1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Luận văn thạc sĩ Công nghệ sinh học: Phát hiện gen mã hóa Carbapenemase trên chủng acinetobacter baumannii bằng kỹ thuật lamp

83 0 0
Tài liệu đã được kiểm tra trùng lặp

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang 83
Dung lượng 0,97 MB

Cấu trúc

  • 1.1. Vi khuҭn Acinetobacter baumannii (15)
    • 1.1.1. Ĉ̿FÿL͋m sinh lý (15)
    • 1.1.4. Nhi͍m khu̱QOLrQTXDQYjWiFÿ͡ng lâm sàng cͯa A. baumannii (24)
  • 1.2. Kháng sinh Carbapenem (26)
    • 1.2.1. S͹ ÿ͉ kháng Carbapenem ͧ Acinetobacter baumannii (27)
    • 1.2.2. Các gen mã hóa carbapenemase (30)
  • 1.3. Kӻ thuұt LAMP (34)
    • 1.3.1. Khái ni͏m (34)
    • 1.3.3. Phát hi͏n s̫n pẖm cͯa LAMP (38)
  • 1.4. Các nghiên cӭu liên quan (40)
  • 2.1. ĈӕLWѭӧng nghiên cӭu (42)
  • 2.3. ThӡLJLDQÿӏDÿLӇm nghiên cӭu (45)
  • 2.4. Vұt liӋu nghiên cӭu (45)
    • 2.5.1. M̳u b͏nh pẖm lâm sàng (46)
    • 2.5.6. Thi͇t l̵p ph̫n ͱng và phát hi͏n s̫n pẖm cͯa LAMP (49)
    • 2.5.7. Thi͇t l̵p ph̫n ͱng và phát hi͏n s̫n pẖm PCR (50)
  • 3.1. KӃt quҧ khҧo sát mүu bӋnh phҭm lâm sàng (52)
  • 3.2. KӃt quҧ ÿӏQKGDQKYLVLQKYjNKiQJVLQKÿӗ (0)
  • 3.3. KӃt quҧ phát hiӋn gen mã hóa bla OXA-23 cӫa LAMP trên khuҭn lҥc (55)
  • 3.5. KӃt quҧ LAMP phát hiӋn gen bla OXA-23 trên mүu bӋnh phҭm lâm sàng (60)
  • 3.6. ĈiQKJLiWtQKKLӋu quҧ cӫa LAMP (61)
  • 3.7. Bàn luұn (63)
  • 4.1. KӃt luұn (67)
  • 4.2. KiӃn nghӏKѭӟng phát triӇn cӫDÿӅ tài (68)

Nội dung

Vi khuҭn Acinetobacter baumannii

Ĉ̿FÿL͋m sinh lý

Acinetobacter baumannii là vi khuҭn Gram âm, hiӃX NKt NK{QJ GL ÿӝng, không lên men, oxidase (-FDWDODVHKjPOѭӧng Guanin - Cytosine (G-C) trong trình tӵ DNA tӯ 39% - 47% [10] và là mӝt mҫm bӋnh FѫKӝi quan trӑng vӅ nhiӉm khuҭn bӋnh viӋn A baumannii có thӇ tӗn tҥi trên bӅ mһt rҳQYjNK{ÿӃn 5 tháng, khҧ QăQJSKiWWULӇn trong phҥm vi rӝng cӫa nhiӋWÿӝ và pH, có mӭFÿӝ NKiQJFDRÿӕi vӟi kháng sinh và chҩt khӱ khuҭn, có khҧ QăQJWҥo màng sinh hӑc giúp bám dính tӕt trên các thiӃt bӏ y tӃ [5] NhiӉm khuҭn A baumannii WKѭӡng là mҳc phҧi sau khi tiӃp xúc vӟLP{LWUѭӡng y tӃ bӏ ô nhiӉm, hoһc tiӃp xúc trӵc tiӃp vӟi các dӏch vө FKăPVyFVӭc khӓHNK{QJÿҧm bҧo và nhân viên y tӃ ÿmPDQJPҫm bӋnh tӯ WUѭӟc [11] Các nguyên QKkQNKiFOLrQTXDQÿӃn nhiӉm khuҭn lâm sàng cӫa A baumannii là: khҧ QăQJÿӅ kháng tӵ nhiên cao, sӵ ÿLӅu chӍnh bҧn thân kháng lҥi các yӃu tӕ bҩt lӧi tӯ P{LWUѭӡng bên ngoài [12]

Hình 1.1: Hình ̫QK$EDXPDQQLLG˱ͣi kính hi͋n vi (ngu͛n Wikimedia)

ViӋc sӱ dөQJFiFSKѭѫQJSKiSSKkQWӱÿһc biӋt là lai DNA-'1$ÿmÿѭӧc sӱ dөQJÿӇ thiӃt lұp danh tính cӫa ít nhҩt 33 loài khác nhau cӫa Acinetobacter [13] Trong sӕ các loài này, Acinetobacter calcoaceticus (genospecies 1), Acinetobacter baumannii (genospecies 2), Acinetobacter genomic species 3 (genospecies 3) và Acinetobacter genospecies 13TU, chia sҿ ÿһF ÿLӇm kiӇu hình giӕng nhau, khiӃn ch~QJ NKy ÿѭӧc phân biӋt trên lâm sàng Phӭc hӧp Acinetobacter baumannii - calcoaceticus (ABC) dӉ bӏ nhҫm lүn khi nhұn dҥQJJk\NKyNKăQFKRYLӋFÿLӅu trӏ,

YuFiFORjLQj\FyÿһFÿLӇm kiӇu hình gҫQWѭѫQJÿӗQJQKѭQJNKiFQKDXYӅ ÿһc tính sinh hӑc, bӋnh lý A baumannii JHQRVSHFLHVÿҥi diӋQFKRêQJKƭDOkPVjQJQKLӅu nhҩt cӫa phӭc hӧp, trong khi A calcoaceticus (genospecies 1) là mӝt mҫm bӋnh tӯ P{LWUѭӡng hiӃPNKLÿѭӧc xem là nguyên nhân gây ra bӋnh nһng [14]

A baumannii, A pittii và A nosocomialis vүQFzQNKy[iFÿӏnh trong hҫu hӃt các phòng thí nghiӋPFK~QJÿҥi diӋn cho 3 loài Acinetobacter FyOLrQTXDQÿӃn lâm sàng nhiӅu nhҩt [15] Mӝt dҩu hiӋu sinh hӑFÿiQJWLQFұ\ÿӇ [iFÿӏnh A baumannii là gen bla OXA-51 nҵm trên nhiӉm sҳc thӇ và thӇ hiӋn sӵ thӫy phân yӃX ÿӕi vӟi Carbapenem [16]

Trong nhӳQJQăPJҫQÿk\FiFSKѭѫQJSKiSWLӃp cұQOLrQTXDQÿӃn mô hình kiӇu gen, kiӇu hình, khҧ QăQJJk\EӋQKÿmJL~S[iFÿӏQKÿѭӧc các yӃu tӕ ÿӝc lӵc cӫa A baumannii [2] Vӟi khoҧQJQKyPJHQÿѭӧF[iFÿӏQKFyOLrQTXDQÿӃQÿӝc lӵc, chӭng tӓ rҵng A baumannii ÿmGjQKPӝt phҫQÿiQJNӇ gen cӫa mình cho quá trình sinh bӋnh [17] Các nghiên cӭu có hӋ thӕQJÿmNK{QJ[iFÿӏQKÿѭӧc mӝt yӃu tӕ ÿӝc lӵc cө thӇ cӫa A baumannii WUrQOkPVjQJTXDQÿLӇm này làm nәi bұt lên tính thích ӭng mҥnh mӁ cӫa A baumannii ÿӕi vӟLFѫWKӇ vұt chӫ YjWiFQKkQP{LWUѭӡng [18]

Hình 1.2: Minh h͕a các y͇u t͙ quy͇W ÿ͓QK ÿ͡c l͹c cͯa A baumannii: AceI: Acinetobacter chlorhexidine efflux protein; CpaA: glycan-specific adamalysin-like protease; Csu: chaperon/usher pilus system; LPS: lipopolysaccharide; Omp: outer membrane protein; PNAG: poly-ȕ-1,6-N-acetylglucosamine; T2SS: type II secretion system; T6SS: type VI secretion system (ngu͛n Antibiotics 2020, 9, 119)

Các protein màng ngoài cӫa vi khuҭn Gram âm nói chung có vai trò quan trӑQJWURQJWѭѫQJWiFYjWKtFKQJKLYӟLP{LWUѭӡng, là nhӳng nhân tӕ FKtQKJk\ÿӝc lӵc [19] Protein màng ngoài chính OmpA cӫa A baumannii tham gia vào quá trình xâm nhұp tӃ bào và quá trình apoptosis, protein 38 kDa này rҩt quan trӑQJÿӕi vӟi sӵ xâm nhұp cӫa chҩt tan nhӓ, nó liên kӃt vӟi bӅ mһt tӃ bào chӫ, khu trú trong cҧ ty thӇ và nhân, gây chӃt tӃ bào [20]

Mӝt loҥi protein màng ngoài khác cӫa A baumannii là protein Omp 33 - 36 kDa hoҥWÿӝQJQKѭPӝt kênh dүQQѭӟc và biӇu hiӋn cӫDFK~QJOLrQTXDQÿӃn khҧ QăQJ NKiQJ Oҥi Carbapenem [21] Trong mӝt nghiên cӭu cho thҩy các chӫng A baumannii bӏ thiӃu Omp 33 - 36 kDa có tӕFÿӝ phát triӇn kém, giҧm khҧ QăQJEiP dính, xâm nhұSYjJk\ÿӝc cho tӃ EjRĈLӅu này cho thҩy Omp 33 - 36 kDa có vai trò quan trӑQJÿӕi vӟi thӇ trҥQJYjÿӝc lӵc cӫa A baumannii [21]

GiӕQJQKѭ2PS- N'D&DU2FNJQJÿyQJPӝt vai trò trong viӋc kháng Carbapenem ӣ A baumannii Sӵ biӇu hiӋQWăQJOrQFӫa CarO làm chұm sӵ xâm nhұp cӫa bҥch cҫu trung tính ӣ phәi thông qua sӵ suy giҧm các phҧn ӭng tiӅn viêm trong khí quҧn và phәi, cho phép vi khuҭn sinh sôi và dүQÿӃn viêm phәi nһng [22]

Trong các mҫm bӋnh Gram âm ӣ QJѭӡi, polysaccharide cӫa thành tӃ bào (LPS) là mӝt trong nhӳng yӃu tӕ ÿӝc lӵc LPS rҩt quan trӑQJÿӇ kháng huyӃt thanh QJѭӡLEuQKWKѭӡng và mang lҥi lӧi thӃ cҥQKWUDQKÿӇ sӕQJ[yWWURQJFѫWKӇ sӕng, LPS FNJQg có thӇ tҥo ra phҧn ӭng tiӅn viêm ӣ FiFP{ÿӝng vұt [23]

Mӝt yӃu tӕ quyӃWÿӏQKÿӃn cҩu trúc tӃ EjRÿӕi vӟLÿӝc lӵc cӫa A baumannii là sӵ hiӋn diӋn cӫa Capsule bao quanh bӅ mһt vi khuҭQ&iFÿѫQYӏ glucose lһSÿL lһp lҥLÿyQJJyLFKһt chӁ cӫa Capsule tҥo ra mӝt rào cҧn chӕng lҥLFiFÿLӅu kiӋn bҩt lӧi cӫDP{LWUѭӡng, cӫa hӋ thӕng miӉn dӏch và mӝt sӕ chҩt kháng khuҭn [24], [25]

3KRVSKROLSDVHÿѭӧc biӃWÿӃn là các yӃu tӕ ÿӝc lӵc bә sung cӫa A baumannii, ÿk\OjQKӳng enzym thӫy phân quan trӑng và có hoҥt tính phân giҧi mӥ chӕng lҥi các phospholipid cӫa màng tӃ EjR QJѭӡi Trong khi enzym phospholipase D giúp A baumannii tӗn tҥi trong huyӃWWKDQKQJѭӡi, thì mӝt enzym khác là phospholipase C lҥLJk\ÿӝc cho tӃ bào biӇu mô [26]

GҫQÿk\HQ]\P&SD$Pӝt protease giӕQJDGDPDO\VLQÿһc hiӋu vӟi glycan, ÿѭӧF[iFÿӏnh là mӝt yӃu tӕ ÿӝc lӵc có tác dөng ӭc chӃ ÿ{QJPiXWK{QJTXDYLӋc bҩt hoҥt yӃu tӕ ;,,'Rÿy&SaA làm giҧm sӵ hình thành huyӃt khӕi trong các vӏ trí nӝi mҥFKWK~Fÿҭy khҧ QăQJSKә biӃn cӫa A baumannii [27]

Trong sӕ tҩt cҧ các yӃu tӕ quyӃWÿӏQKÿӝc lӵc, sӵ hình thành màng sinh hӑFÿm trӣ thành mӝWÿһFÿLӇm sinh bӋnh chính cӫa A baumannii, làm cho sinh vұt này có khҧ QăQJNKiQJÿDWKXӕc Màng sinh hӑc giúp vi sinh vұt có khҧ QăQJFKӕng lҥi các

WiFQKkQErQQJRjLQKѭFKҩt khӱ khuҭn, thanh thҧi hӋ thӕng miӉn dӏch và kháng sinh [28], màng sinh hӑFFzQOjPWUXQJJLDQFKRFiFWѭѫQJWiFJLӳa mҫm bӋnh và vұt chӫ Màng sinh hӑc cӫa A baumannii FzQÿѭӧFÿһFWUѭQJEӣi sҧn xuҩt các protein liên kӃW%DS$EWѭѫQJWӵ QKѭSURWHLQ%DSFӫa Staphylococcus aureus, và có khҧ QăQJ tұp hӧSÿӇ xây dӵng ma trұn màng sinh hӑc nhҵPÿiSӭng vӟLFiFÿLӅu kiӋn môi WUѭӡQJFăQJWKҷng [29]

Nhi͍m khu̱QOLrQTXDQYjWiFÿ͡ng lâm sàng cͯa A baumannii

A baumanni Fy [X Kѭӟng chӏX ÿѭӧF P{L WUѭӡQJ FăQJ WKҷng và nhiӅu loҥi kháng sinh, khiӃn nó có thӇ tӗn tҥLYjOk\ODQQKѭPӝt mҫm bӋnh bӋnh viӋQÿһc biӋt ӣ nhӳng bӋnh nhân nһng, góp phҫQOjPWăQJWӹ lӋ mҳc bӋnh và tӱ vong [2] Các nghiên cӭXWUѭӟFÿk\ÿӅ cұSÿӃn các yӃu tӕ QJX\FѫQKLӉm A baumannii bao gӗm: thӡi gian nҵm viӋQGjLÿLӅu trӏ kháng sinh không hiӋu quҧ, thӣ máy, sӱ dөng các thiӃt bӏ (ӕng thụng, ӕQJÿһt nӝi khớ quҧQÿһWFDWKHWHUô7URQJQKӳQJQăPJҫQÿk\ nhiӉm A baumannii OLrQTXDQÿӃQÿѭӡng hô hҩp, máu, da, mô mӅPÿѭӡng tiӃt niӋu và hӋ thҫQNLQKWUXQJѭѫQJÿmQәLOrQQKѭPӝt vҩQÿӅ nghiêm trӑQJWURQJFiFFѫVӣ FKăPVyFVӭc khӓe

Nhi͍m khu̱Qÿ˱ͥng hô h̭p

Viêm phәLOLrQTXDQÿӃn thӣ máy (VAP) do A baumannii vүn là nguyên nhân KjQJÿҫu gây ra tӹ lӋ tӱ vong cao ӣ nhӳQJQJѭӡi bӋnh nһng [63], A baumannii chiӃm 8% - 14% VAP ӣ Hoa KǤ Yj&KkXặXQKѭQJWiFQKkQJk\EӋnh này cú tӹ lӋ cao KѫQӣ Châu Á, Châu Mӻ Latinh và mӝt sӕ QѭӟF7UXQJĈ{QJ - 50%) [64] Nghiên cӭu gҫQÿk\FKӍ ra rҵng tӹ lӋ lây nhiӉm A baumannii OjQJѭӡi bӋnh ICU/ngày vӟi tӹ lӋ tӱ vong tӯ 52% - 66% [65] Trong mӝt cuӝc khҧo sát kéo dài bҧ\QăPYӅ A baumannii tҥi Lebanon, vӏ trí nhiӉm khuҭn phә biӃn nhҩWOjÿѭӡng hô hҩp (53,1%), vӃWWKѭѫQJSKүu thuұWPiXQѭӟc tiӇu (10,2%), và FiFQѫLNKiF[66] Trong mӝt phân tích tәng hӧp gҫQÿk\Wҥi 29 quӕc gia, tӹ lӋ nhiӉm A baumannii gây viêm phәi mҳc phҧi ӣ bӋnh viӋn và VAP là gҫn 80%, Trung Mӻ, Mӻ Latinh và Caribe có tӹ lӋ mҳc bӋnh cao nhҩWWURQJNKLĈ{QJÈFyWӹ lӋ này thҩp nhҩt [67] Ngoài ra, trong mӝt phân tích sàng lӑc mүu bӋnh phҭPÿѭӡng hô hҩSGѭӟi cӫDQJѭӡi nhiӉm A baumannii ӣ miӅn Nam ViӋt Nam, 80% mүu bӋnh phҭm kháng vӟi kháng sinh Carbapenem [68]

A baumannii ÿm WUӣ WKjQK QJX\rQ QKkQ KjQJ ÿҫu gây nhiӉm khuҭQ ÿѭӡng

PiXWURQJFiFFѫVӣ FKăPVyFVӭc khӓe, tӹ lӋ tӱ vong do A baumannii gây nhiӉm khuҭQÿѭӡng máu là gҫn 40% [69] Trong mӝt nghiên cӭu gҫQÿk\Wӯ mӝt bӋnh viӋn ӣ Tây Bҳc Ethiopia, A baumannii chiӃm khoҧng 9% các ca nhiӉPWUQJÿѭӡng máu tҥi bӋnh viӋQ Yj ÿӅ kháng vӟi Ampicillin và Piperacillin, 33,3% kháng Meropenem, 44,5% kháng Ciprofloxacin [70]+ѫQQӳa, 42% vi khuҭn A baumannii gây nhiӉm khuҭn máu ӣ QJѭӡi bӋnh ICU tӯ mӝt bӋnh viӋn ӣ Hy LҥS ÿm NKiQJ

&ROLVWLQYjFyOLrQTXDQÿӃn tӹ lӋ tӱ vong cao [71] Nhӳng dӳ liӋXSKRQJSK~QKѭ vұ\OLrQTXDQÿӃn sӵ giDWăQJFӫa A baumannii kháng thuӕc trong các bӋnh nhiӉm khuҭQÿѭӡQJPiXÿһc biӋt ӣ nhӳQJQJѭӡi bӋnh nһQJÿzLKӓi phҧi nhҩn mҥnh vào viӋF JLiP ViW Yj [iF ÿӏQK ÿһF ÿLӇm cӫa các mô hình kháng thuӕF FNJQJ QKѭ WăQJ Fѭӡng các biӋn pháp kiӇm soát nhiӉm khuҭn và kháng sinh thích hӧp

Nhi͍m khu̱Qÿ˱ͥng ti͇t ni u

Mһc dù nghiên cӭu vӅ nhiӉm A baumannii chӫ yӃu tұp trung vào viêm phәi và nhiӉm khuҭn máu, các công bӕ gҫQÿk\FKRWKҩy 1/5 chӫng A baumannii ÿѭӧc phân lұp tӯ các vӏ WUtÿѭӡng tiӃt niӋu [72] Trong mӝt nghiên cӭu vӅ FiFÿһFÿLӇm cӫa A baumannii ÿѭӧc phân lұp tӯ khoa ICU tҥi 10 bӋnh viӋn ӣ Hàn Quӕc, 55,6% các chӫng phân lұSFyOLrQTXDQÿӃn nhiӉm khuҭQÿѭӡng tiӃt niӋu, trong sӕ các chӫng này, 19,8% kháng Imipenem, 25% kháng Meropenem, 13,5% kháng Polymyxin B và 17,7% kháng Colistin [73]

Viêm màng não mӫ do A baumannii vүn là mӕLÿHGӑDQJj\FjQJWăQJӣ các ÿѫQYӏ phүu thuұt thҫQNLQKFKăPVyFWtFKFӵc, vӟi tӹ lӋ tӱ vong lên tӟLÿһc biӋt ӣ nhӳQJQJѭӡi bӋnh có can thiӋp tim mҥch hoһc lӛ rò não tӫ\YjÿѭӧFÿLӅu trӏ kháng sinh sau phүu thuұt Trong mӝt báo cáo tҥi mӝt bӋnh viӋn tӯ Trung Quӕc, tӹ lӋ nhiӉm

A baumannii ӣ nhӳQJQJѭӡi bӋnh bӏ nhiӉm trùng nӝi sӑ sau phүu thuұt thҫn kinh là

33,64%, các phân lұS ÿӅ kháng 100% vӟi Imipenem và Meropenem, 98,38% vӟi Cefazolin, 100% vӟi Ceftazidime, 100% vӟi Cefatriaxone, 98,39% vӟi Cefepime, 60,66% vӟi Tigecycline và 49,18% vӟL$PLNDFLQQKѭQJKRjQWRjQQKҥy cҧm vӟi Polymyxin B [74].

Kháng sinh Carbapenem

S͹ ÿ͉ kháng Carbapenem ͧ Acinetobacter baumannii

Các nghiên cӭXÿѭӧc thӵc hiӋn bӣi National Health Care Safety Network cho thҩy khҧ QăQJNKiQJ&DUEDSHQHPWURQJVӕ 33% các chӫng A baumannii có nguӗn gӕc tӯ các trung tâm y tӃ ӣ Hoa KǤ [75], các báo cáo giám sát vi sinh có tiӃt lӝ tӹ lӋ ÿiQJNӇ cӫa A baumannii ÿDNKiQJFKRUҵng vi khuҭQQj\ÿmWUӣ thành mӝt vҩQÿӅ sӭc khӓe cӝQJÿӗQJQJj\FjQJJLDWăQJ[76] Tӹ lӋ A baumannii kháng Carbapenem ngày càng phә biӃQÿѭӧc coi là mӕLÿHGӑDÿӕi vӟLFKăPVyFVӭc khӓe và sӵ an toàn cӫDQJѭӡi bӋnh trên toàn thӃ giӟi, giҧPÿiQJNӇ khҧ QăQJFKӳa khӓi các bӋnh nhiӉm khuҭn Sӵ lây lan cӫa các chӫng CRAB (Carbapenem resistance A baumannii) dүn ÿӃn mӝt nhu cҫu cҩp thiӃWÿӇ phát hiӋQJLiPViWYjKѭӟng dүn hiӋu quҧ cho phòng chӕng và kiӇm soát nhiӉm khuҭn

Hình 1.5: &˯FK͇ kháng Carbapenem ͧ A baumannii (ngu͛n Pawel Nowak, 2016)

Carbapenem xâm nhұp vào tӃ bào vi khuҭn thông qua mӝt sӕ loҥi porin nhҩt ÿӏnh, biӇu hiӋn giҧm cӫa chúng có vai trò trong viӋFÿӅ kháng vӟi các kháng sinh Qj\3RULQÿһFWUѭQJFӫa A baumannii là Carbapenem-associated OMP (CarO) [4], giҧm sӵ biӇu hiӋn cӫa CarO dүQÿӃn giҧm tính nhҥy cҧm tӟi Imipenem [77] Efflux SXPS(3ÿҭy chҩt kháng khuҭn ra khӓi tӃ bào vi khuҭQÿLӅu này có thӇ dүQÿӃn khҧ QăQJFKӕng lҥi mӝt loҥt các chҩt kháng khuҭn MӝWFѫFKӃ khác chӏu trách nhiӋm vӅ kháng Carbapenem ӣ A baumannii FyOLrQTXDQÿӃn sӵ WKD\ÿәi trong các protein liên kӃt Penicilin, các nghiên cӭXOLrQTXDQÿӃn các chӫng CRAb vӟi nhiӅXFѫFKӃ chӏu trách nhiӋm cho quá trình này, cho thҩy sӵ giҧm biӇu hiӋn cӫa các protein PBP ÿmOjPWăQJWtQKNKiQJ&DUEDSHQHP[52]

Các enzym cӫa vi khuҭn chӏu trách nhiӋm cho sӵ bҩt hoҥt thӫy phân cӫa các nhóm kháng sinh beta-lactam khác nhau, chҷng hҥQQKѭ3HQLFLOOLQ&HSKDORVSRULQ 0RQREDFWDPYj&DUEDSHQHPÿѭӧFÿҥi diӋn bӣi beta-ODFWDPDVH&iFHQ]\PQj\ÿѭӧc phân loҥi theo trình tӵ WѭѫQJÿӗng thành bӕn lӟp phân tӱ: A, B, C, D

Giҧm tính thҩm qua màng

&ѫFKӃ quan trӑng nhҩWOLrQTXDQÿӃn kháng Carbapenem ӣ A baumannii là carbapenemase, carbapenemase có thӇ ÿѭӧc phân tách thành các nhóm: metallo- carbapenemase (lӟp B) và phi metallo-carbapenemase (lӟp A, C và D) [38] Cҧ hai nhóm enzym bao gӗm khҧ QăQJNKiQJ&DUEDSHQHPEҵng cách phá vӥ liên kӃt amide cӫa vòng beta-lactam Thӫy phân beta-lactamase lӟp D (CHDL) là yӃu tӕ phә biӃn nhҩt cӫa kháng Carbapenem ӣ các chӫng A baumannii, FiFHQ]\PQj\ÿѭӧc gӑi là OXA (oxacillinase) do khҧ QăQJ FӫD FK~QJ ÿӇ thӫy phân isoxazolylpenicillin - oxacillin nhiӅXQKDQKKѫQEHQ]\OSHQLFLOOLQ[78]&KRÿӃQQD\ÿm[iFÿӏQKÿѭӧc sáu nhóm Carbapenemases OXA ӣ A bauamnnii ÿѭӧFÿҥi diӋn bӣi: OXA-51, OXA-23, OXA-40/24, OXA-58, OXA-143 và OXA-48 [18]

Hình 1.6: Các cDUEDSHQHPDVH ÿ˱ͫc phát hi n ͧ A baumannii (ngu͛n Pawel Nowak, 2016)

OXA-48 OXA-143 OXA-51 OXA-23 SIM

Các gen mã hóa carbapenemase

Các gen mã hóa carbapenemase trong bӝ gen cӫa A baumannii có thӇ nҵm trên nhiӉm sҳc thӇ hoһFSODVPLGÿѭӧc thӇ hiӋn qua các yӃu tӕ: Insertion sequences (IS), Integron, Resistance island (RI), Plasmid [79]

,QVHUWLRQVTXHQFHV,6ÿѭӧc mô tҧ OjFiFÿRҥQ'1$NK{QJYѭӧt quá kích WKѭӟFESGRÿyÿѭӧF[HPOjFiF'1$GLÿӝng nhӓ nhҩt IS tҥRFѫFKӃ kháng bҵng cách cung cҩp thêm các chҩt xúc tác theo thӭ tӵ ÿӇ khuӃFKÿҥi sӵ biӇu hiӋn cӫa mӝt sӕ gen nhҩWÿӏnh [79],6$EDOj,6ÿѭӧFEiRFiRÿҫu tiên ӣ A baumannii vӟi nhiӅu yӃu tӕ quyӃW ÿӏnh khҧ QăQJ NKiQJ NKiQJ VLQK trong viӋF KX\ ÿӝng các carbapenemase loҥi OXA Vӏ trí cӫD,6$EDQJѭӧc dòng vӟi gen bla OXA-51 có thӇ dүQÿӃn kháng vӟL&DUEDSHQHP,6$EDFNJQJÿmÿѭӧFÿѭӧc tìm thҩy liên kӃt vӟi gen bla OXA-23 và bla OXA-58 [46] Tuy nhiên, biӇu hiӋn quá mӭc cӫa ISAba1 bên cҥnh FiFJHQ&+'/FNJQJFyWKӇ là nguyên nhân dүQÿӃn giҧm nhҥy cҧm vӟi kháng sinh Carbapenem [80]

Trong nhӳng thұp kӹ gҫQÿk\LQWHUJRQÿyQJPӝt vai trò quan trӑng trong viӋc WăQJELӇu hiӋn gen kháng thuӕFNKiQJVLQKÿһc biӋt ӣ vi khuҭn Gram âm [81]+ѫQ QăPOӟSLQWHUJRQÿmÿѭӧc mô tҧ FKRÿӃQQD\WURQJÿyLQWHUJRQOӟp 1 phә biӃn nhҩt trong các chӫng lâm sàng A baumannii trên toàn thӃ giӟi [82] A baumannii chӭa intergon lӟp 1 chӍ có thӇ mang gen mã hóa carbapenemase nhóm metallo-beta- lactamase bao gӗm IMP, VIM, SIM, không mang gen OXA hay KPC [83], trong khi ÿyQKyPJHQbla NDM vүQFKѭDÿѭӧc phát hiӋn trên các chӫng A baumannii mang intergon lӟp 1 [84]

&iF5HVLVWDQFHLVODQG5,ÿѭӧFÿӏQKQJKƭDOjPӝt khu vӵc trong bӝ gen tұp trung cao các chҩt kháng khuҭQÿѭӧc chuyӇn theo chiӅu ngang cӫa gen kháng thuӕc ĈmFyUҩt nhiӅX5,ÿѭӧc mô tҧ trong sӕ các chӫng A baumannii bao gӗm: AbaR1, AbaR3, AbaR4, AbaR5-Aba19, AbaR25 [85] 5, ÿѭӧF EiR FiR ÿҫu tiên ӣ A baumannii là AbaR1 trong chӫQJ$

Ngày đăng: 03/08/2024, 13:02

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN