- Phân loại dựa vào khả năng gây bệnh cho người và các động vật: Vi khuẩn lao người, vi khuẩn lao bò, vi khuẩn lao chim, vi khuẩn lao chuột.
1.5.3.Ứng dụng của kỹ thuật PCR tron gy học
Bằng kỹ thuật PCR, từ một lượng khuôn DNA rất nhỏ như: một giọt máu, một sợi tóc hay một tế bào,… người ta có thể khuếch đại chính xác, trật tự một lượng lớn lên đến hàng triệu bản nhằm phục vụ cho các quá trình khảo sát trong
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn
phản ứng. Trong công nghệ sinh học, PCR được sử dụng trong việc lập bản đồ gene, phát hiện gene, dòng hoá gene, giải mã trình tự DNA,…
PCR được ứng dụng rất rộng rãi trong y học: trong chẩn đoán bệnh ung thư (tìm HPV trong ung thư cổ tử cung, phát hiện gene APC trong ung thư đại tràng, gene BRCA 1 - BRCA 2 trong ung thư vú, gene TPMT trong bệnh bạch cầu trẻ em, gene IgH và TCRy trong u lympho không Hodgkin, gene Rb-105 trong u nguyên bào lưới, gene NF-1,2 trong u xơ thần kinh,…), nghiên cứu về hệ kháng nguyên bạch cầu người (HLA, human lymphocyte antigene),…
Trong Vi sinh học, PCR là một phương tiện hữu dụng để phát hiện các tác
nhân vi sinh vật gây bệnh trong các trường hợp:
* Tác nhân không thể nuôi cấy thường quy: như các virus (viêm gan B, viêm gan C, Dengue virus, HIV, Herpes, CMV, EBV, HPV, virus SARS, H5N1,…), các vi khuẩn (Chlamydia, Legionella, Mycoplasma, Treponema pallidum,…).
* Tác nhân nuôi cấy thường quy cho kết quả chậm: M. tuberculosis.
* Tác nhân nuôi cấy thất bại vì có mặt rất ít trong bệnh phẩm, đã bị điều trị kháng sinh trước đó (ví dụ: Lao thất bại nuôi cấy, viêm màng não mủ mất đầu,…). PCR cũng được dùng để xác định độc tố của vi sinh vật: Tiểu đơn vị A của độc tố ruột không chịu nhiệt của Escherichia coli, và gần đây, các gene eltA và elfB của E. coli sinh độc tố ruột (enterotoxigeneic Escherichia coli, ETEC); vt1 và vt2 của E. coli gây chảy máu đường ruột (enterohaemorrhagic Escherichia coli; EHEC); eaeA và bfpA của E. coli gây bệnh đường ruột (enteropathogeneic
Escherichia coli; EPEC); ial của E. coli xâm nhập đường ruột (enteroinvasive
Escherichia coli; EIEC) và Shigella đã được khuyếch đại bằng PCR nhằm chẩn đoán phân biệt giữa các loại Escherichia coli gây tiêu chảy [17, 23, 24, 30, 34, 35].
PCR khuếch đại các gene nói trên đã thay thế hoặc bổ sung cho các thử nghiệm kinh điển có độ nhậy và độ đặc hiệu kém hơn hoặc là thay thế cho các kỹ thuật phức tạp hơn.
Độc tố ruột của vi khuẩn tả (CT - cholera toxin) đóng vai trò chủ đạo trong cơ chế gây bệnh của chúng. PCR đã được dùng khuếch đại đoạn gene mã hoá cho
Số hóa bởi Trung tâm Học liệu – Đại học Thái Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn
CT; nhờ đó, có thể phân biệt một cách chắc chắn Vibrio cholerae gây bệnh tả thực sự với các Vibrio cholerae khác, thuộc các nhóm huyết thanh không gây bệnh tả (trước đây gọi là các Vibrio không ngưng kết; nonagglutination, NAG). Clostridium difficile cũng được định loại thông qua xác định các loại độc tố riêng biệt của chúng bằng PCR.
PCR còn được dùng để nghiên cứu về tính kháng thuốc của vi khuẩn. Ví dụ, khảo sát gene pbp1a và 2a của Streptococcus pneumoniae bằng kỹ thuật PCR- SSCP, kỹ thuật PCR phát hiện đột biến kháng Rifamicin ở gene rpoB, phát hiện kháng INH do thiếu gene catalase (gene Kat G) của vi khuẩn lao, ... [36].
Trong lĩnh vực ký sinh trùng, kỹ thuật PCR được dùng trong chẩn đoán lỵ amíp, Leishmania, Echinococcus, Microsporidia, Giardia, Cryptosporidium,
Toxoplasma gondii,…