Ngày 18/9/2000 Thủ tướng Chớnh phủ đó ban hành quyết định QĐ 890/QĐTTg quy định về chức năng, nhiệm vụ của Bệnh viện trung Ương Huế cụ thể như sau:
1.4.1.1. Khỏm bệnh và chữa bệnh
Bệnh viện là tuyến cuối tiếp nhận khỏm và điều trị bệnh cho nhõn dõn tỉnh Thừa Thiờn Huế và cho nhõn dõn cỏc tỉnh khu vực miền Trung và Tõy Nguyờn từ Hà Tĩnh đến Ninh Thuận.
23
Tổ chức khỏm sức khỏe và cấp giấy chứng nhận sức khỏe cho những người đi học tập, lao động trong và ngoài nước, khỏm chữa bệnh cho người nước ngoài đến làm việc, học tập và du lịch tại Việt Nam.
Tổ chức khỏm, giỏm định sức khỏe khi hội đồng giỏm định y khoa tỉnh, thành phố trưng cầu ; khỏm giỏm định phỏp y khi cơ quan bảo vệ phỏp luật trưng cầu.
1.4.1.2. Đào tạo cỏn bộ y tế
Bệnh viện là cơ sở thực hành chớnh của sinh viờn và học viờn sau đại học của Trường ĐH Y Dược Huế và cỏc cơ sở đào tạo cỏn bộ y tế khỏc tại miền Trung.
Bệnh viện TW Huế cũn là một trong ba Trung tõm đào tạo thực hành cú uy tớn của ngành Y tế, được Bộ Y tế chớnh thức phờ duyệt ngày 06/09/2006, cú nhiệm vụ đào tạo bỏc sĩ thực hành hệ chớnh qui sau đại học và đào tạo đội ngũ điều dưỡng, dược sĩ, bỏc sĩ, thạc sĩ và tiến sĩ cho khu vực. Tổ chức đào tạo liờn tục cho cỏc cỏn bộ cụng chức trong bệnh viện; đào tạo nõng cao kỹ năng lõm sàng và cận lõm sàng cho cỏn bộ y tế cỏc tỉnh miền Trung và Tõy Nguyờn.
1.4.1.3. Nghiờn cứu khoa học
Chủ trỡ thực hiện cỏc đề tài nghiờn cứu khoa học cấp nhà nước, cấp bộ và cấp tỉnh ; xuất bản định kỳ Tạp chớ Y học lõm sàng ; tổ chức cỏc buổi hội nghị khoa học quốc gia và quốc tế, tập huấn chuyờn ngành; định kỳ tổ chức đào tạo trực tuyến; hội họp, hội thảo trực tuyến với cỏc cơ quan trong và ngoài nước.
1.4.1.4. Cụng tỏc chỉ đạo tuyến dưới
Được Bộ Y tế giao nhiệm vụ thực hiện chỉ đạo tuyến và cử cỏn bộ tăng cường giỳp đỡ cho cỏc bệnh viện tuyến dưới (theo đề ỏn 1816) cho 14 tỉnh của khu vực miền Trung và Tõy Nguyờn để triển khai kỹ thuật mới và nõng cao chất lượng chẩn đoỏn và điều trị bệnh trong 15 chuyờn ngành khỏc nhau; đồng thời hỗ trợ cho 10 tỉnh khu vực miền Trung và Tõy Nguyờn về lĩnh vực sức khỏe sinh sản.
24
1.4.1.5. Phũng bệnh và chống dịch
Thu dung và điều trị hiệu quả cỏc dịch bệnh trờn địa bàn; thực hiện cỏc biện phỏp chủ động, phối hợp chặt chẽ với y tế địa phương, phỏt hiện sớm dịch bệnh. Bố trớ nhõn lực và phương tiện, thuốc men cho 2 đội chống dịch cơ động với 2 xe cấp cứu chuyờn dụng, sẵn sàng hỗ trợ cỏc tỉnh miền Trung. Ngoài ra, Bệnh viện phối hợp với Bộ Y tế và Sở Y tế Thừa Thiờn Huế tổ chức tập huấn cho cỏc tỉnh miền Trung về phũng chống dịch cỳm H5N1, HIV/AIDS, sốt xuất huyết, dịch tiờu chảy cấp nguy hiểm, tham gia giỏm sỏt dịch tại cỏc tỉnh miền Trung.
1.4.1.6. Hợp tỏc quốc tế
Hợp tỏc với cỏc tổ chức trong và ngoài nước theo đỳng quy định của nhà nước, tiếp nhận cỏc sinh viờn nước ngoài đến học tập tại bệnh viện.
1.4.1.7. Quản lý kinh tế trong bệnh viện
Về quản lý cơ sở hạ tầng, trang thiết bị:
Bệnh viện cú nhiệm vụ quản lý và cú kế hoạch sử dụng hiệu quả cơ sở hạ tầng của bệnh viện, thường xuyờn duy tu, sửa chữa, bảo trỡ mỏy múc thiết bị. Định kỳ kiểm kờ tài sản, trang thiết bị mỏy múc, nõng cao hiệu quả sử dụng.
Về cụng tỏc quản lý tài chớnh:
Trờn cơ sở Nghị định 43/CP và qui chế chi tiờu nội bộ, bệnh viện nghiờm tỳc thực hiện cỏc chế độ quản lý tài chớnh đồng thời giỏm sỏt chặt chẽ cỏc hoạt động thu chi, cụng khai thuốc và chi phớ cho bệnh nhõn hàng ngày.
Tạo thờm cỏc nguồn kinh phớ từ cỏc dự ỏn lớn từ cỏc tổ chức trong và ngoài nước để nõng cao nguồn lực tài chớnh của bệnh viện.