khác làm s ch b s li u 3 Thao tác v i c s d li u trong Epi Info: mã hoá l i, t o thêm các bi n Gi i thi u Tuy ã có h th ng mã ki m tra u vào c a d li u nh ng khi nh p s li u c ng không th tránh kh i hoàn... o l p m i liên k t t -nhi u gi a b ng thông tin nh nhân và b ng theo d i th m khám, hay m t b nh nhân có th n khám nhi u l n Ch c n ng k t n i trong Epi Info t ng b i s liên k t gi a b ng m và ng con Khi phân tích nh ng b ng n y trong ch ng trình Analysis, Epi Info t ng x y d ng nh ng t khoá c n thi t i quan h trong các b ng n y c Epi Info duy trì trong Enter và MakeView, và khi phân tích s li u b ng... v i các d li u ã nh p: t o bi n m i, mã hoá l i bi n 4 Liên k t c các t p d li u Epi Info v i nhau Gi i thi u Nhân viên nh p d li u, vì m t hay nhi u lý do nào ó, có th s su t nh p ho c d li u l i: Có th là do ch vi t tay khó c, c ng có th do ng i nh p d li u không quen i d ng v n b n và t v ng Thêm n a, kh i l ng v n b n nhi u n m c nhi u ng i ph i cùng nh p d li u ho c m t ng i ph i nh p m t kh i. .. li u Ki m tra l i tính phù h p c a d li u nh n u không tham gia xét nghi m mà l i có k t qu , ng y xét nghi m … Ki m tra l i các thông tin b thi u trong các bi n 30 Phân tích s li u b ng Epi Info u có th h y i chi u t t c các l i v i phi u g c, b n s xác hoá ho c nh p s li u mà có th ch nh s a c nh c các l i mã Tuy nhiên, có nhi u l i do ng i tr l i không nh t quán thông tin nên n u có th b n h y liên... trong d li u i liên k t trên là m i liên k t m t “m ” có th có nhi u con nh ng m t con ch có duy nh t m t m Tr i l i là liên k t nhi u m t, M:1 Liên k t nhi u-nhi u, M:M, có th c t o b i m t c p liên k t m t-nhi u gi a các b ng và nó bao g m liên k t m t nhi u và/ho c nhi u liên k t nhi u m t o m t bi n m i góc d i bên ph i c a trang hai, Risk Information 1 ánh “Theo d i th m khám” là câu h i/ g i ý, ch... cho phép b n liên t i file và ti p nh n m t s p nh t làm m t file hay b ng 5.Kích OK 29 Phân tích s li u b ng Epi Info 1.5 c các nh d ng khác trong Analysis Ghi (Writing (exporting)) m t liên k t t m th i t i m t b ng HTML trong MDB 1.L p l i các b c 1–4 trên c file HTML t 2 ánh ICD9_LINK, tên khác v i tên m c ng t nh TMPLINK_x 3.Kích OK S liên k t ICD9_LINK s file ICD9 Cod.htm c ghi l i nh là s tham... tích s li u b ng Epi Info 1.7Thêm m t trang m i vào b ng câu h i Epi Info có kh n ng t o nhi u trang trong m t view n M i trang t ng t nh t trang trong b ng câu h i trên gi y, ho c có th c dùng t ch c d li u 1.Nh n chu t vào nút Add Page phía bên tr i màn hình o các tr t o m t trang m i ng sau cho view: Câu h i/ G i ý Ki u Ki u Thông tin v nguy c Label/Title Bold, Size 18 Truy n máu bao gi ch a? Yes/No... không có giá tr cho vi c vào d li u khi bi n PatientID không có d li u hay tr ng PatientID b tr ng, m t u ki n c n thi t cho nút liên k t có th ho t ng 7.M t h p tho i m i, Relate view choice, s cho phép b n l a ch n n u b n mu n t o t view liên k t m i hay m t view liên k t ã c t o tr c ó B i vì không có view khác nào ã c t o nên ch p nh n d li u m c nh t o m t view liên k t m i Kích OK B y gi chúng... t v nh vi n trong project c a chúng ta t i b ng n y Chúng ta s o m t liên k t t m th i i s m c nh, Anylasis s t tên các liên k t là TMPLNK_x, v i x là nào ó N u b n t tên cho link (liên k t) nó s c ghi l i N u b n không mu n t o s liên k t t m th i t i trang n y, kích OK s xoá s liên k t khi project c thay i hay khi Analysis c óng l i Kích Cancel s xoá b vi c c s ho t ng thay i tên c a s liên k t cho . hn nhiu so v i phiên bn Epi Info trên m i trng DOS trc  y.  i Vit nam, Epi Info cng c s dng khá ph bin trong rt nhiu nm qua. Phiên n Epi Info 6.04V là phiên bn ting Vit. doán 71 2. H i quy logistics 71 2 .1 Mô hình h i quy logis tic s 72 Ph lc 75 Phân tích s liu bng Epi Info 1 o b câu h i c tiêu: Sau khi hoàn thành b i hc n y, sinh viên có kh nng: 1 liu; thc hin úng các u kin. 3. Thao tác c v i các d liu ã nhp: to bin m i, mã hoá l i bin 4. Liên kt c các tp d liu Epi Info v i nhau Gi i thiu Nhân viên nhp d liu,