Khảo sát một số đặc điểm của chủng xạ khuẩn phân lập từ đất có khả năng đối kháng với nấm fusarium oxysporum f sp cubense (foc) và vi khuẩn gây bệnh hại cây trồng

HỌC VIỆN NÔNG NGIỆP VIỆT NAM KHOA CÔNG NGHỆ SINH HỌC - - KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐỀ TÀI: KHẢO SÁT MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM CỦA CHỦNG XẠ KHUẨN PHÂN LẬP TỪ ĐẤT CÓ KHẢ NĂNG ĐỐI KHÁNG VỚI NẤM Fusarium oxysporum f sp cubense (FOC) VÀ VI KHUẨN GÂY BỆNH HẠI CÂY TRỒNG Hà Nội - 2022 HỌC VIỆN NÔNG NGIỆP VIỆT NAM KHOA CÔNG NGHỆ SINH HỌC - - KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP ĐỀ TÀI: KHẢO SÁT MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM CỦA CHỦNG XẠ KHUẨN PHÂN LẬP TỪ ĐẤT CÓ KHẢ NĂNG ĐỐI KHÁNG VỚI NẤM Fusarium oxysporum f sp cubense (FOC) VÀ VI KHUẨN GÂY BỆNH HẠI CÂY TRỒNG Sinh viên thực : Lê Tuyết Mai Mã sinh viên : 637247 Lớp : K63CNSHC Giảng viên hƣớng dẫn : PGS.TS Nguyễn Văn Giang Hà Nội - 2022 LỜI CAM ĐOAN Tơi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu khoa học độc lập riêng Các số liệu sử dụng khóa luận trung thực chƣa đƣợc sử dụng để bảo vệ cơng trình nghiên cứu ngồi nƣớc Khóa luận tốt nghiệp có tham khảo tài liệu, thơng tin trích dẫn đƣợc rõ phần tài liệu tham khảo Mọi giúp đỡ đƣợc cảm ơn Hà Nội, ngày 16 tháng 05 năm 2022 Sinh viên Lê Tuyết Mai i LỜI CẢM ƠN Sau thời gian thực tập Bộ môn Công nghệ Vi sinh, đƣợc quan tâm, giúp đỡ tận tình thầy, giáo, cán phịng thí nghiệm mơn cố gắng nỗ lực thân, tơi hồn thành khóa luận Tơi xin chân thành cảm ơn thầy, giáo ngồi Khoa Cơng nghệ Sinh học truyền đạt cho kiến thức bổ ích, giúp rèn luyện, học tập dƣới mái trƣờng Học viện Nông nghiệp Việt Nam Tôi xin gửi lời cảm ơn sâu sắc lịng kính trọng tới PGS.TS Nguyễn Văn Giang, giảng viên khoa Công nghệ Sinh học định hƣớng đề tài tận tình hƣớng dẫn, giúp đỡ tơi suốt q trình thực khóa luận Tôi xin chân thành cảm ơn ThS Nguyễn Thanh Huyền, ThS Trần Thị Hồng Hạnh, ThS Trần Thị Đào KS Dƣơng Văn Hoàn, KS Nguyễn Thị Thu giúp đỡ tơi suốt q trình thực nghiên cứu Cuối cùng, với tất lịng kính trọng biết ơn vô hạn, xin gửi lời cảm ơn đến bố mẹ, ơng, bà, ngƣời thân tồn thể bạn bè giúp đỡ, động viên tạo động lực cho tơi suốt q trình nghiên cứu Tơi xin chân thành cảm ơn! Hà Nội, ngày 16 tháng 05 năm 2022 Sinh viên Lê Tuyết Mai ii MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i LỜI CẢM ƠN ii MỤC LỤC iii DANH MỤC BẢNG vi DANH MỤC HÌNH vii TÓM TẮT ix DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT xi PHẦN I MỞ ĐẦU 1.1 Đặt vấn đề 1.2 Mục đích nội dung nghiên cứu 1.2.1 Mục đích nghiên cứu 1.2.2 Đối tƣợng nghiên cứu 1.2.3 Nội dung nghiên cứu PHẦN II TỔNG QUAN TÀI LIỆU 2.1.Tổng quan xạ khuẩn 2.1.1 Giới thiệu xạ khuẩn 2.1.2 Đặc điểm sinh lý, sinh hóa xạ khuẩn 2.1.3 Cấu trúc xạ khuẩn 2.1.4 Khả tổng hợp chất kháng sinh 2.2 Ứng dụng xạ khuẩn 2.2.1 Ứng dụng nông nghiệp 2.2.2.Trong công nghiệp 2.2.3.Trong lĩnh vực bảo vệ môi trƣờng 10 2.2.4 Ứng dụng y học 11 2.3 Khả tổng hợp phytohormon tăng trƣởng thực vật 12 2.4 Khả phân giải photphate khó tan 13 2.5 Tổng quan vi sinh vật gây bệnh trồng 15 2.5.1 Tổng quan vi sinh vật gây bệnh 15 iii 2.5.2 Tổng quan Fusarium oxysforum 18 PHẦN III VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 21 3.1 Vật liệu nghiên cứu 21 3.1.1 Thời gian địa điểm nghiên cứu 21 3.1.2 Đối tƣợng nghiên cứu 21 3.1.3 Thiết bị hóa chất 21 3.2 Phƣơng pháp nghiên cứu 22 3.2.1 Phân lập chủng xạ khuẩn từ đất rễ cà phê Tây Nguyên 22 3.2.2 Phƣơng pháp đáng giá khả đối kháng nấm 23 3.2.3 Khảo sát khả kháng khuẩn chủng xạ khuẩn 23 3.2.4 Phƣơng pháp khảo sát khả tổng hợp IAA 24 3.2.5 Khảo sát khả phân giải phosphate khó tan số chủng 25 xạ khuẩn 25 3.2.6 Khảo sát khả sinh siderophore số chủng xạ khuẩn 26 3.2.7 Khảo sát ảnh hƣởng nồng độ muối đến khả sinh trƣởng số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 27 3.2.8 Khảo sát khả sinh enzyme ngoại bào số chủng xạ khuẩn 27 3.2.9 Khảo sát ảnh hƣởng số điều kiện nuôi cấy đến khả sinh tổng hợp IAA chủng xạ khuẩn tuyển chọn 28 3.2.10 Định danh chủng xạ khuẩnđƣợc tuyển chọn phƣơng pháp xác định trình tự nucleotide 16S rRNA 30 PHẦN IV: KẾT QUẢ 32 4.1 Phân lập xạ khuẩn 32 4.2 Khảo sát khả kháng nấm số chủng xạ khuẩn 34 4.3 Khảo sát khả kháng khuẩn số chủng xạ khuẩn phân lập từ đất trồng cà phê với chủng vi khuẩn gây bệnh mít 37 4.4 Khả sinh tổng hợp IAA chủng xạ khuẩn 39 4.5 Khảo sát khả phân giải phosphate khó tan số chủng xạ khuẩn 42 4.6 Khảo sát khả sinh tổng hợp siderophore số chủng xạ khuẩn 44 iv 4.7 Khảo sát ảnh hƣởng số điều kiện nuôi cấy đến khả sinh IAA số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 47 4.7.1 Ảnh hƣởng pH đến khả sinh tổng hợp IAA số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 47 4.7.2 Ảnh hƣởng thời gian nuôi cấy đến khả sinh tổng hợp IAA số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 48 4.7.3 Ảnh hƣởng nồng độ L-tryptophan đến khả sinh tổng hợp IAA số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 49 4.7.4 Ảnh hƣởng nguồn Cacbon đến khả sinh tổng hợp IAA số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 51 4.7.5 Ảnh hƣởng nguồn Nitrogen đến khả sinh tổng hợp IAA số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 52 4.7.6 Ảnh hƣởng nồng độ muối đến khả sinh trƣởng số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 53 4.7.7 Khả sinh enzyme ngoại bào 55 4.8 Đặc điểm sinh học 59 4.8.1 Đặc điểm hình thái 59 4.8.2 Khả biến dƣỡng citrate số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 61 4.9 Định danh số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 62 4.9.1 Khuếch đại trình tự DNA phản ứng PCR 62 4.9.2 Định danh phân tích phƣơng pháp giải trình tự đoạn gen 63 16S rRNA 63 PHẦN V KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 66 5.1 Kết luận 66 5.2 Kiến nghị 66 TÀI LIỆU THAM KHẢO 67 PHỤ LỤC 77 v DANH MỤC BẢNG Bảng 4.1 Các chủng xạ khuẩn phân lập từ đất trồng cà phê 32 Bảng 4.2 Phân bố xạ khuẩn theo nhóm màu 33 Bảng 4.3 Khả đối kháng nấm Fusarium oxysporum f sp cubense chủng xạ khuẩn phân lập 34 Bảng 4.4 Hoạt tính kháng khuẩn số chủng xạ khuẩn với chủng vi khuẩn gây bệnh mít 38 Bảng 4.5 Khả phân giải phosphate khó tan số chủng xạ khuẩn 43 Bảng 4.6 Khả sinh siderophore số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 45 Bảng 4.7 Đặc điểm hình thái số chủng xạ khuẩn môi trƣờng khác 60 vi DANH MỤC HÌNH Hình 4.1 Hình thái khuẩn lạc số chủng xạ khuẩn phân lập 32 Hình 4.3 Hoạt tính đối kháng chủng HY1.2 với chủng nấm Fusarium oxysporum f sp cubense 36 Hình 4.4 Hoạt tính đối kháng chủng TN 72M với chủng nấm Fusarium oxysporum f sp cubense 36 Hình 4.5 Hoạt tính kháng khuẩn số chủng xạ khuẩn với chủng vi khuẩn gây bệnh mít 38 Hình 4.2 Đƣờng chuẩn thể mối tƣơng quan giữ số OD530 nồng độ IAA 40 Hình 4.6 Hàm lƣợng IAA sinh tổng hợp từ chủng xạ khuẩn 41 Hình 4.7 Khả phân giải phosphate số chủng xạ khuẩn 43 Hình 4.8 Khả sinh tổng hợp siderophore số chủng xạ khuẩn 45 Hình 4.9 Ảnh hƣởng pH đến khả sinh tổng hợp IAA số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 48 Hình 4.10 Ảnh hƣởng thời gian ni cấy đến khả sinh tổng hợp IAA số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 49 Hình 4.11 Ảnh hƣởng nồng độ L-tryptophan đến khả sinh tổng hợp IAA số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 50 Hình 4.12 Ảnh hƣởng nguồn Cacbon đến khả sinh tổng hợp IAA số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 52 Hình 4.13 Ảnh hƣởng nguồn Nitrogen đến khả sinh tổng hợp IAA số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 53 Hình 4.14 Ảnh hƣởng nồng độ muối đến khả sinh trƣởng chủng HY1.2 54 Hình 4.15 Ảnh hƣởng nồng độ muối đến khả sinh trƣởng chủng TN 72M 54 vii Hình 4.16 Hoạt tính sinh enzyme protase số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 56 Hình 4.17 Hoạt tính sinh enzyme cellulase số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 57 Hình 4.18 Hoạt tính sinh enzyme xylanase số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 57 Hình 4.19 Hoạt tính sinh enzyme pectinase số chủng xạ khuẩn tuyển chọn 58 Hình 4.20 Khả biến dƣỡng citrate số chủng xạ khuẩn 61 Hình 4.21 Sản phẩm PCR đoạn gen 16S rRNA ba chủng xạ khuẩn HY 1.2, TN 72M TN 1.11.2 62 Hình 4.22 Cây phân loại dựa trình tự 16S rRAN chủng xạ khuẩn HY 1.2 63 Hình 4.23 Cây phân loại dựa trình tự 16S rRAN chủng xạ khuẩn TN 1.11.2 64 Hình 4.24 Cây phân loại dựa trình tự 16S rRAN chủng xạ khuẩn TN 72M 64 viii 31 Das S., Ward L R., Burke C J A m & biotechnology (2008b) Prospects of using marine actinobacteria as probiotics in aquaculture 81(3): 419-429 32 Datta C & Basu P (2000) Indole acetic acid production by a Rhizobium species from root nodules of a leguminous shrub, Cajanus cajan Microbiological research 155(2): 123-127 33 Dastager S G., Li W J., Dayanand A., Tang S K., Tian X P., Zhi X Y., , Jiang C L (2006) Seperation, identification and analysis of pigment (melanin) production in Streptomyces African journal of biotechnology, 5(11) 34 Dong-sheng Wang, Quan-hong Xue, Yun-yan Ma, Xiao-li Wei, Jie Chen and FeiHe (2014) Oligotrophy is Helpful for the Isolation of Bioactive Actinomycetes Indian J Microbiol 35 Di, X., Takken, F L., & Tintor, N (2016) How phytohormones shape interactions between plants and the soil-borne fungus Fusarium oxysporum Frontiers in plant science, 7, 170 36 Da Silva, I R., Martins, M K., Carvalho, C M., De Azevedo, J L., & de Lima Procópio, R E (2012) The effect of varying culture conditions on the production of antibiotics by Streptomyces spp Isolated from the Amazonian Soil Ferment Technol, 1(3) 37 Djebaili, R., Pellegrini, M., Smati, M., Del Gallo, M., & Kitouni, M (2020) Actinomycete strains isolated from saline soils: plant-growth-promoting traits and inoculation effects on Solanum lycopersicum Sustainability, 12(11), 4617 38 Egamberdieva D., Wirth S., Bellingrath-Kimura S D., Mishra J & Arora N K J F i m (2019) Salt-tolerant plant growth promoting rhizobacteria for enhancing crop productivity of saline soils 10: 2791 39 Embley T & Stackebrandt E J A r o m (1994) The molecular phylogeny and systematics of the actinomycetes 48(1): 257-289 40 Egamberdieva, D., Wirth, S., Bellingrath-Kimura, S D., Mishra, J., & Arora, N K (2019) Salt-tolerant plant growth promoting rhizobacteria for enhancing crop productivity of saline soils Frontiers in microbiology, 2791 41 Fang H., Cai L., Yang Y., Ju F., Li X., Yu Y & Zhang T J S o t t e (2014) Metagenomic analysis reveals potential biodegradation pathways of persistent pesticides in freshwater and marine sediments 470: 983-992 42 Flärdh K., Buttner M J (2009) Streptomyces morphogenetics dissecting differentiation in a filamentous bacterium Nature Reviews Microbiology, 7(1), pp 36-49 43 Fatahi-Bafghi M J E J o C M & Diseases I (2019) Antibiotic resistance genes in the Actinobacteria phylum 38(9): 1599-1624 44 Feling R H., Buchanan G O., Mincer T J., Kauffman C A., Jensen P R & Fenical W J A C I E (2003) Salinosporamide A: a highly cytotoxic proteasome inhibitor from a novel microbial source, a marine bacterium of the new genus Salinospora 42(3): 355-357 45 Forbes B A., Sahm D F & Weissfeld A S (2007) Diagnostic microbiology Mosby St Louis pages pages 70 46 Freel K C., Edlund A & Jensen P R J E m (2012) Microdiversity and evidence for high dispersal rates in the marine actinomycete ‘Salinispora pacifica’ 14(2): 480493 47 Fuentes M., Benimeli C., Cuozzo S., Amoroso M J I B & Biodegradation (2010) Isolation of pesticide-degrading actinomycetes from a contaminated site: bacterial growth, removal and dechlorination of organochlorine pesticides 64(6): 434-441 48 FATMAWATI, U., MERYANDINI, A., NAWANGSIH, A A., & Wahyudi, A T (2019) Screening and characterization of actinomycetes isolated from soybean rhizosphere for promoting plant growth Biodiversitas Journal of Biological Diversity, 20(10) 49 Gayathri P & Muralikrishnan V J I J C M A S (2013) Isolation and characterization of endophytic actinomycetes from mangrove plant for antimicrobial activity 2(11): 78-89 50 George M., Anjumol A., George G & Hatha A M (2012) Distribution and bioactive potential of soil actinomycetes from different ecological habitats African Journal of Microbiology Research 6(10): 2265-2271 51 Glauert A M & Hopwood D A J T J o C B (1961) The fine structure of Streptomyces violaceoruber (S coelicolor) III The walls of the mycelium and spores 10(4): 505-516 52 Gopalakrishnan S, Pande S, Sharma M, Humayun P, Kiran BK, Sandeep D 2011 Evaluation of actinomycete isolates obtained from herbal vermicompost for biological control of Fusariumwilt of chickpea 53 Goodfellow M & Simpson K (1987) Ecology of streptomycetes Front Appl Microbiol 2: 97-125 54 Gupta G., Parihar S S., Ahirwar N K., Snehi S K & Singh V J J M B T (2015) Plant growth promoting rhizobacteria (PGPR): current and future prospects for development of sustainable agriculture 7(2): 096-102 55 Hamdali H., Hafidi M., Virolle M J & Ouhdouch Y J A s e (2008) Growth promotion and protection against damping-off of wheat by two rock phosphate solubilizing actinomycetes in a P-deficient soil under greenhouse conditions 40(3): 510-517 56 Hodgson D A (2000) Primary metabolism and its control in streptomycetes: a most unusual group of bacteria 57 Hozzein W N., Li W J., Ali M I A., Hammouda O., Mousa A S., Xu L H., Jiang C L (2004) Nocardiopsis alkaliphila sp nov., a novel alkaliphilic actinomycete isolated from desert soil in Egypt International journal of systematic and evolutionary microbiology, 54(1), pp 247-252 58 Hong T.-Y., Cheng C.-W., Huang J.-W & Meng M J M (2002) Isolation and biochemical characterization of an endo-1, 3-β-glucanase from Streptomyces sioyaensis containing a C-terminal family carbohydrate-binding module that binds to 1, 3-β-glucanThe GenBank accession number for the sequence reported in this paper is AF21741 148(4): 1151-1159 71 59 Ilic S., Konstantinovic S., Todorovic Z., Lazic M., Veljkovic V., Jokovic N & Radovanovic B J M (2007) Characterization and antimicrobial activity of the bioactive metabolites in streptomycete isolates 76(4): 421-428 60 Jiang C.-L & Xu L.-H (1996) Diversity of aquatic actinomycetes in lakes of the middle plateau, Yunnan, China Applied and environmental microbiology 62(1): 249253 61 Jog R., Pandya M., Nareshkumar G & Rajkumar S J M (2014) Mechanism of phosphate solubilization and antifungal activity of Streptomyces spp isolated from wheat roots and rhizosphere and their application in improving plant growth 160(4): 778-788 62 Jin, L., Zhao, Y., Song, W., Duan, L., Jiang, S., Wang, X., & Xiang, W (2019) Streptomyces inhibens sp nov., a novel actinomycete isolated from rhizosphere soil of wheat (Triticum aestivum L.) International journal of systematic and evolutionary microbiology, 69(3), 688-695 63 Jensen, JB, Egsgaard, H., Van Onckelen, HARRY, & Jochimsen, BU (1995) Catabolism of indole-3-acetic acid and 4- and 5-chloroindole-3-acetic acid in Bradyrhizobium japonicum Journal of Microbiology, 177 (20), 5762-5766 64 Junwei Zhao, Liyuan Han, Mingying Yu, Peng Cao, Dongmei Li, Xiaowei Guo, Yongqiang Liu, Xiangjing Wang and Wensheng Xiang (2019) Characterization of Streptomyces sporangiiformans sp nov., a Novel Soil Actinomycete with Antibacterial Activity against Ralstonia solanacearum pp 1-17 65 Kuster E (1968) Taxonomy of soil actinomycetes and related organisms Ecology of soil bacteria Liverpool University press, Liverpool 322-336 66 Keser S., M.B Mutlu and K Güven (2009) Antimicrobial Effect of Halophilic Actinomycetes on Xanthomonas and Pseudomonas Tomato Disease Agents pp.401404 67 khamna, S., Yokota, A., Peberdy, JF, Lumyong, S 2010 Production of indole-3-acetic acid 68 Khamna, S., Yokota, A., Peberdy, J F., & Lumyong, S (2010) Indole-3-acetic acid production by Streptomyces sp isolated from some Thai medicinal plant rhizosphere soils EurAsian Journal of 69 Kar A (2008) Pharmaceutical microbiology New Age International 70 Lam K S J C o i m (2006) Discovery of novel metabolites from marine actinomycetes 9(3): 245-251 71 Louden, B C., Haarmann, D., & Lynne, A M (2011) Use of blue agar CAS assay for siderophore detection Journal of microbiology & biology education, 12(1), 51-53 72 Lucas, X., Senger, C., Erxleben, A., Grüning, B A., Döring, K., Mosch, J., & Günther, S (2012) StreptomeDB: a resource for natural compounds isolated from Streptomyces species Nucleic acids research, 41(D1), D1130-D1136 73 Mast Y & Stegmann E 2019 Actinomycetes: The antibiotics producers Multidisciplinary Digital Publishing Institute 72 74 Matsukawa E., Nakagawa Y., Iimura Y & Hayakawa M (2007) Stimulatory effect of indole-3-acetic acid on aerial mycelium formation and antibiotic production in Streptomyces spp Actinomycetologica 21(1): 32-39 75 Merckx R., Dijkstra A., Den Hartog A & Van Veen J (1987) Production of rootderived material and associated microbial growth in soil at different nutrient levels Biology and Fertility of Soils 5(2): 126-132 76 Mia M B., Shamsuddin Z & Mahmood M J I J A B (2010) Use of plant growth promoting bacteria in banana: a new insight for sustainable banana production 12(3): 459-467 77 Mohite B J J o s s & nutrition p (2013) Isolation and characterization of indole acetic acid (IAA) producing bacteria from rhizospheric soil and its effect on plant growth 13(3): 638-649 78 Mor R & Sivan A J B (2008) Biofilm formation and partial biodegradation of polystyrene by the actinomycete Rhodococcus ruber 19(6): 851-858 79 Mounyr Balouiri, Moulay Sadiki and Saad Koraichi Ibnsouda (2015) Methods for in vitro evaluating antimicrobial activity: A review 80 Mustafa Oskay, A Üsame Tamer and Cem Azeri (2004) Antibacterial activity of some actinomycetes isolated from farming soils of Turkey African Journal of Biotechnology Vol (9) pp 441-446 81 Naveena B., Annalakshmi G & Partha N J B t (2013) An efficacious degradation of pesticide by salt tolerant Streptomyces venezuelae ACT 132: 378-382 82 Nandimath, A P., Karad, D D., Gupta, S G., & Kharat, A S (2017) Consortium inoculum of five thermo-tolerant phosphate solubilizing Actinomycetes for multipurpose biofertilizer preparation Iranian journal of microbiology, 9(5), 295 83 Nithyanand P., Thenmozhi R., Rathna J & Pandian S K J C m (2010) Inhibition of Streptococcus pyogenes biofilm formation by coral-associated actinomycetes 60(6): 454-460 84 Narayana, K J., Peddikotla, P., Krishna, P S J., Yenamandra, V., & Muvva, V (2009) Indole-3-acetic acid production by Streptomyces albidoflavus J Biol Res, 11, 49-55 85 Olanrewaju O S., Babalola O O J A m & biotechnology (2019) Streptomyces: implications and interactions in plant growth promotion 103(3): 1179-1188 86 Olanrewaju O S., Glick B R., Babalola O O J W J o M & Biotechnology (2017) Mechanisms of action of plant growth promoting bacteria 33(11): 1-16 87 Park J.-H., Lee J.-H., Kim C.-J., Lee J.-C., Cho M H & Lee J J B l (2012) Extracellular protease in Actinomycetes culture supernatants inhibits and detaches Staphylococcus aureus biofilm formation 34(4): 655-661 88 Patten C L & Glick B R (2002) Role of Pseudomonas putida indoleacetic acid in development of the host plant root system Applied and environmental microbiology 68(8): 3795-3801 73 89 Pasti M B., Pometto A., Nuti M P., Crawford D L (1990) Lignin-solubilizing ability of actinomycetes isolated from termite (Termitidae) gutt Appl Environ Microbiol, pp 2213-2218 90 Poovarasan S., Mohandas S., Paneerselvam P., Saritha B & Ajay K J C P (2013) Mycorrhizae colonizing actinomycetes promote plant growth and control bacterial blight disease of pomegranate (Punica granatum L cv Bhagwa) 53: 175-181 91 Poomthongdee, N., Duangmal, K., & Pathom-aree, W (2015) Acidophilic actinomycetes from rhizosphere soil: diversity and properties beneficial to plants The Journal of antibiotics, 68(2), 106-114 92 Qi, D F., Zou, L., Zhou, D., Zhang, M., Wei, Y., Zhang, L., & Wang, W (2021) Identification and Antifungal Mechanism of a Novel Actinobacterium Streptomyces huiliensis sp nov against Fusarium oxysporum f sp cubense Tropical Race of Banana Frontiers in microbiology, 3399 93 Ramesh S., Mathivanan N J W J o M & Biotechnology (2009) Screening of marine actinomycetes isolated from the Bay of Bengal, India for antimicrobial activity and industrial enzymes 25(12): 2103-2111 94 Santana E., Marques E., Dias J J G & Research M (2016) Effects of phosphatesolubilizing bacteria, native microorganisms, and rock dust on Jatropha curcas L growth 15(4): 15048729 95 Satyaprakash M., Nikitha T., Reddi E., Sadhana B., Vani S S J I J o C M & Sciences A (2017) Phosphorous and phosphate solubilising bacteria and their role in plant nutrition 6(4): 2133-2144 96 Savci S J I J o E S & Development (2012) An agricultural pollutant: chemical fertilizer 3(1): 73 97 Savci, S (2012) An agricultural pollutant: chemical fertilizer International Journal of Environmental Science and Development, 3(1), 73 98 Sharma M., Dangi P & Choudhary M J I J C M A S (2014) Actinomycetes: source, identification, and their applications 3(2): 801-832 99 Sharma P., Dutta J & Thakur D (2018) Future Prospects of Actinobacteria in Health and Industry In: New and Future Developments in Microbial Biotechnology and Bioengineering Elsevier: 305-324 pages 100 Sharma S B., Sayyed R Z., Trivedi M H & Gobi T A J S (2013) Phosphate solubilizing microbes: sustainable approach for managing phosphorus deficiency in agricultural soils 2(1): 1-14 101 Shilev S (2013) Soil rhizobacteria regulating the uptake of nutrients and undesirable elements by plants In: Plant microbe symbiosis: fundamentals and advances Springer: 147-167 pages 102 Sreevidya, M., Gopalakrishnan, S., Kudapa, H., and Varshney, R K (2016) Exploring plant growth-promotion actinomycetes from vermicompost and rhizosphere soil for yield enhancement in chickpea Braz J Microbiol 103 Sharma, M., Dangi, P., & Choudhary, M (2014) Actinomycetes: source, 74 identification, and their applications International Microbiology and Applied Sciences, 3(2), 801-832 Journal of Current 104 Saif, S., Khan, M S., Zaidi, A., & Ahmad, E (2014) Role of phosphatesolubilizing actinomycetes in plant growth promotion: current perspective In phosphate solubilizing microorganisms (pp 137-156) Springer, Cham 105 Sajnaga, Ewa, and Waldemar Kazimierczak "Evolution and taxonomy of nematode-associated entomopathogenic bacteria of the genera Xenorhabdus and Photorhabdus: an overview." Symbiosis 80.1 (2020): 1-13 106 Shirokikh, I G., & Shirokikh, A A (2017) Biosynthetic potential of actinomycetes in brown 107 Šuput, J., Lechevalier, MP, & Lechevalier, HA (1967) Chemical composition of aerobic actinomycetes variants Applied Microbiology, 15 (6), 1356-1361 (2019) Screening and characterization of actinomycetes isolated from soybearhizosphere for promoting plant growth Biodiversitas Journal of Biologicalforest soil on the eastern coast of the Aegean Sea Eurasian soil science, 50(11), 1311-1317 108 Parfenova V & Kostornova T Y (2002) The biodiversity of actinomycetes in Lake Baikal Microbiology 71(3): 346-349 109 Tseng M., Hoang K.-C., Yang M.-K., Yang S.-F & Chu W S J B (2007) Polyester-degrading thermophilic actinomycetes isolated from different environment in Taiwan 18(5): 579 110 Tresner H D and Backus E J (1963) System of Color Wheels for Streptomycete Taxonomy pp 335-338 111 van der Heul H U., Bilyk B L., McDowall K J., Seipke R F & van Wezel G P J N p r (2018) Regulation of antibiotic production in Actinobacteria: new perspectives from the post-genomic era 35(6): 575-604 112 Wahyudi A T., Priyanto J A., Afrista R., Kurniati D., Astuti R I & Akhdiya A J O J B S (2019) Plant growth promoting activity of actinomycetes isolated from soybean rhizosphere 19: 1-8 113 Waksman S A & Henrici A T (1943) The nomenclature and classification of the actinomycetes Journal of bacteriology 46(4): 337-341 114 Walker J & Colwell R (1975) Factors affecting enumeration and isolation of actinomycetes from Chesapeake Bay and Southeastern Atlantic Ocean sediments Marine Biology 30(3): 193-201 115 Warrad M., Hassan Y M., Mohamed M S., Hagagy N., Al-Maghrabi O A., Selim S., Saleh A M & AbdElgawad H (2020) A bioactive fraction from Streptomyces sp enhances maize tolerance against drought stress 116 Watve M G., Tickoo R., Jog M M & Bhole B D (2001a) How many antibiotics are produced by the genus Streptomyces? Archives of microbiology 176(5): 386-390 117 Watve M G., Tickoo R., Jog M M & Bhole B D J A o m (2001b) How many antibiotics are produced by the genus Streptomyces? 176(5): 386-390 75 118 Witt D & Stackebrandt E (1990) Unification of the genera Streptoverticillum and Streptomyces, and amendation of Streptomyces Waksman and Henrici 1943, 339AL Systematic and applied microbiology 13(4): 361-371 119 Wu Z., Xie L., Xia G., Zhang J., Nie Y., Hu J., Wang S & Zhang R J T (2005) A new tetrodotoxin-producing actinomycete, Nocardiopsis dassonvillei, isolated from the ovaries of puffer fish Fugu rubripes 45(7): 851-859 120 Wilkinson, K G., Sivasithamparam, K., Dixon, K W., Fahy, P C., & Bradley, J K (1994) Identification and characterisation of bacteria associated with Western Australian orchids Soil Biology and Biochemistry, 26(1), 137-142 121 You J., Xue X., Cao L., Lu X., Wang J., Zhang L., Zhou S J A m & biotechnology (2007) Inhibition of Vibrio biofilm formation by a marine actinomycete strain A66 76(5): 1137-1144 122 Yadav, J., Verma, J P., & Tiwari, K N (2010) Effect of plant growth promoting rhizobacteria on seed germination and plant growth chickpea (Cicer arietinum L.) under in vitro conditions In Biological Forum (Vol 2, No 2, pp 15-18) 123 Zanetti F., Zegada-Lizarazu W., Lambertini C., Monti A J B & Bioenergy (2019) Salinity effects on germination, seedlings and full-grown plants of upland and lowland switchgrass cultivars 120: 273-280 124 Zenova G., Manucharova N & Zvyagintsev D J E s s (2011) Extremophilic and extremotolerant actinomycetes in different soil types 44(4): 417-436 76 PHỤ LỤC Phụ lục Ảnh hƣởng nồng độ muối đến sinh trƣởng số chủng xạ khuẩn Chủng xạ khuẩn HY 1.2 NaCl 1% NaCl 3% NaCl 5% MS 1.5.1 TN 331 TN 1.11.2 TN 72M TN 332 77 NaCl 7% NaCl 9% Phụ lục 2: Khả tổng hợp enzyme ngoại bào số chủng xạ khuẩn Enzyme Xylase Celullose Protase Chủng HY1.2 TN 1.11.2 MS 1.5.1 TN 331 TN 332 TN 72M HY1.2 TN 1.11.2 MS 1.5.1 TN 331 TN 332 TN 72M TN 72M HY1.2 TN 1.11.2 MS 1.5.1 TN 331 TN 332 D (mm) 16 21 20 21 16 22 15 16 17 30 16 31 16 22 10 17 11 10 d (mm) 5 5 5 5 5 5 5 5 5 Đƣờng kính phân gải (cm) 11 16 15 16 11 17 10 11 12 25 11 26 11 17 12 Phụ lục 3: Khả tổng hợp IAA chủng xạ khuẩn phân lập đƣợc 78 Phụ lục 4: Ảnh hƣởng pH khả sinh IAA chủng xạ khuẩn tuyển chọn HY 1.2 TN 1.11.2 TN 332 TN 331 TN 72M MS 1.5.1 79 Phụ lục 5: Ảnh hƣởng L-tryptophan khả sinh IAA chủng xạ khuẩn tuyển chọn Chủng TN 1.11.2 Chủng TN 72M Chủng TN 332 Chủng TN 331 Chủng HY 1.2 Chủng MS 151 80 Phụ lục 6: Ảnh hƣởng nguồn cacbon đến khả sinh IAA chủng xạ khuẩn Chủng TN 72M Chủng TN 331 Chủng HY 1.2 Chủng TN 1.11.2 MS 1.5.1 TN 332 81 Phụ lục 7: Ảnh hƣởng nguồn nito đến khả sinh IAA số chủng xạ khuẩn tuyển chọn TN 72M TN 1.11.2 MS 1.5.1 TN 331 TN 331 TN 332 82 Phụ lục Hoạt tính đối kháng số chủng xạ khuẩn với chủng nấm Fusarium oxysporum f sp cubense (Foc) TN 7.5.2 TN 1.2 TN 9.3 TN 3.2.2 81 TN 752 TN 332 TN 1.2.1 TN 741 82