Luận văn căn nguyên nhiễm khuẩn huyết ở người bệnh điều trị nội trú và mức độ nhạy cảm kháng sinh của một số vi khuẩn gây bệnh tại bệnh viện vinmec times city năm 2019 2021

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO - BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y TẾ CƠNG CỘNG ĐỒN THỊ THÍA CĂN NGUYÊN GÂY NHIỄM KHUẨN HUYẾT Ở NGƯỜI BỆNH ĐIỀU TRỊ NỘI TRÚ VÀ MỨC ĐỘ NHẠY CẢM KHÁNG SINH CỦA MỘT SỐ VI KHUẨN GÂY BỆNH TẠI BỆNH VIỆN VINMEC TIMES CITY NĂM 2019 - 2021 LUẬN VĂN THẠC SĨ KỸ THUẬT XÉT NGHIỆM Y HỌC MÃ SỐ CHUYÊN NGÀNH: 8720601 HÀ NỘI - 2022 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO - BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y TẾ CƠNG CỘNG ĐỒN THỊ THÍA CĂN NGUN NHIỄM KHUẨN HUYẾT Ở NGƯỜI BỆNH ĐIỀU TRỊ NỘI TRÚ VÀ MỨC ĐỘ NHẠY CẢM KHÁNG SINH CỦA MỘT SỐ VI KHUẨN GÂY BỆNH TẠI BỆNH VIỆN VINMEC TIMES CITY NĂM 2019-2021 LUẬN VĂN THẠC SĨ KỸ THUẬT XÉT NGHIỆM Y HỌC MÃ SỐ CHUYÊN NGÀNH: 8720601 NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC PGS.TS ĐOÀN MAI PHƯƠNG HÀ NỘI - 2022 i MỤC LỤC ĐẶT VẤN ĐỀ 11 MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU 13 CHƯƠNG 14 TỔNG QUAN 14 1.1 Giới thiệu nhiễm khuẩn huyết 14 1.1.1 Khái niệm nhiễm khuẩn huyết sốc nhiễm khuẩn 14 1.1.2 Các yếu tố nguy 14 1.1.3 Nguyên nhân 14 1.1.4 Cơ chế bệnh sinh .14 1.1.5 Lâm sàng cận lâm sàng 15 1.1.6 Nguyên tắc điều trị 16 1.1.7 Tình hình nhiễm khuẩn huyết 16 1.2 Xét nghiệm phát nhiễm khuẩn huyết kháng sinh đồ 18 1.2.1 Xét nghiệm phát nhiễm khuẩn huyết .18 1.2.2 Kháng sinh đồ 18 1.3 Tổng quan nguyên nhiễm khuẩn huyết 19 1.3.1 Đặc điểm số vi khuẩn gây nhiễm khuẩn huyết thường gặp .19 1.3.2 Tình hình nguyên nhiễm khuẩn huyết 24 1.4 Sự nhạy cảm kháng sinh 25 1.4.1 Vi khuẩn kháng kháng sinh 25 1.4.2 Tình hình nhạy cảm kháng sinh 30 1.5 Bệnh viện Đa khoa quốc tế Vinmec Times City 32 1.5.1 Giới thiệu bệnh viện 32 1.5.2 Xét nghiệm nuôi cấy định danh bệnh phẩm máu kháng sinh đồ 32 CHƯƠNG 39 ii ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 39 2.1 Đối tượng nghiên cứu 39 2.2 Thời gian thu thập số liệu địa điểm nghiên cứu 39 2.3 Thiết kế nghiên cứu 39 40 2.4 Cỡ mẫu 40 2.5 Phương pháp chọn mẫu 40 2.6 Phương pháp thu thập số liệu 40 2.7 Các biến số nghiên cứu 41 2.8 Bộ công cụ, tiêu chuẩn đánh giá 41 2.9 Phương pháp phân tích số liệu 41 2.10 Đạo đức nghiên cứu 42 CHƯƠNG 43 KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU .43 3.1 Đặc điểm chung người bệnh nhiễm khuẩn huyết 43 3.2 Mô tả nguyên vi khuẩn gây nhiễm khuẩn huyết người bệnh điều trị nội trú Bệnh viện đa khoa quốc tế Vinmec Times City giai đoạn 2019-2021 46 3.2 Mức độ nhạy cảm kháng sinh số chủng vi khuẩn thường gặp gây nhiễm khuẩn huyết 50 CHƯƠNG 56 BÀN LUẬN 56 4.1 Đặc điểm chung người bệnh nhiễm khuẩn huyết 56 4.2 Mô tả nguyên nhiễm khuẩn huyết người bệnh điều trị nội trú bệnh viện đa khoa quốc tế Vinmec Times City giai đoạn 2019-2021 60 4.2 Mức độ nhạy cảm chủng vi khuẩn gây nhiễm khuẩn huyết thường gặp 63 4.2.1 Sự nhạy cảm đề kháng E coli .63 4.2.2 Sự nhạy cảm đề kháng K pneumoniae 65 iii 4.2.3 Sự nhạy cảm đề kháng S aureus 67 4.2.4 Các chủng đa kháng phân lập ICU khoa khác 68 4.3 Hạn chế nghiên cứu 70 KẾT LUẬN 71 KHUYẾN NGHỊ 73 TÀI LIỆU THAM KHẢO 74 PHỤ LỤC 81 PHỤ LỤC 89 PHỤ LỤC 105 PHỤ LỤC 117 PHỤ LỤC 119 iv DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT A baumanii Acinetobacter baumanii AMR Antimicrobial Resistance (Kháng thuốc) CAP College of American Pathologists (Tiêu chuẩn đánh giá chất lượng phòng xét nghiệm Mỹ) CLSI Clinical and laboratory standards institute (Viện chẩn hóa xét nghiệm lâm sàng Hoa Kỳ) DNA Deoxyribonucleic acid E coli Escherichia coli E faecium Enterococcus faecium ESBL Beta-lactamase phổ mở rộng (Extended-spectrum βlactamases) FDA U.S Food and Drug Administration (Cục quản lý Thực phẩm Dược phẩm Hoa Kỳ) I Intermediate (Kháng sinh trung gian) ICU Intensive Care Unit (Khoa điều trị tích cực) K pneumoniae Klebsiella pneumoniae MBC Minimal Bactericidal Concentration (Nồng độ kháng sinh tối thiểu giết chết vi khuẩn) MDR Multidrug resistant (Vi khuẩn đa kháng) MIC Minimal Inhibitory Concentration (Nồng độ kháng sinh tối thiểu ức chế phát triển vi khuẩn) MRSA Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (Tụ cầu vàng kháng methicillin) v MSSA Methicillin-susceptible Staphylococcus aureus (Tụ cầu vàng nhạy cảm methicillin) NKH Nhiễm khuẩn huyết P aeruginosa Pseudomonas aeruginosa (Trực khuẩn mủ xanh) PCR Polymerase Chain Reaction R Resistance (Kháng sinh bị đề kháng) S Sensitivity (Kháng sinh nhạy cảm) S aureus Staphylococcus aureus (Tụ cầu vàng) S pneumoniae Streptococcus pneumoniae (Phế cầu) WHO World Health Organization (Tổ chức Y tế giới) vi DANH MỤC CÁC BẢNG, SƠ ĐỒ BẢNG Bảng 1 Danh sách 14 vi khuẩn đa kháng thuốc ưu tiên (WHO) (44) 28 Bảng Danh mục kháng sinh thử nghiệm với E coli 35 Bảng Danh mục kháng sinh thử nghiệm với K pneumoniae 36 Bảng Danh mục kháng sinh thử nghiệm với S aureus .37 Bảng Phân bố người bệnh nhiễm khuẩn huyết theo tuổi 43 Bảng Biểu lâm sàng thường gặp bệnh nhân nhiễm khuẩn huyết 44 Bảng 3 Các bệnh lý bệnh nhân nhiễm khuẩn huyết 45 Bảng Thời gian lưu viện bệnh nhân nhiễm khuẩn huyết 45 Bảng Các nguyên vi khuẩn gây nhiễm khuẩn huyết 46 Bảng Phân bố số vi khuẩn thường gặp theo khoa phòng 47 Bảng Phân bố vi khuẩn thường gặp theo ổ nhiễm khuẩn tiên phát .48 Bảng Các vi khuẩn gây bệnh sốc nhiễm khuẩn 49 SƠ ĐỒ Sơ đồ 1 Quy trình ni cấy định danh hệ thống tự động bệnh phẩm máu 33 Sơ đồ Sơ đồ nghiên cứu 40 vii DANH MỤC CÁC BIỂU ĐỒ Biểu đồ Phân bố người bệnh nhiễm khuẩn huyết theo giới 44 Biểu đồ Mức độ nhạy cảm đề kháng kháng sinh E coli năm (2019-2021) .50 Biểu đồ 3 Xu hướng E coli kháng kháng sinh từ 2019 - 2021 51 Biểu đồ Mức độ nhạy cảm đề kháng kháng sinh K pneumoniae năm (2019-2021) .52 Biểu đồ Xu hướng K pneumoniae kháng kháng sinh từ 2019 – 2021 .52 Biểu đồ Mức độ nhạy cảm kháng kháng sinh S aureus năm (20192021) 53 Biểu đồ Xu hướng S aureus đề kháng kháng sinh từ 2019 – 2021 54 Biểu đồ Chủng đa kháng khoa ICU vòng năm (2019-2021) 55 Biểu đồ Chủng đa kháng khoa ICU năm (2019-2021) 55 viii DANH MỤC CÁC HÌNH ẢNH Hình 1 Khuẩn lạc E coli thạch UTI thạch máu .19 Hình Khuẩn lạc K pneumoniae thạc máu UTI .20 Hình Khuẩn lạc S aureus thạc máu 22 Hình Các chế vi khuẩn kháng thuốc kháng sinh (42) 27