Thông tin tài liệu
TEF1 KHOA MSSV : 1053010978 2014 ThS. . N TT NGHIP SVTH: PHXINH i 1 PH 1.1. 2 1.1.1. 2 1.1.2. 2 1.1.3. 3 1.1.4. 3 1.1.5. 4 1.2. 6 1.2.1. 6 1.2.2. 7 1.2.3. Tef1 7 1.3. 9 1.4. 9 1.4.1. 9 1.4.2. 10 1.5. 15 1.5.1. 15 1.5.2. 15 1.5.3. 15 1.5.4. 16 U 17 17 in sillico 17 18 N TT NGHIP SVTH: PHXINH ii 2.3. 20 2.3.1. K 20 in sillco 21 21 22 2.3.5. PCR 23 24 24 24 2.3 25 2.3.10. A 25 2.3 25 2.3.12. 25 26 3.2 28 34 3.3.1. 34 3.3.2. LAST 35 Tef1 36 N TT NGHIP SVTH: PHXINH iii TEF1 37 3.5 41 48 48 55 55 55 55 56 N TT NGHIP SVTH: PHXINH iv 23 Tef1 26 Tef1 34 37 -mercaptoethanol. 38 -mercaptoethanol. 39 43 - 45 Tef1 47 Tef1 47 Tef1 Genbank 48 Genbank 54 N TT NGHIP SVTH: PHXINH v Cordyceps militaris 2 5 5 8 Tef1 H. Jecorina 9 Tef1 29 Tef1 30 Tef1 31 35 Tef1 36 Chloroform 37 -mercaptoethanol 38 39 40 Tef1 40 41 - 42 - 42 - 43 - 43 - 44 44 N TT NGHIP SVTH: PHXINH vi - 44 - 45 - 45 Tef1 46 46 Tef1 49 Tef1 50 Tef1 51 N TT NGHIP SVTH: PHXINH vii ATP : Adenosine triphosphate BLAST : Basic Local Alignment Search Tool bp : base-pair DNA : deoxyribonucleotide triphosphate ML : maximum likelihood MP : maximum parsimony NJ : neighbor-joining rDNA : ribosomal DNA RNA : ribosomal RNA TEF1 : The elongation factor 1 alpha N TT NGHIP SVTH: PHXINH 1 m cao , N c . n c hay (anamorph) x Tef1 -1 cho Tef1 au hay trong . Cordyceps Cordyceps gen Tef1 . [...]... [30] danh n PH ] 6 N T T NGHI P [30], [32] Isaria siclairii Cordyceps sobolifera Beauveria sobolifera Cordyceps sobolifera [20 (anamorph) (teleomorph) 1.2.2 - PH 7 N T T NGHI P 1.2.3 Tef1 Gen Tef1 (translation elongation factor 1) -1 [25] EF40S, [24] -t ribosome di EF-1 [10] [25] Gen Tef1 c [6] [19] Buyck (C tenuithrix ng gen Tef1 C altipes) trong chi Cantharellus gen Tef1 Tef1 [8] Tef1 [25] , Tef1. .. 8.0 EDTA 0.5M Ethanol 70% Isopropanol Gel agarose 1.5 % Agarose 1.5g TBE 1X 100ml Ethidium bromide 2.2.2.3 Ti Tef1 SVTH: PH XINH 19 N T T NGHI P 2.3 2.3.1 K gen Tef1 , pubmed) SVTH: PH XINH 20 N T T NGHI P 2.3.2 in sillico 2.3.2.1 GenBank (NCBI, USA) v Tef1 (www.ncbi.nlm.nih.gov) 2.3.2.2 Thu Tef1 BLAST, Annhyb 2.3.3 2.3.3.1 : -mercaptoethanol 2.3.3.1.1 -mercaptoethanol 1,5g) -HCl ,5M ,5M, 266 2O,... Tef1 Tef1 [8] Tef1 [25] , Tef1 m 1200bp [26] [22] PH 8 N T T NGHI P 1.5 Tef1 H Jecorina [12] 1.3 Cordyceps sinensis, Cordyceps militaris Cordyceps sabrolifera [5 Cordyceps nutans Cordyceps gunnii [4] Cordyceps militaris (Isaria tenuipes PH Cordyceps nutans) [4] 9 N T T NGHI P 1.4 1.4.1 1.4.2 sinh sinh 1.4.2.1 PH 10 N T T NGHI P nhau gen hay 1.4.2.2 D 1.4.2.3 1.4.2.4 PH 11 N T T NGHI P u Jukes-Cantor,... OD260/OD280 XINH 22 N T T NGHI P 2.3.5 PCR 2.3.5.1 2.1 Master mix 7,5 l Primer Forward 10 M Primer reverse 10 M DNA Water free nuclease 5,5 15 2.3.5.2 2.1 F/ 2218R b tc SVTH: PH XINH khu Tef1 23 N T T NGHI P 2.3.6 agarose 1,5 5 2.3.7 Tef1 2.3.8 2.3.8.1 2.3.8.2 - ambigous nucleotide code) SVTH: PH XINH 24 N T T NGHI P 2.3.9 Blastn LAST 2.3.10 2.3.11 - 2.3.12 -Joining SVTH: PH XINH 25 ... 1.4.2 sinh sinh 1.4.2.1 PH 10 N T T NGHI P nhau gen hay 1.4.2.2 D 1.4.2.3 1.4.2.4 PH 11 N T T NGHI P u Jukes-Cantor, Kimura 2parameter (K2P), Tamura 3-parameter, Hasegawa-Kishino-Yano (HKY), Tamura Nei, General Time Reversible (GTR) 1.4.2.5 -and- -and-and- tt PH 12 N T T NGHI P 1.4.2.6 - P - ch P joining or- - PH 13 N T T NGHI P lnL 1.4.2.7 1.5 1.5.1 [35] PH 14 N T T NGHI P 1.5.2 ( =300nm) 1.5.3 (guanine), . Buyck ng gen Tef1 (C. tenuithrix C. altipes) trong chi Cantharellus. gen Tef1 . N TT NGHIP PH 8 Tef1 1.2.3. Gen Tef1 (translation elongation factor 1) -1 [25]. EF- 40S,. Tef1 47 Tef1 47 Tef1 Genbank
Ngày đăng: 24/11/2014, 00:11
Xem thêm: Hỗ trợ định danh nấm ký sinh côn trùng dựa trên phân tích phả hệ vùng gen TEF1, Hỗ trợ định danh nấm ký sinh côn trùng dựa trên phân tích phả hệ vùng gen TEF1