1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng

83 639 3

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang 83
Dung lượng 1,53 MB

Nội dung

BỘ Y TẾ BÁO CÁO KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU ĐỀ TÀI CẤP BỘ NGHIÊN CỨU PHÁT HIỆN BIẾN ĐỔI GEN TRONG UNG THƯ ĐẠI TRỰC TRÀNG CHỦ NHIỆM ĐỀ TÀI CƠ QUAN CHỦ TRÌ ĐỀ TÀI PGS.TS Nguyễn Nghiêm Luật 9209 Năm 2012 Trang bìa BỘ Y TẾ BÁO CÁO KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU ĐỀ TÀI CẤP BỘ Tên đề tài: “NGHIÊN CỨU PHÁT HIỆN BIẾN ĐỔI GEN TRONG UNG THƯ ĐẠI TRỰC TRÀNG” Chủ nhiệm đề tài: PGS TS Nguyễn Nghiêm Luật Cơ quan chủ trì đề tài: Trường Đại học Y Hà Nội Cấp quản lý: Bộ Y tế Mã số đề tài (nếu có): Thời gian thực hiện: từ tháng 10 năm 2006 đến tháng 10 năm 2009 Tổng kinh phí thực đề tài 340 Trong đó: kinh phí SNKH Nguồn khác (nếu có) triệu đồng 340 triệu đồng triệu đồng Năm 2012 Trang bìa Báo cáo kết nghiên cứu đề tài cấp Bộ Tên đề tài: “Nghiên cứu phát biến đổi gen ung thư đại trực tràng” Chủ nhiệm đề tài: PGS TS Nguyễn Nghiêm Luật Cơ quan chủ trì đề tài: Trường Đại học Y Hà Nội Cơ quan quản lý đề tài: Bộ Y tế Thư ký đề tài: CN Nguyễn Thúy Hà Phó chủ nhiệm đề tài ban chủ nhiệm đề tài (nếu có): Danh sách người thực chính: - PGS TS Nguyễn Nghiêm Luật - ThS Nguyễn Phương Anh - TS Trần Vân Khánh - CN Nguyễn Thúy Hà Các đề tài nhánh (đề mục) đề tài (nếu có) (a) Đề tài nhánh (đề mục 1) - Tên đề tài nhánh: - Chủ nhiệm đề tài nhánh: (b) Đề tài nhánh - Tên đề tài nhánh - Chủ nhiệm đề tài nhánh Thời gian thực đề tài từ tháng 10 năm 2006 đến tháng 10 năm 2009 Phụ lục BẢN TỰ ĐÁNH GIÁ Về tình hình thực đóng góp đề tài kh&cn cấp Tên đề tài: “Nghiên cứu phát biến đổi gen ung thư đại trực tràng” Thuộc Chương trình (nếu có): Chủ nhiệm đề tài: PGS TS Nguyễn Nghiêm Luật Cơ quan chủ trì đề tài: Trường Đại học Y Hà Nội Thời gian thực (BĐ-KT): 10-2006-10-2009 Tổng kinh phí thực Đề tài: 340 triệu VND Trong đó, kinh phí từ NSNN: 340 triệu VND Tình hình thực đề tài so với đề cương: 7.1/ Về mức độ hồn thành khối lượng cơng việc: hồn thành khối lượng công việc giao thể ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình (family adenomatous polyposis: FAP); riêng phần ung thư đại trực tràng thể không polyp di truyền (heritary non-polyposis colorectal cancer: HNPCC) khơng thực khơng tìm bệnh nhân 7.2/ Về yêu cầu khoa học tiêu sản phẩm KHCN: bảo đảm yêu cầu khoa học tiêu sản phẩm KHCN 7.3/ Về tiến độ thực hiện: chậm năm so với dự kiến Về đóng góp đề tài: Đây lần Việt Nam, đột biến exon 15 gen APC bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình (FAP), bệnh nhân FAP, người thân chưa bị FAP lặp lại đột biến người thân gia đình bệnh nhân xác định Các phát khoa học chủ yếu là: Nghiên cứu đột biến dòng mầm exon 15 gen APC 22 bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình (FAP), 25 người thân 15 gia đình bệnh nhân 15 người khỏe mạnh kỹ thuật giải trình tự trực tiếp DNA, rút kết luận sau: Ở bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình: - Đã phát đột biến gen APC 19/22 (86,36%) bệnh nhân ung thư ĐTT thể FAP - Các đột biến dịch khung (cài xóa từ đến nucleotid) loại đột biến phổ biến nhất, chiếm 86%, lại đột biến thay (1 nucleotid) Các đột biến dịch khung thay nucleotid dẫn đến mã kết thúc (stop codon), làm cho sinh tổng hợp protein APC sớm bị dừng lại, protein APC bị cắt đoạn ngắn, chức ức chế khối u bị giảm Kết cho thấy vai trò đột biến gen APC chế bệnh sinh bệnh ung thư ĐTT thể FAP - Vùng tập trung đột biến gen APC từ codon 1001-1400, chiếm 89,40%, vùng codon 656 – 1000, số đột biến chiếm 10,60% - Không phát đột biến gen APC người khỏe mạnh đối chứng Đột biến exon 15 gen APC thành viên có quan hệ huyết thống với bệnh nhân mang gen đột biến - Có lặp lại giống vị trí kiểu đột biến gen APC thành viên gia đình - 15/25 (60%) thành viên 15 gia đình bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể FAP có mang gen APC đột biến, có 3/15 (20%) người thân mang gen đột biến biểu bệnh đa polyp tuyến gia đình (FAP) Như vậy, đột biến gen APC có khả di truyền gia đình bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình 8.1/ Về giải pháp khoa học - công nghệ: sử dụng kỹ thuật sinh học phân tử đại xác định loại đột biến ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình (FAP) 8.2/ Về phương pháp nghiên cứu: sử dụng kỹ thuật sinh học phân tử đại bậc để xác định đột biến ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình như: tách chiết tinh DNA từ tế bào mầm, khuếch đại DNA kỹ thuật nhân gen PCR, xác định trình tự nucleotid DNA (sequencing) xác định đột biến gen cách so sánh với GenBank nhờ phần mềm chuyên dụng 8.3/ Những đóng góp khác: Về đào tạo: Đã đào tạo thành công nghiên cứu sinh: NCS Nguyễn Phương Anh, Viện K Trung ương, bảo vệ Luận án Tiến sĩ cấp quốc gia 10/2011 Về công trình khoa học: Đã đăng báo khoa học: Tạp chí Y học Việt Nam, Tạp chí Ung thư học Việt Nam, báo: - Nguyễn Phương Anh, Nguyễn Nghiêm Luật Trần Vân Khánh (2010) Phát đột biến dịng mầm ngồi vùng nóng exon 15 gen APC bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình Việt Nam Tạp chí Y học Việt Nam; 372 (2): 22-27 - Nguyễn Phương Anh, Nguyễn Nghiêm Luật Trần Vân Khánh (2010) Phát đột biến dòng mầm vùng nóng exon 15 gen APC bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình Việt Nam Tạp chí Y học Việt Nam; 373 (1): 50-56 - Nguyễn Phương Anh Nguyễn Nghiêm Luật (2010) Đột biến dòng mầm gen APC 15 gia đình bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình Việt Nam Tạp chí Ung thư học Việt Nam; số 1- 2010: 836-640 - Nguyễn Phương Anh Nguyễn Nghiêm Luật (2011) Sự lặp lại đột biến dòng mầm exon 15 gen APC người thân bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình (FAP) Việt Nam Tạp chí Y học Việt Nam; 377 (1): 17-21 Về tham gia hội nghị khoa học: Đã tham gia báo cáo khoa học hội nghị khoa học: - Hội nghị Khoa học Hội Hóa sinh Y Dược Hà Nội tỉnh phía Bắc lần thứ XI, Tam Đảo 19-20/ 8/ 2010 (Báo cáo khoa học) - Hội nghị Sinh học phân tử Hóa sinh Y học tồn quốc lần thứ 2, Hà Nội, 18-19/ 9/ 2010 (Poster) - Hội thảo Quốc gia Phòng chống Ung thư lần thứ XV, Hà Nội, 7-8/ 10/ 2010 (Báo cáo khoa học) Hà Nội, ngày 10 tháng năm2011 CHỦ NHIỆM ĐỀ TÀI (Họ, tên chữ ký) PGS TS Nguyễn Nghiêm Luật Phụ lục Danh sách tác giả đề tài KH&CN cấp Bộ Tên Đề tài: “Nghiên cứu phát biến đổi gen ung thư đại trực tràng” Thuộc Chương trình (nếu có): Thời gian thực hiện: 10/ 2006-10/ 2009 Cơ quan chủ trì: Trường Đại học Y Hà Nội Bộ chủ quản: Bộ Y Tế Danh sách tác giả: TT Học hàm, học vị, họ tên PGS TS Nguyễn Nghiêm Luật ThS Nguyễn Phương Anh TS Trần Vân Khánh Chữ ký CN Nguyễn Thúy Hà Thủ trưởng quan chủ trì đề tài (Họ, tên, chữ ký đóng dấu) BỘ Y TẾ CỘNG HỊA XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI Độc lập – Tự – Hạnh phúc _ Hà Nội, ngày tháng năm 2010 GIẤY XÁC NHẬN CHI TIÊU TÀI CHÍNH ĐỀ TÀI NCKH Tên đề tài: “Nghiên cứu phát biến đổi gen ung thư đại trực tràng” Chủ nhiệm đề tài: PGS TS nguyễn Nghiêm Luật Cơ quan chủ trì đề tài: Trường Đại học Y Hà Nội Cơ quan quản lý đề tài: Bộ Y tế: Đề tài cấp Thời gian thực đề tài theo định phê duyệt BYT: 10/2006- 10/ 2009 Tổng kinh phí duyệt: 340 triệu VND Tổng kinh phí cấp: 340 triệu VND Tổng kinh phí toán: 340 triệu VND Các hoạt động chi tiêu đề tài đảm bảo theo đề cương duyệt đảm bảo qui định tài Nhà nước Số kinh phí cịn lại: (chỉ để khoảng 20 – 25 triệu đồng) phục vụ cho nghiệm thu cấp sở nghiệm thu cấp BYT XÁC NHẬN CỦA PHỊNG TÀI CHÍNH CHỦ NHIỆM ĐỀ TÀI TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI PGS TS Nguyễn Nghiêm Luật MỤC LỤC MỞ ĐẦU TỔNG QUAN 1.1 Đa polyp tuyến gia đình (FAP) 1.2 Cấu trúc chức gen APC 1.2.1 Cấu trúc gen APC protein APC 1.2.2 Các chức gen APC protein APC 11 1.3 Các kỹ thuật sinh học phân tử xác định đột biến gen APC 15 1.3.1 Kỹ thuật PCR 16 1.3.2 PCR đơn mồi 17 1.3.3 PCR đa mồi 17 1.3.4 PCR chép ngược 18 1.3.5 Real-time PCR 18 1.3.6 Kỹ thuật MLPA 19 1.3.7 Kỹ thuật giải trình tự gen 19 ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 20 2.1 Đối tượng nghiên cứu 20 2.2 Dụng cụ, trang thiết bị hóa chất nghiên cứu 20 2.3 Phương pháp nghiên cứu……………………………………… 23 KẾT QUẢ 34 3.1 Các kết giải trình tự DNA exon 15 35 3.2 Kết xác định đột biến gen APC gia đình bệnh nhân …39 3.3 Kết phân tích gen APC thành viên 49 3.4 Kết phân tích gen APC nhóm đối chứng 50 BÀN LUẬN 52 4.1 Về kết xác định đột biến gen APC gia đình 52 4.2 Về kết phân tích gen APC thân nhân 58 4.3 Về kết phân tích gen APC nhóm đối chứng 59 KẾT LUẬN 60 KHUYẾN NGHỊ 61 TÀI LIỆU THAM KHẢO CÁC PHỤ LỤC CÁC BÀI BÁO KHOA HỌC DANH SÁCH BỆNH NHÂN tác protein APC với β-catenin (vốn coi cần thiết cho hoạt động ức chế khối u protein APC) bị tác dụng Nếu protein APC chức năng, nồng độ β-catenin tăng bào tương, vào nhân nơi chúng gắn với yếu tố chép tế bào T (T-cell factor: TCF) yếu tố tăng cường bạch huyết (enhancer lymphoid factor: LEF) yếu tố chép (Barker N Clevers H, 2006 [19]) gen đích đường tín hiệu Wnt hoạt hóa khả chép gây nên kiểm soát tăng sinh tế bào gây khối u đường ruột Điều chứng minh mơ hình chuột thực nghiệm gây bệnh khối u đường ruột Vùng lặp lại 15 20 acid amin protein APC liên quan đến số trình khác phân ly thể nhiễm sắc, ức chế chết tế bào theo chương trình Như vậy, vùng lặp lại 15 20 acid amin protein APC đóng vai trị quan trọng chế bệnh sinh bệnh đa polyp tuyến gia đình nguy tiến triển thành ung thư Các đột biến gen APC gia đình bệnh nhân ung thư ĐTT thể FAP nghiên cứu phần lớn xảy vùng lặp lại 15, 20 acid amin protein APC kết tạo mã kết thúc sớm (stop codon) dẫn đến cắt đoạn ngắn protein làm protein APC bị chức [ Các kết góp phần chứng minh cho sở lý thuyết vai trò đột biến gen APC chế bệnh sinh bệnh đa polyp tuyến gia đình trình sinh ung thư 4.2 Về kết phân tích gen APC thân nhân bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể FAP: Như phần kết quả, số thành viên mang gen APC đột biến 15/25 người, chiếm tỷ lệ (60%) 10 người không mang gen APC đột biến, chiếm tỷ lệ 40% (Bảng 3.4) Điều có nghĩa khơng phải tất người gia đình người bị ung thư đại trực tràng thể FAP mang gen APC đột biến Sự di truyền gen đột biến thực tế phụ thuộc vào gen bô mẹ Hiện chưa gặp trường hợp bố lẫn mẹ mang gen đột biến gen APC chưa tìm tài liệu mơ tả tỷ lệ đột 58 biến gen APC thành viên gia đình có bố mẹ bị ung thư đại trực tràng thể FAP Về tỷ lệ thành viên gia đình bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến mang gen đột biến biểu bệnh FAP, có 3/15 (20%) thành viên gia đình có biểu FAP, cịn lại 12/15 (80%) thành viên 15 gia đình bệnh nhân ung thư ĐTT thể FAP có mang gen APC đột biến chưa biểu bệnh FAP thời điểm lấy mẫu 4.3 Về kết phân tích gen APC nhóm đối chứng Phân tích đột biến gen APC 15 người khỏe mạnh không mắc bệnh lý đại trực tràng cho thấy, không đột biến phát Như vậy, thấy đột biến gen APC đặc điểm điển hình bệnh đa polyp tuyến gia đình (FAP), đặc biệt bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình 59 KẾT LUẬN Nghiên cứu đột biến dòng mầm exon 15 gen APC 22 bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình (FAP), 25 người thân 15 gia đình bệnh nhân 15 người khỏe mạnh kỹ thuật giải trình tự trực tiếp DNA, rút kết luận sau: Ở bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình: - Đã phát đột biến gen APC 19/22 (86,36%) bệnh nhân ung thư ĐTT thể FAP - Các đột biến dịch khung (cài xóa từ đến nucleotid) loại đột biến phổ biến nhất, chiếm 86%, lại đột biến thay (1 nucleotid) Các đột biến dịch khung thay nucleotid dẫn đến mã kết thúc (stop codon), làm cho sinh tổng hợp protein APC sớm bị dừng lại, protein APC bị cắt đoạn ngắn, chức ức chế khối u bị giảm Kết cho thấy vai trò đột biến gen APC chế bệnh sinh bệnh ung thư ĐTT thể FAP - Vùng tập trung đột biến gen APC từ codon 1001-1400, chiếm 89,40%, vùng codon 656 – 1000, số đột biến chiếm 10,60% - Không phát đột biến gen APC người khỏe mạnh đối chứng Đột biến exon 15 gen APC thành viên có quan hệ huyết thống với bệnh nhân mang gen đột biến - Có lặp lại giống vị trí kiểu đột biến gen APC thành viên gia đình - 15/25 (60%) thành viên 15 gia đình bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể FAP có mang gen APC đột biến, có 3/15 (20%) người thân mang gen đột biến biểu bệnh đa polyp tuyến gia đình (FAP) Như vậy, đột biến gen APC có khả di truyền gia đình bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình 60 KHUYẾN NGHỊ Đề nghị Bộ Y tế cho phép tiến hành xác định đột biến exon 15 gen APC (vùng liên quan nhiều đến ung thư đại trực tràng thể FAP: từ codon 1000 đến 1400) bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể FAP thành viên có quan hệ huyết thống gia đình họ để phát sớm nguy có biện pháp phịng ngừa trước ung thư xuất 61 TÀI LIỆU THAM KHẢO TIẾNG VIỆT Nguyễn Bá Đức (2000), Hóa chất điều trị bệnh ung thư, NXB Y học, Hà nội: 87-94 Hiệp Hội quốc tế chống ung thư (1995), Cẩm nang ung bướu học lâm sàng tập I, II, xuất lần thứ 6, NXB Y học, Hà Nội, tr.177-181: 475- 493 Nguyễn Văn Hiếu (2007), Ung thư đại tràng, Chẩn đoán điều trị bệnh ung thư, NXB Y học, Hà Nội: 223 - 236 Phạm Đức Huấn (2006), Ung thư đại tràng, Bệnh học ngoại khoa, tập I (sau đại học) NXB Y học, Hà Nội: 249 - 258 Tạ Long (1992), Ung thư đại tràng, Bài giảng bệnh học nội khoa sau đại học tập II, Học viện Quân Y, Hà Nội: 75 - 81 Hoàng Gia Lợi (1995), Các khối u ruột non đại tràng, Bài giảng bệnh học nội tiêu hoá, Học viện Quân Y, Hà Nội: 215 - 225 Lê Đình Roanh (2001), Bệnh học khối u, NXB y học, Hà Nội Nguyễn Khánh Trạch, Lê Tuyết Anh, Phạm Thị Bình, Mai Minh Huệ, …(2008), Nội soi tiêu hoá, NXB y học, Hà Nội: 128 – 152 Đỗ Đức Vân (2006), Polyp đại tràng, Triệu chứng học ngoại khoa, NXB y học, Hà Nội: 187-191 10 Hồ Huỳnh Thùy Dương (1998), Các phương pháp lai phân tử, Sinh học phân tử, NXB Giáo dục: 149-162 11 Võ Thị Hương Lan (2002), ADN tái tổ hợp, Sinh học phân tử, NXB Đại học Quốc gia Hà Nội: 139-170 12 Lê Đình Lương (2001), “Chọn lọc, sàng lọc phân tích thể tái tổ hợp”, Nguyên lý kỹ thuật di truyền, NXBKhoa học kỹ thuật: 118-130 13 Khất Hữu Thanh (2006), “Một số phương pháp sử dụng kỹ thuật gen”, Cơ sở di truyền phân tử kỹ thuật gen, Nhà xuất Khoa học kỹ thuật: 137-64 14 Phạm Hùng Vân (2009), “Real-time PCR- Các vấn đề bản”, PCR realtime PCR – Các vấn đề áp dụng thường gặp, Nhà xuất Y học: 34-59 TIẾNG ANH 15 Ahmed, Y., Nouri, A and Wieschaus, E (2002) Drosophila Apc1 and Apc2 regulate Wingless transduction throughout development Development 129, 1751-1762 16 Akiyama, T and Kawasaki, Y (2006) Wnt signalling and the actin cytoskeleton Oncogene 25, 7538-7544 17 Andrzej Plawski, Ryard Slomski (2008) APC gene mutations causing familial adenomatous polyposis in Polish patients J Appl Genet 49 (4): 407414 18 Aoki K, Aoki M, Sugai M, Harada N, Miyoshi H, Tsukamoto T, Mizoshita T, Tatematsu M, Seno H, Chiba T et al (2007) Chromosomal instability by -catenin/TCF transcription in APC or -catenin mutant cells Oncogene 26: 3511-3520 19 Barker N and Clevers H (2006) Mining the Wnt pathway for cancer therapeutics Nat Rev Drug Discov 5: 997-1014 20 Beroud C and Soussi T (1996) APC gene: database of germline and somatic mutations in human tumors and cell lines Nucleic Acids Res; 24: 121-124 21 Bienz M (2002) The subcellular destinations of APC proteins Nat Rev Mol Cell Biol 3: 328-338 22 Bienz M and Hamada F (2004) Adenomatous polyposis coli proteins and cell adhesion Curr Opin Cell Biol 16: 528-535 23 Bodmer WF et al (1987) Localization of the gene for familial adenomatous polyposis on chromosome Nature, 328: 614–616 24 Bülow S, Berk T, Neale K The history of Familial Adenomatous Polyposis Fam Cancer 2006, : 213-220 25 Dikovskaya D, Schiffmann D, Newton I P, Oakley A, Kroboth K, Jamieson T J, Meniel V, Clarke A, Sansom O and Nathke I S (2007) Loss of APC induces polyploidy as a result of a combination of defects in mitosis and apoptosis J Cell Biol 176: 183-195 26 Fearnhead NS, Britton MP and Bodmer WF (2001) The ABC of APC Human Molecular Genetics; 10 (7): 721-733 27 Friedl W, Caspari R, Sengteller M, Uhlhaas S, Lamberti C, Jungck M, Kadmon M, Wolf M, Fahnenstich J, Gebert J, Möslein G, Mangold E, Propping P (2001) Can APC mutation analysis contribute to therapeutic decisions in familial adenomatous polyposis? Experience from 680 FAP families Gut; 48(4): 515-521 28 Glass D A, Bialek P, Ahn J D, Starbuck M, Patel, M S, Clevers H, Taketo M M, Long F, McMahon A P, Lang R A et al (2005) Canonical Wnt signaling in differentiated osteoblasts controls osteoclast differentiation Dev Cell 8: 751-764 29 Groden J, Thliveris A, Samowitz W, Carlson M, Gelbert L, Albertsen H, Joslyn G, Stevens J, Spirio L, Robertson M et al (1991) Identification and characterization of the familial adenomatous polyposis coli gene Cell 66: 589-600 30 Hamada F and Bienz M (2002) A Drosophila APC tumour suppressor homologue functions in cellular adhesion Nat Cell Biol; 4: 208-213 31 Hamada F and Bienz M (2004) The APC tumor suppressor binds to Cterminal binding protein to divert nuclear -catenin from TCF Dev Cell 7: 677-685 32 Hamada F, Murata Y, Nishida A, Fujita F, Tomoyasu Y, Nakamura M, Toyoshima K, Tabata T, Ueno N and Akiyama T (1999) Identification and characterization of E-APC, a novel Drosophila homologue of the tumour suppressor APC Genes Cells 4, 465-474 33 Harada N, Tamai Y, Ishikawa T, Sauer B, Takaku K, Oshima M and Taketo M M (1999) Intestinal polyposis in mice with a dominant stable mutation of the -catenin gene EMBO J 18: 5931-5942 34 Hayden M A, Akong K and Peifer M (2007) Novel roles for APC family members and Wingless/Wnt signaling during Drosophila brain development Dev Biol 305: 358-376 35 Henderson B R and Fagotto F (2002) The ins and outs of APC and -catenin nuclear transport EMBO Rep 3: 834-839 36 Jian Q S, Wei J C, Lei F (2010) APC gene mutations in Chinese familial adenomatous polyposis patients World J Gastroenterol; 16 (12): 1522-1526 37 Joncourt F, Neuhaus B, Foegen KJ, Kleinle S, Steiner B, Gallati S (2004), “Rapid Identification of Female Carriers of DMD/BMD by Quantitative Real-Time PCR”, Human Mutation, 23: 385-391 38 Kelly J Smith, Karen A (2003) The APC gene product in normal and tumorcells Proc Natl , 90: 2846-2850 39 Koolman J (2005), DNA sequencing, Color Atlas of Biochemistry, 2nd ed: 260-262 40 Kawasaki Y, Sato R and Akiyama T (2003) Mutated APC and Asef are involved in the migration of colorectal tumour cells Nat Cell Biol 5: 211215 41 Kemler R (1993) From cadherins to catenins: cytoplasmic protein interactions and regulation of cell adhesion Trends Genet 9: 317-321 42 Kielman M F, Rindapaa M, Gaspar C, van Poppel N, Breukel C, van Leeuwen S, Taketo M M, Roberts S, Smits R and Fodde R (2002) Apc modulates embryonic stem-cell differentiation by controlling the dosage of -catenin signaling Nat Genet 32: 594-605 43 Kinzler K W et al (1991) Identification of FAP locus genes from chromosome 5q21 Science, 253: 661–665 44 Knudsen AL, Bisgaard ML, Bülow S: Attenuated familial adenomatous polyposis (AFAP) A review of the literature Fam Cancer 2003, : 43-55 45 Kroboth K, Newton I P, Kita K, Dikovskaya D, Zumbrunn J, WatermanStorer C M and Nathke I S (2007) Lack of adenomatous polyposis coli protein correlates with a decrease in cell migration and overall changes in microtubule stability Mol Biol Cell; 18: 910-918 46 Lee HH, Morse SA, Olsvik O (1997), “Nucleic acid amplification technologies: application to disease diagnosis”, Eaton Publishing: 49-60 47 Louie R K, Bahmanyar S, Siemers K A, Votin V, Chang P, Stearns T, Nelson W J and Barth A I (2004) Adenomatous polyposis coli and EB1 localize in close proximity of the mother centriole and EB1 is a functional component of centrosomes J Cell Sci; 117: 1117-1128 48 Mahmoud N N, Boolbol S K, Bilinski R T, Martucci C, Chadburn A and Bertagnolli M M (1997) Apc gene mutation is associated with a dominantnegative effect upon intestinal cell migration Cancer Res; 57: 5045-5050 49 Marrtjie N, Elsa B, Frederik J H (2007) Genotyp-phenotype corelations in 19 Dutch cases with APC gene deletions and a literature review Eur J hum Genet; 15 (10) : 1034-1042 50 McPherson MJ, Hames BD, Taylor GR (1995) Optimizing PCR, PCR 2- A practical approach, Oxford University Press: 1-22 51 Miyashiro I, Senda T, Matsumine A, Baeg G H, Kuroda T, Shimano T, Miura S, Noda T, Kobayashi S, Monden M et al (1995) Subcellular localization of the APC protein: immunoelectron microscopic study of the association of the APC protein with catenin Oncogene; 11: 89-96 52 Miyoshi Y, Ando H, Nagase H, Nishisho I, Horii A, Miki Y, Mori T, Utsunomiya J, Baba S, Petersen G (1992) Germ-line mutations of the APC gene in 53 familial adenomatous polyposis patients Proc Natl Acad Sci U S A; 89(10): 4452–4456 53 Moisio A, Jurvinen H, Peltomaki P (2002) Genetic and clinical characterisation of familial adenomatous polyposis: a population based study, Gut 50 (6): 845-850 54 Morin P J, Vogelstein B and Kinzler K W (1996) Apoptosis and APC in colorectal tumorigenesis Proc Natl Acad Sci USA; 93: 7950-7954 55 Morrison E E, Wardleworth B N, Askham J M, Markham A F and Meredith D M (1998) EB1, a protein which interacts with the APC tumour suppressor, is associated with the microtubule cytoskeleton throughout the cell cycle Oncogene; 17: 3471-3477 56 Moseley J B, Bartolini F, Okada K, Wen Y, Gundersen G G and Goode B L (2007) Regulated binding of Adenomatous polyposis coli protein to actin J Bio Chem 282: 12661-12668 57 Munemitsu S, Souza B, Muller O, Albert I, Rubinfeld B and Polakis P (1994) The APC gene product associates with microtubules in vivo and promotes their assembly in vitro Cancer Res; 54: 3676-3681 58 Nakamura M, Zhou X Z and Lu K P (2001) Critical role for the EB1 and APC interaction in the regulation of microtubule polymerization Curr Biol; 11: 1062-1067 59 Nathke I (2006) Cytoskeleton out of the cupboard: colon cancer and cytoskeletal changes induced by loss of APC Nat Rev Cancer; 6: 967-974 60 Noritake J, Watanabe T, Sato K, Wang S and Kaibuchi K (2005) IQGAP1: a key regulator of adhesion and migration J Cell Sci; 118: 2085-2092 61 Powell S M, Zilz N, Beazer-Barclay Y, Bryan T M, Hamilton S R, Thibodeau S N, Vogelstein B and Kinzler K W (1992) APC mutations occur early during colorectal tumorigenesis Nature; 359: 235-237 62 Reece RJ (2004) Polymerase chain reaction Analysis of Genes and Genomes, John Wiley & Sons Ltd: 153-182 63 Rowley PT (2004) Screening for an inherited susceptibility to colorectal cancer Genet Test ; : 421-430 64 Sieber OM, Lamlum H, Crabtree MD (2002) Whole gene APC deletions cause classical familial adenomatous polyposis but not attenuated polyposis or “multiple” colorectal adenomas, Proc Natl; 99 (95): 2954-2958 65 Schouten JP, McElgunn CJ, Waaijer R, Zwijnenburg D, Diepvens F, Pals G (2002) Relative quantification of 40 nucleic acid sequences by multiplex ligation-dependent probe amplification Nucleic Acids Res; 30 (12): 57 66 Sellner LN, Taylor GR (2004), “MLPA and MAPH: New Techniques for Detection of Gene Deletions”, Human Mutation, 23: 413-9 67 Shee Ping Chen, Shih Tzu, Shu Wen Jao (2006) Single nucleotid polymorphisms of the APC gene and colorectal cancer risk: a case control study in Taiwan BMC Cancer; 6: 83-89 68 Sorscher DH (1997) DNA amplification techniques Molecular Diagnostics, Humana Press: 98-101 69 Su L K, Burrell M, Hill D E, Gyuris J, Brent R, Wiltshire R, Trent J, Vogelstein B and Kinzler K W (1995) APC binds to the novel protein EB1 Cancer Res; 55: 2972-2977 70 Taketo M M (2006) Wnt signaling and gastrointestinal tumorigenesis in mouse models Oncogene 25: 7522-7530 71 Tighe A, Johnson V L and Taylor S S (2004) Truncating APC mutations have dominant effects on proliferation, spindle checkpoint control, survival and chromosome stability J Cell Sci; 117: 6339-6353 72 Turcot J, Després JP, St Pierre F Malignant tumors of the central nervous system associated with familial polyposis of the colon: report of two cases Dis Colon Rectum 1959, 2: 465-468 73 van Es J H, Giles R H and Clevers H C (2001) The many faces of the tumor suppressor gene APC Exp Cell Res; 264: 126-134 74 Vander Lujit RB, Khan RM, Vasen HF (1997) Molecular Analysis of the APC gene in 105 Dutch kindreds with familial adenomatous polyposis: 67 germline mutations indentified by DGGE, PTT and Sothern analysis; (1): 7-16 75 Wallis YL, Morton DG, McKeown CM and Macdonald Molecular analysis of APC gene in 205 families: extended genotype-phenotype correlations in FAP and evidence for the role of APC amino acid changes in colorectal cance predispoition J Med Genet 1999; 36: 14-20 76 Watanabe T, Wang S, Noritake J, Sato K, Fukata M, Takefuji M, Nakagawa M, Izumi N, Akiyama T and Kaibuchi K (2004) Interaction with IQGAP1 links APC to Rac1, Cdc42, and actin filaments during cell polarization and migration Dev Cell; 7: 871-883 PHỤ LỤC 1: mRNA CỦA GEN APC GenBank: M74088.1 Vùng đề tài khảo sát phần gạch dưới: từ codon 653 (bp 1967) đến codon 1601 (bp 4803), vùng hotspot vùng in đậm: từ codon 998 (bp 2994) đến codon 1467 (bp 4401) Human APC gene mRNA, complete cds LOCUS DEFINITION ACCESSION VERSION KEYWORDS SOURCE HUMFAPAPC 8972 bp mRNA Human APC gene mRNA, complete cds M74088 M74088.1 GI:182396 Homo sapiens (human) linear PRI 09-DEC-1993 ORIGIN 61 121 181 241 301 361 421 481 541 601 661 721 781 841 901 961 1021 1081 1141 1201 1261 1321 1381 1441 1501 1561 1621 1681 1741 1801 1861 1921 1981 2041 2101 2161 2221 2281 2341 gtccaagggt gcactgaaga acaaaactgg attgaagatg cttaacttag tcttatggaa atgggttcat gaagaacttg aaagactggt actgaaaatt caaatcagag cagcgaagaa ttacagtccc catgatgctg ggtaatggtc agtagcacac gtgtattcat ctagctatgt ctcctcatcc ggcagtaaag cctgatgaca gcttactgtg aaaaatccaa aaactttcat attgcagaat attacactaa aacaaggcta tctgaaagtg gcagatgtaa tgtgctttag ttgtcagcac tttttggttg ggaggtggga atcctaagag acaatagtca caggaagcat cacaaaatga gcgaagtaca aggaaacaaa aatatagaca agccaaggat tggagaactc aaactgaggc aagctatggc atagcagtaa gccgggaagg ttccaagaag agaaagagag attacgctca tttccttaca ttgcgatgga tagccagaat aagcaacaga agcggcagaa agggttcaac actctgcacc tgttgtcaat ctagctccca agcttttaca aggctcgggc agagaggcag aaacctgttg tgccagctcc ttgatgaaga tattgcaagt gacgatatgc cgctatgctc aagacttaca atagtaaaaa aagttaaaaa attgcactga gcactcttac tattacggaa agaacaactg gtaatgcatg tatgggacat ttgctatggg aggatgccaa aagccctaga atttaagtcc ggctgcagct aaatcttcga atctaatatg ttcttctgga tttccctgga atctgtatca agggtttgta gtcattgctt acttcagaat aacagatatg agaacaacta tcagcaaatc agcagagagg tgaaggtcaa tacacgaatg tcgaaggctg gcttggtact agacagctgt tggcaatgac cagggccagt gcgtgaaatc ggagtggcag tgttgaacat gcatagacat ggactgtgaa tggaatggct tatgaaaggc gcaggttatt gacgttgcga ggaatcaacc gaataaagct ttaccggagc tgtgtccagc tctacaaact tggaactttg gggggcagtt aagtgctgca tattatgtct agcagaatta caaggcatct tcatatgatc caagagctag aaggaagtac cagattgatt gtaaaactgc agccgttctg aatggaagca cttgctgatc ctcactaaaa accagaaggc ggtacctgcc gaaaaggaca tcatctcaga ggagtgggag gaccatgaaa acaagtcatc catgataagg atatccatgc aaagactctg gcagcactcc cgagtccttc gaagctcatg cagatctgtc gcaatgaatg atgtacgggc ttgacaaact tgcatgagag gcaagtgttt gaagttggaa ctcaaaagcg gatatatgtg cagacaaaca ttgatagcta ttattacaac tggaatctct agcatgctca gctttaagga cctggctcaa gatgctcagc catcgtagta agttgttaaa aagataattc ttaaacaact tattagagcg ggtcaaaaat gagagtgcag gagaaagtac ttgacaaaga gaatagatag aattggaata aggatatgga tacttcgtat acaagcatga aaatcaacat cagccagtgt tgggaaccaa atgatatgtc gacagtctgg tattgttggg acaacatcat atcttttgga aaccaggcat ctgctgtgtg aactaggggg ttactaatga tgacttttgg cacttgtggc tgaggaattt gtgtgaaagc tattgagtgc ctgtagatgg ctttagccat caaatgagga acttaaaatc cagcaagaaa agaacctcat atctcatggc gcttgccatc acttatcaga agcagagaca gcaagttgag caatcatctt acaaggaagt tcttaaagag gtccctccgt tcctgttcct tggatattta agaaaaggaa tcttccttta tgaagcaagg aaaacgagca acgacagctt aaccggctca ggcaacttct tttgagttct ggtggaaatg gcgaactttg atgtcttcct aaattcccgg tcactcacag acagatacgc ggaccaggac tgttctaatg actacaggcc ccactacagt agatgtagcc ccaactaaaa gtcttggcga attgatggaa cttatggaat tgcacttgca tattgaaagt ccacaggcaa tcatagtttg tcctaaagac tcattcaaag aaataggcct tcttcatgtt aacttttgac caagcaaagt 2401 2461 2521 2581 2641 2701 2761 2821 2881 2941 3001 3061 3121 3181 3241 3301 3361 3421 3481 3541 3601 3661 3721 3781 3841 3901 3961 4021 4081 4141 4201 4261 4321 4381 4441 4501 4561 4621 4681 4741 4801 4861 4921 4981 5041 5101 5161 5221 5281 5341 5401 5461 5521 5581 5641 5701 5761 5821 5881 ctctatggtg aatactggca tcttcatcaa gaacgcggaa aagcgaggtt tcagccattc gtgacagatg tacaatttca gaatacaaga aaaagaggtc tgcagttatg gatgataatg cagttgaact ataatagaag tatcctgttt cagcaggaat gtgggttcta tatgaagatg gaagaagaga cagcctattg ttttcattct agtgagaata tctgcacaga aaccaagaaa agttcattat gaagcagatt tcagctgaag agcagactgc tcttcaggag cactatgttc agttttgaga agtggcatta agaagtaaaa aataaagcac gcagttcaga agtactccag tttatacaga aatgaaacag aaaactattg ctagaagaat gcccagactg tacaaacttc ggggatgata acatctctaa gttagaggag agaagtacag gacaataaag gggaaaagtc gcgtcgtctt ccagtaaaac tcaaaaaata aatttgaaaa agaggaagtt tgtttttcac tccagggaaa accagccaca aagcagccaa cagtcatcca gctattgaaa attatgtttt acatgactgt gaggaagctt ttggtctagg tgcagatctc atacctctca agagaaatgc ctaagtcgga gatcttcaaa aaatgaaacc gtcaataccc atggagaact ctggaaggca atgaaataaa atactgagag gtgtttctcc atcatggaat ataagcctac gaccaacaaa attatagttt caaagagttc cgtccacacc gtagaagtgg caatacagac catctttgtc ctgctaatac atcctgtgag agggttctag cgaaatctcc aggagacccc gtcgttcgat taagccccag cacctccacc ctactgctga gggtccaggt atggattttc aagatgtgga aatcagagca attctgaaaa gtattatttc cttcaaaatt taccatcaca tgccacgggt gtgatctaac gagcacagtc atgaggctca cagaggaagg acaagccttt ctgcacccaa ctataccaca atttaaatgc ataattccaa ttgcttttga gaaatgattc aggctgaatt cagaactaac taaatcgagg aagacatacc atactccagt tgacaccaat cctttcacca agatagttct caactaccat caccactgca ggaagacaga acttagaaga aaattcaaat tgatagttta ctcgattgaa agccgaccta agatacacca aagtccttca acaaagtgag cactgatgat atacaggtca taatcaaaat caattatagt ttatagcata aaaatatgcc atctggacaa ttcatctaat tcagcctcaa ttattgtgta atcagctgaa cctgcaaata cgaagttcca tttatcttca ctccaaaagt actcatgttt tgccagctcc tgatcttcca acctcctcaa aaagagagag tcttccagat ttgttcatcc attaagaata gcctaaagaa ggacctatta tgccatgcca acctccacct aaacaggttg gtattgtgtt aatcgaatcc aggtgaattt aggaggaaaa tgatattctt ccgtgtgaaa caaaaatcag aaatactgaa tgagagagtt ggacttcaat ttcacctcat tttgagttct aagaaaggca ctccaaccaa tcagcctaaa agacagaggg ttgcttttct cgacatgatg tatttgaata cgttctgaaa ccagcaacag gcccagattg agttctgggt agctctgctg aggacatgtt aatagtgtca tcctattctg gcccataaaa ataaattata cagaatgaaa caaagacaat aaacacctca cggggagcca gtaagccagt gaacgttact aaatataatg acagatattc agcagtaaaa gccaagaggc aaggctgcca gaagatactc gatgaaatag gcagaaataa gcagtgtcac gaatcagcca ggtgctcaga agcagatgta gttcagagtg gatagccctg acagctcaaa agtggaccta gctgatactt agcctgagtg atgcctccag tcaaatgaaa gatgattcag acaaagtcat gtggcaagga caaccccaaa gaagggacac cctccaaatg gaaaaacgag acctcatctg gcagaatgca aagataatgg ttagatggta tataggacac ttctcagaca gataagctcc cattacacgc ctagattttg aaagaaaata caatcagcta cccatacttc gcagcaactg cataattcct ataataggtc ctacagtgtt aagatagaag aaaatccagg ccaaagtcat ctaccactga cccatacaca ctatgcctta gtagtagtga aagatgatga tacatagtgc gtcttaaata gatgggcaag caaggaatca agttccaacc atggttcaga ctttgtgtca ctgaagaaga aagagaaacg cttcatcaca ccgaacatat agaatcagct cttgcaaagt caatatgttt gatgtaatca aagaaaagat agcaccctag ggcacaaagc cacccaaaag cttctgtcag aaccatgcag gacaaaccat ccaagcgaga agcaagctgc tattacattt ctctgagcct ttcaggaaaa accaagagaa atgatgatga cacgtaaagc aaccaagtca agcatgttag ctataaactt agttagctgc ataccattcc taaccatacc ttaattctgc accaggtcca agaaaaagaa gtgtaagaaa acaaagattc caaataatga ctattgaagg atgatgatga aggaatcaga ataagacaca agaaacaatc atgaaaagtt ctctgagttc agacaatttt acccagctcc tttggagaga aacttcttca ggaagaagtg attacattgt ttcaaacact tgccaaatta tggttatggt aagtaagttt aaatcatatg ttcagatgag acccaaacac aagtacaact acattttgga aacaaatcga agaagatgac acagcatgaa tcatgtggat gaaacagtca gtcttcaagc ccatccaagt ttcttctatt ttcaagatgt gacgacacag tggaactagg aaccaaatcc tgttgaattt tccacctgaa ttcacttgat tggaatggta gccaccaagc agtacctaaa agtaaatgct tgccacggaa cgatgagcca tgacaatggg agaggcagaa tattgaaata aaaaaagcca gctgcctgtg ttttacaccg ttccacagct tggagaagga tacagaaggc tgaattggat tatgcccaaa gcaagcatct accaacttca aaatgcagac aaagaaacag agatagagtc aactccttac tgttgacctt ggctaaagtt agctattgca cacttttccc acagaatttt tctcagtgac 5941 6001 6061 6121 6181 6241 6301 6361 6421 6481 6541 6601 6661 6721 6781 6841 6901 6961 7021 7081 7141 7201 7261 7321 7381 7441 7501 7561 7621 7681 7741 7801 7861 7921 7981 8041 8101 8161 8221 8281 8341 8401 8461 8521 8581 8641 8701 8761 8821 8881 8941 attgaccaag tcacagggag gaagataccc gaagatgacc agactcaagg gatctgacac gattcagaaa ttacatcaag atcctttccc gaagaaaaac acattggaaa tataaaagtt cagccccttc ggagttcgaa actccagcct aagccatctg tcaagtaaag caaccattaa ggaataagtc tcaactaagt caacagaacc gagtctgcct gaactttcta cctgtattag aaattggagg actaggtccc acacattcgt atagagtata agtccttcta tcatcatccc tctgcttcat atttcaggaa ataaaagaaa acaaatggtg gaggatgttt cccacaggta aaagattcaa accgtgggtt ggaactgaga tctatagtgg gggactgttg gcagatagca aagcgagatt tctgggtctt tatgttaatt aaattttgta tagtatactt atagtaaagc ccaacttcct tatattgctg attggtattt aaaacaacaa aaccaagtaa cagtttgttt tgttgcagga gtgataatga ttgatttgaa attttgattg ctgctgctgc tgaaatcagg cctttacaag ctaaaaagat tgattactgg aagcaaacat atagctcctc ccaaaagccc tgaaatcaga caccttctag gtagacctat ctcctaacaa cctcaggttc ttaccaaaca ccaaaggact gaatgtcttc tacgccagtc aatctgcttc aggcacaaac ctgttcaggc atgatggaag gacttccaat ttcctcgagt cagaatccag ccaaacaaag atgaattttc ctgaatcaaa gggtgagaat atactccccc aagataatca tggaaaatcg taaaaccagg aacgtacccc ctgccagagt cttcagctcg ccaaaactga accttgtgac acaactgcta aataggtttg tgtcttcact caagtatgtt ttaattattg ttatcaatca atgcaaaaaa taaagaaaat acctcaagca ctcaagaaac atgtataagc aaaacatagt agatatacag gaaagctatt tgcatgttta aatctctctg taataaaggc agaatctgaa aaaagttcga gccttcaatc aagtacaagt tagtgaaggt attaagccct atcaggatct acagtctcct attatctcaa tggaaaaatg aacaggttta aaatcagatg aactaaatca aactttcatc atttgaatct tccagtttta tggtggatgg accagcaaag caataggtca aagcacttgg tgaaaaagca taaagaaaac tcccacaaat gactctaatt tgaggactgt ggtgattgac ggcaaaacaa cctgaactcc acaaaataat attcagttct gactcctttt gccatctcag cagcacagaa atctgtttaa tatagacatt attcttgtta ggtcttattt tgtacagtat cttgtcttaa tttctagatt aaatgttttt gaacctatca tcaggctatg agttctctca tccgcaatgc cccagaaata agaccagatt caggaaggtg tctagacaag ggatcaccat ccacgaattc agtaaaggaa tctaattcag tctcgaggca cctgtttcta caaacagcca gttgccaggc agagattcga ggccgaaact cttccaagga tcatatacat tccaagaatg aataatggta agtggaagtg aaagaagctc ctttctccat agtccttccc cgaaaactcc cgccatgata ggaacctgga agaagaactg aaaagtgagg caagtatccg agtacttctc tatcaaatgg cccattaaca agtgtttcag aatgtgggta tttattcagg cctgtccctg agcagctcaa aattacaacc atcccaactc tccagtggaa aagagaggaa ttgtttcaaa gagggttttt tgggaggcac gttttacatg aataatgaac ataaactgac gt aagagactga ctcctaaatc gttctcttag caaaaaagaa tgggtggcat cagaacatgg caaattccat cttcgtctga ttcatcttac taaaaccagg tcaaaggagg aaatttcagg ggacaatgat aaaaaggccc ccacttctcc agacatccca ccccttcaag caatttcccc catcatcccc ctccaggtag ccagtagtat atggagccaa aatctgatag caagcccaac catctagacc ttcctgatat cacctaatct ttgcacggtc aacgtgagca gaagttcatc atgaaaaaca caaaaggaac agaccgtttc cacctgctgt atcctagatc aaaaggcaaa atggcagtgt tggatgcccc tatcagagac gcaaacacag caagccctag cagtgaataa cccaaagtcc gaatgaaact tgaaacttta gttctggaag tcttgatggt tatttaaagt actacagata taaacttaca gccccctgac atttcatgtt tattgactct aaagccttca attaggtgaa tctatcccct agtaagtagt ttcagattcc acctgatcaa ggagaaaagt aaaaaaagtt ccaaatgaaa tcatattcca accccttaag tagaggagcc aataggtggg acctgcccag tggtagaaat tagtactgct acagatgagc tccaagaagt taaaaaggta atcagaaaga cttaagaaga agcttctccc gtctctatcc cagtcccact tcattctgaa cagcaaacat ttcaattctt tgtgaactct atggagaaaa ctcaggtgct ttctaaaaca tggaagatct tccaaacatt tcccatgcgt tgaccaaaaa taatgaaagt ttcacctagt gaaaagcagc caacacaaag taagcgccat aagaaaattc aaagactgaa ccatatttga taggaaaaaa agcacccatc gaaaatatga tcagggaaaa PHỤ LỤC 2: PROTEIN APC >AAA03586.1 Trình tự protein APC với 2843 acid amin – sản phẩm gen APC Phần gạch phần đề tài khảo sát (từ codon 653 đến codon 1601) phần in đậm phần hotspot (từ codon 998 đến codon 1467) MAAASYDQLL KQVEALKMEN SNLRQELEDN SNHLTKLETE ASNMKEVLKQ LQGSIEDEAM 61 ASSGQIDLLE RLKELNLDSS NFPGVKLRSK MSLRSYGSRE GSVSSRSGEC SPVPMGSFPR 121 RGFVNGSRES TGYLEELEKE RSLLLADLDK EEKEKDWYYA QLQNLTKRID SLPLTENFSL 181 QTDMTRRQLE YEARQIRVAM EEQLGTCQDM EKRAQRRIAR IQQIEKDILR IRQLLQSQAT 241 EAERSSQNKH ETGSHDAERQ NEGQGVGEIN MATSGNGQGS TTRMDHETAS VLSSSSTHSA 301 PRRLTSHLGT KVEMVYSLLS MLGTHDKDDM SRTLLAMSSS QDSCISMRQS GCLPLLIQLL 361 HGNDKDSVLL GNSRGSKEAR ARASAALHNI IHSQPDDKRG RREIRVLHLL EQIRAYCETC 421 WEWQEAHEPG MDQDKNPMPA PVEHQICPAV CVLMKLSFDE EHRHAMNELG GLQAIAELLQ 481 VDCEMYGLTN DHYSITLRRY AGMALTNLTF GDVANKATLC SMKGCMRALV AQLKSESEDL 541 QQVIASVLRN LSWRADVNSK KTLREVGSVK ALMECALEVK KESTLKSVLS ALWNLSAHCT 601 ENKADICAVD GALAFLVGTL TYRSQTNTLA IIESGGGILR NVSSLIATNE DHRQILRENN 661 CLQTLLQHLK SHSLTIVSNA CGTLWNLSAR NPKDQEALWD MGAVSMLKNL IHSKHKMIAM 721 GSAAALRNLM ANRPAKYKDA NIMSPGSSLP SLHVRKQKAL EAELDAQHLS ETFDNIDNLS 781 PKASHRSKQR HKQSLYGDYV FDTNRHDDNR SDNFNTGNMT VLSPYLNTTV LPSSSSSRGS 841 LDSSRSEKDR SLERERGIGL GNYHPATENP GTSSKRGLQI STTAAQIAKV MEEVSAIHTS 901 QEDRSSGSTT ELHCVTDERN ALRRSSAAHT HSNTYNFTKS ENSNRTCSMP YAKLEYKRSS 961 NDSLNSVSSS DGYGKRGQMK PSIESYSEDD ESKFCSYGQY PADLAHKIHS ANHMDDNDGE 1021 LDTPINYSLK YSDEQLNSGR QSPSQNERWA RPKHIIEDEI KQSEQRQSRN QSTTYPVYTE 1081 STDDKHLKFQ PHFGQQECVS PYRSRGANGS ETNRVGSNHG INQNVSQSLC QEDDYEDDKP 1141 TNYSERYSEE EQHEEEERPT NYSIKYNEEK RHVDQPIDYS LKYATDIPSS QKQSFSFSKS 1201 SSGQSSKTEH MSSSSENTST PSSNAKRQNQ LHPSSAQSRS GQPQKAATCK VSSINQETIQ 1261 TYCVEDTPIC FSRCSSLSSL SSAEDEIGCN QTTQEADSAN TLQIAEIKEK IGTRSAEDPV 1321 SEVPAVSQHP RTKSSRLQGS SLSSESARHK AVEFSSGAKS PSKSGAQTPK SPPEHYVQET 1381 PLMFSRCTSV SSLDSFESRS IASSVQSEPC SGMVSGIISP SDLPDSPGQT MPPSRSKTPP 1441 PPPQTAQTKR EVPKNKAPTA EKRESGPKQA AVNAAVQRVQ VLPDADTLLH FATESTPDGF 1501 SCSSSLSALS LDEPFIQKDV ELRIMPPVQE NDNGNETESE QPKESNENQE KEAEKTIDSE 1561 KDLLDDSDDD DIEILEECII SAMPTKSSRK AKKPAQTASK LPPPVARKPS QLPVYKLLPS 1621 QNRLQPQKHV SFTPGDDMPR VYCVEGTPIN FSTATSLSDL TIESPPNELA AGEGVRGGAQ 1681 SGEFEKRDTI PTEGRSTDEA QGGKTSSVTI PELDDNKAEE GDILAECINS AMPKGKSHKP 1741 FRVKKIMDQV QQASASSSAP NKNQLDGKKK KPTSPVKPIP QNTEYRTRVR KNADSKNNLN 1801 AERVFSDNKD SKKQNLKNNS KDFNDKLPNN EDRVRGSFAF DSPHHYTPIE GTPYCFSRND 1861 SLSSLDFDDD DVDLSREKAE LRKAKENKES EAKVTSHTEL TSNQQSANKT QAIAKQPINR 1921 GQPKPILQKQ STFPQSSKDI PDRGAATDEK LQNFAIENTP VCFSHNSSLS SLSDIDQENN 1981 NKENEPIKET EPPDSQGEPS KPQASGYAPK SFHVEDTPVC FSRNSSLSSL SIDSEDDLLQ 2041 ECISSAMPKK KKPSRLKGDN EKHSPRNMGG ILGEDLTLDL KDIQRPDSEH GLSPDSENFD 2101 WKAIQEGANS IVSSLHQAAA AACLSRQASS DSDSILSLKS GISLGSPFHL TPDQEEKPFT 2161 SNKGPRILKP GEKSTLETKK IESESKGIKG GKKVYKSLIT GKVRSNSEIS GQMKQPLQAN 2221 MPSISRGRTM IHIPGVRNSS SSTSPVSKKG PPLKTPASKS PSEGQTATTS PRGAKPSVKS 2281 ELSPVARQTS QIGGSSKAPS RSGSRDSTPS RPAQQPLSRP IQSPGRNSIS PGRNGISPPN 2341 KLSQLPRTSS PSTASTKSSG SGKMSYTSPG RQMSQQNLTK QTGLSKNASS IPRSESASKG 2401 LNQMNNGNGA NKKVELSRMS STKSSGSESD RSERPVLVRQ STFIKEAPSP TLRRKLEESA 2461 SFESLSPSSR PASPTRSQAQ TPVLSPSLPD MSLSTHSSVQ AGGWRKLPPN LSPTIEYNDG 2521 RPAKRHDIAR SHSESPSRLP INRSGTWKRE HSKHSSSLPR VSTWRRTGSS SSILSASSES 2581 SEKAKSEDEK HVNSISGTKQ SKENQVSAKG TWRKIKENEF SPTNSTSQTV SSGATNGAES 2641 KTLIYQMAPA VSKTEDVWVR IEDCPINNPR SGRSPTGNTP PVIDSVSEKA NPNIKDSKDN 2701 QAKQNVGNGS VPMRTVGLEN RLNSFIQVDA PDQKGTEIKP GQNNPVPVSE TNESSIVERT 2761 PFSSSSSSKH SSPSGTVAAR VTPFNYNPSP RKSSADSTSA RPSQIPTPVN NNTKKRDSKT 2821 DSTESSGTQS PKRHSGSYLV TSV ... lý sớm trước ung thư xuất hiện, thực đề tài ? ?Nghiên cứu phát biến đổi gen ung thư đại trực tràng? ??, tập trung vào nghiên cứu đột biến dòng mầm gen APC bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa polyp... phổ biến 70-80 Hầu hết ung thư đại trực tràng có liên quan đến yếu tố ngoại sinh, số di truyền Ung thư đại tràng xích ma trực tràng chiếm 50% trường hợp ung thư đại trực tràng Ung thư đại tràng. .. đề tài nghiên cứu đột biến gen ung thư đại trực tràng cơng bố Vì vậy, để đánh giá nguy ung thư đại trực tràng thể đa polyp tuyến gia đình người thân gia đình bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể

Ngày đăng: 17/04/2014, 13:05

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo Loại Chi tiết
1. Nguyễn Bá Đức (2000), Hóa chất điều trị bệnh ung thư, NXB Y học, Hà nội: 87-94 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nguyễn Bá Đức (2000), Hóa chất điều trị bệnh ung thư, "NXB Y học
Tác giả: Nguyễn Bá Đức
Nhà XB: NXB Y học"
Năm: 2000
2. Hiệp Hội quốc tế chống ung thư (1995), Cẩm nang ung bướu học lâm sàng tập I, II, xuất bản lần thứ 6, NXB Y học, Hà Nội, tr.177-181: 475- 493 Sách, tạp chí
Tiêu đề: NXB Y học
Tác giả: Hiệp Hội quốc tế chống ung thư
Nhà XB: NXB Y học"
Năm: 1995
3. Nguyễn Văn Hiếu (2007), Ung thư đại tràng, Chẩn đoán và điều trị bệnh ung thư, NXB Y học, Hà Nội: 223 - 236 Sách, tạp chí
Tiêu đề: NXB Y học
Tác giả: Nguyễn Văn Hiếu
Nhà XB: NXB Y học"
Năm: 2007
4. Phạm Đức Huấn (2006), Ung thư đại tràng, Bệnh học ngoại khoa, tập I (sau đại học). NXB Y học, Hà Nội: 249 - 258 Sách, tạp chí
Tiêu đề: NXB Y học
Tác giả: Phạm Đức Huấn
Nhà XB: NXB Y học"
Năm: 2006
5. Tạ Long (1992), Ung thư đại tràng, Bài giảng bệnh học nội khoa sau đại học tập II, Học viện Quân Y, Hà Nội: 75 - 81 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Học viện Quân Y
Tác giả: Tạ Long
Năm: 1992
6. Hoàng Gia Lợi (1995), Các khối u ruột non và đại tràng, Bài giảng bệnh học nội tiêu hoá, Học viện Quân Y, Hà Nội: 215 - 225 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Học viện Quân Y
Tác giả: Hoàng Gia Lợi
Năm: 1995
7. Lê Đình Roanh (2001), Bệnh học các khối u, NXB y học, Hà Nội Sách, tạp chí
Tiêu đề: NXB y học
Tác giả: Lê Đình Roanh
Nhà XB: NXB y học"
Năm: 2001
9. Đỗ Đức Vân (2006), Polyp đại tràng, Triệu chứng học ngoại khoa, NXB y học, Hà Nội: 187-191 Sách, tạp chí
Tiêu đề: NXB y học
Tác giả: Đỗ Đức Vân
Nhà XB: NXB y học"
Năm: 2006
10. Hồ Huỳnh Thùy Dương (1998), Các phương pháp lai phân tử, Sinh học phân tử, NXB Giáo dục: 149-162 Sách, tạp chí
Tiêu đề: NXB Giáo dục
Tác giả: Hồ Huỳnh Thùy Dương
Nhà XB: NXB Giáo dục": 149-162
Năm: 1998
11. Võ Thị Hương Lan (2002), ADN tái tổ hợp, Sinh học phân tử, NXB Đại học Quốc gia Hà Nội: 139-170 Sách, tạp chí
Tiêu đề: NXB Đại học Quốc gia
Tác giả: Võ Thị Hương Lan
Nhà XB: NXB Đại học Quốc gia "Hà Nội: 139-170
Năm: 2002
12. Lê Đình Lương (2001), “Chọn lọc, sàng lọc và phân tích các thể tái tổ hợp”, Nguyên lý kỹ thuật di truyền, NXBKhoa học và kỹ thuật: 118-130 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Chọn lọc, sàng lọc và phân tích các thể tái tổ hợp”, Nguyên lý kỹ thuật di truyền, "NXBKhoa học và kỹ thuật
Tác giả: Lê Đình Lương
Nhà XB: NXBKhoa học và kỹ thuật": 118-130
Năm: 2001
13. Khất Hữu Thanh (2006), “Một số phương pháp cơ bản sử dụng trong kỹ thuật gen”, Cơ sở di truyền phân tử và kỹ thuật gen, Nhà xuất bản Khoa học và kỹ thuật: 137-64 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Một số phương pháp cơ bản sử dụng trong kỹ thuật gen”, "Cơ sở di truyền phân tử và kỹ thuật gen
Tác giả: Khất Hữu Thanh
Nhà XB: Nhà xuất bản Khoa học và kỹ thuật: 137-64
Năm: 2006
14. Phạm Hùng Vân (2009), “Real-time PCR- Các vấn đề cơ bản”, PCR và real- time PCR – Các vấn đề cơ bản và các áp dụng thường gặp, Nhà xuất bản Y học: 34-59 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Real-time PCR- Các vấn đề cơ bản”, "PCR và real-time PCR – Các vấn đề cơ bản và các áp dụng thường gặp
Tác giả: Phạm Hùng Vân
Nhà XB: Nhà xuất bản Y học: 34-59
Năm: 2009
15. Ahmed, Y., Nouri, A. and Wieschaus, E. (2002). Drosophila Apc1 and Apc2 regulate Wingless transduction throughout development. Development 129, 1751-1762 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Drosophila" Apc1 and Apc2 regulate Wingless transduction throughout development. "Development
Tác giả: Ahmed, Y., Nouri, A. and Wieschaus, E
Năm: 2002
16. Akiyama, T. and Kawasaki, Y. (2006). Wnt signalling and the actin cytoskeleton. Oncogene 25, 7538-7544 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Oncogene
Tác giả: Akiyama, T. and Kawasaki, Y
Năm: 2006
17. Andrzej Plawski, Ryard Slomski (2008). APC gene mutations causing familial adenomatous polyposis in Polish patients. J Appl Genet 49 (4): 407- 414 Sách, tạp chí
Tiêu đề: J Appl Genet
Tác giả: Andrzej Plawski, Ryard Slomski
Năm: 2008
18. Aoki K, Aoki M, Sugai M, Harada N, Miyoshi H, Tsukamoto T, Mizoshita T, Tatematsu M, Seno H, Chiba T et al (2007). Chromosomal instability by -catenin/TCF transcription in APC or -catenin mutant cells. Oncogene 26:3511-3520 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Oncogene
Tác giả: Aoki K, Aoki M, Sugai M, Harada N, Miyoshi H, Tsukamoto T, Mizoshita T, Tatematsu M, Seno H, Chiba T et al
Năm: 2007
19. Barker N and Clevers H (2006). Mining the Wnt pathway for cancer therapeutics. Nat Rev Drug Discov 5: 997-1014 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nat Rev Drug Discov
Tác giả: Barker N and Clevers H
Năm: 2006
20. Beroud C and Soussi T (1996). APC gene: database of germline and somatic mutations in human tumors and cell lines. Nucleic Acids Res; 24: 121-124 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nucleic Acids Res
Tác giả: Beroud C and Soussi T
Năm: 1996
21. Bienz M (2002). The subcellular destinations of APC proteins. Nat Rev Mol Cell Biol 3: 328-338 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Nat Rev Mol Cell Biol
Tác giả: Bienz M
Năm: 2002

HÌNH ẢNH LIÊN QUAN

Hình 1. Hình ảnh đa polyp tuyến gia đình đại trực tràng - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Hình 1. Hình ảnh đa polyp tuyến gia đình đại trực tràng (Trang 15)
Hình 2:  Cấu trúc của protein APC. Protein APC gồm 6 vùng chức năng chính là: vùng  Armadillo, vùng lặp lại 15 aa, vùng lặp lại 20 aa, vùng cơ bản, vùng gắn EB1 và vùng gắn  axin  (Fearnhead NS và cộng sự [26]) - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Hình 2 Cấu trúc của protein APC. Protein APC gồm 6 vùng chức năng chính là: vùng Armadillo, vùng lặp lại 15 aa, vùng lặp lại 20 aa, vùng cơ bản, vùng gắn EB1 và vùng gắn axin (Fearnhead NS và cộng sự [26]) (Trang 18)
Hình 3:  Sự liên quan giữa kiểu đột biến gen APC và kiểu hình của đa polyp tuyến gia đình  (FAP) - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Hình 3 Sự liên quan giữa kiểu đột biến gen APC và kiểu hình của đa polyp tuyến gia đình (FAP) (Trang 20)
Hình 4. Các vùng chức năng  đa dạng của protein APC và các đột biến cắt ngắn gây nên sự  mất chức năng của nó, dẫn đến sự tạo thành các polyp và ung thư đại trực tràng - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Hình 4. Các vùng chức năng đa dạng của protein APC và các đột biến cắt ngắn gây nên sự mất chức năng của nó, dẫn đến sự tạo thành các polyp và ung thư đại trực tràng (Trang 23)
Hình : sơ đồ kỹ thuật PCR sử dụng 6 cặp mồi khác nhau  để  khuyếch đại exon 15 của gen APC - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
nh sơ đồ kỹ thuật PCR sử dụng 6 cặp mồi khác nhau để khuyếch đại exon 15 của gen APC (Trang 37)
Hình 3.1. Kỹ thuật PCR khuếch đại đoạn gen 1A ở exon 15 của gen APC - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Hình 3.1. Kỹ thuật PCR khuếch đại đoạn gen 1A ở exon 15 của gen APC (Trang 50)
Hình 3.2. Hình ảnh kết quả giải trình tự đột biến cài thêm (insert) 4 nucleotid - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Hình 3.2. Hình ảnh kết quả giải trình tự đột biến cài thêm (insert) 4 nucleotid (Trang 51)
Hình 3.4. Kỹ thuật PCR khuếch đại đoạn gen 2 ở exon 15 của gen APC - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Hình 3.4. Kỹ thuật PCR khuếch đại đoạn gen 2 ở exon 15 của gen APC (Trang 52)
Hình 3.5. Hình ảnh giải trình tự đột biến xóa 1 nucleotid 3407delA ở gia đình - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Hình 3.5. Hình ảnh giải trình tự đột biến xóa 1 nucleotid 3407delA ở gia đình (Trang 53)
Hình 3.6. Kỹ thuật PCR khuếch đại đoạn gen 3C ở - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Hình 3.6. Kỹ thuật PCR khuếch đại đoạn gen 3C ở (Trang 54)
Hình 3.9. Hình ảnh giải trình tự đột biến xóa 2 nucleotid 4144-4145delAT ở gia - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Hình 3.9. Hình ảnh giải trình tự đột biến xóa 2 nucleotid 4144-4145delAT ở gia (Trang 55)
Hình 3.10. Hình ảnh giải trình tự đột biến cài thêm 2 nucleotid - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Hình 3.10. Hình ảnh giải trình tự đột biến cài thêm 2 nucleotid (Trang 56)
Hình 3.11. Kỹ thuật PCR khuếch đại đoạn gen 2B ở exon 15 - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Hình 3.11. Kỹ thuật PCR khuếch đại đoạn gen 2B ở exon 15 (Trang 57)
Hình 3.12. Hình ảnh giải trình tự đột biến  thay thế  1 nucleotid 3587G>T ở gia  đình số 11 (dị hợp tử) - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Hình 3.12. Hình ảnh giải trình tự đột biến thay thế 1 nucleotid 3587G>T ở gia đình số 11 (dị hợp tử) (Trang 57)
Bảng 3.2. Tổng hợp những đột biến trên exon 15 của gen APC ở các thành viên - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Bảng 3.2. Tổng hợp những đột biến trên exon 15 của gen APC ở các thành viên (Trang 58)
Bảng 3.4. Tỷ lệ các thành viên gia đình bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Bảng 3.4. Tỷ lệ các thành viên gia đình bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa (Trang 60)
Bảng 3.3. Bảng phân bố vị trí các đột biến ở 15 gia đình bệnh nhân ung thư đại - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Bảng 3.3. Bảng phân bố vị trí các đột biến ở 15 gia đình bệnh nhân ung thư đại (Trang 60)
Bảng 3.5. Tỷ lệ các thành viên gia đình bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa - Nghiên Cứu Phát Hiện Biến Đổi Gen Trong Ung Thư Đại Trực Tràng
Bảng 3.5. Tỷ lệ các thành viên gia đình bệnh nhân ung thư đại trực tràng thể đa (Trang 61)

TỪ KHÓA LIÊN QUAN

TRÍCH ĐOẠN

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w