How to implement genomic selection: Đánh giá hội nghị chuyên đề: cách thực hiện lựa chọn bộ gen_Chăn nuôi thú nhai lại

Symposium review: How to implement genomic selection P M VanRaden† Animal Genomics and Improvement Laboratory, USDA, Agricultural Research Service, Beltsville, MD 20705-2350 Trường Đại học Nông Lâm TP HCM – Khoa Chăn nuôi Thú Y Danh sách thành viên nhóm 13: Ngơ Thị Hồng Hạnh 17111038 Võ Phạm Danh 17111020 Trần Đình Đức 17111028 Mai Thế Xuân 17111176 GVHD: ThS Nguyễn Văn Chánh Tác giả báo: Paul VanRaden Trường Đại học Nông Lâm TP HCM – Khoa Chăn nuôi Thú Y Đặt vấn đề  • Lý Trong 10 năm sau lần triển khai đầu tiên, chọn lọc gen ứng dụng phổ biến, nhà lai tạo tiếp tục tìm cơng cụ để thử nghiệm gen • Thực tế giá trị lai tạo với độ tin cậy cao trước ước tính cách kết hợp kiểu gen DNA cho hàng nghìn locus với phả hệ kiểu hình • Các dự đoán từ sở liệu gen quốc tế thường xác tiết kiệm chi phí so với dự đoán từ sở liệu nước trước thiết kế để kiểm tra hệ cháu Các số lựa chọn bao gồm nhiều đặc điểm mới, thường có hệ số di truyền thấp đòi hỏi đầu tư ban đầu lớn để thu kiểu hình, tạo thêm động lực để hợp tác quốc tế Trường Đại học Nông Lâm TP HCM – Khoa Chăn nuôi Thú Y Đặt vấn đề  Mục tiêu • Đánh giá cách thức lựa chọn gen nhà chăn nuôi bò sữa thực so sánh với phương thức đề cập • Gợi ý phương thức nhà lai tạo quần thể khác thực thành công việc chọn lọc gen cách sử dụng kiến thức thu lần thử nghiệm cuối Trường Đại học Nông Lâm TP HCM – Khoa Chăn ni Thú Y Giới thiệu • • Chọn lọc kiểu gen khác với chọn lọc phả hệ chọn lọc kiểu hình cách kiểm tra trực tiếp DNA • Trước đây, nhiệm vụ xác nhận phương pháp gen hoạt động với liệu thực (Mäntysaari cộng sự, 2010) thuyết phục nhà lai tạo dự đốn gen xác (VanRaden cộng sự, 2009) • Một loạt báo Animal Frontiers (Ibanez-Escriche Simianer, 2016) đánh giá tình trạng chọn lọc gen số quần thể, Boichard et al (2015) đánh giá nhiều công nghệ sử dụng phát triển mơ hình chăn ni bền vững Trước kiểu gen có sẵn đánh dấu, nhà nghiên cứu bắt đầu tìm phương pháp thống kê mơ q trình dự đốn chọn lọc (Nejati- Javaremi et al., 1997; Meuwissen et al., 2001) Trường Đại học Nông Lâm TP HCM – Khoa Chăn nuôi Thú Y Sự phát triển chọn lọc di truyền  Lịch sử gen • Sau quy luật di truyền Gen phát (Mendel, 1866) phát lại (Bateson, 1900), chương trình cải tiến di truyền cho tính trạng số lượng sử dụng kiểu hình phả hệ kỷ sử dụng khơng có kiểu gen liên kết với kiểu hình • • • Giá trị gây giống = liệu riêng cá thể + mối quan hệ họ hàng gần + tất họ hàng Các mối quan hệ gen tổng hợp bên cạnh mối quan hệ phả hệ Lựa chọn gen ban đầu áp dụng cho đực dự đoán hiệu suất hệ cháu, áp dụng rộng rãi cho chí cho phơi để dự đốn hiệu suất chúng thực tế Trường Đại học Nơng Lâm TP HCM – Khoa Chăn nuôi Thú Y Sự phát triển chọn lọc di truyền  Cơ sở liệu bị sữa vào năm 2019 chứa số lượng lớn kiểu gen hàng trăm lần so với năm 2009 bắt đầu chọn lọc gen Trường Đại học Nông Lâm TP HCM – Khoa Chăn nuôi Thú Y Sự phát triển chọn lọc di truyền  DNA kiểu gen • • Thành phần cần thiết chọn lọc gen DNA • Độ xác kiểu gen cao với hầu hết dấu hiệu; tỷ lệ lỗi chi phí chọn lọc gen rẻ Chi phí năm 2008 khoảng 250 đô la / mẫu với 50.000 (50K) dấu hiệu, giảm xuống 80 đô la cho 50K 40 đô la -> tạo kiểu gen mật độ thấp (khoảng 20.000 dấu) Các kiểu gen nguyên thủy cho phép khám phá mối quan hệ phả hệ với nhiều tổ tiên khác (chẳng hạn cháu ngoại cháu chắt) mà vật chưa chưa thông tin (Nani et al., 2020) Trường Đại học Nơng Lâm TP HCM – Khoa Chăn nuôi Thú Y Sự phát triển chọn lọc di truyền  Nguồn DNA để xác định kiểu gen gia súc thay đổi nhiều kể từ năm 2008 (Bảng 2) Đối với phát triển ban đầu, tinh dịch sử dụng tham khảo cho bò đực giống máu sử dụng để chọn lọc bò đực Chỉ năm sau vào năm 2010, mẫu DNA bao gồm 82% từ tóc, 12% sợi từ mũi , 5% từ máu,