BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƢỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHỆ TP HỒ CHÍ MINH ĐỒ ÁN TỐT NGHIỆP SÀNG LỌC CHỦNG VI KHUẨN QUANG DƢỠNG TÍA CÓ KHẢ NĂNG HẤP THU MUỐI Ngành CÔNG NGHỆ SINH HỌC Chuyên ngành CÔNG NGHỆ SINH HỌ[.]
BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƢỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHỆ TP HỒ CHÍ MINH ĐỒ ÁN TỐT NGHIỆP SÀNG LỌC CHỦNG VI KHUẨN QUANG DƢỠNG TÍA CĨ KHẢ NĂNG HẤP THU MUỐI Ngành: CÔNG NGHỆ SINH HỌC Chuyên ngành: CƠNG NGHỆ SINH HỌC Giảng viên hƣớng dẫn : Ths.Ngơ Đức Duy Sinh viên thực MSSV: 1611100121 : Nguyễn Thị Diễm My Lớp: 16DSHA2 TP Hồ Chí Minh, 2020 LỜI CAM ĐOAN Đồ án tốt nghiệp thực Viện Sinh học Nhiệt Đới cơng trình nghiên cứu thân dƣới hƣớng dẫn Thạc sĩ Ngô Đức Duy Những số liệu kết phân tích đề tài hồn tồn trung thực, khơng chép từ nguồn tài liệu tham khảo khác dƣới hình thức Một số nội dung đồ án tốt nghiệp có tham khảo sử dụng liệu trích dẫn đƣợc cơng bố công khai báo khoa học, website, tác phẩm theo danh mục tài liệu tham khảo đồ án Nếu có chép khơng trung thực báo này, ngƣời thực đề tài xin hoàn toàn chịu trách nhiệm trƣớc Viện Khoa học Ứng dụng Hutech trƣớc ban giám hiệu trƣờng Đại học Cơng nghệ Thành phố Hồ Chí Minh Ngày … tháng … năm 2020 Sinh viên thực Nguyễn Thị Diễm My LỜI CẢM ƠN Trong thời gian thực đề tài Viện Sinh Học Nhiệt Đới, đƣợc hƣớng dẫn tận tình Thầy Cơ, anh chị bạn, tơi hồn thành tốt đồ án Xin chân thành gửi lời biết ơn đến: ThS Ngơ Đức Duy, phịng Vi Sinh ứng dụng, Viện Sinh Học Nhiệt Đới, Viện Hàn Lâm Khoa Học Công Nghệ Việt Nam giảng dạy, giúp đỡ, tạo điều kiện sở vật chất, trang thiết bị, hóa chất cho tơi suốt thời gian thực đề tài Xin chân thành cảm ơn chị Dƣơng Thị Hồng Đào, tận tình giúp đỡ, hƣớng dẫn truyền đạt kinh nghiệm quý báu suốt thời gian vừa qua Anh Nguyễn Hoàng Dũng cán phụ trách phòng vi sinh ứng dụng, trình thực đề tài quan tâm giúp đỡ tạo điều kiện cho tơi hồn thành cơng việc Xin chân thành cảm ơn đến quý Thầy, Cô Viện Khoa học Ứng dụng, Trƣờng Đại học Công nghệ Thành phố Hồ Chí Minh cho tơi tiếp nhận kiến thức đầu nguồn để thực tốt đồ án tốt nghiệp Cảm ơn bạn lớp 16DSHA2 đồng hành suốt thời gian học tập thực đề tài Cuối cùng, xin cảm ơn Ba Mẹ ni nấng, chăm sóc, hỗ trợ tơi mặt tinh thần, tài chính, tạo điều kiện cho học tập trở thành ngƣời có ích cho xã hội Đồ án tốt nghiệp MỤC LỤC MỤC LỤC DANH MỤC VIẾT TẮT DANH MỤC BẢNG DANH MỤC HÌNH ẢNH MỞ ĐẦU .8 Tính cấp thiết đề tài Tình hình nghiên cứu 2.1 Tình hình nghiên cứu giới .9 2.2 Tình hình nghiên cứu nƣớc 10 Mục đích nghiên cứu 11 Nhiệm vụ nghiên cứu 11 Phƣơng pháp nghiên cứu 11 Các kết đạt đƣợc .11 Kết cấu đồ án tốt nghiệp .12 CHƢƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 13 1.1 Tình hình xâm nhập mặn Việt Nam hƣớng giải 13 1.1.1 Tình hình xâm nhập mặn Việt Nam 13 1.1.2 Nguyên nhân gây xâm nhập mặn .14 1.1.3 Các cách khắc phục xâm nhập mặn 14 1.2 Các chế khử muối 16 1.2.1 Cơ chế khử muối tự nhiên .16 Đồ án tốt nghiệp 1.2.2 Cơ chế khử muối thực vật 17 1.2.3 Cơ chế khử muối động vật .18 1.2.4 Cơ chế khử muối vi sinh vật 18 1.3 Tổng quan nhóm vi khuẩn quang dƣỡng 19 1.3.1 Giới thiệu chung vi khuẩn quang dƣỡng 19 1.3.2 Vi khuẩn quang dƣỡng tía 21 1.3.3 Vi khuẩn quang dƣỡng tía khơng lƣu huỳnh 22 1.3.4 Các yếu tố ảnh hƣởng đến sinh trƣởng vi khuẩn quang dƣỡng 23 1.3.5 Ứng dụng vi khuẩn quang hợp .23 1.4 Định danh phƣơng pháp sinh học phân tử 24 1.4.1 Phƣơng pháp ly trích DNA vi sinh vật 25 1.4.2 PCR định danh vi sinh vật 25 1.4.2.1 Kỹ thuật PCR (Polymerase Chain Reaction) 25 1.4.2.2 Ribosome DNA (rDNA) 26 1.4.2.3 Mồi 26 1.4.2.4 Ứng dụng PCR trình định danh loài vi sinh vật .27 1.4.3 Xây dựng phát sinh loài 28 CHƢƠNG 2: VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 29 2.1 Thời gian địa điểm nghiên cứu 29 2.2 Vật liệu nghiên cứu 29 2.3 Phƣơng pháp nghiên cứu .30 2.3.1 Phƣơng pháp phân lập làm 30 2.3.2 Phƣơng pháp nhuộm Gram hình thái .31 Đồ án tốt nghiệp 2.3.3 Phƣơng pháp sàng lọc chủng vi khuẩn chịu mặn 31 2.3.4 Phƣơng pháp bảo quản giống 31 2.3.5 Phƣơng pháp sàng lọc chủng vi khuẩn hấp thu mặn 32 2.3.6 Phƣơng pháp định danh sinh học phân tử 33 2.3.6.1 Tách chiết DNA 33 2.3.6.2 Phản ứng Polymerase Chain Reaction (PCR) 33 2.3.6.3 Tinh sản phẩm PCR kit The QIAquick PCR Purification 34 2.3.6.4 Điện di kiểm tra sản phẩm ly trích DNA, sản phẩm PCR, sản phẩm tinh gel agarose 34 2.3.7 Các phần mềm sử dụng 35 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ BIỆN LUẬN 35 3.1 Kết phân lập làm 36 3.2 Kết nhuộm Gram hình thái học 39 3.3 Kết sàng lọc chủng vi khuẩn chịu mặn 40 3.4 Kết sàng lọc sơ chủng khả hấp thu NaCl .48 3.5 Kết định danh sinh học phân tử 50 3.5.1 Ly trích, thu nhận DNA 50 3.5.2 Phản ứng PCR 51 3.5.3 Tinh 52 3.5.4 Xác định trình tự DNA - so sánh với ngân hàng liệu NCBI công cụ BLAST 52 CHƢƠNG 4: KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 55 4.1 Kết Luận 55 Đồ án tốt nghiệp 4.2 Kiến Nghị .56 TÀI LIỆU THAM KHẢO 57 Tài liệu tiếng Việt 57 Tài liệu tiếng Anh 57 PHỤ LỤC A: MỘT SỐ ĐỊA ĐIỂM THU MẪU PHỤ LỤC B: THÔNG SỐ CƠ BẢN MẪU NƢỚC, BÙN PHỤ LỤC C: KẾT QUẢ PHÂN LẬP VÀ LÀM THUẦN 15 PHỤ LỤC D: TRÌNH TỰ VÙNG GENE 16S rDNA CỦA CÁC CHỦNG VI KHUẨN 19 Đồ án tốt nghiệp DANH MỤC VIẾT TẮT BIM Basic Isolation Media bp base pair CTAB Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide DNA Deoxyribonucle acid ĐBSCL Đồng sông Cửu Long ED Electrodialysisi EDTA Taq thermus aquaticus FO Forward Osmosis GM Glutamate - Malate IC Ion Exchange ICM Intracytoplasmic Membrane MSF Multistage flash distillation NCBI National Center for Biotechnology Information NTP 3’ - Deoxyribonucleoside - 5’ - Triphosphate NSSW Nutrient Supplemented SeaWater OD Optical Density PCR Polymerase Chain Reaction PHB Polyhydroxybutyrate RC Reaction Center RO Reverse Osmosis TAE Tris acetate TMAO Trimethylamine N-oxide UV Ultraviolet (light) VCD Vapor Compression Distillation VKQD Vi Khuẩn Quang Dƣỡng Đồ án tốt nghiệp DANH MỤC BẢNG Bảng 1.1 Các tính chất vi khuẩn quang hợp 20 Bảng 1.2 Một số đặc điểm vi khuẩn tía 21 Bảng 1.3 Các trình tự gene đoạn mồi 16S rDNA 27 Bảng 2.1 Các thành phần môi trƣờng BIM agar 29 Bảng 2.2 Các trình tự gene đoạn mồi 16S rRNA 30 Bảng 2.3 Thành phần phản ứng PCR vùng gene 16S rDNA 33 Bảng 3.1 Các thông số mẫu nƣớc, bùn thu đƣợc Tiền Giang, Cần Giờ, Cà Mau, Sóc Trăng (Phụ lục B) 36 Bảng 3.2 Đặc điểm hình thái khuẩn lạc nhóm chủng vi khuẩn đại diện 38 Bảng 3.3 Kết nhuộm gram nhóm đại diện 39 Bảng 3.4 Giá trị OD660nm chủng vi khuẩn quang dƣỡng sau ngày nồng độ 25‰ 45 Bảng 3.5 Giá trị OD660nm chủng vi khuẩn quang dƣỡng sau ngày nồng độ 25‰ 46 Bảng 3.6 Giá trị OD660nm chủng vi khuẩn quang dƣỡng sau ngày nồng độ 25‰ 47 Bảng 3.7 Giá trị OD660nm mật độ tế bào (cfu/ml) chủng vi khuẩn sau 48h49 Đồ án tốt nghiệp DANH MỤC HÌNH ẢNH Hình 1.1 Cơ chế dung nạp muối thực vật: hình thành tinh thể Avicennia geminans (A) Atriplex (B) 17 Hình 1.2 Cơ chế hấp thu Na+ thông qua hệ thống bơm ion màng (Halorhodosin) nhờ ánh sáng mặt trời vi sinh vật 18 Hình 2.1 Chu trình nhiệt phản ứng PCR vùng gene 16S rDNA dựa cặp mồi 27F/1492R 34 Hình 3.1 Kết số mẫu bùn, nƣớc thu đƣợc Cần Giờ, Cà Mau, Sóc Trăng Tiền Giang 36 Hình 3.2 Kết tăng sinh số chủng vi khuẩn mơi trƣờng BIM 37 Hình 3.3 Kết phân lập số chủng vi khuẩn môi trƣờng BIM agar sau ngày nuôi cấy 38 Hình 3.4 Kết làm số chủng vi khuẩn môi trƣờng BIM agar sau ngày quan sát 39 Hình 3.5 Kết hình Gram số chủng VKQD gram âm (-) quan sát dƣới vật kính 100X 40 Hình 3.6 Kết hình bảo quản giống phƣơng pháp đông khô 40 Hình 3.7 Kết khảo sát khả chịu mặn chủng CG3.1 41 Hình 3.8 Kết khảo sát khả chịu mặn chủng CM37 42 Hình 3.9 Kết khảo sát khả chịu mặn chủng CM53.2 43 Hình 3.10 Kết khảo sát khả chịu mặn chủng ST23 44 Hình 3.11 Nồng độ NaCl chủng vi khuẩn sau ngày quan sát 49 Hình 3.15 Cây phân loại dựa phân tích trình tự vùng gene 16S rDNA chủng CM53.2, ST23, CG2.1, CG3.1, TG8, CM8D, CM37 với số chủng ngân hàng NCBI 54 Đồ án tốt nghiệp 14 17.8 28.3 28.6 35 28.6 7.57 Bùn:6.40 Nƣớc:7.27 15 17.7 28.1 28.5 35.1 28.5 7.64 Bùn:6.62 Nƣớc:7.26 16 14.4 28.5 23.6 42.4 23.6 7.71 Bùn:7.38 Nƣớc:6.94 17 15.5 27.7 24.8 40 24.8 7.69 18 17.1 28 27.6 36.3 27.6 7.57 19 17.4 27.6 35.7 28 7.52 20 14.7 27.3 24 41.7 24 21 2.5 28 29 34.6 28.9 22 26.9 28.8 27.3 36.7 27.3 7.08 23 23.8 28 37.3 26.8 37.8 7.63 24 26.8 28.1 20.7 48 20.7 7.62 25 12.5 28.1 20.7 48.3 20.7 7.7 26 14.2 28.5 23.3 42.9 23.3 6.77 27 12.9 27.3 21.3 47.1 21.2 6.96 28 9.4 27.8 16.07 6.2 16.14 6.67 29 13.3 28.1 22 45.5 22 6.98 30 7.3 27.8 16.65 79.4 12.58 6.88 31 17 28.1 27.4 36.5 27.3 7.2 32 15.5 28.4 25.2 39.7 25.2 7.62 33 20 28.2 31.9 31.3 31.9 7.65 34 18.5 28.2 29.6 33.7 29.6 7.61 Đồ án tốt nghiệp 35 20.44 28.2 32.4 30.8 32.4 7.63 37 13.8 28.3 22.7 44 22.7 7.67 38 13.6 28.3 22.9 44.3 22.9 7.42 39 18.3 28.3 29.5 33.9 29.5 40 19.8 28.3 31.5 31.7 31.5 7.43 41 20.6 28.3 32.7 30.6 32.7 7.21 42(H20) 23.1 28.3 36.3 27.6 36.3 6.9 42(Bùn) 14.5 28.3 23.9 41.8 23.9 6.72 43 18 28.4 29 34.5 29 44 23 28.7 36.1 27.7 36.1 45 18.7 28.3 30.1 33.3 30.1 7.2 46 17.3 28.6 28.8 34.7 28.9 7.37 47 17 28.3 28.5 35 28.5 7.32 49 16 29.3 25.9 38.6 25.9 6.86 50 14 29.5 22.7 44.1 22.7 7.08 51 13.8 29.1 22.7 44.1 22.6 7.31 52(H2O) 21.6 29.2 34.2 29.3 34.2 7.34 52(Bùn) 13.1 29.1 21.7 46.2 21.6 7.42 53 14 28.8 23 43.6 22.9 7.62 54 16.3 29.2 26.4 37.9 26.4 7.69 55 14.9 29.2 23.9 42.3 23.5 7.61 56 9.4 28.3 15.9 62.7 15.9 7.84 57(Bùn) 13.9 29.2 22.4 44.6 22.4 7.89 57(H2O) 17.6 29.6 28.3 35.3 28.3 7.89 58 18 29.3 28.9 34.6 28.9 7.91 59(H2O) 16.5 29.2 26.8 37.4 26.8 36 48 Đồ án tốt nghiệp 60(Bùn) 11.4 28.6 18.9 52.8 18.9 7.99 61(Bùn) 14 28.8 22.9 43.7 22.9 7.91 62(Bùn) 6.4 29.3 26.5 37.8 26.5 7.98 63(H2O) 17.1 29.5 27.6 36.2 27.6 63(Bùn) 11.4 29.2 19.08 52.4 19.08 7.99 64(Bùn) 28.6 13.68 73.2 13.66 8.98 65(H2O) 20.4 29.5 32.3 30.9 32.3 7.96 65(Bùn) 12.4 28.7 20.3 49.9 20.1 7.94 66(H2O) 17.4 29.3 25.1 35.6 28.1 7.91 66(Bùn) 12.4 28.8 20.4 56.1 17.7 7.93 67(Bùn) 10.6 28.8 17.7 56.3 17.7 8.01 68(Bùn) 14.2 29 23.3 42.8 23.3 8.09 69(Bùn) 9.1 29.2 15.4 64.9 15.4 8.06 70(Bùn) 10.1 29.1 17.04 58.7 17.04 8.22 71(Bùn) 13.7 28.5 22.5 44.4 22.5 8.01 71(Bùn) 12.9 29.1 25.1 44.6 25.1 7.99 CẦN GIỜ STT Sal T0 λ ρ TDS pH 5.8 31.7 10.16 98.5 10.16 4.27 1.1 5.7 31.7 10.03 99.8 10.06 5.98 5.2 31.6 9.25 108.5 9.21 7.4 2.1 5.1 31.4 9.11 109.6 9.12 6.25 3.8 31.8 6.89 145.2 6.88 6.35 3.1 3.8 31.8 6.78 147.6 6.77 6.35 4.2 31.9 7.51 133.3 7.51 7.25 4.1 4.2 32 7.49 133.3 7.51 6.86 1.7 31.9 3.14 319 3.13 7.26 10 Đồ án tốt nghiệp 5.1 1.7 32 3.18 315 3.18 7.07 2.2 31.7 4.12 243 4.1 8.85 6.1 2.4 31.8 4.49 223 4.48 6.5 2.7 31.5 5.01 199.8 5.82 6.71 7.1 31.5 5.44 183.8 5.45 6.72 3.1 31.7 5.67 177.2 5.64 6.54 8.1 3.2 31.5 5.61 178.1 5.62 6.23 3.2 31.7 5.87 170.9 5.84 6.7 9.1 3.2 31.6 5.83 171.5 5.84 6.27 10 2.7 32.1 4.9 204 4.89 6.85 10.1 2.7 32 4.89 205 4.89 6.29 11 2.8 32 5.11 195.2 5.12 3.25 11.1 2.8 32 5.13 193.3 5.17 3.12 12 32 5.52 181.3 5.51 6.8 12.1 3.1 31.9 5.66 176.8 5.66 6.37 13.1 8.2 32 13.94 71.9 13.93 6.65 13.2 8.3 32 14.09 71 14.1 6.58 14 31.9 15.31 65.2 15.34 6.6 14.1 31.2 15.22 65.8 15.21 6.61 15 10.5 31.8 15.38 65.4 15.26 6.64 15.1 9.2 31.8 15.5 64.5 15.53 6.53 16 8.2 31.4 13.94 71.8 13.94 6.81 16.1 8.2 32 13.94 71.7 13.91 6.35 18 9.4 31.9 15.87 63.2 15.85 6.69 18.1 9.3 31.9 15.77 63.4 15.77 6.41 19 2.5 31.9 4.64 216 4.64 6.83 19.1 2.5 32.6 4.71 212 4.71 6.77 20 32 32 9.63 104.3 9.58 6.22 11 Đồ án tốt nghiệp 20.1 31.6 31 9.5 105.5 9.5 6.68 22 32.4 32.4 10.51 95.1 10.51 6.85 22.1 31.8 31.8 10.54 95.1 10.51 6.51 23 31.9 31.9 12.84 77.5 19.88 6.24 23.1 32.7 32.7 11.41 87.7 11.41 6.54 24 32.3 32.3 11.36 88.1 11.35 6.76 24.1 31.8 31.8 12.76 78 12.83 6.44 25 31.9 31.9 13.24 75.1 13.3 6.66 25.1 32.6 32.6 13.07 76.5 13.12 6.4 27 3.5 32.1 6.31 158.2 6.32 6.8 27.1 3.5 32.2 6.31 158.4 6.32 6.16 28 5.5 31.8 9.65 104.4 9.58 6.87 Phèn 3.7 31.5 6.68 150.6 6.64 3.82 SÓC TRĂNG STT Sal T0 λ ρ TDS pH 2.6 32.6 4.76 211 4.74 7.38 4.3 32.7 7.62 131.7 7.61 7.49 13.9 32.6 22.8 43.8 22.8 9.16 11.8 32.2 19.59 51 19.6 7.44 5.1 9.3 31.8 15.65 64 15.62 8.81 5.2 11.8 34.2 19.44 51.5 19.42 8.08 13.4 32.7 22 45.5 22 8.24 13.7 34.7 22.4 44.6 22.4 7.58 13.9 33.5 22.7 44.1 22.6 7.74 10 9.3 33.5 15.61 64.1 15.58 9.39 11 0.3 33.1 819 1221 819 6.93 12 0.3 32.6 808 1237 807 8.91 12 Đồ án tốt nghiệp 13 0.3 34.5 810 1237 809 8.76 14 0.3 32.9 817 1225 815 7.26 15 0.6 34 1294 773 1294 8.97 16 16.6 33.6 26.8 37.3 26.8 8.44 17 8.1 34 13.66 73.3 13.64 8.72 18 9.9 34.7 16.64 60.1 16.63 7.94 19 14.7 34 23.9 42.1 23.7 20 14.9 33.1 24.1 41.7 23.9 7.83 21 16.2 32.3 26.2 38.2 26.2 8.31 22 16.2 33 26.2 38.1 26.2 6.99 23 6.1 32.4 10.64 93.9 10.66 8.97 24 11.8 34.5 19.55 51.3 19.48 8.64 25 15.4 32.6 25 40.1 25 7.74 26 15.7 32.7 25.3 39.5 25.3 7.85 27 15.1 32.3 24.4 41 24.4 7.68 28 15.1 34.2 24.4 40.9 24.4 7.56 29 12 34.5 19.8 50.5 19.78 8.44 30 15.5 33.9 25.1 39.8 25.1 7.8 31 15.4 33 25.1 39.9 25.1 7.69 32 14.7 34.3 23.7 42.2 23.7 7.41 33 14.9 32.5 24.1 41.6 24 7.56 34 16 34.3 25.7 38.9 25.7 7.8 35 16.1 34.3 26 38.5 26 8.2 36 19.1 32.2 30.5 32.8 30.5 7.25 37 19.2 34.6 30.5 32.8 30.5 6.87 38 33.2 13.62 262 23.1 8.19 39 3.6 32.8 6.41 156 6.41 8.5 40 3.6 34.2 6.37 157.2 6.36 8.25 13 Đồ án tốt nghiệp 41 4.1 34.4 7.23 138.6 7.21 8.23 42 32.2 7.2 138.8 7.2 8.12 43 34.5 7.14 140 7.14 7.44 44 4.1 32.4 7.15 139.9 7.15 7.27 45 32.1 7.1 140.9 7.1 8.02 46 33.5 7.13 140.6 7.1 8.15 47 2.4 33.6 4.51 222 4.51 9.57 48 2.5 32.2 4.6 216 4.62 7.24 14 Đồ án tốt nghiệp PHỤ LỤC C: KẾT QUẢ PHÂN LẬP VÀ LÀM THUẦN TIỀN GIANG TG29.2 TG2 TG3.1 TG3.2 TG4 TG5 TG6 TG19.1 TG8 TG9 TG14 TG19.1 15 Đồ án tốt nghiệp CÀ MAU CM1.1 CM1.2 CM1.3 CM2 CM3 CM4 CM4.2 CM5.1 CM5.2 CM6 CM7.1 CM7.2 16 Đồ án tốt nghiệp CẦN GIỜ CG6.1 CG7 CG7.1 CG8 CG8.1 CG10 CG10.1 CG10.1.1 CG10.1.2 CG11 CG11.1 CG12 17 Đồ án tốt nghiệp SÓC TRĂNG ST11 ST12 ST13.1 ST13.2 ST15 ST16 ST17.1 ST17.2 ST19 ST20 18 ST18 ST21 Đồ án tốt nghiệp PHỤ LỤC D: TRÌNH TỰ VÙNG GENE 16S rDNA CỦA CÁC CHỦNG VI KHUẨN Trình tự vùng gene chủng CG2.1 CAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAATGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCG AGCGAAGTCTTCGGACTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTGCCCTTTGCTTCG GAATAGCCCCGGGAAACTGGGAGTAATACCGAATGTGCCCTACGGGGGAAAGATTTATCGGCA AAGGATCGGCCCGCGTTGGATTAGGTAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGCCGACGATCCAT AGCTGGTTTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAG GCAGCAGTGGGGAATCTTAGACAATGGGCGCAAGCCTGATCTAGCCATGCCGCGTGATCGATG AAGGCCTTAGGGTTGTAAAGATCTTTCAGGTGGGAAGATAATGACGGTACCACCAGAAGAAGC CCCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGGGCTAGCGTTATTCGGAATTACT GGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCGGAAAGTCAGAGGTGAAATCCCAGGGCTCAACCCTGG AACTGCCTTTGAAACTCCCGATCTTGAGGTCGAGAGAGGTGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGT GAAATTCGTAGATATTCGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCTCGATACTGACG CTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACG ATGAATGCCAGTCGTCGGGCAGCATGCTGTTCGGTGACACACCTAACGGATTAAGCATTCCGCC TGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGA GCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAACCCTTGACATGGCGATCGCGGTT CCAGAGATGGTTCCTTCAGTTCGGCTGGATCGCACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCG TGTCGTGAGATGTTCGGTTAAGTCCGGCAACGAGCGCAACCCACGTCCTTAGTTGCCAGCATTC AGTTGGGCACTCTAGGGAAACTGCCGGTGATAAGCCGGAGGAAGGTGTGGATGACGTCAAGTC CTCATGGCCCTTACGGGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCAGTGACAATGGGTTAATCCCA AAAAGCTGTCTCAGTTCGGATTGGGGTCTGCAACTCGACCCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAA TCGCGTAACAGCATGACGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCAT GGGAATTGGTTCTACCCGAAGGCGGTGCGCCAACCTCGCAAGAGGAGGCAGCCGACCACGGTA GG Trình tự vùng gene chủng CG3.1 CAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAATGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCG AGCGAAGTCTTCGGACTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTGCCCTTTGCTTCG GAATAGCCCCGGGAAACTGGGAGTAATACCGAATGTGCCCTTTGGGGGAAAGATTTATCGGCA AAGGATCGGCCCGCGTTGGATTAGGTAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGCCGACGATCCAT AGCTGGTTTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAG GCAGCAGTGGGGAATCTTAGACAATGGGCGCAAGCCTGATCTAGCCATGCCGCGTGATCGATG AAGGCCTTAGGGTTGTAAAGATCTTTCAGGTGGGAAGATAATGACGGTACCACCAGAAGAAGC CCCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGGGCTAGCGTTATTCGGAATTACT GGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCGGAAAGTCAGAGGTGAAATCCCAGGGCTCAACCCTGG AACTGCCTTTGAAACTCCCGATCTTGAGGTCGAGAGAGGTGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGT GAAATTCGTAGATATTCGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCTCGATACTGACG CTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACG ATGAATGCCAGTCGTCGGGCAGCATGCTGTTCGGTGACACACCTAACGGATTAAGCATTCCGCC TGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGA GCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAACCCTTGACATGGCGATCGCGGTT CCAGAGATGGTTCCTTCAGTTCGGCTGGATCGCACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCG TGTCGTGAGATGTTCGGTTAAGTCCGGCAACGAGCGCAACCCACGTCCTTAGTTGCCAGCATTC AGTTGGGCACTCTAGGGAAACTGCCGGTGATAAGCCGGAGGAAGGTGTGGATGACGTCAAGTC CTCATGGCCCTTACGGGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCAGTGACAATGGGTTAATCCCA AAAAGCTGTCTCAGTTCGGATTGGGGTCTGCAACTCGACCCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAA 19 Đồ án tốt nghiệp TCGCGTAACAGCATGACGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCAT GGGAATTGGTTCTACCCGAAGGCGGTGCGCCAACCTCGCAAGAGGAGGCAGCCGACCACGGTA GGATCAGTGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACC TCCTTTCTAAGGATGCTTCTGGCAGACAGGCTTGCCTGTCTCGTGAAGCTACTTGGCAGAGACC AGTCATGGTCTCAACACGCGGCCAGGCCGTCCCCATATCCCTTCAAAGACAGAGCAAGCGCGG GTTCGTAACCGCCGTGTGAGCCACCTCGGGCCTTGCGGCCCTCGGCACATGCCTCAAAACGGTC CACTGGACCGTTTTGCCGCGCAGCGGACGGCATGTGGGTCGGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCA CGCCTGATAAGCGTGAGGTCGGAGGTTCAAGTCCTCCTCGACCCACCATCAAATCCGGCGGATT TGATGCCAGCGCCAGCGCGGCAGGACTGCGAGGGGCCTTA Trình tự vùng gene chủng TG8 AGCGAAGTCTTCGGACTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTGCCCTTTGCTTCG GAATAGCCCCGGGAAACTGGGAGTAATACCGAATGTGCCCTACGGGGGAAAGATTTATCGGCA AAGGATCGGCCCGCGTTGGATTAGGTAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGCCGACGATCCA TAGCTGGTTTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGA GGCAGCAGTGGGGAATCTTAGACAATGGGCGCAAGCCTGATCTAGCCATGCCGCGTGATCGAT GAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGATCTTTCAGGTGGGAAGATAATGACGGTACCACCAGAAGAAG CCCCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGGGCTAGCGTTATTCGGAATTAC TGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCGGAAAGTCAGAGGTGAAATCCCAGGGCTCAACCCTG GAACTGCCTTTGAAACTCCCGATCTTGAGGTCGAGAGAGGTGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAG GTGAAATTCGTAGATATTCGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCTCGATACTGA CGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAA CGATGAATGCCAGTCGTCGGGCAGCATGCTGTTCGGTGACACACCTAACGGATTAAGCATTCCG CCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTG GAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAACCCTTGACATGGCGATCGCGG TTCCAGAGATGGTCCTTCAGTTCGGCTGGATCNACACAGGTGCTGCATGGCTGGCGTCAGCTCC GGGTCGGGAAATGTTCGGTTAATCCGGGAACAGAGGCAACCCCCGTCCTTANTTGCCAACATCA GTTGGGCACTCTAGGGAAACTGCCGGGGAAAACCCGGGGAAAGGGGGGG Trình tự vùng gene chủng CM8D ATTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAATGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAG CGAAGTCTTCGGACTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTGCCCTTTGCTTCGGA ATAGCCCCGGGAAACTGGGAGTAATACCGAATGTGCCCTACGGGGGAAAGATTTATCGGCAAA GGATCGGCCCGCGTTGGATTAGGTAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGCCGACGATCCATAG CTGGTTTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGC AGCAGTGGGGAATCTTAGACAATGGGCGCAAGCCTGATCTAGCCATGCCGCGTGATCGATGAA GGCCTTAGGGTTGTAAAGATCTTTCAGGTGGGAAGATAATGACGGTACCACCAGAAGAAGCCC CGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGGGCTAGCGTTATTCGGAATTACTGG GCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCGGAAAGTCAGAGGTGAAATCCCAGGGCTCAACCCTGGAA CTGCCTTTGAAACTCCCGATCTTGAGGTCGAGAGAGGTGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGA AATTCGTAGATATTCGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCTCGATACTGACGCT GAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGAT GAATGCCAGTCGTCGGGCAGCATGCTGTTCGGTGACACACCTAACGGATTAAGCATTCCGCCTG GGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAG CATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAACCCTTGACATGGCGATCGCGGTTC CAGAGATGGTTCCTTCAGTTCGGCTGGATCGCACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGT GTCGTGAGATGTTCGGTTAAGTCCGGCAACGAGCGCAACCCACGTCCTTAGTTGCCAGCATTCA GTTGGGCACTCTAGGGAAACTGCCGGTGATAAGCCGGAGGAAGATGTGGATGACGTCAAGTCC TCATGGCCCTTACGGGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCAGTGACAATGGGTTAATCCCAA AAAGCTGTCTCAGTTCGGATTGGGGTCTGCAACTCGACCCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAAT 20 Đồ án tốt nghiệp CGCGTAACAGCATGACGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATG GGAATTGGTTCTACCCGAAGGCGGTGCGCCAACCTCGCAAGAGGAGGCAGCCGACCACGGTAG GATCAGTGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGAAT Trình tự vùng gene chủng CM37 TCTTCGTTGTATACCATGCAAGTCGAGCGAGTCTTCGGACTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACG CGTGGGAACGTGCCCTTTGCTTCGGAATAGCCCCGGGAAACTGGGAGTAATACCGAATGTGCCC TACGGGGGAAAGATTTATCGGCAAAGGATCGGCCCGCGTTGGATTAGGTAGTTGGTGGGGTAA TGGCCTACCAAGCCGACGATCCATAGCTGGTTTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAG ACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTAGACAATGGGCGCAAGCCTGA TCTAGCCATGCCGCGTGATCGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGATCTTTCAGGTGGGAAGATA ATGACGGTACCACCAGAAGAAGCCCCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGG GGGCTAGCGTTATTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCGGAAAGTCAGAGG TGAAATCCCAGGGCTCAACCCTGGAACTGCCTTTGAAACTCCCGATCTTGAGGTCGAGAGAGGT GAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTCGGAGGAACACCAGTGGCGAAGG CGGCTCACTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATA CCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAATGCCAGTCGTCGGGCAGCATGCTGTTCGGTGACAC ACCTAACGGATTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAAACTCAAGGAATTG ACGGGGGGCTCGCACAAGCGTGGAGCCATGTGGATTAGTTCGTAAGCAATCGGCGGC Trình tự vùng gene chủng CM53.2 CAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAATGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCG AGCGAAGTCTTCGGACTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTGCCCTTTGCTTCG GAATAGCCCCGGGAAACTGGGAGTAATACCGAATGTGCCCTTTGGGGGAAAGATTTATCGGCA AAGGATCGGCCCGCGTTGGATTAGGTAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGCCGACGATCCAT AGCTGGTTTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAG GCAGCAGTGGGGAATCTTAGACAATGGGCGCAAGCCTGATCTAGCCATGCCGCGTGATCGATG AAGGCCTTAGGGTTGTAAAGATCTTTCAGGTGGGAAGATAATGACGGTACCACCAGAAGAAGC CCCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGGGCTAGCGTTATTCGGAATTACT GGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCGGAAAGTCAGAGGTGAAATCCCAGGGCTCAACCCTGG AACTGCCTTTGAAACTCCCGATCTTGAGGTCGAGAGAGGTGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGT GAAATTCGTAGATATTCGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCTCGATACTGACG CTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACG ATGAATGCCAGTCGTCGGGCAGCATGCTGTTCGGTGACACACCTAACGGATTAAGCATTCCGCC TGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGA GCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAACCCTTGACATGGCGATCGCGGTT CCAGAGATGGTTCCTTCAGTTCGGCTGGATCGCACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCG TGTCGTGAGATGTTCGGTTAAGTCCGGCAACGAGCGCAACCCACGTCCTTAGTTGCCAGCATTC AGTTGGGCACTCTAGGGAAACTGCCGGTGATAAGCCGGAGGAAGGTGTGGATGACGTCAAGTC CTCATGGCCCTTACGGGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCAGTGACAATGGGTTAATCCCA AAAAGCTGTCTCAGTTCGGATTGGGGTCTGCAACTCGACCCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAA TCGCGTAACAGCATGACGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCAT GGGAATTGGTTCTACCCGAAGGCGGTGCGCCAACCTCGCAAGAGGAGGCAGCCGACCACGGTA GGATCAGTGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACC TCCTTTCTAAGGATGCTTCTGGCAGACAGGCTTGCCTGTCTCGTGAAGCTACTTGGCAGAGACC AGTCATGGTCTCAACACGCGGCCAGGCCGTCCCCATATCCCTTCAAAGACAGAGCAAGCGCGG GTTCGTAACCGCCGTGTGAGCCACCTCGGGCCTTGCGGCCCTCGGCACATGCCTCAAAACGGTC CACTGGACCGTTTTGCCGCGCAGCGGACGGCATGTGGGTCGGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCA CGCCTGATAAGCGTGAGGTCGGAGGTTCAAGTCCTCCTCGACCCACCATCAAATCCGGCGGATT TGATGCCAGCGCCAGCGCGGCAGGACTGCGAGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTGCT 21 Đồ án tốt nghiệp TTGCAAGCAGGGGGTCATCGGTTCGATCCCGATAGGCTCCACCAGATCCGGTTCGATCGCCAAG CCCATGTGGTGGGTTTGGCCGTCCAACCGGACGAGATTTTGACATCGTTCAGAGAGATACAACA TCAGTATCGCCGGTCTCCCGAGTAGGGGAAGACCTGGGGTTCGACCCCGCAGGCGATATTGTTC CAAGTCTAGTACAACTGACCGCGACGACCTTCGGGTCATCGCATGGGAATGTACATGCTTCTGA CATGGGAAAGAGCCTTGCTCTTTCCGGATCAGATCAAGCGCGAAAAGGGCGTTTGGTGGATGCC TAGGCAGCAAGAGGCGATGAAGGACGTGATACCCTGCGTTAAGCCATGGGGAGCCGGGAATGG GCTTTGATCCATGG Trình tự vùng gene chủng ST23 CAACTTGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAATGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCG AGCGAAGTCTTCGGACTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACGTGCCCTTTGCTTCG GAATAGCCCCGGGAAACTGGGAGTAATACCGAATGTGCCCTTTGGGGGAAAGATTTATCGGCA AAGGATCGGCCCGCGTTGGATTAGGTAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGCCGACGATCCAT AGCTGGTTTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAG GCAGCAGTGGGGAATCTTAGACAATGGGCGCAAGCCTGATCTAGCCATGCCGCGTGATCGATG AAGGCCTTAGGGTTGTAAAGATCTTTCAGGTGGGAAGATAATGACGGTACCACCAGAAGAAGC CCCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGGGCTAGCGTTATTCGGAATTACT GGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGATCGGAAAGTCAGAGGTGAAATCCCAGGGCTCAACCCTGG AACTGCCTTTGAAACTCCCGATCTTGAGGTCGAGAGAGGTGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGT GAAATTCGTAGATATTCGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTCACTGGCTCGATACTGACG CTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACG ATGAATGCCAGTCGTCGGGCAGCATGCTGTTCGGTGACACACCTAACGGATTAAGCATTCCGCC TGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGA GCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAACCCTTGACATGGCGATCGCGGTT CCAGAGATGGTTCCTTCAGTTCGGCTGGATCGCACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCG TGTCGTGAGATGTTCGGTTAAGTCCGGCAACGAGCGCAACCCACGTCCTTAGTTGCCAGCATTC AGTTGGGCACTCTAGGGAAACTGCCGGTGATAAGCCGGAGGAAGGTGTGGATGACGTCAAGTC CTCATGGCCCTTACGGGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCAGTGACAATGGGTTAATCCCA AAAAGCTGTCTCAGTTCGGATTGGGGTCTGCAACTCGACCCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAA TCGCGTAACAGCATGACGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCAT GGGAATTGGTTCTACCCGAAGGCGGTGCGCCAACCTCGCAAGAGGAGGCAGCCGACCACGGTA GGATCAGTGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACC TCCTTTCTAAGGATGCTTCTGGCAGACAGGCTTGCCTGTCTCGTGAAGCTACTTGGCAGAGACC AGTCATGGTCTCAACACGCGGCCAGGCCGTCCCCATATCCCTTCAAAGACAGAGCAAGCGCGG GTTCGTAACCGCCGTGTGAGCCACCTCGGGCCTTGCGGCCCTCGGCACATGCCTCAAAACGGTC CACTGGACCGTTTTGCCGCGCAGCGGACGGCATGTGGGTCGGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCA CGCCTGATAAGCGTGAGGTCGGAGGTTCAAGTCCTCCTCGACCCACCATCAAATCCGGCGGATT TGATGCCAGCGCCAGCGCGGCAGGACTGCGAGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTGCT TTGCAAGCAGGGGGTCATCGGTTCGATCCCGATAGGCTCCACCAGATCCGGTTCGATCGCCAAG CCCATGTGGTGGGTTTGGCCGTCCAACCGGACGAGATTTTGACATCGTTCAGA 22 ... Kết sàng lọc sơ chủng khả hấp thu NaCl Thực qui trình sàng lọc khả hấp thu Na+ theo phƣơng pháp Kei Sasaki Từ kết sàng lọc chịu mặn chủng vi khuẩn quang dƣỡng, tiếp tục chọn chủng vi khuẩn quang. .. vi khuẩn quang dưỡng Độ pH: Quang hợp vi khuẩn quang dƣỡng xảy mội trƣờng có pH 3-11 [15] Vi khuẩn tía sinh trƣởng phát triển pH tối ƣu khoảng - [15] Cƣờng độ ánh sáng: Vi khuẩn quang dƣỡng tía. .. Na+ từ nhóm vi sinh vật nói chung nhóm vi khuẩn quang dƣỡng nói riêng đƣợc phân lập nghiên cứu Vi? ??t Nam Do vậy, đồ án bƣớc đầu ? ?Sàng lọc chủng vi khuẩn quang dƣỡng tía có khả hấp thu muối” nhằm